Life Sciences Commons^™

Investigating Structural And Biochemical Characteristics Of A Peptidase Required For Staphylococcus Aureus Virulence, Sagar Bhusal

Master's Theses

Staphylococcus aureus is an opportunistic Gram-positive pathogen that transiently colonizes 30% of the population at any given time. Upon breaching host skin or mucosal barriers, S. aureus can infect and cause disease in nearly all host tissues. Once inside the host, S. aureus expresses a plethora of virulence factors, mostly regulated by the Accessory Gene Regulatory (Agr) quorum sensing system, which facilitates the evasion of immune responses or directly promotes pathogenesis. The S. aureus Agr system relies on the production of a small peptide known as an auto-inducing peptide (AIP) to control virulence gene expression in response to cell density. …

Investigating Putative Toxin-Immunity Pairs From A New Class Of Rhs Proteins In Pseudomonas Aeruginosa, Syed Faieq Imam

Master's Theses

Pseudomonas aeruginosa is a gram-negative, opportunistic pathogen that is ubiquitous in nature, especially in human/animal impacted environments. One of the reasons for this is the arsenal of protein systems and toxins that P. aeruginosa utilizes to mold its environment to suit its needs. Recently, we discovered a novel locus in the P. aeruginosa genome, which resembles other loci that are known to mediate interbacterial competition. Our bioinformatic analysis found this locus to be enriched in a rearrangement hotspot (rhs) motif which led us to ad-interim term the three ORFs of the loci as rhsB, rhsC, and rhsI. Furthermore, we have …

Characterization Of The Full-Length Bag3 Protein And Stress Induced Formation Of Bag3-Z, Ahmed Gamal Abdalla Zied

Master's Theses

Bcl2-associated athanogene-3 (BAG3) is a pro-autophagy co-chaperone that we havepreviously shown localizes to the cardiac sarcomere and is critical for proteostasis and maintenance of normal sarcomeric function. Indeed, BAG3 loss in heart failure (HF) results in accumulation of ubiquitinated sarcomeric proteins, and depressed maximum force generating capacity (Fmax). However, how BAG3 is regulated in the cell is not well understood, with uncertainty about its structure and proteoforms. During our analysis of human heart tissue, BAG3 appears as a “doublet”, with one band at 74 kDa (BAG3-Z) and a second at a higher 85 kDa (BAG3-FL). Previous studies hypothesized the full-length …

Comparison Of Taxonomy Assignment And Strain Detection In Urobiome Communities Using 16s Rrna Sequencing And Shotgun Metagenomic Sequencing, Delaney Sauer

Master's Theses

Advancements in sequencing technologies have enabled scientists to gain insight into the microbes that inhabit the human body, including the urinary tract. Cataloging the bacteria that inhabit the urinary tract has primarily relied on amplification and sequencing of specific variable regions of the 16S rRNA gene enabling genus-level taxonomic identification. Recently, shotgun metagenomic sequencing has been employed such that bacterial taxonomy as well as the functionality that they encode can be inferred. In this study, we compare taxonomies assigned by 16S sequencing and shotgun metagenomic sequencing of the urinary microbiota (urobiome) of females with and without a clinical diagnosis of …

A Population Level Examination Of The Incredible Fruit Diversity In Astragalus Lentiginosus, Quinn Thomas

Master's Theses

Astragalus lentiginosus is the most taxomically diverse species in the North American flora with over 40 recognized varieties. The incredible diversity within A. lentiginosus, particularly in respect to its fruit morphology, makes it an exceptional model to study adaptation and evolution. However, it remains unknown whether fruit morphology is an adaptation and, if so, the extent to which selection or neutral evolutionary processes shape the striking diversity in this trait. In order to understand the adaptive significance of fruit morphology we must first understand the genetic structure of A. lentiginosus. Varieties of A. lentiginosus vary considerably in their range size …

Expression Of Predicted Salt Tolerant Gene In Rice Oryza Sativa L. And Characterization Of Osbtbz1 Gene, Triono Bagus Saputro

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

Rice (Oryza sativa L.) holds significant importance as a primary food source globally. In Asia, the production of rice plays a crucial role in enhancing food security. Salinity poses a substantial constraint on plants like rice, leading to a reduction in their growth and overall productivity. The advancement of transcriptomics in agriculture has provided a powerful tool for understanding the molecular processes in crops, contributing to the development of more resilient, productive, and sustainable agricultural systems. The transcriptomic approach in rice using two rice lines with close genetic relationships, but different salt tolerance ability, CSSL16 and KDML105 combined with single …

โปรตีนเข้มข้นจากโครงไก่: การเตรียมและการใช้ในผลิตภัณฑ์นักเก็ต, ชนากานต์ มณฑาทิพย์กุล

