Open Access. Powered by Scholars. Published by Universities.®

Microbiology Commons™

Open Access. Powered by Scholars. Published by Universities.®

8,152 Full-Text Articles 18,399 Authors 3,792,094 Downloads 269 Institutions

All Articles in Microbiology

Faceted Search

8,152 full-text articles. Page 159 of 311.

The Vaccinia Virus (Vacv) B1 And Cellular Vrk2 Kinases Promote Vacv Replication Factory Formation Through Phosphorylation-Dependent Inhibition Of Vacv B12, Annabel T. Olson, Zhigang Wang, Annabel Olson, Alexandria C. Linville, Brianna L. Bullard, Eric A. Weaver, Clinton Jones, Matthew S. Wiebe 2019 University of Nebraska - Lincoln

The Vaccinia Virus (Vacv) B1 And Cellular Vrk2 Kinases Promote Vacv Replication Factory Formation Through Phosphorylation-Dependent Inhibition Of Vacv B12, Annabel T. Olson, Zhigang Wang, Annabel Olson, Alexandria C. Linville, Brianna L. Bullard, Eric A. Weaver, Clinton Jones, Matthew S. Wiebe

Nebraska Center for Virology: Faculty Publications

Comparative examination of viral and host protein homologs reveals novel mechanisms governing downstream signaling effectors of both cellular and vi- ral origin. The vaccinia virus B1 protein kinase is involved in promoting multiple facets of the virus life cycle and is a homolog of three conserved cellular enzymes called vaccinia virus-related kinases (VRKs). Recent evidence indicates that B1 and VRK2 mediate a com- mon pathway that is largely uncharacterized but appears independent of previous VRK substrates. Interestingly, separate studies described a novel role for B1 in inhibiting vac- cinia virus protein B12, which otherwise impedes an early event in the …


Histone Acetylation Increases In Response To Ferulic, Gallic, And Sinapic Acids Acting Synergistically In Vitro To Inhibit Candida Albicans Yeast‐To‐Hyphae Transition, Cristiane R. S. Câmara, Qin-Yin Shi, Matthew Pedersen, Richard Zbasnik, Kenneth Nickerson, Vicki Schlegel 2019 University of Nebraska - Lincoln

Histone Acetylation Increases In Response To Ferulic, Gallic, And Sinapic Acids Acting Synergistically In Vitro To Inhibit Candida Albicans Yeast‐To‐Hyphae Transition, Cristiane R. S. Câmara, Qin-Yin Shi, Matthew Pedersen, Richard Zbasnik, Kenneth Nickerson, Vicki Schlegel

Department of Food Science and Technology: Faculty Publications

Novel treatments are needed to prevent candidiasis/candidemia infection due to the emergence of Candida species resistant to current antifungals. Considering the yeast-to‐hyphae switch is a critical factor to Candida albicans virulence, phenols common in plant sources have been reported to demonstrating their ability to prevent dimorphism. Therefore, phenols present in many agricultural waste stress (ferulic (FA) and gallic (GA) acid) were initially screened in isolation for their yeast‐to‐hyphae inhibitory properties at times 3, 6, and 24 hr. Both FA and GA inhibited 50% of hyphae formation inhibitory concentration (IC50) but at a concentration of 8.0 ± 0.09 and …


Improved Methods For The Quantification Of Viable Ascaris Suum And Application To Biosolids, Tanner Keyzers 2019 Michigan Technological University

Improved Methods For The Quantification Of Viable Ascaris Suum And Application To Biosolids, Tanner Keyzers

Dissertations, Master's Theses and Master's Reports

The current method for detection of Ascaris ova in biosolids and wastewater has several drawbacks including being labor and time intensive as well as being difficult to quantify viable ova that have larvated during treatment. The goal of this thesis was to improve several methods for the detection and quantification of Ascaris ova during long term-storage of biosolids including improvement of quantifying viable ova using a heat and bleach treatment to promote movement of larvae inside of ova, and comparison of the traditional microscopic method with qPCR and PMA-qPCR to prevent the false-positive results. Improved methods to promote movement of …


การต้านการเจริญและการผลิตสารพิษจากราของ Aspergillus Flavus และ Aspergillus Carbonarius โดยยีสต์ปฏิปักษ์, พิชามญชุ์ โสมา 2019 คณะวิทยาศาสตร์

การต้านการเจริญและการผลิตสารพิษจากราของ Aspergillus Flavus และ Aspergillus Carbonarius โดยยีสต์ปฏิปักษ์, พิชามญชุ์ โสมา

