Mrna Vaccine Encoding Neoantigen For Cancer Immunotherapy Using Mouse Melanoma As A Model,
2021
Faculty of Science
Mrna Vaccine Encoding Neoantigen For Cancer Immunotherapy Using Mouse Melanoma As A Model, Chutamath Sittplangkoon
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
Cancer is the leading cause of death globally with an urgent need to find more effective approaches for prevention and treatment. mRNA vaccine is a promising vaccine platform over conventional vaccines in terms of safety, ease of large-scale production and effectiveness in inducing both cellular and humoral immune responses. Breakthrough in mRNA technology allowed novel strategies to improve mRNA stability and efficacy including nucleoside modifications. Modification of mRNA with N1-methylpseudouridine (m1Ψ) was reported to enhance protein expression and decrease innate immunogenicity due to low binding affinity to pattern recognition receptors, and low type I interferon (IFN-I) secretion. Therefore, this study …
Association Between Gene Expression And Promoter Methylation Of Cgb3, Gstp1 And Nop56 Genes And Their Potential In Biomarker Development - Associated Cervical Cancer.,
2021
Faculty of Science
Association Between Gene Expression And Promoter Methylation Of Cgb3, Gstp1 And Nop56 Genes And Their Potential In Biomarker Development - Associated Cervical Cancer., Palak Singh
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
Binding of DNMT1-E7 complex can induce promoter methylation in tumor suppressor genes, such as CCNA1, CADM1 leading to their expression suppression and thus, cause cancer progression. This research establishes the association between methylation-related expression of CGB3 and NOP56 genes in cervical cell lines treated with 5-Azacytidine drug. Using MSP-PCR and qPCR, it was found that the methylation of CGB3 and NOP56 were significantly decreased as concentration of 5-Aza increased and this was inversely related with their expression. This demonstrated the association between gene methylation and the regulation of gene expression which were assessed by 5’-aza drug treatment. Of note, the …
Identification Of Α-Glucosidase Inhibitors From Black Garlic,
2021
Faculty of Science
Identification Of Α-Glucosidase Inhibitors From Black Garlic, Pattraporn Tantiwatcharachai
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
Black garlic has emerged as one of the fastest-growing health food products on the market. It is processed by incubating fresh garlic under high temperature and high humidity conditions. The process causes the changes in characteristics of black garlic such as texture, flavor, nutrient contents, chemical composition and it pharmacological properties, especially antidiabetic activity. In the present investigation, we applied α-glucosidase inhibition guided isolation to identify active compounds. Four compounds named 5-hydroxymethylfurfural (5-HMF), 5-hydroxymethyl-2-furancarboxylic acid (HMFCA), 4-(hydroxymethyl)phenol and 2-deoxy-ribono-1,4 lactone were isolated. On evaluation against α-glucosidase, HMFCA, 4-(hydroxymethyl)phenol, and 2-deoxy-ribono-1,4 lactone were active against maltase with IC50 values of 18.83 …
Production And Characterization Of Mannanase From Aureobasidium Sp. For Mannooligosaccharide Preparation From Spent Coffee Ground,
2021
Faculty of Science