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

งานวิจัยนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษาภาวะที่เหมาะสมสำหรับการสกัดโปรตีนจากโครงไก่ เพื่อเตรียมโปรตีนเข้มข้นและนำมาศึกษาสมบัติทางเคมีกายภาพและสมบัติเชิงหน้าที่ของโปรตีนเข้มข้นจากโครงไก่และศึกษาผลของการเติมโปรตีนเข้มข้นต่อคุณภาพและเนื้อสัมผัสของผลิตภัณฑ์นักเก็ตไก่ ผลการศึกษาการสกัดโปรตีนด้วยสารละลายด่างที่ค่าความเป็นกรด-ด่าง 8.5 - 11.5 และระยะเวลาในการสกัด 30 - 300 นาที ด้วยวิธีพื้นผิวตอบสนองและการออกแบบการทดลองแบบส่วนผสมกลางพบว่าสมการการทำนายผลตอบสนองประสิทธิภาพในการผลิตโปรตีนเข้มข้นมีความเหมาะสมในการอธิบายความสัมพันธ์และทำนายค่าของตัวแปรอิสระให้มีความสัมพันธ์กับผลตอบสนองที่ต้องการ โดยค่าสัมประสิทธิ์การถดถอย (Regression coefficient) ของตัวแปรอิสระมีความสัมพันธ์กับประสิทธิภาพในการผลิตโปรตีนเข้มข้นในระบบฐานแห้ง (Dry basis) รวมถึงค่าสัมประสิทธิ์การตัดสินใจมีค่ามากกว่า 0.80 และมีค่า Root Mean Square Error (RMSE) ต่ำหมายความว่าค่าความแตกต่างเฉลี่ยกำลังสองระหว่างค่าที่ได้จากการทำนายกับค่าที่ได้จากการทดลองมีค่าต่ำ เมื่อพิจารณาค่า Adjusted r–Squared พบว่ามีค่าใกล้เคียงกับค่าสัมประสิทธิ์การตัดสินใจ การทำนายภาวะการสกัดโปรตีนจากโครงไก่จากการกำหนดเกณฑ์ของค่าประสิทธิภาพในการผลิตโปรตีนเข้มข้นสูงที่สุดพบว่าภาวะค่าความเป็นกรด-ด่างเท่ากับ 10.15 และระยะเวลาในการสกัดเท่ากับ 185 นาที เป็นภาวะที่เหมาะสมที่สุดสำหรับการสกัดโปรตีนจากโครงไก่ โดยค่าผลตอบสนองที่ได้จากการทำนายจากสมการมีความแตกต่างจากค่าที่ได้จากการทดลองเท่ากับ 12.67% เมื่อนำโปรตีนเข้มข้นที่ผลิตในภาวะที่เหมาะสมที่สุดมาทดสอบความสามารถในการอุ้มน้ำและค่าความสามารถในการเกิดอิมัลชันพบว่ายังมีความสามารถในการอุ้มน้ำต่ำกว่าเนื้อไก่ส่วนขาและส่วนอก (p < 0.05) จึงนำโปรตีนเข้มข้นมาพัฒนาสมบัติเชิงหน้าที่พบว่าการพัฒนาโปรตีนเข้มข้นด้วยกระบวนการปรับปรุงด้วยเกลือ ฟอสเฟตและความดันและการปรับปรุงด้วยเกลือ ฟอสเฟตและส่วนผสม (โปรตีนถั่วเหลืองไอโซเลท แป้งข้าวสาลี แป้งมันสำปะหลัง) และความดันส่งผลให้โปรตีนเข้มข้นมีความสามารถในการเกิดอิมัลชันและความสามารถในการคงตัวของอิมัลชันสูงกว่าโปรตีนเข้มข้นจากโครงไก่ที่ไม่ผ่านการปรับปรุงอยู่ในช่วงระหว่าง 6.03 - 12.27% และ 4.93 - 6.83% ตามลำดับ รวมถึงมีความสามารถในการละลายที่ดีกว่าเนื้อไก่ในช่วง pH เท่ากับ 6 - 7 เมื่อนำโปรตีนเข้มข้นเติมลงในผลิตภัณฑ์นักเก็ตไก่จะเห็นได้ว่าการเติมโปรตีนเข้มข้นที่สัดส่วนเท่ากับ 12.50% ส่งผลทำให้นักเก็ตไก่มีค่า Hardness, Gumminess และ Chewiness สูงกว่าสูตรปกติระหว่าง 3899.44 - 4324.59, 2676.22 - 3243.04 และ 2363.65 - 3011.87 g-force ในขณะที่ปริมาณโปรตีนและค่าสีของตัวอย่างนักเก็ตไม่มีความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญ (p ≥ 0.05) เมื่อเทียบกับสูตรควบคุม นอกจากนี้การใช้โปรตีนเข้มข้นมีส่งผลให้ประสิทธิภาพในการผลิตสูงกว่าสูตรปกติ โดยประสิทธิภาพในการผลิตของสูตรเติมโปรตีนเข้มข้นปรับปรุงด้วยเกลือ ฟอสเฟตและส่วนผสม (โปรตีนถั่วเหลืองไอโซเลท แป้งข้าวสาลี แป้งมันสำปะหลัง) และความดันมีค่าสูงที่สุดเท่ากับ 136.43% แต่อย่างไรก็ตามเมื่อพิจารณาจากต้นทุนในระดับ Commercial production scale พบว่าการเติมโปรตีนเข้มข้นด้วยกระบวนการปรับปรุงด้วยเกลือ ฟอสเฟตและความดันมีต้นทุนการผลิตต่ำที่สุด รวมถึงมีปริมาณโปรตีนและคุณภาพด้านสีไม่แตกต่างจากสูตรปกติ จึงเลือกโปรตีนเข้มข้นด้วยกระบวนการปรับปรุงด้วยเกลือ ฟอสเฟตและความดันเป็นกระบวนการปรับปรุงที่ดีที่สุด โดยในระยะเวลา 1 เดือนจะสามารถผลิตนักเก็ตไก่จากโปรตีนเข้มข้นได้ทั้งหมด 1250 กิโลกรัมและสามารถลดต้นทุนการผลิตได้ที่ 175 บาทต่อเดือน

