Biotechnology Commons^™

Suspicion Encoded: Women Of Color And Biometric Technology In The United States, Lilith A. Saylor

sprinkle: an undergraduate journal of feminist and queer studies

This paper explores the commodification of privacy through biometric technology in the United States. It examines the impact of this technology on poor women of color (WOC), arguing that poor WOC face intersectional discrimination based on the convergence of sex, race, and class in their identities. I highlight the unique and powerful intrusion of biometric technology into the lives of poor WOC, and argue that the connection between data and the physical body created through biometric data has formed an environment in which the state wields unrestricted control in all spheres over the privacy of poor WOC.

Root Nrt, Nir, Amt, Gs, Gogat And Gdh Expression Levels Reveal No Andaba Mediated Drought Tolerance In Brassica Juncea L., Seema Sahay, Luis Robledo-Arratia, Katarzyna Glowacka, Meetu Gupta

Department of Biochemistry: Faculty Publications

Little is known about the interactive effects of exogenous nitric oxide (NO) and abscisic acid (ABA) on nitrogen (N) metabolism and related changes at molecular and biochemical levels under drought stress. The present study highlights the independent and combined effect of NO and ABA (grouped as “nitrate agonists”) on expression profiles of representative key genes known to be involved in N-uptake and assimilation, together with proline metabolism, N–NO metabolism enzyme’s activity and nutrient content in polyethylene glycol (PEG) treated roots of Indian mustard (B. juncea cv. Varuna). Here we report that PEG mediated drought stress negatively inhibited growth performance, as …

Development Of A Dna Biosensor Using Crispr/Dcas9 On A Graphene Oxide Surface For Detecting Antibiotic Resistance Genes, Wendy Cecil

Mahurin Honors College Capstone Experience/Thesis Projects

Antibiotic resistance is a rapidly spreading global threat to human health. Previously in our lab, we developed a simple method for facile detection of antibiotic resistance genes (ARGs) in bacteria. This DNA detection system takes advantage of the CRISPR-Cas system (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeat and CRISPRAssociated Protein). We designed CRISPR in complex with nuclease deactivated Cas9 (dCas9) on graphene oxide (GO) sheets conjugated with Cas9 antibodies. Single guide RNA (sgRNA) was customized to program dCas9 for target DNA binding. sgRNA was covalently labeled with fluorescein to provide fluorescence signal. Graphene oxide (GO) is utilized for its quenching properties …

Integrative Network Analyses Of Transcriptomics Data Reveal Potential Drug Targets For Acute Radiation Syndrome, Robert Moore, Bhanwar Lal Puniya, Robert Powers, Chittibabu Guda, Kenneth W. Bayles, David Berkowitz, Tomas Helikar

Department of Biochemistry: Faculty Publications

Recent political unrest has highlighted the importance of understanding the short- and long-term effects of gamma-radiation exposure on human health and survivability. In this regard, effective treatment for acute radiation syndrome (ARS) is a necessity in cases of nuclear disasters. Here, we propose 20 therapeutic targets for ARS identified using a systematic approach that integrates gene co-expression networks obtained under radiation treatment in humans and mice, drug databases, disease-gene association, radiation-induced differential gene expression, and literature mining. By selecting gene targets with existing drugs, we identified potential candidates for drug repurposing. Eight of these genes (BRD4, NFKBIA, CDKN1A, TFPI, MMP9, …

Lipid Droplet Membrane Proteome Remodeling Parallels Ethanol-Induced Hepatic Steatosis And Its Resolution, Carol A. Casey, Terrence M. Donohue Jr., Jacy L. Kubik, Vikas Kumar, Michael J. Naldrett, Nicholas T. Woods, Cole P. Frisbie, Mark A. Mcniven, Paul G. Thomes

Nebraska Center for Biotechnology: Faculty and Staff Publications

Abstract Lipid droplets (LDs) are composed of neutral lipids enclosed in a phospholipid monolayer, which harbors membrane-associated proteins that regulate LD functions. Despite the crucial role of LDs in lipid metabolism, remodeling of LD protein composition in disease contexts, such as steatosis, remains poorly understood. We hypothesized that chronic ethanol consumption, subsequent abstinence from ethanol, or fasting differentially affects the LD membrane proteome content and that these changes influence how LDs interact with other intracellular organelles. Here, male Wistar rats were pair-fed liquid control or ethanol diets for 6 weeks, and then, randomly chosen animals from both groups were either …

Root Nrt, Nir, Amt, Gs, Gogat And Gdh Expression Levels Reveal No Andaba Mediated Drought Tolerance In Brassica Juncea L., Seema Sahay, Luis Robledo-Arratia, Katarzyna Glowacka, Meetu Gupta

