Marine Biology Commons^™

High Frequency Temperature Variability Reduces The Risk Of Coral Bleaching, Aryan Safaie, Nyssa J. Silbiger, Timothy R. Mcclanahan, Geno Pawlak, Daniel J. Barshis, James L. Hench, Gareth J. Williams, Kristen A. Davis

Biological Sciences Faculty Publications

Coral bleaching is the detrimental expulsion of algal symbionts from their cnidarian hosts, and predominantly occurs when corals are exposed to thermal stress. The incidence and severity of bleaching is often spatially heterogeneous within reef-scales (km), and is therefore not predictable using conventional remote sensing products. Here, we systematically assess the relationship between in situ measurements of 20 environmental variables, along with seven remotely sensed SST thermal stress metrics, and 81 observed bleaching events at coral reef locations spanning five major reef regions globally. We find that high-frequency temperature variability (i.e., daily temperature range) was the most influential factor in …

Sea Turtles And Survivability In Demersal Trawl Fisheries: Do Comatose Olive Ridley Sea Turtles Survive Post-Release?, Sara M. Maxwell, Matthew J. Witt, Gaspard Abitsi, Marie Pierre Aboro, Pierre Didier Agamboue, Georges Mba Asseko, Francois Boussamba, Emmanuel Chartain, Micheline Schummer Gnandji, Brice Didier Koumba Mabert

Biological Sciences Faculty Publications

Incidental capture of air‑breathing species in fishing gear is a major source of mortality for many threatened populations. Even when individuals are discarded alive, they may not survive due to direct injury, or due to more cryptic internal physiological injury such as decompression sickness. Post‑release mortality, however, can be difficult to determine. In this pilot study, we deployed survivorship pop‑up archival tags (sPAT) (n = 3) for an air‑breathing species, the olive ridley sea turtle (Lepidochelys olivacea), one of the first studies to do so. We found that at least two of the three turtles survived after being …

Integrating Dynamic Subsurface Habitat Metrics Into Species Distribution Models, Stephanie Brodie, Michael G. Jacox, Steven J. Bograd, Heather Welch, Heidi Dewar, Kylie L. Scales, Sara M. Maxwell, Dana M. Briscoe, Christopher A. Edwards, Larry B. Crowder, Rebecca L. Lewison, Elliott L. Hazen

Biological Sciences Faculty Publications

Species distribution models (SDMs) have become key tools for describing and predicting species habitats. In the marine domain, environmental data used in modeling species distributions are often remotely sensed, and as such have limited capacity for interpreting the vertical structure of the water column, or are sampled in situ, offering minimal spatial and temporal coverage. Advances in ocean models have improved our capacity to explore subsurface ocean features, yet there has been limited integration of such features in SDMs. Using output from a data-assimilative configuration of the Regional Ocean Modeling System, we examine the effect of including dynamic subsurface …

Energy-Rich Mesopelagic Fishes Revealed As A Critical Prey Resource For A Deep-Diving Predator Using Quantitative Fatty Acid Signature Analysis, Chandra Goetsch, Melinda G. Conners, Suzanne M. Budge, Yoko Mitani, William A. Walker, Jeffrey F. Bromaghin, Samantha E. Simmons, Colleen Reichmuth, Daniel P. Costa

Biological Sciences Faculty Publications

Understanding the diet of deep-diving predators can provide essential insight to the trophic structure of the mesopelagic ecosystem. Comprehensive population-level diet estimates are exceptionally difficult to obtain for elusive marine predators due to the logistical challenges involved in observing their feeding behavior and collecting samples for traditional stomach content or fecal analyses. We used quantitative fatty acid signature analysis (QFASA) to estimate the diet composition of a wide-ranging mesopelagic predator, the northern elephant seal (Mirounga angustirostris), across five years. To implement QFASA, we first compiled a library of prey fatty acid (FA) profiles from the mesopelagic eastern North Pacific. Given …

ฤดูสืบพันธุ์และนิเวศวิทยาการกินอาหารของปลาคางคก Allenbatrachus Grunniens (Linnaeus, 1758) บริเวณปากแม่น้ำปราณบุรี จังหวัดประจวบคีรีขันธ์, ทัพประดิษฐ์ มิตรเปรียญ