การพัฒนาบล็อกคอนกรีตปูพื้นจากกากของเสียในกระบวนการเผาไหม้แบบฟลูอิไดซ์เบด, ณัฐวรรณ ดวงแก้ว

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

งานวิจัยนี้ศึกษาการใช้ประโยชน์เถ้าลอย และทรายของเสีย (ขนาดละเอียดและหยาบ) จากกระบวนการเผาไหม้แบบฟลูอิไดซ์เบดเพื่อนำความร้อนมาใช้ในการอบแห้งในกระบวนการผลิตกระดาษ มาใช้เป็นวัตถุดิบในการเตรียมบล็อกคอนกรีต 2 ประเภทวัสดุ คือ คอนกรีตฐานปูนซีเมนต์ปอร์ตแลนด์ และคอนกรีตฐานจีโอพอลิเมอร์ สำหรับการเตรียมคอนกรีตฐานปูนซีเมนต์ปอร์ตแลนด์ ได้ศึกษาผลของการใช้เถ้าลอยทดแทนส่วนของปูนซีเมนต์ปอร์ตแลนด์ (วัสดุประสาน) และศึกษาอัตราส่วนของทรายของเสีย (มวลรวม) ต่อวัสดุประสาน ที่มีต่อสมบัติของคอนกรีต ขึ้นรูปด้วยวิธีการอัด บ่มชิ้นงานเป็นเวลา 1 7 และ 28 วัน พบว่าตัวอย่างที่มีเถ้าลอยทดแทนปูนซีเมนต์ปอร์ตแลนด์ร้อยละ 15 โดยน้ำหนักของวัสดุประสาน และมีอัตราส่วนของ มวลรวมต่อวัสดุประสาน เท่ากับ 1:1 โดยน้ำหนัก ที่อายุ 7 วัน มีค่ากำลังอัด 45 MPa เป็นไปตามมาตรฐาน มอก.827-2531 นอกจากนั้นยังได้นำส่วนผสมดังกล่าวมาเตรียมบล็อกประสานปูพื้นฐานปูนซีเมนต์ปอร์ตแลนด์ที่มีขนาดและรูปทรงตามมาตรฐานดังกล่าวด้วยเครื่องผลิตบล็อกคอนกรีต พบว่าสามารถเตรียมบล็อกประสานปูพื้นฐานปูนซีเมนต์ปอรต์แลนด์ที่มีเถ้าลอยทดแทนส่วนของปูนซีเมนต์ปอร์ตแลนด์ได้ ในส่วนของการศึกษาความเป็นไปได้ในการผลิตบล็อกฐานจีโอพอลิเมอร์เป็นการทดลองเตรียมจีโอพอลิเมอร์แบบส่วนเดียว โดยใช้เถ้าลอยร่วมกับสารแอลคาไลซึ่งประกอบด้วย โซเดียมซิลิเกตและโซเดียมไฮดรอกไซด์ (วัสดุประสาน) และผสมกับมวลรวมในสัดส่วนของวัสดุประสานต่อมวลรวมเท่ากับ 1:1 เช่นเดียวกับการเตรียมบล็อกคอนกรีตฐานซีเมนต์ ใช้อัตราส่วนผสมน้ำต่อวัสดุประสานเท่ากับ 0.31 ขึ้นรูปด้วยวิธีการอัด โดยศึกษาผลของสัดส่วนของเถ้าลอยต่อสารอัลคาไล และสัดส่วนของโซเดียมซิลิเกตต่อโซเดียมไฮดรอกไซด์ ที่มีต่อสมบัติของคอนกรีต พบว่าชิ้นงานที่ใช้เถ้าลอยร้อยละ 80 โดยน้ำหนักของวัสดุประสาน และใช้สารอัลคาไล (โซเดียมซิลิเกตต่อโซเดียมไฮดรอกไซด์เท่ากับ 60:40 โดยน้ำหนัก) ร้อยละ 20 โดยน้ำหนักของวัสดุประสาน ที่อายุ 28 วัน มีกำลังอัด 5.45 MPa ซึ่งเป็นค่าที่ต่ำกว่าค่าตามมาตรฐาน มอก.827-2531 จึงไม่สามารถใช้ทำบล็อกประสานปูพื้นได้ แต่ค่ากำลังอัดของบล็อกฐานจีโอพอลิเมอร์ก็สูงมากพอสำหรับผลิตบล็อกกลวงไม่รับน้ำหนักตาม มอก.58-2560