Production And Characterization Of Mannanase From Aureobasidium Sp. For Mannooligosaccharide Preparation From Spent Coffee Ground, Syahriar Nur Maulana Malik Ibrahim
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
The aims of this study are to produce and characterize mannanase from the selected Thai Aureobasidium strain and use the enzyme for hydrolysis of spent coffee ground extract (SCGE) to prepare mannooligosaccharide (MOs). The optimum condition for SCGE extraction by hot water was 1:30 solid to liquid ratio with 60 min incubation time at 121°C 15 lbs per in2. The maximum yield was 9.5 g/100 g substrate. The second dominant composition of SCGE was hemicellulose at 28 %. Aureobasidium pullulans NRRL 58524 was selected as the best mannanase producer with 8.07 U/mL. The mannanase production medium was optimized by using …
Proteomics Analysis Of Bt-474 And Skov-3 Cancer Cell Lines Treated With Purified Compounds From Bee Pollen And Cerumen,
2021
Faculty of Science
Proteomics Analysis Of Bt-474 And Skov-3 Cancer Cell Lines Treated With Purified Compounds From Bee Pollen And Cerumen, Teeranai Ittiudomrak
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
Breast and gynaecological cancers are the main causes of global cancer death in females. So far, several compounds have been identified from traditional medicine components and natural products that exhibited anticancer activity. Previously, α-mangostin (α-MG) and apigenin (APG) had been extracted and purified from cerumen of Tetragonula laeviceps and bee pollen of Apis mellifera respectively. Preliminary studies reported that these compounds express antiproliferative activity in several cancer cell lines. In this study, α-MG and APG were investigated for antiproliferation effect in breast cancer cell line BT-474 and ovarian adenocarcinoma cell line SKOV-3 using MTT assay, fluorescent staining coupled with flow …
การคัดแยกแบคทีเรียจากวัสดุเหลือทิ้งในอุตสาหกรรมการผลิตแป้งมันสำปะหลังเพื่อการผลิตปุ๋ยหมัก,
2021
คณะวิทยาศาสตร์
การคัดแยกแบคทีเรียจากวัสดุเหลือทิ้งในอุตสาหกรรมการผลิตแป้งมันสำปะหลังเพื่อการผลิตปุ๋ยหมัก, เฌอญานุส บุตรคำโชติ
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
ในประเทศไทยกระบวนการผลิตแป้งมันสำปะหลังก่อให้เกิดของเหลือทิ้งจำนวนมาก เช่น กากมันสำปะหลัง และกากตะกอนจากระบบบำบัดน้ำเสียที่ก่อให้เกิดมลพิษทางสิ่งแวดล้อม ในงานวิจัยนี้ศึกษาการเปลี่ยนกากมันสำปะหลัง และกากตะกอนจากระบบบำบัดน้ำเสียให้เป็นปุ๋ยหมักโดยใช้หัวเชื้อแบคทีเรีย หัวเชื้อแบคทีเรียที่ใช้ประกอบด้วย กลุ่มเชื้อที่ทำหน้าที่ย่อยเซลลูโลส B. subtilis TISTR 008, B. subtilis C-CV1033 และ B. shackletonii C-S1052 กลุ่มเชื้อที่ทำหน้าที่ย่อยแป้ง B. subtilis A-CV1031 และ B. subtilis A-S51041 เชื้อที่ทำหน้าที่ตรึงไนโตรเจน B. ginsengihumi N-BS1 เชื้อที่ทำหน้าที่ละลายฟอสเฟต B. shackletonii P-S1041 และเชื้อที่ทำหน้าที่ละลายโพแทสเซียม B. bataviensis K-S1043 การใช้หัวเชื้อแบคทีเรียกลุ่มดังกล่าวกับกากมันสำปะหลัง กากตะกอนจากระบบบำบัดน้ำเสีย ร่วมกับรำข้าว มูลวัว ผงหินฟอสเฟต และแร่เฟลด์สปาร์ เพื่อผลิตเป็นปุ๋ยหมัก พบว่ามีปริมาณไนโตรเจน ฟอสฟอรัส โพแทสเซียม แคลเซียม และแมกนีเซียม เท่ากับร้อยละ 1.77, 1.97, 1.75, 3.76, 0.72 และมีปริมาณ สังกะสี แมงกานีส เหล็ก และทองแดงเท่ากับ 139, 740, 3040 และ 11.26 มิลลิกรัมต่อกิโลกรัม ตามลำดับ ในขณะที่อัตราส่วนของคาร์บอนต่อไนโตรเจนของปุ๋ยลดลง การใช้กากมันสำปะหลัง กากตะกอนจากระบบบำบัดน้ำเสีย ร่วมกับรำข้าว มูลวัว ผงหินฟอสเฟต และแร่เฟลด์สปาร์ มีศักยภาพในการเพิ่มปริมาณธาตุอาหารให้แก่ปุ๋ยหมักจากวัสดุเหลือทิ้งได้