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

ปลาคางคกชนิด Allenbatrachus grunniens (Linnaeus, 1758) เป็นปลาน้ำกร่อยชนิดสำคัญและมีความสำคัญต่อระบบนิเวศ ปากแม่น้ำปราณบุรี จังหวัดประจวบคีรีขันธ์ ในอดีตยังไม่มีรายงานทางด้านวิชาการถึงบทบาทและการใช้ประโยชน์ของปลาชนิดนี้ จากบริเวณปากแม่น้ำ การศึกษาครั้งนี้ จึงทำการศึกษาฤดูสืบพันธุ์และนิเวศวิทยาการกินอาหารของปลาคางคกชนิด A. grunniens บริเวณปากแม่น้ำปราณบุรี โดยทำการเก็บตัวอย่างปลาชนิดนี้ (จำนวน 111 ตัว) จาก 5 สถานี (St1-St5) ระหว่างเดือนพฤศจิกายน พ.ศ. 2559 ถึง เดือนตุลาคม พ.ศ. 2560 ผลการศึกษาพบว่าการกระจายตัวของปลา A. grunniens สามารถพบได้แค่ 2 สถานี (St4 และ St5) เท่านั น ขณะที่ปลา A. grunniens ความยาวเหยียดเฉลี่ย 17.46±3.53 เซนติเมตร ข้อมูลทางด้านสัณฐานวิทยาและมิญชวิทยาแสดงให้เห็นว่าโครงสร้างของรังไข่จัดเป็นแบบไข่สุก ไม่พร้อมกัน (asynchronous development ovary) เนื่องจากประกอบด้วยเซลล์ไข่หลากหลายระยะ ที่สามารถแบ่งออกเป็น 4 ระยะ คือ โอ โอโกเนีย ระยะการเจริญของการพัฒนาเซลล์ไข่ขั้นปฐมภูมิ ระยะการเจริญของการพัฒนาเซลล์ไข่ขั้นทุติยภูมิ และระยะปล่อยเซลล์ไข่ ในขณะที่โครงสร้างอัณฑะในปลาเพศผู้จัดเป็น unrestricted spermatogonial testis ที่สามารถพบการกระจายของระยะสเปอร์มาโทโกเนียมตลอด ความยาวของท่อสร้างอสุจิ ทั้งนี้ ระยะสเปอร์มาโทไซต์ระยะแรก ระยะสเปอร์มาโทไซต์ระยะที่สอง ระยะสเปอร์มาทิดและระยะสเปอร์มาโทซัวก็ ยังสามารถพบได้ภายในท่อสร้างอสุจิ (สำหรับสัดส่วนเพศของปลา A. grunniens เป็น 1:1) จากค่าดัชนีความสมบูรณ์เพศ (GSI), ค่าดัชนีความ สมบูรณ์ของตับ (HSI) และการเปลี่ยนแปลงร้อยละของการเจริญของอวัยวะสร้างเซลล์สืบพันธุ์ พบว่าค่าดัชนีความสมบูรณ์เพศสอดคล้องกับการ เจริญของอวัยวะสืบพันธุ์ของปลาคางคกทั้งสองเพศ พบช่วงสืบพันธุ์สองช่วง [ช่วงแรกคือ ช่วงเดือนมกราคม พ.ศ.2560 ถึงเดือนกุมภาพันธ์ พ.ศ.2560 และช่วงที่สอง คือ ช่วงเดือนกรกฏาคม พ.ศ.2560 ถึงเดือนตุลาคม พ.ศ.2560] A. grunniens …

Effect Of Temperature On Antioxidant Enzyme Activities And Gene Expression In Sand Worm Perinereis Quatrefagesi (Grube, 1878), Sucharat Suksai

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

Polychaetes is one of intertidal animals that face the fluctuations of coastal environment through time. One of important environmental factors to animals is temperature regarding to the fluctuation of temperature in intertidal environment. Human activities could also cause high changes in water temperature by high temperature discharges from urban and industries. Since global warming is still a main issue, an increase of seawater temperature about 3°C could be possible as a prediction. This study aimed to investigate effect of temperature in polychaetes Perinereis quatrefagesi at cellular level, which could be indicated by heat shock response and oxidative stress due to …

นิเวศวิทยาการกินอาหารเชิงเปรียบเทียบระหว่างปลาแป้นจมูกสั้น Nuchequula Gerreoides (Bleeker, 1851) และปลาแป้นกระสวย Eubleekeria Splendens (Cuvier, 1829) จากปากแม่น้ำปราณบุรี ประเทศไทย, ทัศพร กาญจนเรขา

