Open Access. Powered by Scholars. Published by Universities.®

Biotechnology Commons™

Open Access. Powered by Scholars. Published by Universities.®

3,204 Full-Text Articles 8,860 Authors 1,219,756 Downloads 220 Institutions

All Articles in Biotechnology

Faceted Search

3,204 full-text articles. Page 69 of 143.

กระบวนการพัฒนาโปรแกรมตัวส่งระหว่างโมเดลเชิงวัตถุและเชิงสัมพันธ์ด้วยเทคนิคโลวโค้ดบนโอดู, โสภณวิชญ์ พิชิตเธียรธรรม 2020 คณะวิทยาศาสตร์

กระบวนการพัฒนาโปรแกรมตัวส่งระหว่างโมเดลเชิงวัตถุและเชิงสัมพันธ์ด้วยเทคนิคโลวโค้ดบนโอดู, โสภณวิชญ์ พิชิตเธียรธรรม

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

งานวิจัยนี้นำเสนอมอดูลเจนเนอเรเตอร์ ซึ่งเป็นเครื่องมือสำหรับการเขียนโปรแกรมตัวส่งระหว่างโมเดลเชิงวัตถุและเชิงสัมพันธ์บนโอดู โอดูเป็นซอฟต์แวร์อีอาร์พีแบบเปิดเผยรหัสต้นฉบับที่รวบรวมมอดูลที่จำเป็นสำหรับการจัดการธุรกิจต่าง ๆ และผู้พัฒนาสามารถพัฒนามอดูลเพื่อขยายขีดความสามารถของโอดูได้ โดยในช่วงไม่กี่ปีที่ผ่านมาการพัฒนาซอฟต์แวร์บนโอดู มักต้องใช้เวลาในการเรียนรู้เพราะมีความซับซ้อนของเฟรมเวิร์ก จึงมีการนำแนวทางการพัฒนาซอฟต์แวร์แบบโลวโค้ด (การเขียนโค้ดที่น้อยกว่าปกติ) มาใช้ในการพัฒนามอดูลเจนเนอเรเตอร์ขึ้น เพื่อให้เป็นเครื่องมือสำหรับออกแบบและสร้างรหัสต้นฉบับสำหรับมอดูล ทำให้ผู้พัฒนาซอฟต์แวร์บนโอดูไม่ต้องกังวลเรื่องข้อผิดพลาดอันเนื่องมาจากความซับซ้อนของเฟรมเวิร์ก และให้ความสำคัญกับการเขียนโปรแกรมในด้านอื่น ๆ ได้มากขึ้น โดยเครื่องมือนี้ถูกพัฒนาด้วยภาษา ไพธอนให้เป็นเว็บแอปพลิเคชันทำงานบนเว็บเบราว์เซอร์ และได้มีการทดสอบการใช้งานกับทั้งผู้พัฒนามอดูลบนโอดู ผู้ใช้งานโอดูที่มีทักษะการเขียนโปรแกรม ผู้ที่ไม่เคยมีประสบการณ์กับโอดู และอาสาสมัครภายนอกบริษัท ซึ่งได้ผลลัพธ์ว่า ผู้ทดสอบทั้งหมดสามารถพัฒนามอดูลโดยใช้มอดูลเจนเนอเรเตอร์ได้สำเร็จ เครื่องมือนี้จึงสามารถช่วยให้ผู้ที่ไม่มีประสบการณ์ในการพัฒนามอดูลบนโอดูสามารถพัฒนามอดูลขึ้นมาได้โดยใช้เวลาไม่นาน และเมื่อเปรียบเทียบเวลาที่ใช้ในการพัฒนามอดูลของกลุ่มผู้พัฒนามอดูลบนโอดู ระหว่างแบบปกติที่เขียนโค้ดด้วยตนเองกับการใช้ มอดูลเจนเนอเรเตอร์ พบว่าการใช้เครื่องมือนี้สามารถลดเวลาการพัฒนามอดูลโดยเฉลี่ยได้ถึง 20% อีกทั้งมอดูลเจนเนอเรเตอร์ยังนำไปใช้ได้จริงในโครงการการพัฒนาซอฟต์แวร์ของบริษัท