การพัฒนาระบบพลาสมาไอออนไนเซอร์ประสิทธิภาพสูงสำหรับเครื่องปรับอากาศ,
2021
คณะวิทยาศาสตร์
การพัฒนาระบบพลาสมาไอออนไนเซอร์ประสิทธิภาพสูงสำหรับเครื่องปรับอากาศ, นฤสรณ์ แน่นหนา
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
ในงานวิจัยนี้ วงจรเครื่องกำเนิดพลาสมาถูกออกแบบโดยวางรากฐานอยู่บนการใช้ Flyback Transformer ซึ่งเป็นเทคโนโลยีการสวิตชิ่งกำลังไฟฟ้าของ MOSFET ในการคายประจุแบบพลาสมาไดอิเล็กตริกแบริเออร์ดิสชาร์จเชิงผิวเพื่อนำมาเปรียบเทียบกับพลาสมาไอออนไนเซอร์ซึ่งเป็นเทคโนโลยีของบริษัท บิทไว้ส์ (ประเทศไทย) จำกัด แรงดันไฟฟ้ากระแสสลับที่จ่ายให้กับเครื่องพลาสมาไดอิเล็กตริกแบริเออร์ดิสชาร์จเชิงผิวใช้แรงดันไฟฟ้า 5.38 kV วงจรกำเนิดพลาสมาได้รับการออกแบบมีการทำงานที่ความถี่ 0.2 Hz เมื่อใช้ Duty Cycle ที่ 5%, 10%, 20% และ 100% การศึกษาอุณหภูมิวัสดุไดอิเล็กตริกที่เปิดระบบไว้ 10 นาที อยู่ที่ 34.0 °C, 36.5 °C, 39.6 °C และ 67.0 °C ตามลำดับ และเมื่อตรวจวัดค่าโอโซนพบว่ามีความเข้มข้นโอโซน 174 ppb, 794 ppb, 1,820 ppb และ 9,849 ppb ตามลำดับ จากการศึกษาสเปกโตรสโกปีการเปล่งแสงของพลาสมาไดอิเล็กตริกแบริเออร์ดิสชาร์จพื้นผิวที่ความดันบรรยากาศเผยให้เห็นว่ามีกลุ่ม N2, NO และ OH ซึ่งสารอนุมูลอิสระเหล่านี้มีบทบาทสำคัญในการฆ่าเชื้อจุลินทรีย์ โดยการใช้ Optical Emission Spectrometer พบว่ามีอุณหภูมิพลาสมาที่ 0.82 eV การทดสอบประสิทธิภาพการกำจัดเชื้อใช้ Escherichia coli (E. coli) ATCC 25922 ในการทดสอบ เชื้อ E. coli ถูกฉายด้วยไดอิเล็กตริกแบริเออร์ดิสชาร์จเชิงผิวและพลาสมาไอออนไนเซอร์เป็นเวลา 10 นาที จากผลการทดลองแสดงให้เห็นว่าไดอิเล็กตริกแบริเออร์ดิสชาร์จเชิงผิวสามารถลดปริมาณเชื้อ E. coli ได้ถึง 100% ในขณะที่พลาสมาไอออนไนเซอร์ไม่สามารถลดปริมาณเชื้อ E. coli ได้
การออกแบบและพัฒนาอุปกรณ์หยิบจับสำหรับผลิตภัณฑ์ยางแปรรูป,
2021
คณะวิทยาศาสตร์
การออกแบบและพัฒนาอุปกรณ์หยิบจับสำหรับผลิตภัณฑ์ยางแปรรูป, พีรวัส รัตนโชติ
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
วิทยานิพนธ์ฉบับนี้เสนอแนวทางการเลือกใช้และพัฒนาอุปกรณ์หยิบจับ (Gripper) สำหรับผลิตภัณฑ์ยางแปรรูปให้เหมาะสมกับรูปร่าง ขนาด และคุณสมบัติทางกลของยางแปรรูป ซึ่งอุปกรณ์หยิบจับนี้ถูกนำมาใช้เพื่อนำผลิตภัณฑ์ยางที่ผ่านกระบวนการขึ้นรูปชิ้นงานด้วยแม่พิมพ์โดยการให้ความร้อนออกจากแม่พิมพ์ออกจากแม่พิมพ์โลหะ ซึ่งจำเป็นที่ต้องทราบถึงแรงที่ใช้นำชิ้นงานออกจากแม่พิมพ์โดยแรงนี้ถูกเรียกว่า Demolding force และโดยปกติแรงนี้จะประกอบไปแรงเสียดทาน (Friction Force) และแรงยึดติด (Adhesion force) ดังนั้นวิทยานิพนธ์ฉบับนี้จึงมุ่งเน้นไปที่ปัจจัยที่ส่งผลต่อ Demolding force ได้แก่ รูปทรง พื้นที่สัมผัส ความแข็งของยาง และความหยาบผิวของแม่พิมพ์ โดยได้มีการออกแบบการทดลองโดยใช้ Full factorial design และใช้การวิเคราะห์ถดถอยพหุคูณ (Multiple regression analysis) เพื่อใช้ในการพยากรณ์ นอกจากนี้ยังได้พัฒนาซอฟท์แวร์มาเพื่อแนะนำการออกแบบและพัฒนาอุปกรณ์หยิบจับ และสุดท้ายได้มีการพัฒนาอุปกรณ์หยิบจับตัวต้นเพื่อทดสอบประสิทธิภาพของซอฟท์แวร์นี้
ปัจจัยที่ส่งผลถึงการประมาณค่าการนำความร้อนในยางคอมพาวด์,
2021
คณะวิทยาศาสตร์
ปัจจัยที่ส่งผลถึงการประมาณค่าการนำความร้อนในยางคอมพาวด์, สุทธิพัฒน์ กมลสุทธิไพจิตร
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