การพัฒนาระบบเซลล์สุริยะติดตั้งบนหลังคา เพื่อใช้งานในสายการผลิตยางคอมปาว์ด, อินทุอร ธรรมสอน

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

งานวิจัยนี้ได้ทำการศึกษา วิเคราะห์การใช้พลังงานของโรงงาน เพื่อออกแบบระบบเซลล์สุริยะบนหลังคา การกำหนดแผนงานติดตั้ง ศึกษาปัจจัยหลักที่ส่งผลกระทบต่อการผลิตไฟฟ้า และการประเมินประสิทธิภาพการใช้พลังงานไฟฟ้าจากเซลล์สุริยะจากการใช้งานเป็นแหล่งพลังงานสะอาดสำหรับกระบวนการผลิตยางคอมปาว์ด โดยออกแบบการใช้พลังงานไฟฟ้าให้เกิดประสิทธิภาพสูงสุดในอุตสาหกรรมผลิตยางคอมปาว์ด 2 โครงการ ระบบไฟฟ้าเซลล์สุริยะแบบออนกริดที่มีขนาดกำลังไฟฟ้าติดตั้งขนาด 865 กิโลวัตต์ และ 630 กิโลวัตต์ จากการศึกษาพบว่าทั้ง 2 โรงงานมีการใช้พลังงานไฟฟ้าในกระบวนการผลิตเป็นหลัก และความต้องการใช้พลังงานไฟฟ้าแปรผันตามยอดผลิตยางคอมปาว์ดร้อยละ 90 จากการวิเคราะห์ติดตามผลการใช้งานไฟฟ้าเซลล์สุริยะมีประสิทธิภาพต่ำกว่าร้อยละ 75 ในช่วงระยะ 5 เดือนหลัง เนื่องจากความต้องการใช้พลังงานไฟฟ้าของโรงงานลดลงและการจัดการโหลดการผลิตไม่เหมาะสมในช่วงกลางวัน และพบฝุ่นที่สะสมบนเซลล์สุริยะเป็น ผงคาร์บอน แคลเซียมคาร์บอนเนต และซิลิกาซึ่งเป็นส่วนผสมของการผลิตยางคอมปาว์ด จากการศึกษาพบว่า ฝุ่นจากกระบวนการผลิตส่งผลกระทบต่อการผลิตไฟฟ้าของเซลล์สุริยะร้อยละ 4 ดังนั้นระยะเวลาการล้างแผงเซลล์สุริยะของทั้ง 2 โครงการที่จุดสมดุลคือ ทุกๆ 3 เดือน จากการศึกษาข้อมูลการใช้ไฟฟ้าจากระบบเซลล์สุริยะนี้ชี้ให้เห็นว่า การผลิตไฟฟ้าของระบบเซลล์สุริยะแบบออนกริดนี้ มีปัจจัยหลักต่อการผลิตไฟฟ้าคือความต้องการใช้ไฟฟ้าของโรงงานเป็นหลัก เนื่องจากทั้ง 2 โรงงานมีการใช้ไฟฟ้าน้อยกว่ากำลังติดตั้งจึงทำให้เซลล์สุริยะผลิตไฟฟ้าน้อย แม้จะมีค่ารังสีดวงอาทิตย์สูงก็ตาม อย่างไรก็ตามระบบไฟฟ้าเซลล์สุริยะไม่สามารถจ่ายไฟฟ้าได้ตลอดเวลา ดังนั้นการบริหารจัดการโหลดการผลิตให้เหมาะสมจึงจำเป็นมาก เพื่อการใช้ไฟฟ้าจากเซลล์สุริยะให้มีประสิทธิภาพสูงสุด

การจำแนกชนิดปลาทูและปลาลัง Rastrelliger Spp. ด้วยเครื่องหมายพันธุกรรมไมโทคอนเดรียลดีเอ็นเอ, ปรินทร อยู่คงแก้ว