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

Description of the resource partitioning (or niche differentiation) among fish is an essential part of substantial difference in a resources used for coexisting species for reducing competition. Food and reproductive activity are the most important factor concerning the resource partitioning among fishes. Decorated ponyfish (Nuchequula gerreoides) and splendid ponyfish (Eubleekeria splendens) are the two abundantly co-occurring leiognathid’s species in the Pranburi river estuary. The coexistence of these two species may promote resource partitioning. To examine this hypothesis, two important ponyfishes were collected from the Pranburi river estuary in this study. All fish specimens collection were carried out during dry (February …

บทบาทของสัตว์ทะเลหน้าดินขนาดใหญ่ในการเป็นแหล่งอาหารของนกชายเลนในนาเกลือที่ถูกทิ้งร้าง จังหวัดเพชรบุรี, ธนภัทร กลับชุ่ม

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

นกชายเลนเป็นกลุ่มนกอพยพที่เข้ามาหากินในอ่าวไทยตอนในบริเวณหาดเลนและบางส่วนของนาเกลือ นาเกลือที่ถูกทิ้งร้างมีศักยภาพเป็นแหล่งหาอาหารของนกชายเลน เนื่องจากเป็นที่อาศัยของสัตว์ทะเลหน้าดินขนาดใหญ่ซึ่งเป็นอาหารหลักของนกชายเลนหลายชนิดในช่วงฤดูอพยพ งานวิจัยนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษาความสัมพันธ์ระหว่างโครงสร้างชุมชนของของสัตว์ทะเลหน้าดินขนาดใหญ่ และความชุกชุมของนกชายเลนที่ลงเข้าใช้ในบ่อนาเกลือที่ถูกทิ้งร้างในตำบลปากทะเล อำเภอบ้านแหลม จังหวัดเพชรบุรี ในบ่อนาเกลือที่ถูกทิ้งร้างสองแบบ คือ บ่อที่ดินโผล่พ้นน้ำเมื่อน้ำลง (A) และบ่อที่ถูกน้ำท่วมตลอดเวลา (B) ทำการเก็บตัวอย่างดิน และเก็บข้อมูลของนกชายเลนในช่วงเวลาน้ำลงต่ำสุด เดือนละ 1 ครั้ง ตั้งแต่เดือนตุลาคม พ.ศ. 2560 - เดือนพฤษภาคม พ.ศ. 2561 ผลการศึกษาพบสัตว์ทะเลหน้าดินขนาดใหญ่ทั้งสิ้น 60 ชนิด กลุ่มที่มีความหนาแน่นสูงสุด คือ ไส้เดือนทะเลและแมลง ตามลำดับ โดยไส้เดือนทะเลมีความหนาแน่นสูงในบ่อที่ดินโผล่พ้นน้ำซึ่งมีความเค็มใกล้เคียงกับความเค็มของน้ำทะเล ส่วนบ่อที่ถูกน้ำท่วมตลอดเวลาที่มีลักษณะพื้นที่ที่แตกต่างกัน เช่น พื้นที่น้ำท่วมสูง และพื้นที่เนินดินที่ถูกปกคลุมด้วยไบโอฟิลม์ ซึ่งมีแมลงเป็นกลุ่มเด่น ส่วนนกชายเลนพบทั้งสิ้น 23 ชนิด รวม 7,715 ตัว ความชุกชุมของนกชายเลนสูงสุดในเดือนตุลาคมซึ่งเป็นช่วงต้นฤดูอพยพ รองลงมาในเดือนมกราคมเป็นฤดูอพยพ และในเดือนเมษายนเป็นช่วงปลายฤดูอพยพ ตามลำดับ การผันแปรชองชนิดและความหนาแน่นของสัตว์ทะเลหน้าดินขนาดใหญ่และนกชายเลนอยู่ภายใต้อิทธิพลของปัจจัยสิ่งแวดล้อมที่สำคัญ คือ ระดับน้ำในบ่อ ซึ่งในบ่อที่ถูกน้ำท่วมตลอดเวลามีน้ำลึกเฉลี่ย 10 เซนติเมตร ดินตะกอนในบ่อมีปริมาณอินทรีย์สารและปริมาณซัลไฟด์ทั้งหมดสูง ส่วนนกชนิดเด่นที่พบลงหากินในบ่อนี้ คือ นกปากแอ่นหางดำและนกตีนเทียน ซึ่งเป็นนกขนาดใหญ่ที่มีปากและขายาว โดยเฉพาะนกปากแอ่นหางดำเป็นนกที่มีสถานภาพใกล้ถูกคุกคามและมีความสัมพันธ์กับความหนาแน่นของแมลง ส่วนบ่อที่ดินโผล่พ้นน้ำมีน้ำตื้น (เฉลี่ย 3 เซนติเมตร) นกชนิดเด่นที่พบในบ่อนี้ คือ นกหัวโตทรายและนกชายเลนปากกว้างซึ่งเป็นนกขนาดเล็กและมีขาสั้น การศึกษาครั้งนี้แสดงให้เห็นถึงความสำคัญความอุดมสมบูรณ์ของสัตว์ทะเลหน้าดินรวมถึงสภาพแวดล้อมในนาเกลือที่ถูกทิ้งร้าง เช่น ความลึกของน้ำและความเค็มของน้ำในบ่อซึ่งใกล้เคียงกับสภาพของหาดเลนในธรรมชาติ ส่งผลให้บ่อนาเกลือร้างที่ศึกษามีความสำคัญทั้งในด้านของการเป็นแหล่งอาหารและหากินของนกชายเลน (ซึ่งรวมถึงนกที่มีสถานภาพการอนุรักษ์ถึง 7 ชนิด) นอกจากนี้นาเกลือที่ถูกทิ้งร้างเป็นแหล่งทำรังวางไข่ให้แก่นกประจำถิ่น