Department of Biochemistry: Faculty Publications

Little is known about the interactive effects of exogenous nitric oxide (NO) and abscisic acid (ABA) on nitrogen (N) metabolism and related changes at molecular and biochemical levels under drought stress. The present study highlights the independent and combined effect of NO and ABA (grouped as “nitrate agonists”) on expression profiles of representative key genes known to be involved in N-uptake and assimilation, together with proline metabolism, N–NO metabolism enzyme’s activity and nutrient content in polyethylene glycol (PEG) treated roots of Indian mustard (B. juncea cv. Varuna). Here we report that PEG mediated drought stress negatively inhibited growth performance, as …

The Role Of Ms-818 In Altering Age-Related Characteristics Of An In Vitro Model Of Senescence In Neural Stem Cells, Sandeep Sreerama

Honors Undergraduate Theses

Aging of the brain is the leading risk factor for neurodegenerative diseases and brain cancers and has deleterious effects on brain functions. It follows that attempts to reverse the aging process may be therapeutically valuable. Neural stem cells (NSC) have been shown to play a critical role in maintaining brain functions, and their number is severely decreased with age. The development of senescence-like characteristics and declining functions in NSCs have been proposed to be responsible for brain aging and tumorigenesis. MS-818 is a pyrrolopyrimidine that has been shown to increase the NSC population and reverse the decline of behavioral function …

Visualizing Barrier Dysfunction Using Clarity, Rachel Robbe

Lewis Honors College Thesis Collection

Epilepsy and Alzheimer’s disease are two prevalent neurological disorders. The blood-brain barrier (BBB) is a factor in why there are no long-term treatments for these diseases. The transporters in the neurovascular unit (NVU), which makes up the BBB, are highly specialized, so most drugs cannot pass the barrier to treat these diseases. It is unknown why drug uptake in the BBB varies in a diseased and wild-type brain, but one theory is that there are spatial differences in the NVU. One method for examining the NVU is the CLARITY tissue clearing technique which is unique in its capability to clear …

Assessing The Utility Of Environmental Dna Techniques To Monitor White Shrimp (Litopenaeus Setiferus) Abundance On The Georgia Coast, Raven Hurt

College of Graduate Studies: Theses & Dissertations

Environmental DNA (eDNA) surveys have developed over the last decade from once being a novel tool to now acting as an effective technology often used in complement to traditional capture surveys for assessing the distribution of organisms in freshwater and marine environments. However, many uncertainties on how to properly develop, operate, and analyze eDNA based techniques still hinder this technology effectiveness in the field. The white shrimp, Litopenaeus setiferus, is a common, commercially and recreationally important species in the United States, with landings exceeding $254 million in 2020. L. setiferus is also used as a key indicator species to changes …

Lysosomal Slc46a3 Modulates Hepatic Cytosolic Copper Homeostasis, Jung-Hwan Kim, Tsutomu Matsubara, Jaekwom Lee, Cristina Fenollar-Ferrer, Kyungreem Han, Donghwan Kim, Shang Jia, Christopher J. Chang, Heejung Yang, Tomokazu Nagano, Kristopher W. Krausz, Sun Hee Yim, Frank J. Gonzalez

Department of Biochemistry: Faculty Publications

The environmental contaminant 2,3,7,8-tetrachlorodibenzo-p-dioxin (TCDD) causes hepatic toxicity associated with prominent lipid accumulation in humans. Here, the authors report that the lysosomal copper transporter SLC46A3 is induced by TCDD and underlies the hepatic lipid accumulation in mice, potentially via effects on mitochondrial function. SLC46A3 was localized to the lysosome where it modulated intracellular copper levels. Forced expression of hepatic SLC46A3 resulted in decreased mitochondrial membrane potential and abnormal mitochondria morphology consistent with lower copper levels. SLC46A3 expression increased hepatic lipid accumulation similar to the known effects of TCDD exposure in mice and humans. The TCDD-induced hepatic triglyceride accumulation was significantly …

การวิเคราะห์ปัจจัยสำหรับการเกิดคราบบนแม่พิมพ์ระหว่างวัลคาไนเซชันยางด้วยการออกแบบการทดลองเชิงแฟกทอเรียล, สิรีธร อุตมโชติ