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

งานวิจัยนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษากลไกสำคัญในการยับยั้งการเจริญและการผลิตอะฟลาทอกซินบี 1 และโอคราทอกซินเอของ Aspergillus flavus และ Aspergillus carbonarius ตามลำดับ โดยใช้ยีสต์ปฏิปักษ์สามชนิด ได้แก่ Wickerhamomyces anomalus MSCU 0652, Saccharomyces cerevisiae MSCU 0654 และ Kluyveromyces marxianus MSCU 0655 จากผลการวิจัยพบว่า ยีสต์ปฏิปักษ์ทั้งสามชนิดสามารถยับยั้งการเจริญและการผลิตสารพิษจากราได้อย่างมีประสิทธิภาพแตกต่างกัน โดยมีกลไกสำคัญ ได้แก่ การสร้างสารประกอบอินทรีย์ระเหยง่ายที่มีผลต่อลักษณะทางสัณฐานวิทยาของเส้นใยรา และเมื่อศึกษาปัจจัยที่ส่งผลต่อการสร้างสารประกอบอินทรีย์เหยง่ายของยีสต์ปฏิปักษ์พบว่า W. anomalus MSCU 0652 มีประสิทธิภาพในการสร้างสารประกอบอินทรีย์ระเหยง่ายเพื่อยับยั้งการเจริญและการผลิตอะฟลาทอกซินบี 1 ของ A. flavus M3T8R4G3 ได้ดีที่สุดเมื่อเจริญบนอาหารที่ค่าความเป็นกรด-เบสเท่ากับ 5 (81.27±1.23 เปอร์เซ็นต์) บ่มที่อุณหภูมิห้อง (81.38±1.80 เปอร์เซ็นต์) และค่าความเข้มข้นของอาหารเลี้ยงยีสต์ปกติ (82.86±1.14 เปอร์เซ็นต์) และลดการผลิตอะฟลาทอกซินบี 1 ได้ดีที่สุดเมื่อเจริญบนอาหารที่ค่าความเป็นกรด-เบสเท่ากับ 4.5 (99.91±0.01 เปอร์เซ็นต์) บ่มที่ 25 องศาเซลเซียส (99.73±0.21 เปอร์เซ็นต์) และค่าความเข้มข้นของอาหารเลี้ยงยีสต์ 0.5 เท่า (99.67±0.12 เปอร์เซ็นต์) สำหรับ A. carbonarius TK4.2 พบว่า W. anomalus MSCU 0652 มีประสิทธิภาพในการยับยั้งการเจริญและการผลิตสารพิษจากราได้ดีที่สุดเมื่อเลี้ยงบนอาหารที่ค่าความเป็นกรด-เบสเท่ากับ 5 (82.42±2.76 เปอร์เซ็นต์) บ่มที่อุณหภูมิห้อง (81.20±2.65 เปอร์เซ็นต์) และค่าความเข้มข้นของอาหารเลี้ยงยีสต์ปกติ (83.88±0.32 เปอร์เซ็นต์) และลดการผลิตโอคราทอกซินเอได้ดีที่สุดเมื่อเลี้ยงบนอาหารที่ค่าความเป็นกรด-เบสเท่ากับ 5 (99.91±0.07 เปอร์เซ็นต์) บ่มที่อุณหภูมิห้อง (99.92±0.01 เปอร์เซ็นต์) และค่าความเข้มข้นของอาหารเลี้ยงยีสต์ปกติ (99.97±0.01 เปอร์เซ็นต์) นอกจากนี้ เมื่อทดสอบความสามารถในการลดการปนเปื้อนสารพิษจากราพบว่า ตะกอนเซลล์ยีสต์ที่ไม่มีชีวิตของ S. cerevisiae …


การผลิตสารลดแรงตึงผิวชีวภาพจาก Bacillus Velezensis B49 และการยับยั้งราก่อโรคพืช, สิรภพ ภูมิภูติกุล 2019 คณะวิทยาศาสตร์

การผลิตสารลดแรงตึงผิวชีวภาพจาก Bacillus Velezensis B49 และการยับยั้งราก่อโรคพืช, สิรภพ ภูมิภูติกุล