การสะสมของพิษอัมพาตในหอยแมลงภู่ Perna Viridis จากการกรองกิน Alexandrium Minutum ที่แยกจากบริเวณปากแม่น้ำเจ้าพระยา, ปฏิภาณ พุ่มพวง

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

Alexandrium minutum เป็นไดโนแฟลกเจลเลตที่เป็นสาเหตุของพิษอัมพาตในหอย สามารถพบการกระจายในปริมาณน้อยเป็นบางครั้งบริเวณชายฝั่งอ่าวไทย เนื่องจากบริเวณอ่าวไทยเป็นพื้นที่เลี้ยงหอยแมลงภู่ที่สำคัญของประเทศ ทำให้มีความเป็นไปได้ของการสะสมพิษอัมพาตในหอยแมลงภู่จากการกรองกิน A. minutum อย่างไรก็ตามการศึกษาการสะสมพิษอัมพาตในหอยแมลงภู่ในประเทศไทยยังมีอยู่อย่างจำกัด เพื่อให้เกิดความเข้าใจมากขึ้น จึงทำการศึกษาการสะสมพิษอัมพาตในหอยแมลงภู่ (Perna viridis) และแพลงก์ตอนพืชที่กรองแยกจากน้ำทะเลในพื้นที่เลี้ยงหอย บริเวณศรีราชา จังหวัดชลบุรี และคลองด่าน จังหวัดสมุทรปราการ ในฤดูลมมรสุมตะวันตกเฉียงใต้ และฤดูลมมรสุมตะวันออกเฉียงเหนือ และการสะสมพิษอัมพาตที่ส่งผ่านจาก A. minutum ไปสู่หอยแมลงภู่ในห้องปฏิบัติการ ด้วยการให้หอยกรองกิน A. minutum อย่างต่อเนื่องเป็นเวลา 2 สัปดาห์ และในช่วงเวลากำจัดพิษ ให้หอยกรองกินแพลงก์ตอนชนิด Isochrysis sp. ซึ่งไม่สร้างสารชีวพิษเป็นเวลา 2 สัปดาห์ ทำการตรวจวัดปริมาณและองค์ประกอบพิษอัมพาตโดยเครื่อง HPLC ด้วยวิธีตรวจวัดแบบ pre-chromatographic oxidation ผลการศึกษาในพื้นที่เลี้ยงหอยแมลงภู่ ไม่พบเซลล์ของ A. minutum แต่พบปริมาณพิษอัมพาตในหอยแมลงภู่อยู่ในระดับต่ำกว่าเกณฑ์มาตรฐานสารชีวพิษกลุ่มพิษอัมพาตในหอยสองฝา การศึกษาในห้องปฏิบัติการ ใช้เซลล์ A. minutum ที่เติบโตในช่วงปลายของระยะ exponential ซึ่งมีปริมาณพิษอัมพาตอยู่ในช่วง 3.75-4.46 pgSTXeq./เซลล์ และมี GTX1,4 เป็นองค์ประกอบพิษหลักมากกว่า 90% เป็นอาหารแก่หอยแมลงภู่ ผลการทดลองพบว่าปริมาณพิษอัมพาตที่สะสมในหอยแมลงภู่ต่อตัวเพิ่มขึ้นสอดคล้องกับปริมาณ A. minutum ที่ถูกกรองกิน ปริมาณพิษอัมพาตมีค่ามากกว่าค่าควบคุมภายใน 24 ชั่วโมง และมีค่าสูงสุดในวันสุดท้ายที่กรองกิน A. minutum คือ วันที่ 14 (11.20 µg STXeq.ต่อตัว) ซึ่งมีค่าสูงกว่าระดับควบคุม 14 เท่า โดยตลอดช่วงการศึกษาพบการสะสมพิษอัมพาตมีค่าอยู่ระหว่าง 23-47% ของปริมาณที่ได้รับจากการกรองกิน ในช่วงการกำจัดพิษพบว่า ปริมาณพิษอัมพาตต่อตัวหอยลดลงอย่างรวดเร็วและต่ำกว่าค่าควบคุมภายใน 3 วัน โดยในวันสุดท้ายของการกำจัดพิษพบพิษอัมพาต 0.08% จากปริมาณที่ได้รับ นอกจากนี้ยังพบความแตกต่างของการกำจัดพิษอัมพาตที่ได้รับจาก A. minutum คือ GTX1,4 (อนุพันธ์ที่มีความเป็นพิษสูง) สามารถถูกกำจัดจากเนื้อหอยอย่างรวดเร็ว และการที่องค์ประกอบของพิษอัมพาตแต่ละชนิดมีการเปลี่ยนแปลงตลอดช่วงการทดลอง แสดงให้เห็นความสามารถของกระบวนการทางชีวเคมีของหอยในการกำจัดพิษอัมพาตออกจากร่างกาย การศึกษาครั้งนี้แสดงให้เห็นได้ว่าพิษอัมพาตจาก …