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

ปลาทูและปลาลังในสกุล Rastrelliger เป็นปลาเศรษฐกิจที่สำคัญในน่านน้ำไทยและมีลักษณะทางสัณฐานวิทยาที่ใกล้เคียงกันมาก การจำแนกชนิดพันธุ์ที่ถูกต้องจึงมีความจำเป็นในการจัดการทรัพยากร การศึกษาในครั้งนี้จึงมีวัตถุประสงค์เพื่อค้นหาเครื่องหมายพันธุกรรมที่ใช้จำแนกชนิดปลาทู (Rastrelliger brachysoma) และปลาลัง (R. kanagurta) ในอ่าวไทย รวมถึงตรวจสอบความถูกต้องของวิธีการจำแนกชนิดด้วยลักษณะสัณฐานวิทยาของปลาทูและปลาลังในอ่าวไทยโดยเก็บตัวอย่างจากท่าเรือประมงพื้นบ้านจำนวน 5 พื้นที่ครอบคลุมทั่วอ่าวไทยในเดือนตุลาคม พ.ศ.2564 คือ จังหวัดตราด ชลบุรี สมุทรสงคราม ชุมพร และสงขลา รวมตัวอย่างปลาทูและปลาลังที่ผ่านการจำแนกชนิดด้วยยีน 16S rRNA โดยเทคนิคทางอณูชีววิทยาทั้งหมด 295 ตัว แบ่งเป็นปลาทู 128 ตัวและปลาลัง 167 ตัว มีขนาดความยาวเหยียดเท่ากับ 15.90-21.00 เซนติเมตร และ 15.30-23.90 เซนติเมตรตามลำดับ ทำการวิเคราะห์ลักษณะทางสัณฐานวิทยาจากการวัดขนาดรูปร่าง พบว่าปลาทูและปลาลังมีอัตราส่วนระหว่างความยาวส้อมหางต่อความลึกของส่วนหัวเท่ากับ 3.6-4.3 และ 3.7-4.6 ตามลำดับ ซึ่งมีช่วงที่ซ้อนทับกันระหว่างชนิดทำให้ไม่สามารถจำแนกความต่างระหว่างชนิดได้ และเมื่อวิเคราะห์ความสัมพันธ์ระหว่างลักษณะต่างๆ ด้วยวิธีการวิเคราะห์องค์ประกอบหลัก (PCA) ก็ไม่สามารถจำแนกชนิดได้อย่างชัดเจนแต่สามารถเห็นความแตกต่างเมื่อพิจารณาเฉพาะแต่ละพื้นที่ ประชากรในจังหวัดตราด ชลบุรี และสงขลามีลักษณะทางสัณฐานวิทยาที่ค่อนข้างแตกต่างกันอย่างชัดเจน ในขณะที่ประชากรในจังหวัดสมุทรสงครามมีลักษณะทางสัณฐานวิทยาที่ใกล้เคียงกันมาก และประชากรในจังหวัดชุมพรมีทั้งส่วนที่แตกต่างกันและใกล้เคียงกัน การวิเคราะห์ลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีน 16S rRNA ในไมโทคอนเดรียลดีเอ็นเอ (mtDNA) เพื่อจำแนกชนิดและศึกษาความสัมพันธ์ทางพันธุกรรม ยืนยันว่าปลาทูและปลาลังในอ่าวไทยมีความใกล้ชิดกันมากซึ่งสอดคล้องกับงานวิจัยก่อนหน้า อย่างไรก็ตาม พบความไม่สอดคล้องกันระหว่างลักษณะทางสัณฐานวิทยาและ mtDNA ในบางตัวอย่าง ซึ่งอาจเป็นผลมาจากการผสมข้ามสายพันธุ์ การศึกษาครั้งนี้ประสบความสำเร็จในการพัฒนา 16S rRNA ไพรเมอร์ ที่สามารถจำแนกชนิดปลาทูและปลาลังได้ตั้งแต่ขั้นตอนการทำพีซีอาร์ ซึ่งจะเป็นประโยชน์อย่างยิ่งสำหรับการศึกษาในอนาคต การศึกษาครั้งนี้ชี้ให้เห็นความสัมพันธ์ระหว่างปลาทูและปลาลังในอ่าวไทยที่มีความซับซ้อนจำเป็นต้องศึกษาเพิ่มเติมโดยใช้เครื่องหมายพันธุกรรมที่หลากหลาย เพื่อทำความเข้าใจลักษณะเฉพาะของปลาทั้ง 2 ชนิด และโครงสร้างประชากร ซึ่งจะนำไปสู่การอนุรักษ์ทรัพยากรประมงอย่างยั่งยืนต่อไป

Reconstructing The Germination Pathway From The Rafflesia Seed Transcriptome, Venkata Siva Sankar Maddu