การวัลคาไนซ์เซชั่นยางในอุตสาหกรรมต้องอาศัยอุณหภูมิและระยเวลาในการคงรูปชิ้นงานซึ่งระยะเวลาในการคงรูปชิ้นงานจะขึ้นกับค่าการนำความร้อนของยางคอมปาวด์ที่แต่ละสูตร โดยงานวิจัยนี้จึงมีจุดประสงค์เพื่อศึกษาหลักการและกระบวนการทดสอบค่าการนำความร้อน การประมาณค่าการนำความร้อนในยางคอมปาวด์และปัจจัยที่ส่งผลต่อค่าการนำความร้อนในกระบวนการคงรูป โดยขั้นแรกได้ศึกษาการประมาณค่าการนำความร้อน พบว่า การประมาณค่านำความร้อนของแบบจำลองขนานเทียบกับค่าการนำความร้อนที่ได้จากการทดสอบ HFM จะมีค่าความคาดเคลื่อนเกิดขึ้นไม่เกิน 5 % สำหรับยางคอมปาวด์ที่วัลคาไนซ์เซชั่นอย่างสมบูรณ์ ขั้นที่สองเป็นศึกษาปัจจัยที่ส่งผลกระทบต่อค่าการนำความร้อน พบว่า สัดส่วนโดยปริมาตรของสารตัวเติมมีผลกระทบต่อค่าการนำความร้อนที่จะเปลี่ยนแปลงไปรวมถึงปริมาณน้ำมันที่ส่งผลกระทบต่อค่าการนำความร้อนอย่างมาก ส่วนยางที่วัลคาไนซ์เซชั่นอย่างสมบูรณ์จะให้ค่าการนำความร้อนสูงกว่ายางคอมปาวด์และยางที่วัลคาไนซ์เซชั่นร้อยละ 50 จะมีฟองอากาศภายในยางส่งผลให้ค่าการนำความร้อนต่ำกว่ายางคอมปาวด์ ส่วนยางที่เกิด และขั้นที่สามออกแบบชุดทดสอบสำหรับหาค่าการนำความร้อน พบว่า ชุดต้นแบบใช้วิธีการหาค่าการนำความร้อนในสภาวะคงที่ซึ่งต้องควบคุมความสม่ำเสมอของความร้อนและป้องสูญเสียความร้อนของชุดต้นแบบ ดังนั้นชุดต้นแบบจะมีส่วนประกอบหลักเป็นฮีตเตอร์สำหรับเป็นแหล่งความร้อนโดยจะใช้น้ำหล่อเย็นสำหรับการควบคุมอุณหภูมิประกอบกับฉนวนกันความร้อนสำหรับป้องกันการสูญเสียความร้อนโดยจะใช้การไหลของความร้อนในหนึ่งหน่วยพื้นที่เป็นตัวกำหนดค่าการนำความร้อน
การพัฒนาเทอร์มอพลาสติกวัลคาไนเซตจากยางโบรโมบิวทิลและพอลิโพรพิลีนสำหรับจุกปิดหลอดเก็บเลือด,
2021
คณะวิทยาศาสตร์
การพัฒนาเทอร์มอพลาสติกวัลคาไนเซตจากยางโบรโมบิวทิลและพอลิโพรพิลีนสำหรับจุกปิดหลอดเก็บเลือด, สุพรรณษา คุณขยัน
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
งานวิจัยนี้ศึกษาอัตราส่วนผสมยางโบรโมบิวทิล (BIIR) พอลิโพรพิลีน (PP) และเอทิลีนออกทีนโคพอลิเมอร์ (EOC) เพื่อปรับปรุงความแข็งให้เท่ากับความแข็งของจุกปิดหลอดเก็บเลือดทางการค้า จากผลการทดสอบสมบัติความแข็งพบว่าที่อัตราส่วนผสม B65P10E25 (BIIR 65 wt%, PP 10wt% และ EOC 25 wt%) มีค่าความแข็งเท่ากับ 43 Shore A ซึ่งอยู่ในเกณฑ์ค่าความแข็งของจุกปิดหลอดเก็บเลือด จึงได้เลือกอัตราส่วนนี้มาเตรียมเป็นเทอร์มอพลาสติกวัลคาไนเซต (TPV) โดยผสมสารวัลคาไนซ์ไดคิวมิลเพอร์ออกไซด์ 1.5 wt% และสารโคเอเจนต์ไตรเมทิลออลโพรเพนไตรเมทาอะคริเลท 1 wt% ผลการทดสอบสมบัติเชิงกลต่าง ๆ พบว่า TPV ที่เตรียมได้มีสมบัติความแข็ง ความต้านทานต่อแรงดึง ระยะยืดสูงสุด ณ จุดขาด และความต้านทานต่อแรงฉีกขาดสูงขึ้น ในขณะที่เปอร์เซ็นต์การยุบตัวหลังได้รับแรงกดลดลงเป็น 21.83% เมื่อเทียบกับ B65P10E25 ที่ไม่มีสารวัลคาไนซ์ ผลจากภาพกล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอนแบบส่องกราด (SEM Micrograph) พบว่าการเติม EOC ในสัดส่วนที่เพิ่มขึ้น จะช่วยปรับปรุงความเข้ากันได้และการกระจายตัวของ BIIR และ PP นอกจากนี้เมื่อผสม EOC ในสัดส่วนที่มากกว่า 25% วัสดุจะแสดงสมบัติการคืนตัวหลังแทงเข็มที่ดี โดยสูตรที่ผ่านการทดสอบนี้ ได้แก่ B65P10E25, B65E35 (BIIR 65 wt% และ EOC 35 wt%) และ B65P10E25 TPV (TPV ที่เตรียมขึ้นจากอัตราส่วน B65P10E25) เป็นต้น นอกจากนี้ความสามารถในการซึมผ่านแก๊สออกซิเจนของ B65P10E25 TPV มีค่าเท่ากับ 151.81 cm3·mm/m2·day·0.1MPa ซึ่งอยู่ในเกณฑ์ที่ใช้พิจารณาวัสดุที่จะนำมาใช้เป็นจุกปิดสำหรับผลิตภัณฑ์ที่ต้องการป้องกันการซึมผ่านของอากาศภายนอกได้ดี ดังนั้นงานวิจัยนี้จึงสามารถเตรียม TPV ที่มีสมบัติเชิงกลที่ดี มีอัตราการซึมผ่านแก๊สต่ำ และสามารถคืนตัวได้หลังจากดึงเข็มออก ซึ่งสมบัติเหล่านี้ผ่านเกณฑ์ที่ใช้พิจารณาสำหรับนำไปประยุกต์ใช้เป็นจุกปิดในหลอดเก็บเลือด นอกจากนี้ยังสามารถนำมาผ่านกระบวนการขึ้นรูปซ้ำใหม่ได้
Assessing The Utility Of Environmental Dna Techniques To Monitor White Shrimp (Litopenaeus Setiferus) Abundance On The Georgia Coast,
2021
Georgia Southern University
Assessing The Utility Of Environmental Dna Techniques To Monitor White Shrimp (Litopenaeus Setiferus) Abundance On The Georgia Coast, Raven Hurt
College of Graduate Studies: Theses & Dissertations
