Biotechnology Commons^™

Examining The Effects Of Artemisia Annua On Neuro2a Cells, Wesley Lim

Honors Undergraduate Theses

Artemisia annua L. is a well-known medicinal herb used in Traditional Chinese Medicine for many centuries and contains artemisinin, which exhibits antimalarial properties [1] and is a potential treatment for SARS-CoV-2 [2]. However, the neurological effect of A. annua and its compounds are poorly understood. We hypothesize that A. annua extracts and artemisinin will provide protection against oxidative stress in mouse neuronal Neuro2A cells. Superoxide dismutase 1 (SOD1) is an anti-oxidant enzyme that protects against oxidative damage [3]. Growth Arrest and DNA Damage-inducible 45 alpha (Gadd45a) is involved in DNA repair and is a common biomarker for DNA damage[4]. SOD1 …

Hybridization Kinetics Of Four-Way Junctions Localized On A Dna Scaffold, Katherine N. Taylor

Honors Undergraduate Theses

DNA computing is an ever-growing field with scientists trying to design structures that optimize logic gate communication to develop fast, biologically compatible, computational structures. We hypothesize that by using the principles of DNA computing, it is possible to design a DNA tile capable of studying localized DNA hybridization that can differentiate between oligonucleotides of different structural conformations. This includes synthetically manipulating DNA into a nanostructure that can perform Boolean logic functions to calculate the different rates of hybridization. To test our hypothesis, we designed a DNA Tile that incorporated a 4WJ using YES logic. Linear and hairpin single-stranded (ss) DNA …

A Tool To Automate Neuropathological Assessment In Huntington Disease Mouse Models, Samuel A. Moldenhauer

Honors Undergraduate Theses

As our life expectancy continues to rise, so does the prevalence of neurodegenerative diseases, such as Huntington disease (HD). Neurodegeneration leads to progressive regional brain atrophy, typically initiating prior to symptom onset. With the advancements of medical treatments designed to target neurodegeneration, researchers measure their impact on atrophy in animal models to assess their effectiveness. This is important because treatments designed to combat neuropathology are more likely to modify the disease itself, per contra to treatments designed to mask or treat symptoms. One method of brain region size quantification is magnetic resonance imaging (MRI), which while accurate, is prohibitively expensive. …

Testing The Strength Of Thin Feather-Edge Monolithic Multilayered Zirconia Crowns: A Pilot Study With A Novel Acoustic Test, Estelle Saab, Camille Haddad, Maher Abboud, Maha Daou, Amine Zoghbi

International Arab Journal of Dentistry

Introduction: Limited research has explored the mechanical characteristics of recently introduced multilayered monolithic zirconia (MZC) crowns with feather-edge margins design. Moreover, most of the conventional techniques for evaluating the mechanical behavior of brittle dental ceramics rely on destructive tests, making it impossible to precisely evaluate real strength values due to premature crack initiation detection failure.

Objectives: The main objective of the study was to assess the load capacity of translucent multilayered monolithic zirconia crowns with feather-edge margin thicknesses of 0.4 mm and 0.5 mm. Additionally, the research introduced a novel non-destructive acoustic emission testing (AET) technique in the …

Nudcl2 Is Required For Cytokinesis By Stabilizing Rcc2 With Hsp90 At The Midbody, Xiaoyang Xu, Yuliang Huang, Feng Yang, Xiaoxia Sun, Rijin Lin, Jiaxing Feng, Mingyang Yang, Jiaqi Shao, Xiaoqi Liu, Tianhua Zhou, Shanshan Xie, Yuehong Yang

Markey Cancer Center Faculty Publications

Cytokinesis is required for faithful division of cytoplasmic components and duplicated nuclei into two daughter cells. Midbody, a protein-dense organelle that forms at the intercellular bridge, is indispensable for success- ful cytokinesis. However, the regulatory mechanism of cytokinesis at the midbody still remains elusive. Here, we unveil a critical role for NudC-like protein 2 (NudCL2), a co-chaperone of heat shock protein 90 (Hsp90), in cytokinesis regulation by stabilizing regulator of chromosome condensation 2 (RCC2) at the midbody in mam- malian cells. NudCL2 localizes at the midbody, and its downregulation results in cytokinesis failure, multinu- cleation, and midbody disorganization. Using iTRAQ-based …