การวิเคราะห์การเกิดตำหนิในการผลิตกระจกโฟลต, คณุตม์ ไพบูลย์ 2020 คณะวิทยาศาสตร์

การวิเคราะห์การเกิดตำหนิในการผลิตกระจกโฟลต, คณุตม์ ไพบูลย์

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

งานวิจัยนี้มุ่งเน้นศึกษาปัจจัยที่มีผลต่อการเกิดตำหนิและหาแนวทางปรับปรุงกระบวนการผลิตเพื่อลดปริมาณตำหนิชนิดฟองอากาศและรีม ด้วยการนำตัวแปรจากกระบวนการผลิตได้แก่ การชั่งน้ำหนักส่วนผสม อุณหภูมิในการหลอม อุณหภูมิในการขึ้นรูปและองค์ประกอบทางเคมีของกระจก มาหาความสัมพันธ์กับปริมาณตำหนิที่เกิดขึ้นด้วยการวิเคราะห์การถดถอย จากผลการวิเคราะห์ตำหนิฟองอากาศด้วยเทคนิคแมสสเปกโทรเมตรีและเทคนิครามานสเปคโทรสโคปีพบว่าฟองอากาศส่วนใหญ่พบแก๊ส CO2 เป็นองค์ประกอบอยู่ที่ 30 ถึง 70 เปอร์เซ็นต์ ซึ่งเกิดจากการสลายตัวทางความร้อนของวัตถุดิบและการไล่ฟองอากาศที่ไม่สมบูรณ์ และจากความสัมพันธ์ของปริมาณฟองอากาศและตัวแปรจากกระบวนการผลิตพบว่า อุณหภูมิการหลอมที่สูงขึ้น ปริมาณ fining agent ที่น้อยลง และกำลังการผลิตที่เพิ่มขึ้นส่งผลให้ตำหนิชนิดฟองอากาศเพิ่มขึ้น จากการศึกษาตำหนิชนิดรีมโดยใช้กล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอนแบบส่องกราดร่วมกับการวัดการกระจายพลังงานของรังสีเอกซ์ในการวิเคราะห์องค์ประกอบธาตุของตำหนิชนิดรีมเทียบกับบริเวณโดยรอบโดยพบว่ารีมมีปริมาณธาตุ Si และ Na สูงกว่าบริเวณโดยรอบ ซึ่งเกิดจากการชั่งวัตถุดิบที่คลาดเคลื่อนไปจากสูตรการผลิต โดยเกิดจากวัตถุดิบติดค้างบริเวณกรวยรับวัตถุดิบ ส่งผลให้องค์ประกอบทางเคมีของส่วนผสมไม่สม่ำเสมอ ยิ่งความแตกต่างของน้ำหนักส่วนผสมจากสูตรการผลิตยิ่งมาก จะทำให้ปริมาณรีมเพิ่มสูงขึ้น ซึ่งสามารถความผิดพลาดจากการชั่งนี้สามารถแก้ไขได้โดยติดตั้งค้อนลมเพื่อเคาะวัตถุดิบให้ลงไปในโม่ผสมวัตถุดิบครบถ้วนตามสูตรการผลิต


ผลของลำดับการผสมวัตถุดิบต่อประสิทธิภาพการใช้พลังงานในการหลอมแก้ว, ปรีณาพรรณ ปิ่นหอม 2020 คณะวิทยาศาสตร์

ผลของลำดับการผสมวัตถุดิบต่อประสิทธิภาพการใช้พลังงานในการหลอมแก้ว, ปรีณาพรรณ ปิ่นหอม