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

ในอุตสาหกรรมการผลิตชิ้นส่วนยางพบปัญหาจากการเกิดชิ้นงานที่มีจุดบกพร่อง เช่น พอง ฉีกขาด แผล และคราบ โดยชิ้นงานที่เป็นคราบ คือ ชิ้นงานที่ผิวที่ไม่เรียบและต้องหยุดการผลิตเพื่อนำแม่พิมพ์ไปทำความสะอาด ทำให้ต้นทุนการผลิตเพิ่มขึ้น สาเหตุของการเกิดคราบถูกนำมาวิเคราะห์ด้วยวิธีการออกแบบการทดลองเชิงแฟกทอเรียลเพื่อหาความสำคัญทางสถิติของแต่ละตัวแปร โดยตัวแปรที่ศึกษาได้แก่ เวลาที่ใช้ในการขึ้นรูป ปริมาณซิงค์ออกไซด์ ปริมาณแคลเซียมคาร์บอเนต และอัตราส่วนโดยน้ำหนักของน้ำยาถอดแบบต่อน้ำปราศจากไอออน จากผลการทดลองเชิงแฟกทอเรียล พบว่าเวลาที่ใช้ในการขึ้นรูปและอัตราส่วนโดยน้ำหนักของน้ำยาถอดแบบต่อน้ำปราศจากไอออน คือ ตัวแปรสำคัญที่ทำให้ชิ้นงานเกิดคราบ เนื่องจากการใช้เวลาในการขึ้นรูปที่นานขึ้น ทำให้ยางเกิดระดับการวัลคาไนเซชันเพิ่มขึ้น ซึ่งทำให้แรงยึดติดระหว่างชิ้นงานกับแม่พิมพ์ลดลง ส่งผลให้ทำให้มีคราบที่เกิดขึ้นลดลง และเมื่ออัตราส่วนโดยน้ำหนักของน้ำยาถอดแบบต่อน้ำปราศจากไอออนที่ 1:100 พบว่ามีชิ้นงานที่เป็นคราบลดลง เนื่องจากน้ำยาถอดแบบทำให้ผิวของแม่พิมพ์มีความลื่น จึงทำให้ไม่มีสิ่งตกค้างหลงเหลืออยู่ที่สามารถนำไปสู่การเกิดคราบบนผิวของแม่พิมพ์ได้ โดยแนวโน้มของการเกิดคราบต่อการปรับเปลี่ยนเวลาในการขึ้นรูปและอัตราส่วนของน้ำยาถอดแบบได้มาจากการทดลองเชิงเดี่ยว พบว่าเมื่อเวลาการขึ้นรูปมากขึ้นจาก 350 ไปเป็น 450 วินาที และอัตราส่วนโดนน้ำหนักของน้ำยาถอดแบบต่อน้ำปราศจากไอออนจาก 1:450 ไปเป็น 1:250 ทำให้มีชิ้นงานที่เป็นคราบลดลง

Nature-Inspired Material Strategies Towards Functional Devices, Sayantan Pradhan

Theses and Dissertations

Naturally sourced, renewable biomaterials possess outstanding advantages for a multitude of biomedical applications owing to their biodegradability, biocompatibility, and excellent mechanical properties. Of interest in this dissertation are silk (protein) and chitin (polysaccharide) biopolymers for the fabrication of functional biodevices. One of the major challenges restricting these materials beyond their traditional usage as passive substrate materials is the ability to combine them with high-resolution fabrication techniques. Initial research work is directed towards the fabrication of micropatterned, flexible 2D substrates of silk fibroin and chitin using bench-top photolithographic techniques. Research is focused on imparting electrochemical properties to silk proteins using conducting …

Use Of Lymesim 2.0 To Assess The Potential For Single And Integrated Management Methods To Control Blacklegged Ticks (Ixodes Scapularis; Acari: Ixodidae) And Transmission Of Lyme Disease Spirochetes, Shravani Chitineni, Elizabeth R. Gleim, Holly D. Gaff

Undergraduate Honors Theses

Annual Lyme disease cases continue to rise in the U.S. making it the most reported vector-borne illness in the country. The pathogen (Borrelia burgdorferi) and primary vector (Ixodes scapularis; blacklegged tick) dynamics of Lyme disease are complicated by the multitude of vertebrate hosts and varying environmental factors, making models an ideal tool for exploring disease dynamics in a time- and cost-effective way. In the current study, LYMESIM 2.0, a mechanistic model, was used to explore the effectiveness of three commonly used tick control methods: habitat-targeted acaricide (spraying), rodent-targeted acaricide (bait boxes), and white-tailed deer targeted acaricide (4-poster …

Late-Stage Product Development And Approvals By Biotechnology Companies After Initial Public Offering, 1997-2016, Laura M. M. Mcnamee, Ekaterina Galkina Cleary, Sunyi Zhang, Usama Salim, Fred D. Ledley

Natural & Applied Sciences Faculty Publications

Purpose: This work describes the late-stage product portfolios of the biotechnology companies that completed initial public offerings (IPOs) from 1997 to 2016. We asked whether these emerging companies continue to develop innovative, biologic products and produce the innovation promised by the early biotechnology industry.