An Assessment Of User Satisfaction On Remote Court Hearings In The Brunei Civil Court, Hazwani Masli, Seyed M. Buhari

ASEAN Journal on Science and Technology for Development

Remote court hearings (RCHs) have significantly benefited the Brunei Civil Court in maintaining its judicial system and reducing backlogs as a preventative measure, during COVID-19. RCHs have enhanced the judicial system's accessibility, saving resources and increasing court performance and productivity. However, technical problems and mistrust have slowed the RCH's adoption. This study assessed user satisfaction with remote court hearings using the Technology Acceptance Model (TAM) framework. Three external variables influenced the perceived usefulness of remote court hearings: trust, perceived risk, and fairness expectations. This study also included moderator variables such as age group and professions. This study showed that trust, …

Exploiting Quadratic Unconstrained Binary Optimization And Column Generation For Solving Vehicle Routing Problem With Discretized Time Windows, Krittin Phornsiricharoenphant

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

No abstract provided.

Bio-Bust: Investigating Biotech Stock Factors Contributing To Abnormal Returns In The Wake Of Silicon Valley Bank's Failure, Spencer Kent

CMC Senior Theses

Following the unprecedented collapse of Silicon Valley Bank (SVB) in March 2023, this study explores abnormal stock price reactions within the biotechnology sector. As the chosen financial institution for countless Silicon Valley-type technology and healthcare firms, SVB's failure had a profound impact on small to mid-sized biotech companies. Analyzing a dataset of 180 biotech firms during a two-day event window over SVB’s collapse, I investigate whether exposure to SVB, or other factors, was the primary contributor to negative abnormal stock price reactions, considering variables such as the percentage of cash held at SVB, whether a firm maintained an active SVB …

Mechanistic Analysis Of Four-Way Dna Junctions And Cytokine-Binding Aptamers For Therapeutic Interventions, Roaa S. Mahmoud

Theses and Dissertations

DNA is inherently dynamic and topologically diverse and can fold into many different structures. Besides the canonical Watson-Crick structure, other higher-order structures such as G-quadruplexes (G4), i-motifs (iM), and four-way DNA junctions are possible. Although these high-order DNA structures are known to form transiently, they are important due to the crucial roles they play in many cellular processes including DNA replication, recombination, and repair. Among these DNA structures, 4-way junctions (also known as Holliday junctions, HJ) which are formed during the repair of double-strand DNA breaks (DSBs) and interact with proteins have garnered significant attention due to their central role …

Exploring A Medicinal Strain Of White-Rot Fungus For Biofuel Applications, Kortney L. Lucius

Masters Theses

The major limitation to producing biofuels from lignocellulosic biomass, such as miscanthus straw, is the difficulty in accessing fermentable carbohydrates encased in lignin. Traditional methods for separating lignin are economically and environmentally costly. Biological pretreatment using white-rot fungi, such as Trametes versicolor, has been demonstrated to potentially reduce the need for harsh chemical and physical pretreatment methods. Despite these efforts, the process of converting lignocellulose to ethanol remains financially challenging. To explore a potential co-product for the process, this study evaluated the efficacy of T. versicolor strain CM-101, known for producing the valuable medicinal macromolecule polysaccharide-K (PSK), as a …

Utilizing Ai Integrated Neuroimaging Technology To Expand Upon Machine Learning In Positron Emission Tomography Technology With The Aim Of Detecting Amyloid Beta Biomarkers Early In The Onset Of Alzheimer's., Ethan S. Terman

UROP Posters

Early intervention in Alzheimer's is vital for treatment. The earlier a professional can detect symptoms and make a diagnosis the earlier a prognosis can be implemented. With the prevalence of data in our day-to-day world combined with Artificial intelligence (AI), utilizing both for machine learning can pave the way for more accurate and efficient detection of Alzheimer's and other neurodegenerative diseases. AI combined with Machine learning (ML) increases diagnostic efficiency and reduces human errors, making it a valuable resource for physicians and clinicians alike. With the increasing amount of data processing and image interpretation required, the ability to use AI …