Selected Full-Text Master Theses 2021-

Rafflesia (Rafflesiaceae) produces the largest flowers in the world but has no stems, roots, or leaves. It is a holoparasitic angiosperm that derives all its nutrients from its host vine, Tetrastigma. All species are also threatened with extinction, but propagating it has been incredibly challenging. Its germination from seed has never been observed. The thesis aims to reconstruct the germination pathway of Rafflesia from its published seed transcriptome to gain insight into its molecular genetics and understand what germination genes can be stimulated to facilitate infection of its host for ex-situ propagation. The published seed transcriptome of Rafflesia speciosa was …

Pharmaceuticals From Natural Products: The Utility Of The Phylogeny, Shaimaa Magdy Saad

Selected Full-Text Master Theses 2021-

About 60% of approved drugs during the last 30 years are either directly or indirectly from natural products. Previous studies have shown that the phylogeny has predictive utility in drug discovery. In this study the pharmacological applications of various naturally-derived drugs were mapped on the phylogeny reconstructed from DNA sequences of the source organisms to decipher phylogenetic patterns that may facilitate drug discovery. A multi-step approach was employed starting with a literature search to compile a comprehensive list of pharmaceutical drugs derived from natural sources. A phylogeny was reconstructed from the source organisms and their pharmacological uses mapped on the …

Changes In Running Biomechanics In Master Runners Over Age 50: A Systematic Review, Matthew Klein, Chris Patterson

Faculty Publications - College of Physical Therapy

The number of individuals over 50 years of age participating in recreational and competitive running has increased over the past ten years. It has been established that older runners experience a reduction in strength and power. These changes may contribute to different running biomechanics from younger runners. The pur-pose of this study was to synthesise the current evidence on run-ning biomechanical differences in the lower extremity between masters runners over 50 years and younger runners under 40 years. The systematic data search included CINAHL, MEDLINE, and SPORTDiscus databases. Fourteen cross-sectional studies that com-pared lower extremity biomechanics of masters runners to …

Bat Activity And Insect Biomass On Mcconnell Airforce Base Compared To Surrounding Wichita Parks, Michaela Sielaff

Master's Theses or Doctor of Nursing Practice

Bats are bioindicators of the communities to which they belong, giving researchers insight into the overall health of those ecosystems. Bats are also very adaptable and are capable of tolerating urbanization. Some species, such as Lasiurus borealis and Lasionycteris noctivagans may even benefit from adjacent industrial and commercial land use, although this is not the case for all bat species. In 2021, we began acoustic and mist net surveys of bats at McConnell Air Force Base (MAFB, or “base”) in Wichita, KS. However, no bats were captured or seen during mist net surveys, although some were detected acoustically over a …

Relationship Between Bats And Prairie-Dog (Cynomys Ludovicianus) Colonies In Western Kansas, Mario N. Rodriguez

Master's Theses or Doctor of Nursing Practice

Although it is known that prairie dog colonies can increase biodiversity in the areas surrounding them, there is extraordinarily little known about the relationship between bats and black-tailed prairie dogs (Cynomys ludovicianus). In a recent study from the Front Range of Colorado, several bat species were found to be consistently flying around prairie dog colonies, presumably foraging due to increased insect diversity and abundance. Despite the importance of prairie dogs to the ecosystem, prairie dog colonies are usually eradicated due to the perception that they adversely impact cattle grazing. If insectivorous bats are attracted to prairie dog colonies …

Methylation Patterns Across Tissue Type And Time In Peromyscus Leucopus: A Targeted Museum Study, Loryn Smith

Master's Theses or Doctor of Nursing Practice

Museum specimens are a vital data source for many types of studies. One relatively new use includes studying methylation patterns. Methylation patterns are a form of epigenetics or how gene expression changes without alteration of the genetic code. These patterns have been examined in many mammals. However, the focus has previously been on overall epigenetic patterns. Few studies have investigated whether methylation patterns differ across tissue types, time, or preservation method. In this study, I compared methylation patterns in muscle, liver, toe pads, and nasal bones from Peromyscus leucopus (white-footed mouse) museum specimens collected in 2022, 2018, 2014, and 2008 …

Conservation Status Of The Chihuahuan Green Toad, Anaxyrus Debilis, In Western Kansas Range, Mackenzie Reh

Master's Theses or Doctor of Nursing Practice

Amphibians remain an important model organism closely associated with environmental conditions and ecological processes. They are considered critical bioindicators of the relative health of ecosystems providing insights into levels of pollution, such as agricultural and industrial runoff, effects of UVB increases, ecosystem service functionality and much more (Rohman et al. 2021). Amphibians are an essential food source to organisms at higher trophic levels and to humans in developing countries (Schleich et al. 1996). Amphibians also provide pest control for agricultural and urban landscapes (Warkentin et al. 2009). Amphibians provide novel medicinal treatments for a wide variety of human ailments and …

Grassland Nesting Birds And Visual Obstruction Measurements In Western Kansas On Smoky Valley Ranch, Connor J. Champney