Methods: We identified therapeutic products that reached Phase III development from 1997 to 2016, the characteristics of the products, the dates of the initiation of Phase III and product approval, proxy indicators of the innovativeness of each product, and the contribution of each biotechnology company. Companies were characterized by IPO window and clinical status of the …

การพัฒนาพาสต้าปราศจากกลูเตนที่มีเส้นใยอาหารสูงจากฟลาวร์มันสำปะหลัง, พลิตา อุดมสิรินิกร

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

งานวิจัยนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษาอิทธิพลของฟลาวร์ข้าวเจ้า สตาร์ชข้าวโพด เส้นใยมันสำปะหลัง และกัวกัม ต่อสมบัติทางกายภาพและสมบัติทางประสาทสัมผัสของพาสต้าปราศจากกลูเตนที่มีเส้นใยอาหารสูงจากฟลาวร์มันสำปะหลัง และเพื่อพัฒนาพาสต้าปราศจากกลูเตนที่มีเส้นใยอาหารสูงจากฟลาวร์มันสำปะหลังที่ขึ้นรูปด้วยกระบวนการอัดรีด จากการศึกษาสมบัติทางเคมีกายภาพของสตาร์ชและฟลาวร์ พบว่า สตาร์ชมันสำปะหลัง สตาร์ชข้าวเจ้า และสตาร์ชข้าวโพด มีปริมาณแอมิโลสร้อยละ 16.31, 21.35 และ 23.15 ตามลำดับ สตาร์ชมันสำปะหลังมีกำลังการพองตัวและการละลายสูงกว่าสตาร์ชข้าวโพดและสตาร์ชข้าวเจ้า จากการวิเคราะห์องค์ประกอบทางเคมีของฟลาวร์มันสำปะหลังและเส้นใยมันสำปะหลัง พบว่า มีปริมาณเส้นใยอาหารร้อยละ 7.42 และ 54.75 โดยน้ำหนักแห้ง ตามลำดับ จึงคำนวณสูตรและนำเส้นใยมันสำปะหลังมาเสริมแหล่งของเส้นใยอาหาร และนำฟลาวร์ข้าวเจ้าและสตาร์ชข้าวโพดมาทดแทนฟลาวร์มันสำปะหลังที่สัดส่วนต่าง ๆ จากนั้นศึกษาคุณภาพพาสต้าที่ขึ้นรูปด้วยวิธีการรีดและตัด พบว่า พาสต้าสูตร RF50 ที่มีส่วนผสมจากฟลาวร์มันสำปะหลัง ฟลาวร์ข้าวเจ้า สตาร์ชข้าวโพด เส้นใยมันสำปะหลัง ในปริมาณร้อยละ 35 : 50 : 0 : 15 มีคุณภาพหลังปรุงสุกและลักษณะเนื้อสัมผัสของพาสต้าดีกว่าพาสต้าสูตรอื่น (p≤0.05) จากนั้นนำกัวกัมมาเสริมในพาสต้าสูตร RF50 ที่ร้อยละ 1 และ 2 โดยน้ำหนักฟลาวร์ผสม พบว่า พาสต้าสูตร RF50GG2 ที่มีส่วนผสมจากฟลาวร์มันสำปะหลัง ฟลาวร์ข้าวเจ้า เส้นใยมันสำปะหลัง ในปริมาณร้อยละ 35 : 50 : 15 และเสริมกัวกัมร้อยละ 2 โดยน้ำหนัก ฟลาวร์ผสม มีคุณภาพหลังปรุงสุกและลักษณะเนื้อสัมผัสของพาสต้า ไม่แตกต่างจากพาสต้ามันสำปะหลังทางการค้า (p>0.05) และได้คะแนนการทดสอบทางประสาทสัมผัสทางด้านเนื้อสัมผัสและความชอบโดยรวม มากกว่าพาสต้าสูตรอื่น (p≤0.05) ในกระบวนการอัดรีดด้วยสกรูเดี่ยว กำหนดสภาวะการตั้งค่าพารามิเตอร์ในส่วนของอัตราการป้อนวัตถุดิบ 70 กิโลกรัมต่อชั่วโมง, อุณหภูมิน้ำ 70 องศาเซลเซียส, อุณหภูมิบาเรลส่วนนวดผสม 65 องศาเซลเซียส, ความเร็วรอบสกรูส่วนนวดผสม 70 rpm, อุณหภูมิบาเรลส่วนอัดรีด 45 องศาเซลเซียส, ความเร็วรอบสกรูส่วนอัดรีด 25 rpm, อุณหภูมิหัวได 55 องศาเซลเซียส และแปรปริมาณน้ำที่ …