Large T Antigen Mediated Target Gene Replication Improves Site-Specific Recombination Efficiency, Zening Wang, Chuan Chen, Xin Ge

Faculty, Staff and Student Publications

With advantages of high-fidelity, monoclonality and large cargo capacity, site-specific recombination (SSR) holds great promises for precise genomic modifications. However, broad applications of SSR have been hurdled by low integration efficiency, and the amount of donor DNA available in nucleus for SSR presents as a limiting factor. Inspired by the DNA replication mechanisms observed in double-stranded DNA virus SV40, we hypothesized that expression of SV40 large T antigen (TAg) can increase the copy number of the donor plasmid bearing an SV40 origin, and in consequence promote recombination events. This hypothesis was tested with dual recombinase-mediated cassette exchange (RMCE) in suspension …

One-Step Production Of Fully Biotinylated And Glycosylated Human Fc Gamma Receptors, Minhyo Kang, Zening Wang, Xin Ge

Faculty, Staff and Student Publications

Initiating and regulating humoral immunity, Fc gamma receptors (FcγRs) have been identified both as therapeutics and as drug targets, and thus production of biologically active FcγRs is highly demanded for biopharmaceutical development. Focusing on low-affinity FcγRs IIA (131H/R allotypes), IIB, and IIIA (176F/V), this study used human 293-F cells to achieve correct post-translational modifications (PTMs) including biotinylation, N-glycosylation, and disulfides. Approaches involving co-expression of FcγR-AviTag and Escherichia coli biotin ligase BirA, endoplasmic reticulum retention, stable and transient transfections, and optimization of transgene ratio were investigated. Protein electrophoresis under reducing and non-reducing conditions, enzymatic deglycosylation, streptavidin pull-down assays, and binding kinetic …

Effect Of Pgi And Edd Gene Deletion In Escherichia Coli K12 On Production Of Poly(3-Hydroxybutyrate) And Copolymer Poly(3-Hydroxybutyrate-Co-3-Hydroxyvalerate), Jittakan Pachimsawat

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

The biomaterial poly(3-hydroxybutyrate) (PHB) is a promising alternative renewable and green polymer. In this research, we incorporated deletion of phosphogluconate dehydratase (edd) and phosphoglucose isomerase (pgi) in E. coli for PHB production for the first time. As a result, the edd mutant harboring pBSKCABA-04 reached the highest PHB production of 93.0%wt with 7.55 g/L PHB concentration at 30 hours of cultivation. A specific production rate of 0.21 h-1 and maximum productivity of 0.25 g/L.h were obtained using glucose as a sole carbon source. On the other hand, deletion of pgi gene only recovered the cell growth but did not promote …

Extraction Of Lipid And Polysaccharides From Rambutan Seed Waste By Supercritical Carbon Dioxide And Subcritical Water, Kamonthip Nilmat

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

The rambutan processing industry generates around 37,000–42,000 tons of seed waste each year, which holds potential for sustainable utilization. This study investigates the extraction of lipids and polysaccharides from rambutan seeds using green extraction technologies. Initial analysis revealed that rambutan seeds contain lipids 30.48%, lipids, 11.9%, carbohydrates 42%, fiber 6.6%, and ash 1.72%. Lipid extraction using supercritical CO2 with ethanol (SCCO2-EtOH) achieved higher phenolic content and antioxidant activity compared to Soxhlet extraction. After that, the defatted rambutan seeds underwent additional processing to extract polysaccharides by subcritical water extraction (SWE) and hot water extraction (HWE). Supercritical water extraction (SWE) at ideal …

Valorization Of Spent Coffee Grounds As Feedstock For Biodiesel Production Using Supercritical Fluid Technology, Wirasinee Supang

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

Spent coffee grounds (SCGs) is the solid residue generated during coffee brewing. The amount of SCGs tends to increase annually due to the growth of the coffee industry. The valorization of SCGs can reduce this huge waste by using SCGs as the feedstock for biodiesel production. This study used green technology for biodiesel production. To evaluate the potential of SCGs, the characterization of SCGs and the optimization of biodiesel production from SCGs using supercritical fluid technology were investigated. Moreover, to understand the possibility of biodiesel production from the SCGs process on an industrial scale, techno-economic analysis (TEA) was applied to …