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

โดยทั่วไปกระบวนการหลอมแก้วระดับอุตสาหกรรมต้องการพลังงานสูงสำหรับการเปลี่ยนแปลงจากวัตถุดิบเป็นน้ำแก้ว วัตถุประสงค์ในงานวิจัยนี้จะกล่าวถึงการพัฒนากระบวนการหลอมแก้วโซดาไลม์โดยวิธีปรับลำดับการผสมในระดับห้องปฏิบัติการ ซึ่งอาศัยกลไกของปฏิกิริยาสถานะของแข็งระหว่างทรายแก้วและโซเดียมคาร์บอเนตในช่วงแรกของการหลอม การเตรียมส่วนผสมแบบดั้งเดิมเป็นการผสมวัตถุดิบทั้งหมดภายในครั้งเดียว ในงานวิจัยนี้ต้องการปรับเปลี่ยนวิธีการเตรียมส่วนผสมให้เหมาะสมที่สุดต่อการหลอมโดยการปรับลำดับของการผสม ประกอบด้วยสองขั้นตอนการผสม ขั้นตอนแรกคือการผสมทรายแก้วและโซเดียมคาร์บอเนต จากนั้นจึงผสมวัตถุดิบที่เหลือเป็นขั้นตอนที่สอง เพื่อเปรียบเทียบและศึกษาผลของการเตรียมส่วนผสมทั้งสองวิธี ได้ทำการศึกษาสภาพและการเปลี่ยนแปลงระหว่างกระบวนการหลอมที่อุณหภูมิตั้งแต่ 600 ถึง 1000 องศาเซลเซียส นอกจากนี้มีผลของปริมาณวัตถุดิบที่หลอมไม่หมดบนพื้นผิวซึ่งยังคงลงเหลือในสภาพผลึก ณ สภาวะที่กำหนด เพื่อเปรียบเทียบแนวโน้มประสิทธิผลในการหลอมของส่วนผสมจากการผสมสองวิธี โดยภาพถ่ายผิวหน้าและโดยเทคนิคการเลี้ยวเบนรังสีเอกซ์ ผลการวิจัยพบว่าการจัดลำดับการผสมเป็นวิธีการผสมที่เหมาะสมกว่า ส่งผลต่ออัตราการหลอม พื้นผิวสัมผัสที่เพิ่มขึ้นระหว่างทรายแก้วและโซเดียมคาร์บอเนตจากการผสมขั้นตอนแรกนำไปสู่การเพิ่มอัตราการหลอมของทั้งระบบ ต่างจากวิธีการเดิมที่อาจมีวัตถุดิบอื่นเป็นตัวขัดขวางการเกิดปฏิกิริยาสถานะของแข็งดังกล่าว


Effects Of Chitosan Combined With Chitosan-Montmorillonite Nanocomposites Coating On Postharvest Quality Of 'Hom Thong' Banana Fruit, Arisa Wantat 2020 Faculty of Science

Effects Of Chitosan Combined With Chitosan-Montmorillonite Nanocomposites Coating On Postharvest Quality Of 'Hom Thong' Banana Fruit, Arisa Wantat

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

Chitosan (CTS) has been widely applied as a fruit coating in commercial fruit crops to prolong their shelf-life. In the present research, chitosan coatings were applied on ‘Hom Thong’ banana fruit, an important exported cultivar of Thailand. Postharvest qualities of ‘Hom Thong’ banana were measured after coating with 1% (w/v) low molecular weight (LMW-CTS: 65 kDa), medium molecular weight (MMW-CTS: 265 kDa), and high molecular weight (HMW-CTS: 540 kDa) chitosan for 1 min. The application of HMW-CTS showed the thickest of coated film and had effectiveness as a barrier of water vapor and O2 transmission. HMW-CTS treatment could retard fruit …


Higher Tensile Forces Across Cellular Junctions And An Intact Nuclear Linc Complex Is Required For Epithelial Function And Stability, FNU Vani Narayanan 2020 Virginia Commonwealth University

Higher Tensile Forces Across Cellular Junctions And An Intact Nuclear Linc Complex Is Required For Epithelial Function And Stability, Fnu Vani Narayanan

Theses and Dissertations

Recent advances in three-dimensional (3D) cell culture systems have provided key insights into the understanding of biochemical and physiological states of native tissue. A significant progress in the field of mechanobiology involves measuring cellular traction forces in a more native 3D environment. However, the effects of mechanical forces exerted across cellular junctions and the nuclear LINC complex, in an organized 3D system has not been investigated thus far. Epithelial cells spontaneously form acini (also known as cysts or spheroids) with a single, fluid-filled central lumen, when grown in 3D matrices. The size of the lumen is dependent on apical secretion …