การประยุกต์ใช้เทคโนโลยีพลาสมาเพื่อฆ่าจุลินทรีย์ก่อโรค, ตันติกร เหล่าสุข

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

ปัจจุบันการแพร่ระบาดของเชื้อก่อโรคมีความรุนแรงเพิ่มมากขึ้น ทำให้ผู้บริโภคให้ความสนใจเกี่ยวกับสุขลักษณะที่ดี นำมาสู่ความสนใจในเทคโนโลยีกำจัดจุลินทรีย์ที่อยู่ในสภาพแวดล้อมในอุปกรณ์เครื่องมือชีวิตประจำวัน ได้แก่ เครื่องปรับอากาศ และเครื่องฟอกอากาศ ซึ่งปัจจุบันบริษัท บิทไว้ส์ (ประเทศไทย) จำกัด ผู้ผลิตเครื่องปรับอากาศได้มีการพัฒนาเทคโนโลยี 2 ชนิด ได้แก่ negative ion generator (NIG) และพลาสมาชนิด dielectric barrier discharge (DBD plasma) เพื่อตอบโจทย์ผู้บริโภคดังกล่าว งานวิจัยนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อหาภาวะที่เหมาะสมในการทดสอบประสิทธิภาพในการกำจัดจุลินทรีย์ ด้วยเทคโนโลยีพลาสมา และทดสอบประสิทธิภาพการกำจัดจุลินทรีย์สำคัญในกลุ่มแบคทีเรีย รา และไวรัส ด้วยเทคโนโลยีพลาสมา พร้อมทั้งทดสอบผลของเทคโนโลยีพลาสมาต่อเซลล์มนุษย์ โดยสร้างกล่องทดลองอะคริลิค ที่ติดตั้ง NIG กำลังไฟ 1 วัตต์ และสร้าง กล่องทดลองอะคริลิค ที่ติดตั้งพลาสมาชนิด DBD กำลังไฟ 15 วัตต์ เพื่อใช้ในการทดสอบ ซึ่งในการทดสอบแบคทีเรียนั้นใช้แบคทีเรียแกรมบวก แบคทีเรียแกรมลบ และแบคทีเรียที่ทนต่อสารปฏิชีวนะ ได้แก่ Escherichia coli ATCC25922, Staphylococcus aureus ATCC6538P และ Pseudomonas aeruginosa ATCC9027 ตามลำดับ โดยเลี้ยงและนำมากระจายเชื้อบนอาหารแข็งชนิด LB จากนั้นนำมาสัมผัส NIG และพลาสมาชนิด DBD เป็นเวลา 60 นาที พบว่าพลาสมาชนิด DBD สามารถกำจัดแบคทีเรียทั้ง 3 ชนิดได้ 100% แต่ NIG ไม่มีประสิทธิภาพในการกำจัดแบคทีเรียดังกล่าว ในการทดสอบผลต่อยีสต์โดยเลือก Saccharomyces cerevisiae ATCC4105 เป็นตัวแทนเนื่องจากโครงสร้างใกล้เคียงยีสต์ที่ก่อโรคในมนุษย์ โดยทดสอบนำยีสต์มากระจายเชื้อบนอาหารแข็งชนิด YPD และสัมผัส NIG และพลาสมาชนิด DBD เป็นเวลา 60 นาที พบว่าพลาสมาชนิด DBD มีประสิทธิภาพในการฆ่ายีสต์ 100% และ NIG ไม่มีประสิทธิภาพในการฆ่ายีสต์ …

Impact Of Short Meditation On Attentional Performance, Lauren E. Guerriero

Theses and Dissertations--Biology

Meditation describes a large variety of traditions that all include the conscious focus of attention. By maintaining attention, meditators experience both acute and long-term changes in physiology, anatomy, and cognitive performance. The type of performance benefit is believed to depend, at least in part, on the specific type of mental training. What is much less clear in the literature is the impact of a single session of meditation on the brain and how the acute changes could impact performance. Studies in advanced meditators show an increase in neuronal coordination and slowing of neuronal firing across many regions in the brain, …

Fabrication And Characterization Of Agarwood Extract-Loaded Nanocapsules And Evaluation Of Their Toxicity And Anti-Inflammatory Activity On Raw 264.7 Cells And In Zebrafish Embryos, Eman Ramadan, Manar A. Eissa, Noha Badawi

Pharmacy

Aquilaria malaccensis has been traditionally used to treat several medical disorders including inflammation. However, the traditional claims of this plant as an anti-inflammatory agent has not been substantially evaluated using modern scientific techniques. The main objective of this study was to evaluate the anti-inflammatory effect of Aquilaria malacensis leaf extract (ALEX-M) and potentiate its activity through nano-encapsulation. The extract-loaded nanocapsules were fabricated using water-in-oil-in-water (w/o/w) emulsion method and characterized via multiple techniques including DLS, TEM, FTIR, and TGA. The toxicity and the anti-inflammatory activity of ALEX-M and the extract-loaded nanocapsules (ALEX-M-PNCs) were evaluated in-vitro on RAW 264.7 macrophages …

Novel Mechanistic Insights Towards The Repositioning Of Alogliptin In Parkinson's Disease, Eman Ramadan, Marwa M. Safar