ผลของพลาสมาที่ไม่ใช้ความร้อนต่อสมบัติและการลดไซยาไนด์ใน ฟลาวร์มันสำปะหลัง, ยุทธพงศ์ อิ่มเอิบ

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

มันสำปะหลังเป็นพืชเศรษฐกิจสำคัญของประเทศไทย ซึ่งมีการนำไปใช้ในอุตสาหกรรมอย่างหลากหลาย อย่างไรก็ตามมันสำปะหลังมีไซยาโนเจนิกไกลโคไซด์ ซึ่งเมื่อนำไปแปรรูปจะเกิดสารไฮโดรเจนไซยาไนด์ที่เป็นพิษ จึงจำเป็นต้องลดปริมาณไซยาไนด์ให้อยู่ในระดับที่ปลอดภัยต่อการบริโภค ปัจจุบันการลดไซยาไนด์ในมันสำปะหลังใช้กระบวนการที่มีข้อจำกัด เช่น การโม่เปียกที่ใช้น้ำปริมาณมากและก่อให้เกิดน้ำเสีย หรือการโม่แห้งซึ่งยังมีประสิทธิภาพไม่เพียงพอในการลดปริมาณไซยาไนด์ให้อยู่ในระดับที่ปลอดภัย งานวิจัยนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษาผลของปริมาณความชื้นและชนิดของก๊าซที่ใช้ในการสร้างพลาสมาแบบไม่ใช้ความร้อน (Non-thermal Plasma) ต่อการลดปริมาณไซยาไนด์ในฟลาวร์มันสำปะหลังโม่แห้ง โดยศึกษาที่ความชื้นร้อยละ 5, 10 และ 15 นอกจากนี้ยังมีการแปรความหนา 2, 4 และ 6 มิลลิเมตร โดยใช้แรงดันไฟฟ้า 12 กิโลโวลต์ และใช้ก๊าซฮีเลียมเป็นแหล่งกำเนิดพลาสมา พบว่าที่ความชื้นร้อยละ 15 และความหนา 2 มิลลิเมตร มีการลดลงของปริมาณไซยาไนด์สูงที่สุดถึงร้อยละ 42.37 เมื่อพิจารณาผลของชนิดของก๊าซที่ใช้เป็นแหล่งกำเนิดพลาสมา โดยศึกษาผลของก๊าซฮีเลียม และอาร์กอนที่ความชื้นร้อยละ 15 ความหนา 2 มิลลิเมตร ใช้แรงดันไฟฟ้า 12 กิโลโวลต์ พบว่าก๊าซอาร์กอนสามารถลดปริมาณไซยาไนด์ได้สูงที่สุดถึงร้อยละ 53.80 แม้ว่าการใช้พลาสมาจะสามารถลดปริมาณไซยาไนด์ลงได้ในระดับหนึ่ง แต่ปริมาณไซยาไนด์ที่เหลือยังคงสูงกว่าเกณฑ์มาตรฐานความปลอดภัยที่กฎหมายกำหนด พิจารณาผลกระทบของพลาสมาต่อสมบัติทางเคมีกายภาพของฟลาวร์พบว่าฟลาวร์ที่ผ่านการให้พลาสมามีความหนืดลดลง ทั้งในส่วนของความหนืดสูงสุดและความหนืดสุดท้าย อันเป็นผลมาจากกระบวนการ ดีพอลิเมอไรเซชันของสายแอมิโลส และแอมิโลเพคติน รวมถึงการเชื่อมข้ามโมเลกุลของฟลาวร์ส่งผลให้ความหนืดลดลง

การศึกษาความเป็นไปได้ในการประยุกต์ใช้น้ำเสียที่ผ่านการบำบัดในกระบวนการอบยาง, สิรวิชญ์ โพธิ์ระหง