Numerical Modeling Of Submicron Particles For Acoustic Concentration In Gaseous Flow, Jizhou Liu, Xiaodong Li, Fang Q. Hu 2020 Old Dominion University

Numerical Modeling Of Submicron Particles For Acoustic Concentration In Gaseous Flow, Jizhou Liu, Xiaodong Li, Fang Q. Hu

Mathematics & Statistics Faculty Publications

This paper intends to explore the rationality and feasibility of modeling dispersed submicron particles in air by a kinetic-based method called the unified gas-kinetic scheme (UGKS) and apply it to the simulation of particle concentration under a transverse standing wave. A gas-particle coupling scheme is proposed where the gas phase is modeled by the two-dimensional linearized Euler equations (LEE) and, through the analogous behavior between the rarefied gas molecules and the air-suspended particles, a modified UGKS is adopted to estimate the particle dynamics. The Stokes' drag force and the acoustic radiation force applied on particles are accounted for by introducing …


Development Of A Novel Highly-Sensitive Brucellosis Sensor Based On Surface Plasmon Resonance Spectroscopy, Amal Kasry, Ihab Adly, Asharf Sayour, Hossam Sayour 2020 The British University in Egypt

Development Of A Novel Highly-Sensitive Brucellosis Sensor Based On Surface Plasmon Resonance Spectroscopy, Amal Kasry, Ihab Adly, Asharf Sayour, Hossam Sayour

Nanotechnology Research Centre

Brucellosis is considered a significant health threat, it is an infectious disease caused by the bacteria Brucella, which can spread from animals to humans causing severe diseases. Through this project, we aim to develop a very highly sensitive biosensor to detect Brucella early before spreading. This sensor is based on surface plasmon resonance (SPR) technique, which is used to analyze kinetics of interaction between biomolecules. It can detect down to picomolar concentrations of some proteins.


Innovation In Meat Production: A Problem And An Opportunity, Christopher J. Bryant 2020 University of Bath

Innovation In Meat Production: A Problem And An Opportunity, Christopher J. Bryant

Animal Sentience

Innovation in meat production has enabled modern humans to inflict far greater harm on animals, the environment, and public health than was possible just a few decades ago. Wiebers & Feigin aptly express the urgency with which these issues must be addressed. Those advocating for animals on moral grounds face resistance from omnivores citing taste, price and convenience. Further innovation in meat production (plant-based and cultured meat) will enable us to preserve the experience of eating meat whilst phasing out the many problems caused by industrial animal farming.


Synthesis And The Genetic Encoding Of Novel Lysine Post-Translational Modifications, Sahan A. Galbada Liyanage 2020 Virginia Commonwealth University

Synthesis And The Genetic Encoding Of Novel Lysine Post-Translational Modifications, Sahan A. Galbada Liyanage

Theses and Dissertations

Post-translational modifications (PTMs) play a significant role in regulating cell signaling and regulating the inner cellular environment. The study of PTMs and their primary biological functions is critical for the development of new medicines targeting the pathways and biomolecules responsible for the PTMs.

Previous studies revealed the direct coupling of the β -hydroxybutyryl lysine (KBHB) modification with the gene expression. KBHB in histone proteins links metabolism to epigenetics and gene expression and enables to study in-depth, how cell metabolism controls the gene expression and vice versa. Similar novel histone modification, KLac, attracts a special interest …


Singv – The Convective-Scale Numerical Weather Prediction System For Singapore, Huang Xiang-Yu, Barker Dale, Webster Stuart, Dipankar Anurag, Lock Adrian, Mittermaier Marion, Sun Xiangming, North, Darvell Rob, Boyd Douglas, Lo Jeff, Liu Jianyu, Macpherson Bruce, Heng Peter, Maycock Adam, Pitcher Laura, Tubbs Robert, McMillan Martin, Zhang Sijin, Hagelin Susanna, Porson Aurore, Song Guiting, Beckett Becky, Cheong Wee Kiong, Semple Allison, Gordon Chris 2019 Universiti Brunei Darussalam