Master's Theses or Doctor of Nursing Practice

North American grassland declines and increasing changes in land use patterns have revived the importance of studying grasslands and their inhabitants. Grassland breeding bird populations are declining rapidly, and conservation efforts are ramping up. Smoky Valley Ranch (SVR) owned by The Nature Conservancy (TNC) is in Logan County, Kansas. Surrounding private land is characteristically comprised of row crops, livestock agriculture, Conservation Reserve Program (CRP), and a few patches of native and restored prairie. The study of obligate grassland birds utilizing this area during the breeding season is essential to the proliferation of grassland bird nesting habitat in western, Kansas. The …

Habitat Associations And Fine-Scale Movements Of The Red-Spotted Toad (Anaxyrus Punctatus) In Kansas And The Efficacy Of Remote Telemetry For Monitoring Small-Scale Movements, Elisabeth Russell

Master's Theses or Doctor of Nursing Practice

As climate change progresses, arid-adapted anurans might be particularly susceptible to population declines because of their reliance on ephemeral pools for successful reproduction. Because arid-adapted anurans are difficult to study due to short active seasons and cryptic lifestyles, little is known about their habitat preferences. One such arid-adapted species is the Red-Spotted Toad (Anaxyrus punctatus; RST), a Kansas Species in Need of Conservation. Since this designation in 1987, little research has been conducted to understand their conservation needs. During the summers of 2021 and 2022, RST surveys were conducted both near areas where the species has historically been …

Timing Of Diversification, Dispersal, And Biogeography Of Parrots In The Genus Amazona (Psittaciformes: Psittacidae) Throughout The Caribbean, Visualized In Gis, Christopher Kingwill

Master's Theses or Doctor of Nursing Practice

Avian fossil records from across the Caribbean (Greater and Lesser Antilles) demonstrate higher avian diversity prior to extinction events due to climate change at the end of the Pleistocene and human impact across the Caribbean throughout the Holocene. Amazon parrots (Amazona) are a diverse genus of New World parrots found throughout Central and South America, as well as the Caribbean. Their phylogeny and evolutionary history, specifically for Caribbean species, has been debated in terms of source areas in Central and South America and the timing of and number of colonization events to different islands that preceded diversification into …

The Impact Of Study Strategies On Academic Performance For Medical Students At Wright State University, Markia Black

Browse all Theses and Dissertations

Studying plays an important role in the academic success of medical students. It is likely that ineffective study skills result in poor performances on required standardized exams. There is a concern for the lack of empirical data related to what study strategies are the most productive for medical students to practice. My goal is to 1) identify what study strategies students use in their pre-clinical years of medical school, 2) determine if these strategies impact students’ performance on Comprehensive Basic Science Exams and Step 1 exam, and 3) identify study methods that best support student achievement in the pre-clinical phase …

Investigating The Mechanism Of Tdp-43 Toxicity In Yeast: A Model For Amyotrophic Lateral Sclerosis, Cassidy Nicole Alspaugh

Browse all Theses and Dissertations

Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) is a progressive neurodegenerative disease that causes the degeneration of motor neurons which leads to loss of motor function and eventual death. Over 20 genes have been implicated in ALS’s pathogenesis, one being TARDBP, which codes for TDP-43. TDP-43 mislocalizes from the nucleus, accumulates, and then aggregates in the cytoplasm and is linked to cellular toxicity. We have modeled this aggregation and toxicity of TDP-43 in budding yeast. From genetic screens of human genes and their ability to modulate TDP-43 toxicity, we found 50 human genes that were able to reduce TDP-43 toxicity. 12 of these …

To Determine The Role Of The Platelet Activating Factor - Receptor In Folfirinox Therapy-Mediated Microvesicles Particle Generation, Krishna Awasthi

Browse all Theses and Dissertations

Given that Pancreatic cancer continues to be one of the primary causes of cancer-related death and that existing treatment options have a poor success rate, it is important to investigate the role of potential factor(s) involved in pancreatic cancer growth or diminishing the effectiveness of chemotherapeutic agents. An alternative regimen for pancreatic cancer treatment called FOLFIRINOX has shown to increase the survival rate and improve Eastern Cooperative Oncology Group (ECOG) performance status score among the pancreatic cancer patients. However, FOLFIRINOX therapy is associated with several side effects. Through mechanisms involving the secretion of microvesicle particles (MVP), studies, including ours have …

Personality Traits Of Dairy Calves And Their Relationship With Feeding Behavior, Activity, And Performance, Emily A. Michalski

Theses and Dissertations--Animal and Food Sciences

Detection of individual differences in personality traits of animals may prove beneficial for producers to help tailor management for individuals and to make selection decisions. Therefore, the objectives of this thesis were to

1) review and evaluate literature on relationships between individual cattle personality traits and feeding behavior, activity, and performance; and

2) evaluate and develop tests suitable for characterizing crossbred dairy-beef calves’ personalities and associations with behavioral patterns and performance.