Pharmacy

Parkinson's disease (PD) is a progressive neurodegenerative disease that impairs people's lives tremendously. The development of innovative treatment modalities for PD is a significant unmet medical need. The critical function of glucagon-like peptide-1 (GLP-1) in neurodegenerative diseases has raised impetus in investigating the repositioning of a dipeptidyl peptidase IV inhibitor, alogliptin (ALO), as an effective treatment for PD. As a result, the focus of this research was to assess the effect of ALO in a rat rotenone (ROT) model of PD. For 21 days, ROT (1.5 mg/kg) was delivered subcutaneously every other day. ALO (30 mg/kg/day), delivered by gavage for …

'Induction Of Apoptosis, Cytotoxicity And Radiosensitization By Novel 3,4-Dihydroquinazolinone Derivatives, Eman Ramadan, Amira Khalil

Pharmacy

Twenty new quinazolinone derivatives bearing a piperonyl moiety were designed and synthesized. The structures of the target compounds were in agreement with the microanalytical and spectral data. Compounds 4-10, 13, 14 and 17-27 were screened for their cytotoxic activity against HepG-2 and MCF-7 cancer cell lines. The target compounds showed IC₅₀ in the range of 2.46-36.85 µM and 3.87-88.93 µM for HepG-2 and MCF-7, respectively. The promising compounds 7, 19, 26 and 27 were selected to measure their EGFR inhibitory activity. The IC₅₀ values of the promising compounds were in the range of 146.9-1032.7 nM for EGFR in …

Comparison Of Standard And Environmental Dna Methods For Estimating Chinook Salmon Smolt Abundance In The Klamath River, California, Doyle Joseph Coyne

Cal Poly Humboldt theses and projects

Evaluating abundance of juvenile salmonids is critical to conservation and management. Current abundance estimation involves use of rotary screw traps and mark-recapture studies. Use of environmental DNA (eDNA) in water samples offers a noninvasive and less expensive approach that may potentially improve or eventually replace traditional monitoring. Here I evaluate the utility of eDNA to predict weekly abundance estimates of outmigrating Chinook salmon (Oncorhynchus tshawytscha) smolts in the Klamath River, California. A total of 15 water samples were collected per week over the 17-week smolt outmigration in both 2019 and 2020. Chinook salmon eDNA concentration in each water …

Competence Transcriptome Changes In Streptococcus Pneumoniae, Smitha Shambhu

Electronic Theses and Dissertations, 2020-2023

Streptococcus pneumoniae is a human commensal and the causative agent of pneumococcal disease. Pneumococci are naturally competent – able to uptake exogenous DNA from the environment and incorporate it into their genome through homologous and non-homologous recombination. Recombination has significantly shaped the evolutionary history of S. pneumoniae, as it allows pneumococci to rapidly adapt to interventions such as antibiotic therapy or vaccine introduction. Recombination frequencies vary considerably across pneumococcal populations; yet the underlying mechanisms for these variations are not well understood. Entry and exit into competence, a state in which the cell can uptake DNA, is tightly regulated through transcriptional …

ความต้องการทางการตลาดของเทคโนโลยีเครื่องควบแน่นแบบระเหยสำหรับระบบปรับอากาศในกลุ่มตลาดใหม่, กมลวรรณ บรรจงแก้ว