Singv – The Convective-Scale Numerical Weather Prediction System For Singapore, Huang Xiang-Yu, Barker Dale, Webster Stuart, Dipankar Anurag, Lock Adrian, Mittermaier Marion, Sun Xiangming, North, Darvell Rob, Boyd Douglas, Lo Jeff, Liu Jianyu, Macpherson Bruce, Heng Peter, Maycock Adam, Pitcher Laura, Tubbs Robert, Mcmillan Martin, Zhang Sijin, Hagelin Susanna, Porson Aurore, Song Guiting, Beckett Becky, Cheong Wee Kiong, Semple Allison, Gordon Chris

ASEAN Journal on Science and Technology for Development

Extreme rainfall is one of the primary meteorological hazards in Singapore, as well as elsewhere in the deep tropics, and it can lead to significant local flooding. Since 2013, the Meteorological Service Singapore (MSS) and the United Kingdom Met Office (UKMO) have been collaborating to develop a convective-scale Numerical Weather Prediction (NWP) system, called SINGV. Its primary aim is to provide improved weather forecasts for Singapore and the surrounding region, with a focus on improved short-range prediction of localized heavy rainfall. This paper provides an overview of the SINGV development, the latest NWP capabilities at MSS and some key results …


Temporary Shelter Simulation Towards Effectiveness Value Of Ottv And Thermal Comfort, Ayu Dyah Puspa, Prayitno Budi, Hariyadi Agus 2019 Universiti Brunei Darussalam

Temporary Shelter Simulation Towards Effectiveness Value Of Ottv And Thermal Comfort, Ayu Dyah Puspa, Prayitno Budi, Hariyadi Agus

ASEAN Journal on Science and Technology for Development

Indonesia is prone to a variety of natural disasters, one of which is earthquakes. Earthquakes are detrimental to human life, causing among other things a loss of shelter. As such, victims of earthquakes need basic assistance in the form of shelter, which the Indonesian government provides in the transition phase of emergency responses. Several innovations in the provision of temporary shelter have arisen in terms of packaging and fast unloading. This research aimed to examine the effective value of OTTV energy (overall thermal transfer value), differences in room temperature, and thermal comfort in existing temporary shelters. OTTV values and thermal …


Analyzing The Characteristics Of Domestic Wastes In Belik River, The Special Region Of Yogyakarta, Indonesia, Suprayogi Slamet, Marfai Muh Aris, Cahyadi Ahmad, Latifah Reviana, Fatchurohman Hendy 2019 Universiti Brunei Darussalam

Analyzing The Characteristics Of Domestic Wastes In Belik River, The Special Region Of Yogyakarta, Indonesia, Suprayogi Slamet, Marfai Muh Aris, Cahyadi Ahmad, Latifah Reviana, Fatchurohman Hendy

ASEAN Journal on Science and Technology for Development

The multiplying number of population in the City of Yogyakarta has resulted in a larger volume of wastes in the region. People living on the riverbanks are unfortunately in the habit of discarding domestic waste directly to the river channel, worsening the already polluted water. This study was intended to analyze the characteristics of the municipal wastewater contaminating Belik River. During the water quality test, a rapid investigation method and laboratory analysis were employed. The sampling in the field was based on river segments and travel time of river water. Based on the laboratory test results, the concentrations of phosphate, …


Fenton Oxidation Using Easily Recoverable Catalyst Of Magnetite (Fe3o4) As An Efficient Approach To Treatment Of Rhodamine B Dyeing Effluent In Traditional Fabrics Industry, Prasetyo Imam, Akbar Febry, Prabandari Anindya Widi, Ariyanto Teguh 2019 Universiti Brunei Darussalam

Fenton Oxidation Using Easily Recoverable Catalyst Of Magnetite (Fe3o4) As An Efficient Approach To Treatment Of Rhodamine B Dyeing Effluent In Traditional Fabrics Industry, Prasetyo Imam, Akbar Febry, Prabandari Anindya Widi, Ariyanto Teguh