ความชุกชุมและความหลากหลายของแพลงก์ตอนสัตว์กลุ่มเจลาตินัสในอ่าวไทยตอนใน, หัทยา จิตรพัสตร์

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

แพลงก์ตอนสัตว์กลุ่มเจลาตินัสมีความหลากหลายทางชีวภาพและทางนิเวศวิทยาสูงพบได้ทั้ง herbivores และ carnivores ปัจจุบันการเพิ่มจำนวนของแพลงก์ตอนสัตว์กลุ่มเจลาตินัสในทะเลเป็นที่สนใจทั่วโลก การศึกษาครั้งนี้จึงมีวัตถุประสงค์เพื่อสำรวจความชุกชุมและความหลากหลายของแพลงก์ตอนสัตว์กลุ่มเจลาตินัสบริเวณอ่าวไทยตอนใน โดยเก็บตัวอย่างด้วยถุงลากแพลงก์ตอนขนาดตา 330 ไมโครเมตร จากอ่าวไทยตอนในในเดือนมิถุนายนเป็นตัวแทนฤดูมรสุมตะวันตกเฉียงใต้ เดือนตุลาคมเป็นตัวแทนปลายฤดูมรสุมตะวันตกเฉียงใต้ ปี 2560 และเดือนเมษายนเป็นตัวแทนฤดูร้อน ปี 2561 ผลการศึกษาพบแพลงก์ตอนสัตว์กลุ่มเจลาตินัสทั้งหมด 63 ชนิด ไฮโดรเมดูซีเป็นกลุ่มที่มีความหลากชนิดมากที่สูงสุด ขณะที่หนอนธนูชนิด Flaccisagitta enflata เป็นชนิดเด่นจากการสำรวจทั้งสามฤดูโดยเฉพาะฤดูมรสุมตะวันตกเฉียงใต้และฤดูร้อน นอกจากนี้แพลงก์ตอนสัตว์กลุ่มเด่นอื่น ๆ แตกต่างกันตามฤดูกาล โดยมี Doliolum sp. เป็นชนิดเด่นในปลายฤดูมรสุมตะวันตกเฉียงใต้ ดัชนีความหลากชนิดรวมทั้งความชุกชุมของแพลงก์ตอนสัตว์กลุ่มเจลาตินัสในบริเวณก้นอ่าวมีค่าสูงกว่าแนวห่างจากฝั่ง เนื่องจากอิทธิพลปัจจัยสิ่งแวดล้อมที่มีการผันแปรสูงโดยเฉพาะความเค็มรวมทั้งความอุดมสมบูรณ์ของแหล่งอาหาร ความชุกชุมของแพลงก์ตอนสัตว์กลุ่มเจลาตินัสขึ้นอยู่กับระยะห่างจากปากแม่น้ำและฤดูกาลโดยมีค่าผันแปรอยู่ในช่วง 43-1,369 ตัวต่อลูกบาศก์เมตร ในฤดูร้อนพบความหนาแน่นเฉลี่ยมากที่สุด ในช่วงปลายฤดูมรสุมตะวันตกเฉียงใต้ที่พบความชุกชุมของ salps สูง ทำให้ค่าปริมาตรชีวภาพสูงที่สุดด้วย ผลการวิเคราะห์องค์ประกอบชนิดและปริมาณของแพลงก์ตอนสัตว์กลุ่มเจลาตินัสพบความแตกต่างชุมชนแพลงก์ตอนสัตว์กลุ่มนี้ในบริเวณก้นอ่าวและบริเวณห่างฝั่งออกไป ผลการศึกษายังแสดงว่าในบริเวณก้นอ่าวมีความเค็มต่ำนั้นจะพบไฮโดรเมดูซีเป็นกลุ่มเด่น ขณะที่หนอนธนูเป็นกลุ่มเด่นในแนวถัดออกมาจากปากเเม่น้ำซึ่งเป็นบริเวณที่มีความเค็มสูง