The existing literature indicates that growth, intake, activity, and milk production measures from precision technologies have associations with cattle personality traits and behaviors identifiable through standardized tests. This indicates …

The Effects Of Exogenous Enzyme Supplementation On The Performance, Bone Quality, And Nutrient Utilization Of Broiler Chickens, Megan Bauer

Theses and Dissertations--Animal and Food Sciences

Two experiments were conducted to examine the effects of Allzyme® Spectrum supplementation to a reduced nutrient diet on the growth performance, energy and nutrient digestibility and utilization, bone quality, and jejunal digesta viscosity in broiler chickens. Each experiment used 300 one-day old Cobb by-product breeder chicks with 5 treatments, 10 replicates, and 6 birds per replicate cage in a randomized complete block design. The only differences between the two experiments were experiment 1 lasted for 21 days using a corn-soybean meal-based diet and experiment 2 lasted for 22 days using a wheat-soybean meal-based diet. The 5 treatments included a positive …

Biomass And Productivity Of Thalassia Testudinum In Estuaries Of The Florida Panhandle, Laura A. Yarbro, Paul R. Carlson, Ken L. Heck, Dorothy Byron, Sandra Brooke, Linda Fitzhugh, Sheila Scolaro, Barbara Albrecht, Rachel Presley, Jane M. Caffrey

Gulf and Caribbean Research

Thalassia testudinum often dominates seagrass meadows of the Florida panhandle but few measurements of productivity, biomass, density, turnover or leaf area index in this region have been made. We targeted 5 estuaries located at similar latitudes, 30⁰ ± 0.3⁰N: Big Lagoon, Santa Rosa Sound, St. Andrew Bay, St. Joseph Bay, and St. George Sound. This study was one component of a collaborative partnership of state and local researchers examining factors preventing recovery in panhandle estuarine areas that had historically contained seagrass in the 1940s and 1950s. Measurements were made twice in 2016, once in June and then again in summer …

Dynamics Of The Benthic Communities Of Pigeon Islets (Guadeloupe Island, Lesser Antilles) From 2012 To 2021 Monitored By A Photo-Quadrats Technique, Hanna-May Malahel, Camille Freschet, Simone Mège, Claude Bouchon

Gulf and Caribbean Research

Since 2012, the benthic communities of the Pigeon Islets (Guadeloupe Island, Lesser Antilles) have been monitored biannually by the National Park of Guadeloupe using photo—quadrats. This monitoring was carried out at 12 coral reef stations distributed around the islets. The data collected from 2012 to 2021 highlight the significant events that disrupted the coral communities of Guadeloupe. Among these remarkable phenomena, an episode of coral bleaching occurred in 2019, followed by the appearance of a new coral disease, Stony Coral Tissue Loss Disease (SCTLD), in 2020. As a result of these threats, a drop of 54% of coral cover was …

Gulf And Caribbean Research Reviewers, Mark S. Peterson

Gulf and Caribbean Research

No abstract provided.

Experiences With Covid-19 Stress Among Hispanic/Latino Farmworkers, Brenda Berumen-Flucker, Hadiza Galadima, Sylvia Shangani, Michele Kekeh, Muge Akpinar-Elci

Community & Environmental Health Faculty Publications

BACKGROUND: Hispanics/Latinos, particularly those that identify as foreign-born, are overrepresented in the agricultural sector in the U.S. Over the course of the COVID-19 pandemic, this subpopulation of farmworkers was recognized as an invaluable group of essential workers unable to implement COVID-19 protections.

METHODS: Previously validated COVID-19 stress scale measures were identified, adapted, and translated to collect COVID-19 stress data from Hispanic/Latino agricultural workers in two heavily agricultural counties in northeastern North Carolina. Participants were recruited using purposive convenience sampling. Data collection took place from June to November of 2021.

RESULTS: The majority of Hispanic/Latino agricultural workers surveyed reported experiencing worries …

Obesity During Adolescence And Feeding Practices During Infancy: Cross-Sectional Study, Reem Sharaf-Alddin, Radhia Almathkoori, Hara Kostakis, Ahmed N. Albatineh, Abdullah Al-Taiar, Muge Akpinar-Elci

Community & Environmental Health Faculty Publications

Background: Breastfeeding is proposed to play a role in reducing the risk of obesity throughout life. Kuwait has an extremely high prevalence of childhood obesity (45% of adolescents are overweight/obese) and extremely low breastfeeding indicators, particularly exclusive breastfeeding. In fact, little is known about the association between breastfeeding and obesity from Kuwait and the broader Middle East.

Aims: To estimate the prevalence of overweight/obesity in female adolescents in Kuwait and assess its association with breastfeeding during infancy.

Methods: This is a cross-sectional study that included 775 girls randomly selected from public and private high schools in Kuwait. The primary exposure …