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

วัตถุประสงค์ของการวิจัยครั้งนี้ 1. ศึกษาลักษณะตลาดเครื่องปรับอากาศ แนวโน้มการตลาด และลักษณะของตลาดผลิตภัณฑ์ เครื่องควบแน่นแบบระเหยสำหรับระบบปรับอากาศ (Evaporative Condensing Unit) ที่บริษัทต้องการพัฒนา 2. ศึกษาแนวทางการพัฒนาตลาดสำหรับผลิตภัณฑ์ใหม่ในสองรูปแบบ คือ แบบติดตั้งเพิ่มเติม (Retrofitting) และแบบที่ติดตั้งสำเร็จ (Built-in) โดยเก็บข้อมูลจากการสัมภาษณ์กลุ่มตัวอย่างผู้จัดการดูแลงานโครงการภาคใต้ และผู้เชี่ยวชาญด้านการติดตั้งซ่อมบำรุงระบบเครื่องปรับอากาศ 10 คน, บุคคลทั่วไป 10 คน และเจ้าของสถานประกอบการ 4 คน ร่วมกับการเก็บข้อมูลโดยใช้แบบสอบถาม 2 ชุด ชุดแรกสำหรับผู้จัดการดูแลงานโครงการภาคใต้ และผู้เชี่ยวชาญด้านการติดตั้งซ่อมบำรุงระบบเครื่องปรับอากาศ 10 คน ชุดที่ 2 สำหรับกลุ่มตัวอย่างผู้ที่เคยซื้อ หรือกำลังตัดสินใจซื้อผลิตภัณฑ์ใหม่ 400 คน โดยใช้วิธีแจกแบบสอบถามออนไลน์ในการเก็บข้อมูล ซึ่งใช้สถิติพรรณนา และสถิติอนุมาน ในการวิเคราะห์รายงานผล ผลการวิจัยพบว่า ปัจจุบันมีการใช้เครื่องปรับอากาศที่มีเครื่องควบแน่นแบบระเหย เพียงร้อยละ 0.8 โดยผู้บริโภคส่วนใหญ่มีพฤติกรรมค้นหาข้อมูลของผลิตภัณฑ์ประเภทเดียวกันจากหลายยี่ห้อ จากผู้จัดจำหน่ายหลายแห่งก่อนการตัดสินใจซื้อ ซึ่งส่วนใหญ่สนใจจะซื้อผลิตภัณฑ์ใหม่แบบที่ติดตั้งสำเร็จ (Built-in) และแบบติดตั้งเพิ่มเติม (Retrofitting) ช่วง 6-10 ปี ข้างหน้าโดยผู้บริโภคจะยอมจ่ายเพื่อซื้อเครื่องปรับอากาศที่มีเครื่องควบแน่นแบบระเหยแบบที่ติดตั้งสำเร็จ (Built-in) ขนาด 25,000 btu/h ประเภทธรรมดา (Fix speed) ในช่วงราคา 30,252-31,421 บาท สำหรับเครื่องปรับอากาศที่มีเครื่องควบแน่นแบบระเหยแบบที่ติดตั้งสำเร็จ (Built-in) ขนาด 36,000 btu/h ประเภทธรรมดา (Fix speed) ในช่วงราคา 47,369-52,020 บาท สำหรับผู้บริโภคกลุ่มเจ้าของกิจการจะยอมจ่ายเพื่อซื้อเครื่องปรับอากาศที่มีเครื่องควบแน่นแบบระเหยแบบที่ติดตั้งสำเร็จ (Built-in) ขนาด 25,000 btu/h ประเภทธรรมดา (Fix speed) ไม่เกิน 37,828 บาท สำหรับเครื่องปรับอากาศที่มีเครื่องควบแน่นแบบระเหยแบบที่ติดตั้งสำเร็จ (Built-in) ขนาด 36,000 btu/h ประเภทธรรมดา (Fix speed) ไม่เกิน 66,587.81 …

การพัฒนาหน่วยควบแน่นแบบระเหยสำหรับระบบปรับอากาศขนาดกลาง, ไปรยา ทองเหลือง

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

หน่วยควบแน่นแบบระเหย (Evaporative condenser unit) คือการอาศัยหลักการระเหยของน้ำมาช่วยเพิ่มความสามารถในการระบายความร้อนของเครื่องปรับอากาศ งานวิจัยนี้มีจุดประสงค์เพื่อพัฒนาหน่วยควบแน่นแบบระเหยและศึกษาปัจจัยที่มีผลต่อการเพิ่มประสิทธิภาพของเครื่องปรับอากาศ ได้แก่ ความชื้นสัมพัทธ์โดยรอบ (Ambient relative humidity) และอัตราการไหลของน้ำ (Water flow rate) โดยออกแบบคอยล์เสริมเพื่อเป็นบริเวณที่ใช้ในการฉีดพ่นน้ำ พบว่าการเชื่อมต่อคอยล์เสริมบริเวณดิสชาร์จสูงกว่าบริเวณลิควิด 3.5% การทดลองเพื่อศึกษาเปลี่ยนแปลงค่าความชื้นสัมพัทธ์ควบคุมโดยปรับค่าความเร็วอากาศพบว่าเมื่อความเร็วอากาศลดลงทำให้ความชื้นสัมพัทธ์เพิ่มขึ้น และความสามารถในการระบายความร้อนมีค่าสูงสุดในช่วงความชื้นสัมพัทธ์ระหว่าง 73.1% ถึง 80.9% การทดลองศึกษาการเปลี่ยนแปลงอัตราการไหลของน้ำพบว่าพื้นที่สัมผัสบริเวณผิวคอยล์เสริมมากจะสามารถลดอุณหภูมิของสารทำความเย็นได้มากเช่นกัน นอกจากนี้ขนาดของหัวฉีดพ่นและความชื้นสัมพัทธ์ยังส่งผลต่อการลดลงของอุณหภูมิสารทำความเย็นอีกด้วย ยิ่งไปกว่านั้นในการทดลองเพื่อหาประสิทธิภาพการทำงานของต้นแบบหน่วยควบแน่นแบบระเหยพบว่าสามารถเพิ่มประสิทธิภาพจากเครื่องปรับอากาศที่ระบายความร้อนด้วยลมปกติได้สูงถึง 20.36%

Laser-Scribed Graphene Electrodes As Inflammatory Biosensors (Laserflame), Pei Shee Tan