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

บริษัท สยามมิชลิน จำกัด (โรงงานพระประแดง) จังหวัดสมุทรปราการ มุ่งมั่นในการจัดการทรัพยากรน้ำอย่างมีประสิทธิภาพและยั่งยืนในกระบวนการผลิตยางรถยนต์ การผลิตยางรถยนต์และยางรถจักรยานยนต์มีการใช้น้ำจำนวนมากในกระบวนการผลิต จึงเป็นเหตุให้เกิดน้ำเสียจำนวนมากตามมาเช่นกัน น้ำเสียเหล่านี้จะถูกส่งเข้าระบบบำบัดน้ำเสียแบบเลี้ยงตะกอนเร่งเพื่อบำบัดและมีสมบัติได้ตามมาตรฐานน้ำทิ้ง แนวทางในการลดการปล่อยน้ำเสียหลังการบำบัดแล้วสู่สาธารณะ คือ การนำน้ำเสียที่ผ่านการบำบัดเหล่านี้กลับมาใช้เพื่อสามารถหมุนเวียนทรัพยากรให้กลับมาใช้ใหม่อย่างมีประสิทธิภาพสูงสุด และยังสอดคล้องกับแผนการบริหารด้านความยั่งยืนในการจัดการสิ่งแวดล้อมของบริษัทอีกทางหนึ่งด้วย ในงานวิจัยนี้จึงศึกษาความเป็นไปได้ในการนำน้ำเสียที่ผ่านการบำบัดแล้วกลับมาใช้ใหม่ในกระบวนการอบยาง โดยศึกษาและปรับปรุงประสิทธิภาพอัตราการไฟล (%Recovery) ของระบบรีไซเคิลรีเวอร์สออสโมซิสแบบขั้นตอนเดียวด้วยสารกรองแก้ว (AFM®ng) พบว่ามีประสิทธิภาพเพิ่มขึ้นจากเป็นร้อยละ 64 จากนั้นศึกษาเปรียบเทียบความเป็นไปได้ของโครงการระหว่างระบบรีไซเคิลแบบสองขั้นตอน (Double-pass RO) มีร้อยละผลตอบแทนของโครงการ (%ROI) และระยะเวลาคืนทุน (Payback period) เท่ากับ ร้อยละ 242, 1.22 ปีและระบบรีไซเคิลแบบสองขั้นตอนร่วมกับระบบการกรองระดับอัลตร้า (UF-RO/RO) เท่ากับร้อยละ 189, 1.97 ปีตามลำดับ แสดงให้เห็นว่าระบบรีไซเคิลแบบสองขั้นตอน (Double-pass RO) มีผลตอบแทนด้านการลงทุน (ROI) ที่ดีที่สุด และระยเวลาการคืนทุนที่เร็วกว่า แม้ว่าระบบรีไซเคิลแบบสองขั้นตอนร่วมกับระบบการกรองระดับอัลตร้า (UF-RO/RO) จะมีคุณภาพน้ำดีกว่า แต่เมื่อพิจารณาต้นทุนแล้ว พบว่าไม่แตกต่างกันมากนัก เนื่องจากระบบรีไซเคิลแบบสองขั้นตอน (Double-pass RO)มีร้อยละผลตอบแทนการลงทุนที่ดีที่สุด และระยะเวลาคืนทุนเร็วกว่า บริษัทฯ จึงเลือกใช้ระบบนี้ในการผลิตน้ำป้อนเข้าสู่หม้อต้มไอน้ำ ส่งผลให้สัดส่วนการใช้น้ำประปาในการอบยางลดลงร้อยละ 26 สัดส่วนการใช้น้ำรีไซเคิลเพิ่มขึ้นถึงร้อยละ 42 และลดการปลดปล่อยก๊าซคาร์บอนไดดอกไซด์ได้ 111.63 ตันคาร์บอนไดออกไซด์ต่อปี

Salt Tolerance In Rice ‘Jao Khao’: Molecular Marker Development By Bulk Segregant Analysis And Two-State Weighted Gene Co-Expression Network Analysis, Prasit Khunsanit

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

We validated a QTL based on our previous QTL-Seq mapping study (bulk segregant analysis combined with high-throughput DNA sequencing) using the salt-tolerant donor line ‘Jao Khao’ in a cross of two different genetic backgrounds. The QTL was related to cell membrane stability (CMS) and tiller number (TN), and located in the same interval region of 38.26-38.95 Mb on chromosome 1, indicating pleiotropy. The results confirmed the co-localization of the qCMS1 and qTN1 traits on chromosome 1. Based on the CMS trait, qCMS1/qTN1 stably expressed 6–18% of the phenotypic variance in the two validation populations, while qCMS1/qTN1 accounted for 16–20% of …