ASEAN Journal on Science and Technology for Development

A direct release of dye wastewater to a water environment without pre-treatment could cause negative impacts. To solve them, an effective method for degrading wastewater contaminants is needed. In this research, the Fenton reaction using Fe3O4 catalyst for removal of wastewater contaminants taken from a traditional fabrics industry was studied. For this purpose, reaction temperature was varied in the range of 27–90°C. Furthermore, catalyst concentration was also varied in the range of 2–6 g/L solution. The results showed that increasing both temperature and catalyst concentration will increase the performance of the Fenton reaction in degrading wastewater contaminants. The contaminant degradation …


Theranostics For Antiretroviral Biodistribution And Pharmacokinetics, Brendan M. Ottemann 2019 University of Nebraska Medical Center

Theranostics For Antiretroviral Biodistribution And Pharmacokinetics, Brendan M. Ottemann

Theses & Dissertations

RATIONALE: Our laboratories birthed the field of human immunodeficiency virus (HIV) theranostics. The new field allows simultaneous detection (diagnostics) and treatment (therapeutic) for the identification, treatment and inevitable elimination of virus in cell and tissue compartments. By employing theranostics, antiretroviral drugs (ARVs) can be tracked in lymph nodes, gut, spleen and liver. Cellular viral reservoirs including CD4+ T cell populations and mononuclear phagocytes (MP; monocytes, macrophages, microglia and dendritic cells) along with subcellular endosomal structures can now be targeted for drug delivery bringing therapeutics to areas where virus replicates. The overarching idea rests in improving precision targeted ARV delivery. …


Feeding The Future Meat Doesn’T Come Cheap, Lukas C. Southard 2019 Cuny Graduate School of Journalism

Feeding The Future Meat Doesn’T Come Cheap, Lukas C. Southard

Capstones

Cultured – or as it is referred to by companies innovating the technology clean – meat is expected to be the next innovation to change the way the world gets its animal protein. Meat from animal cells grown in a lab seems like science fiction but it is around the corner from hitting your supermarket shelves. The technology has been developed but how these companies intend on scaling up their production to meet retail demands remains a mystery. So far companies have relied on seed and early stage investment from venture capital companies and private sources to fund research. Predictions …


Total Phenolic And Flavonoid Contents Of Anacyclus Pyrethrum Link Plant Extracts And Their Antioxidant Activity, Hanane Elazzouzi, Nadia Zekri, Touriya Zair, Mohamed Alaoui El Belghiti 2019 University Mohammed V, Faculty of Sciences Rabat

Total Phenolic And Flavonoid Contents Of Anacyclus Pyrethrum Link Plant Extracts And Their Antioxidant Activity, Hanane Elazzouzi, Nadia Zekri, Touriya Zair, Mohamed Alaoui El Belghiti

Karbala International Journal of Modern Science

In this study, Anacyclus pyrethrm Link (roots) is a medicinal plant from the Asteraceae family, endemic to Morocco and is widely used in traditional medicine; was investigated for their total phenolics, flavonoids contents and antioxidant activities. The quantitative estimation of total flavonoids and phenols by the colorimetric method showed that the extracts were prepared by fractionation of the crude hydromethanolic extract (ethyl acetate and n-butanol). The phenol content of various extracts, estimated by the Folin-Ciocalteu method, was between 1,44 and 12,82 mg EAG / g extract of A. pyrethrum. Moreover, it is clear that ethyl acetate was the …


Interaction Between Fusarium Head Blight And Crown Rot Disease Incidence And Environmental Factors And Soil Physiochemical Analysis On Wheat In The South Of Iraq, Basra Province, Mohammed Hussein Minati Dr., Mohanad Khalaf Mohammed-ameen Dr. 2019 Dep. Biology/Plant Pathology, College of Science, University of Basrah, Iraq

Interaction Between Fusarium Head Blight And Crown Rot Disease Incidence And Environmental Factors And Soil Physiochemical Analysis On Wheat In The South Of Iraq, Basra Province, Mohammed Hussein Minati Dr., Mohanad Khalaf Mohammed-Ameen Dr.