Environmental DNA (eDNA) surveys have developed over the last decade from once being a novel tool to now acting as an effective technology often used in complement to traditional capture surveys for assessing the distribution of organisms in freshwater and marine environments. However, many uncertainties on how to properly develop, operate, and analyze eDNA based techniques still hinder this technology effectiveness in the field. The white shrimp, Litopenaeus setiferus, is a common, commercially and recreationally important species in the United States, with landings exceeding $254 million in 2020. L. setiferus is also used as a key indicator species to changes …
Resource Characterization And Utilization Of Lepironia Articulata (Retz.) Domin At Kg. Beris Tok Kuand Kg. Beting Lintang, Terengganu,
2021
Universiti Malaya
Resource Characterization And Utilization Of Lepironia Articulata (Retz.) Domin At Kg. Beris Tok Kuand Kg. Beting Lintang, Terengganu, Shoma Tani
Student Works (2020-2029)
This research focused on how handicrafts could contribute to sustainable community development with natural resource management. This research aims to characterize Lepironia articulata as a resource by taxonomy and distribution patterns, examine its utilization through group and semi-structured interviews with ten local residents who got involved in handicraft productions at two selected villages in Setiu Wetlands of Terengganu state and identify their capacity development opportunities by following a guideline provided by United Nations Development Programme. This research clarified that the height of Lepironia articulata in Setiu Wetlands was shorter than the records of the other description and the other site …
Covid-19 And Biocybersecurity's Increasing Role On Defending Forward,
2021
Old Dominion University
Covid-19 And Biocybersecurity's Increasing Role On Defending Forward, Xavier Palmer, Lucas N. Potter, Saltuk Karahan
Electrical & Computer Engineering Faculty Publications
The evolving nature of warfare has been changing with cybersecurity and the use of advanced biotechnology in each aspect of the society is expanding and overlapping with the cyberworld. This intersection, which has been described as “biocybersecurity” (BCS), can become a major front of the 21st-century conflicts. There are three lines of BCS which make it a critical component of overall cybersecurity: (1) cyber operations within the area of BCS have life threatening consequences to a greater extent than other cyber operations, (2) the breach in health-related personal data is a significant tool for fatal attacks, and (3) health-related misinformation …
Applications Of Machine Learning In Microbial Forensics,
2021
Michigan Technological University
Applications Of Machine Learning In Microbial Forensics, Ryan B. Ghannam
Dissertations, Master's Theses and Master's Reports
Microbial ecosystems are complex, with hundreds of members interacting with each other and the environment. The intricate and hidden behaviors underlying these interactions make research questions challenging – but can be better understood through machine learning. However, most machine learning that is used in microbiome work is a black box form of investigation, where accurate predictions can be made, but the inner logic behind what is driving prediction is hidden behind nontransparent layers of complexity.