การประเมินคาร์บอนฟุตพริ้นท์องค์กรและการลดก๊าซเรือนกระจกภายใต้โครงการสนับสนุนกิจกรรมลดก๊าซเรือนกระจก: กรณีศึกษาโรงงานผลิตยางคอมพาวด์, ปภาวรินท์ ทรงพัฒนาศิลป์

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

ปัญหาการเปลี่ยนแปลงสภาพภูมิอากาศในปัจจุบันเกิดจากการเพิ่มขึ้นของปริมาณก๊าซเรือนกระจก ซึ่งมีความรุนแรงและมีแนวโน้มที่จะส่งผลกระทบที่เพิ่มมากขึ้น ประเทศต่าง ๆ และองค์กรทั่วโลกได้กำหนดเป้าหมายในการลดการปล่อยก๊าซเรือนกระจก จึงเป็นสิ่งสำคัญที่ต้องตระหนักถึงและแก้ไขผลกระทบที่เห็นได้ชัดจากการเปลี่ยนแปลงสภาพภูมิอากาศ เพื่อส่งเสริมความร่วมมือในการบรรเทาปัญหาอย่างมีประสิทธิภาพ การศึกษานี้มีวัตถุประสงค์เพื่อประเมินปริมาณคาร์บอนฟุตพริ้นท์องค์กรของโรงงานผลิตยางคอมพาวด์ และประเมินปริมาณการลดการปล่อยก๊าซเรือนกระจกจากกิจกรรมในองค์กร ภายใต้โครงการสนับสนุนกิจกรรมลดก๊าซเรือนกระจก (Low Emission Support Scheme: LESS) ขององค์การบริหารจัดการก๊าซเรือนกระจก (องค์การมหาชน) ในปี พ.ศ. 2565 และ 2566 ผลการศึกษาพบว่าปริมาณการปล่อยก๊าซเรือนกระจกทั้งหมดมีแนวโน้มลดลงจาก 41,675.07 ตันคาร์บอนไดออกไซด์เทียบเท่าต่อปี ในปี พ.ศ. 2565 สู่ 38,043.30 ตันคาร์บอนไดออกไซด์เทียบเท่าต่อปีในปี พ.ศ. 2566 โดยขอบเขตที่ 3 การปล่อยก๊าซเรือนกระจกทางอ้อมอื่นๆ มีสัดส่วนที่สูงที่สุด คิดเป็นร้อยละ 78.55 และ 79.81 ตามลำดับ รองลงมา คือ ขอบเขตที่ 2 การปล่อยจากการใช้พลังงาน มีสัดส่วนคิดเป็นร้อยละ 20.05 และ 18.40 และขอบเขตที่ 1 การปล่อยทางตรงขององค์กร มีสัดส่วนต่ำที่สุด คิดเป็นร้อยละ 1.39 และ 1.80 เมื่อวิเคราะห์ต่อยอดการผลิต พบว่า ปริมาณการปล่อยก๊าซเรือนกระจกประเภทที่ 1 และ 2 ต่อยอดผลิตในปี พ.ศ. 2565 และ 2566 เท่ากับ 0.1717 และ 0.1699 ตามลำดับ ขณะที่ปริมาณการปล่อยก๊าซเรือนกระจกขอบเขตที่ 1 2 และ 3 ต่อยอดผลิต เท่ากับ 0.8005 และ 0.8413 ตันคาร์บอนไดออกไซด์เทียบเท่าต่อตัน ผลการศึกษาในการลดก๊าซเรือนกระจกจากการดำเนินกิจกรรมภายในองค์กรสามารถลดปริมาณการปล่อยก๊าซเรือนกระจกในปี พ.ศ. 2565 และ 2566 เท่ากับ 2,255.29 ตันคาร์บอนไดออกไซด์เทียบเท่า โดยการติดตั้งระบบพลังงานหมุนเวียนจากแสงอาทิตย์ (Solar Rooftop) สามารถลดปริมาณก๊าซเรือนกระจกได้ในปี พ.ศ. 2565 …