The Effects Of Ocean Acidification And Reduced Oxygen On The Behavior And Physiology Of Juvenile Rockfish, Corianna H. Flannery

Cal Poly Humboldt theses and projects

As climate change progresses, the frequency and duration of upwelling events that bring low pH, low dissolved oxygen (DO) water to nearshore habitats are expected to increase. In addition, long-term global changes in ocean pH and DO are expected to occur within the next few decades to centuries. Locally, there have been documented reductions in near-shore pH along with the expansion of oxygen minimum zones within the California Current System. However, very few studies have investigated the potential interactive effect of these stressors on temperate reef fish. For this thesis, two sets of laboratory experiments were conducted to determine the …

Predictive Mapping Of Two Nearshore, Demersal Fish Species On Northern California Reefs Using Scuba-Based Visual Surveys And Remote Sensing, Christopher H. Teague

Cal Poly Humboldt theses and projects

California's shallow rocky reefs provide critical habitat for a diverse assemblage of fishes. Effective management strategies for these species require both accurate stock assessments as well as a spatially explicit understanding of the relationship between fishes and characteristics of their habitat. We used a generalized additive model framework to create spatially predictive maps of the abundance and biomass of two demersal fish species prevalent on northern California reefs: lingcod (Ophiodon elongatus) and kelp greenling (Hexagrammos decagrammus). These models incorporated data from SCUBA-based fish and habitat surveys at depths from 12-26 meters as well as measures of …

Characterizing Habitat Preference In Three Nearshore Reef-Associated Fishes Through Collaborative Research, Public Data, And Open Source Software, Ian D. Kelmartin

Cal Poly Humboldt theses and projects

Black rockfish (Sebastes melanops), canary rockfish (S. pinniger), and lingcod (Ophidion elongatus) are important species in Northern California’s nearshore recreational and commercial fisheries. These species are associated with nearshore rocky reefs and are among a suite of species intended to benefit from the establishment of the marine protected area (MPA) network along the Northern California Coast in 2012.

Many aspects of the North Coast’s nearshore ecosystem remain poorly studied, including the spatial distribution and habitat associations of nearshore fish species. This study used data collected from Cape Mendocino State Marine Reserve (SMR), Ten Mile …

The Role Of Enso On The Agulhas Current Leakage Region, Morgan Lauren Paris

Theses and Dissertations

The southern end of the African continent marks the division between the Atlantic Ocean and the Indian Ocean where warm, saline waters propagate into the Atlantic Ocean in the form of rings, eddies, and filaments. These warm, saline waters released during the retroflection of the Agulhas Current are referred to as Agulhas leakage. The Agulhas Current is a poleward flowing western boundary current that forms the limb of the winddriven anti-cyclonic circulation of the south Indian Ocean. The current originates south of Madagascar fed by the Mozambique Channel and the East Madagascar Current. Smallscale variations have been identified in Agulhas …