Accordingly, the goal of this dissertation is to provide an interpretable and in-depth machine learning approach to investigate microbial biogeography and to use micro-organisms as …
Identification And Characterisation Of Putative Drug Binding Sites In Human Atp-Binding Cassette B5 (Abcb5) Transporter,
2021
Edith Cowan University
Identification And Characterisation Of Putative Drug Binding Sites In Human Atp-Binding Cassette B5 (Abcb5) Transporter, Lokeswari P. Tangella, Mahreen Arooj, Evelyne Deplazes, Elin S. Gray, Ricardo L. Mancera
Research outputs 2014 to 2021
© 2020 The Author(s) The human ATP-binding cassette B5 (ABCB5) transporter, a member of the ABC transporter superfamily, is linked to chemoresistance in tumour cells by drug effluxion. However, little is known about its structure and drug-binding sites. In this study, we generated an atomistic model of the full-length human ABCB5 transporter with the highest quality using the X-ray crystal structure of mouse ABCB1 (Pgp1), a close homologue of ABCB5 and a well-studied member of the ABC family. Molecular dynamics simulations were used to validate the atomistic model of ABCB5 and characterise its structural properties in model cell membranes. Molecular …
Comparison Of Standard And Environmental Dna Methods For Estimating Chinook Salmon Smolt Abundance In The Klamath River, California,
2021
Cal Poly Humboldt
Comparison Of Standard And Environmental Dna Methods For Estimating Chinook Salmon Smolt Abundance In The Klamath River, California, Doyle Joseph Coyne
Cal Poly Humboldt theses and projects
Evaluating abundance of juvenile salmonids is critical to conservation and management. Current abundance estimation involves use of rotary screw traps and mark-recapture studies. Use of environmental DNA (eDNA) in water samples offers a noninvasive and less expensive approach that may potentially improve or eventually replace traditional monitoring. Here I evaluate the utility of eDNA to predict weekly abundance estimates of outmigrating Chinook salmon (Oncorhynchus tshawytscha) smolts in the Klamath River, California. A total of 15 water samples were collected per week over the 17-week smolt outmigration in both 2019 and 2020. Chinook salmon eDNA concentration in each water …
Spatio-Temporal Variations In Bacterial Abundance With An Emphasis On Fecal Indicator Bacteria And Vibrio Spp. In And Around Visakhapatnam Port, East Coast Of India,
2020
Universiti Brunei Darussalam
Spatio-Temporal Variations In Bacterial Abundance With An Emphasis On Fecal Indicator Bacteria And Vibrio Spp. In And Around Visakhapatnam Port, East Coast Of India, Khandeparker Lidita, Desai Dattesh V., Sawant Subhash Shivram, Krishnamurthy Venkat, Chandrashekar Anil Arga
ASEAN Journal on Science and Technology for Development
The ecological health of port environments, which are dynamic and hotspots of anthropogenic activities, can be analyzed using specific pathogenic bacteria as they provide definite evidence and source of pollution. The influence of seasons and environmental settings on total bacterial count (TBC), distribution of fecal indicators, and Vibrio spp. was explored in Visakhapatnam port, located along the east coast of India. South-west monsoon had a significant influence on TBC, fecal indicators, and Vibrio spp., and the abundance was influenced by the eutrophic environment in the inner harbour. Fecal indicators were one order higher in sub-surface water when compared with sediment, …