Karbala International Journal of Modern Science

This study was conducted to evaluate the interaction between disease incidence of both Fusarium head blight (FHB) and crown rot (FCR) and physiochemical parameters for soil samples and environmental factors in 14 selected wheat fields in the North of Basra province. The results showed that both diseases were occurred in all surveyed fields. The level of FCR incidence was higher than FHB. The incidence of both diseases was increased with favourable weather conditions (high humidity and temperature ˃15 °C), reaching the highest levels in crucial periods before and during the ripening stage. The percentage of disease incidence ranged between 6 …


Structural Basis Of Non-Canonical Transcriptional Regulation By The A-Bound Iron-Sulfur Protein Whib1 In M. Tuberculosis, Tao Wan, Shanren Li, Daisy Guiza Beltran, Andrew Schacht, Lu Zhang, Donald F. Becker, Limei Zhang 2019 University of Nebraska-Lincoln

Structural Basis Of Non-Canonical Transcriptional Regulation By The A-Bound Iron-Sulfur Protein Whib1 In M. Tuberculosis, Tao Wan, Shanren Li, Daisy Guiza Beltran, Andrew Schacht, Lu Zhang, Donald F. Becker, Limei Zhang

Department of Biochemistry: Faculty Publications

WhiB1 is amonomeric iron–sulfur cluster-containing transcription factor in the WhiB-like family that is widely distributed in actinobacteria including the notoriously persistent pathogen Mycobacterium tuberculosis (M. tuberculosis). WhiB1 plays multiple roles in regulating cell growth and responding to nitric oxide stress inM. tuberculosis, but its underlying mechanism is unclear. Here we report a 1.85 A° -resolution crystal structure of the [4Fe–4S] cluster-bound (holo- )WhiB1 in complex with the C-terminal domain of the 70-family primary sigma factor A of M. tuberculosis containing the conserved region 4 (A 4). Region 4 of the 70-family primary sigma factors is commonly used by transcription factors …


High-Throughput Nano-Scale Characterization Of Membrane Proteins Using Fluorescence-Detection Size-Exclusion Chromatography, Alex J. Vecchio, Robert M. Stroud 2019 University of California, San Francisco & University of Nebraska–Lincoln

High-Throughput Nano-Scale Characterization Of Membrane Proteins Using Fluorescence-Detection Size-Exclusion Chromatography, Alex J. Vecchio, Robert M. Stroud

Department of Biochemistry: Faculty Publications

Structural biology has revealed predicting heterologous expression levels, homogeneity, and stability of a protein from its primary structure are exceedingly difficult. Membrane proteins, in particular, present numerous challenges that make obtaining milligram quantities of quality samples problematic. For structural and functional investigation of these molecules, however, this is what is required. Fluorescence size-exclusion chromatography (F-SEC), a technique where a protein of biological interest is fused to green fluorescent protein (GFP) and monitored, circumvents many bottlenecks inherent to membrane protein structural biology. In vivo expression yields, as well as in vitro homogeneity and stability, can be rapidly evaluated utilizing nanogram quantities …


The Antimicrobial Activity And Cellular Targets Of Plant Derived Aldehydes And Degradable Pro-Antimicrobial Networks In Pseudomonas Aeruginosa, Yetunde Adewunmi 2019 University of Southern Mississippi

The Antimicrobial Activity And Cellular Targets Of Plant Derived Aldehydes And Degradable Pro-Antimicrobial Networks In Pseudomonas Aeruginosa, Yetunde Adewunmi

Dissertations

Essential oils (EOs) are plant-derived products that have been long exploited for their antimicrobial activities in medicine, agriculture, and food preservation. EOs represent a promising alternative to conventional antibiotics due to the broad-range antimicrobial activity, low toxicity to human commensal bacteria, and the capacity to kill microorganisms without promoting resistance. Despite the progress in the understanding of the biological activity of EOs, many aspects of their mode of action remain inconclusive. The overarching aim of this work was to address these gaps by studying molecular interactions between antimicrobial plant aldehydes and the opportunistic human pathogen Pseudomonas aeruginosa. We initiated …


Digital Commons powered by bepress