Climate Metric Coherence: Stationarity Of The Relationships Between North Pacific Climate Indices And Ecological Processes In The Gulf Of Alaska, Michael Opiekun

Theses and Dissertations

The Pacific Decadal Oscillation (PDO) has been used to characterize the dominant basin-scale climate variability, in the North Pacific. The PDO index has been correlated to Pacific salmon (Oncorhynchus spp.) population dynamics in the Gulf of Alaska (GOA) during the late 1900s, but the stationarity of the statistical relationships between salmon production and the basin-scale index (and between the regional physical processes and the basin-scale index) has not been quantified. A change in the relationship between the PDO and salmon catches has been noted during the late 1980s, motivating further investigation of variability in climate and ecosystem properties during this …

An Investigation Into The Physiological Impacts Of Ocean Acidification On Recruits Of The Temperate Coral, Oculina Arbuscula, Brianne Varnerin

College of Graduate Studies: Theses & Dissertations

Ocean acidification is well-researched with respect to adult scleractinian corals, however information on whether adults and recruits of the same species respond similarly to this environmental stress is lacking. I investigated the responses to increased pCO₂ of recruits of the temperate coral, Oculina arbuscula, whose adults are known to withstand high levels of pCO₂ with no depression in calcification (up to 1000 ppm CO₂). I addressed the hypothesis that O. arbuscula recruit health is not affected by increased pCO₂ by exposing small colonies (5-12mm diameter) to 475, 711, and 1270 ppm CO₂ for …

Copepod Distribution In Relation To Environmental Parameters On Diel And Tidal Time Scales In Mission Bay, San Diego, California, Joy Renee Shapiro

Theses

The vertical distribution of copepods in estuaries is known to vary in relation to environmental factors. However, the relationships between environmental conditions (e.g., tides, hydrography) and copepod distributions are not well understood. This project examined connections between environmental parameters and copepod distribution in Mission Bay, San Diego, California. Copepods (adults, juveniles, and nauplii) were collected every two hours over a diel cycle at three sites across the bay. A plankton pump was used to draw ~2 m³ of water from each of two depths - just below the surface and just above the bottom. Copepods were retained in a …

Parasitaemia Data And Molecular Characterization Of Haemoproteus Catharti From New World Vultures (Cathartidae) Reveals A Novel Clade Of Haemosporida, Michael J. Yabsley, Ralph E.T. Vanstreels, Ellen S. Martinsen, Alexandra G. Wickson, Amanda E. Holland, Sonia M. Hernandez, Alec T. Thompson, Susan L. Perkins, Christopher A. Lawrence Bryan, Christopher A. Cleveland, Emily Jolly, Justin D. Brown, Dave Mcruer, Shannon Behmke, James C. Beasley

Faculty & Staff Scholarship

Background: New World vultures (Cathartiformes: Cathartidae) are obligate scavengers comprised of seven species in five genera throughout the Americas. Of these, turkey vultures (Cathartes aura) and black vultures (Coragyps atratus) are the most widespread and, although ecologically similar, have evolved differences in morphology, physiology, and behaviour. Three species of haemosporidians have been reported in New World vultures to date: Haemoproteus catharti, Leucocytozoon toddi and Plasmodium elongatum, although few studies have investigated haemosporidian parasites in this important group of species. In this study, morphological and molecular methods were used to investi- gate the epidemiology and molecular biology of haemosporidian parasites of …

Philippine Aquatic Food Production Afs 450, Michael Cerbo

Library Impact Statements

No abstract provided.

Oceanic, Latitudinal, And Sex-Specific Variation In Demography Of A Tropical Deepwater Snapper Across The Indo-Pacific Region, Ashley J. Williams, C. Wakefield, Stephen J. Newman, Elodie Vourey, Francisco J. Abascal, Tuikolongahau Halafihi, Jeremie Kaltavara, Simon J. Nicol

Fisheries Research Articles

Deepwater tropical fisheries provide an important source of income and protein to Pacific and Indian Ocean coastal communities who are highly dependent on fish for food security. The development of quantitative assessments and management strategies for these deepwater fisheries has been hindered by insufficient biological and fisheries data. We examine the age-specific demography of the pygmy ruby snapper Etelis carbunculus, an important target species in tropical deepwater fisheries, across 90° of longitude and 20° of latitude in the Pacific and Indian Oceans. Our results show that growth of E. carbunculus varies significantly between oceans and sexes and across latitudes …