Two Approaches To Measure Trace Metals Fluxes At The Sediment–Water Interface: Sediment Porewater Profile And Benthic Incubation,
2020
Universiti Brunei Darussalam
Two Approaches To Measure Trace Metals Fluxes At The Sediment–Water Interface: Sediment Porewater Profile And Benthic Incubation, Harmesa, Wahyudi Johan
ASEAN Journal on Science and Technology for Development
The biogeochemical cycle of trace metals is very likely affected by the global change in the ocean, especially due to the increasing of sea surface temperature and acidity. Thus, assessing biogeochemical cycle of trace metals will beneficial in elucidating the potential impact of climate change as well as ocean acidification. The assessment of the biogeochemical cycle of trace metals can be performed by measuring trace metals fluxes crossing the sediment–water interface. The main challenge in this measurement is the difficulty of measuring metal concentrations at trace levels due to either physical factors or biological factors that can affect the total …
Sea Level Rise In Indonesia: The Drivers And The Combined Impacts From Land Subsidence,
2020
Universiti Brunei Darussalam
Sea Level Rise In Indonesia: The Drivers And The Combined Impacts From Land Subsidence, Triana Karlina, Wahyudi A'An Johan
ASEAN Journal on Science and Technology for Development
Sea level changes play an important role as an indicator of climate change. However, without climate change, the sea level itself shows strong regional patterns, both in space and time, that could deviate significantly from global averages. The spatial variability of sea level changes in Indonesia can be divided based on its drivers, i.e., climatic and seasonal weather-driven and non-climatic and geological-driven. Seasonally, the sea level in Indonesia is generally high in northwest monsoon and low in southeast monsoon. Nevertheless, there is a possibility of extreme natural phenomenon influences that generate anomalies and a thermosteric process that also affects the …
Establishing An Ocean Acidification Monitoring System For The Tropical Waters Of Indonesia Facing Regional Climate Variability,
2020
Universiti Brunei Darussalam
Establishing An Ocean Acidification Monitoring System For The Tropical Waters Of Indonesia Facing Regional Climate Variability, Prayitno Hanif Budi, Puspitasari Rachma, Jandang Suppakarn, Triana Karlina, Taufiqurrahman Edwards, Lestari, Afdal, Wulandari, Harmesa, Meirinawati Hanny, Lastrini Suci, Kaisupy Muhamad Taufik, Wahyudi A'An Johan
ASEAN Journal on Science and Technology for Development
The emission of greenhouse gases, including high CO2 and other materials, initiates global warming and climate change. Atmospheric CO2 that affects the carbonate system of seawater causes ocean acidification (OA). OA affects marine organisms directly, as well as humans economically and ecologically. Considering the high impact of OA and following the United Nations' Sustainable Development Goals, systematic research and monitoring of OA is necessary in Indonesia, whose seas play an important role in this emerging phenomenon. This review discusses the urgency of OA monitoring systems and suggests carbonate system monitoring, as well as carbon biogeochemistry. OA significantly affects marine production …