Theses

Laser-scribed graphene electrodes (LSGE) are a low cost, portable, flexible and ideal electrochemical platform approach as point of care biosensors. It is anticipated that integrating the detection of immune cell inflammatory cytokines with LSGEs may present a useful diagnostic platform for managing the risk of inflammatory diseases as early detection of inflammatory molecules could significantly improve the treatment and outcome of diseases induced by protracted inflammation, such as cancer, asthma and rheumatoid arthritis. This study proposed LSGE first time novel use in the detection of an inflammatory cytokine released by immune cells (monocyte THP-1 cell line), with high sensitivity and …

Titanium Dioxide Nanoparticles Binding To Human Blood Plasma Proteins, Morgan Miller

Williams Honors College, Honors Research Projects

Titanium Dioxide (TiO₂, titania) nanoparticles are widely studied in cosmetology, food administration, and medical fields. This is due to the nanoparticles’ suitable properties, specific combination of strength and high corrosion resistance. With the increasing attention to these particles, there is concern with potential health complications. Some of the complications involved with titania nanoparticles include blood clots and immune reactions (Sit et al., 2019). In this study, we continue the study conducted in the Sahai research group (J. Chen. MS thesis, 2020), on the binding of titania nanoparticles with blood plasma proteins, focusing on potential effects of shape only. …

Covid-19 And Biocybersecurity's Increasing Role On Defending Forward, Xavier Palmer, Lucas N. Potter, Saltuk Karahan

Electrical & Computer Engineering Faculty Publications

The evolving nature of warfare has been changing with cybersecurity and the use of advanced biotechnology in each aspect of the society is expanding and overlapping with the cyberworld. This intersection, which has been described as “biocybersecurity” (BCS), can become a major front of the 21st-century conflicts. There are three lines of BCS which make it a critical component of overall cybersecurity: (1) cyber operations within the area of BCS have life threatening consequences to a greater extent than other cyber operations, (2) the breach in health-related personal data is a significant tool for fatal attacks, and (3) health-related misinformation …

Long Non-Coding Rna Meg3 Deficiency Impairs Glucose Homeostasis And Insulin Signaling By Inducing Cellular Senescence Of Hepatic Endothelium In Obesity, Xiao Cheng, Mohamed Sham Shihabudeen Haider Ali, Matthew Moran, Martonio Ponte Viana, Sarah L. Schlichte, Matthew C. Zimmerman, Oleh Khalimonchuk, Mark W. Feinberg, Xinghui Sun

Department of Biochemistry: Faculty Publications

Obesity-induced insulin resistance is a risk factor for diabetes and cardiovascular disease. However, the mechanisms underlying endothelial senescence in obesity, and how it impacts obesity-induced insulin resistance remain incompletely understood. In this study, transcriptome analysis revealed that the long non-coding RNA (lncRNA) Maternally expressed gene 3 (Meg3) is one of the top differentially expressed lncRNAs in the vascular endothelium in diet-induced obese mice. Meg3 knockdown induces cellular senescence of endothelial cells characterized by increased senescence-associated β–galactosidase activity, increased levels of endogenous superoxide, impaired mitochondrial structure and function, and impaired autophagy. Moreover, Meg3 knockdown causes cellular senescence of hepatic endothelium in …

Teaching Metabolism In Upper-Division Undergraduate Biochemistry Courses Using Online Computational Systems And Dynamical Models Improves Student Performance, Christine S. Booth, Changsoo Song, Michelle E. Howell, Achilles Rasquinha, Aleš Saska, Resa M. Helikar, Sharmin M. Sikich, Brain A. Couch, Karin Van Dijk, Rebecca Roston, Tomáš Helikar

Department of Biochemistry: Faculty Publications

Understanding metabolic function requires knowledge of the dynamics, interdependence, and regulation of metabolic networks. However, multiple professional societies have recognized that most undergraduate biochemistry students acquire only a surface-level understanding of metabolism. We hypothesized that guiding students through interactive computer simulations of metabolic systems would increase their ability to recognize how individual interactions between components affect the behavior of a system under different conditions. The computer simulations were designed with an interactive activity (i.e., module) that used the predict–observe–explain model of instruction to guide students through a process in which they iteratively predict outcomes, test their predictions, modify the interactions …

The Need For Research-Grade Systems Modeling Technologies For Life Science Education, Tomáš Helikar

Department of Biochemistry: Faculty Publications

The coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic not only challenged deeply-rooted daily patterns but also put a spotlight on the role of computational modeling in science and society. Amid the impromptu upheaval of in-person education across the world, this article aims to articulate the need to train students in computational and systems biology using research-grade technologies. ...

Life sciences education needs multiple technical infrastructures explicitly designed to support this field’s vast computational needs. Developing and sustaining effective, scientifically authentic educational technologies is not easy. It requires expertise in software development and the scientific domain as well as in education and education …