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

ราก่อโรคพืชสามารถทำลายผลผลิตทางการเกษตรได้ทั่วโลก การใช้วิธีทางชีวภาพสามารถลดการใช้สารเคมีในการกำจัดราก่อโรคพืชได้ ราก่อโรคพืชที่พบส่วนใหญ่ ได้แก่ Acremonium furcatum, Colletotrichum gloeosporioides, Fusarium moniliforme, Fusarium proliferatum, Fusarium solani, Phytophthora palmivora และ Pyricularia oryzae การศึกษาก่อนหน้านี้พบว่า Bacillus velezensis B49 สามารถยับยั้งราที่ก่อโรคในพืช และสามารถสร้างสารลดแรงตึงผิวชีวภาพได้ งานวิจัยนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อเพิ่มการผลิตสารลดแรงตึงผิวชีวภาพจาก B. velezensis B49 และทดสอบการยับยั้งราก่อโรคพืชด้วยสารลดแรงตึงผิวชีวภาพที่ผลิตได้ ผลการทดสอบการยับยั้งการเจริญของราก่อโรคพืชโดยใช้เทคนิคการขีดเชื้อและเทคนิคผสมน้ำเลี้ยงเชื้อของ B. velezensis B49 แสดงความสามารถในการยับยั้งการเจริญของราต่อโรคพืชทั้ง 7 ชนิด ทดสอบสมบัติการผลิตสารลดแรงตึงผิวชีวภาพของ B. velezensis B49 โดยใช้ 4 วิธีที่แตกต่างกัน ได้แก่ การทดสอบการยุบตัวของน้ำเลี้ยงเชื้อบนฟิล์มน้ำมัน, การทดสอบการแตกของเม็ดเลือดแดง, การทดสอบการกระจายตัวของน้ำมัน และการทดสอบการเกิดอิมัลชัน พบว่า B. velezensis B49 ให้ผลบวกกับทั้ง 4 วิธี ซึ่งยืนยันได้ว่า B. velezensis B49 สามารถผลิตสารลดแรงตึงผิวชีวภาพได้ การทดสอบผลของความเป็นกรดเบสที่มีต่อสมบัติของสารลดแรงตึงผิวชีวภาพ พบว่าที่ความเป็นกรดเบสระหว่าง pH 2 – 10 ทำให้เกิดอิมัลชันไม่แตกต่างกัน แต่เมื่อความเป็นกรดเบสสูงขึ้น ส่งผลทำให้การเกิดอิมัลชันลดลงจนกระทั่งไม่เกิดอิมัลชันเลย ส่วนการทดสอบผลของอุณหภูมิที่มีต่อสมบัติของสารลดแรงตึงผิวชีวภาพของ B. velezensis B49 พบว่า อุณหภูมิไม่มีผลต่อสมบัติการเกิดอิมัลชัน การทดสอบผลของแหล่งคาร์บอนและไนโตรเจนที่มีต่อการผลิตสารลดแรงตึงผิวชีวภาพในอาหาร Mineral salt solution พบว่า B. velezensis B49 สามารถเจริญได้ในแหล่งคาร์บอน ได้แก่ กลูโคส, ฟรุกโทส และซูโครส ส่วนแหล่งไนโตรเจน ได้แก่ แอมโมเนียมไนเตรต และแอมโมเนียมซัลเฟต อย่างไรก็ตาม อาหารสูตรสมบูรณ์ให้ผลการเกิดอิมัลชันสูงกว่า ความสัมพันธ์ระหว่างการเจริญและการเกิดอิมัลชันต่อเวลา พบว่า B. velezensis B49 …


Efficacy Of Cold Plasma For Direct Deposition Of Antibiotics As A Novel Approach For Localized Delivery And Retention Of Effect, Agatha Los, Dana Ziuzina, Daniela Boehm, Lu Han, Denis O'Sullivan, Liam O'Neill, Paula Bourke 2019 Technological University Dublin

Efficacy Of Cold Plasma For Direct Deposition Of Antibiotics As A Novel Approach For Localized Delivery And Retention Of Effect, Agatha Los, Dana Ziuzina, Daniela Boehm, Lu Han, Denis O'Sullivan, Liam O'Neill, Paula Bourke

Articles

Antimicrobial coating of medical devices has emerged as a potentially effective tool to prevent or ameliorate device-related infections. In this study the plasma deposition process for direct deposition of pharmaceutical drugs on to a range of surfaces and the retention of structure function relationship and antimicrobial efficacy against mono-species biofilms were investigated. Two selected sample antibiotics—ampicillin and gentamicin, were deposited onto two types of surfaces—polystyrene microtiter plates and stainless steel coupons. The antimicrobial efficacy of the antibiotic-coated surfaces was tested against challenge populations of both planktonic and sessile Escherichia coli and Pseudomonas aeruginosa, with responses monitored for up to …


The Abundance Of Akkermansia Muciniphila And Its Relationship With Sulphated Colonic Mucins In Health And Ulcerative Colitis, Helen Earley, Grainne Earley, Aine Balfe, J. Calvin Coffey, Desmond C. Winter, Ronan O'Connell 2019 University College Dublin

The Abundance Of Akkermansia Muciniphila And Its Relationship With Sulphated Colonic Mucins In Health And Ulcerative Colitis, Helen Earley, Grainne Earley, Aine Balfe, J. Calvin Coffey, Desmond C. Winter, Ronan O'Connell

Articles

Akkermansia muciniphila utilises colonic mucin as its substrate. Abundance is reduced in ulcerative colitis (UC), as is the relative proportion of sulphated mucin in the mucus gel layer (MGL). It is unknown if these phenomena are related, however reduced sulphated mucins could contribute to reduced abundance, owing to a lack of substrate. The aim of this study was to quantify A. muciniphila within the MGL and to relate these findings with markers of inflammation and the relative proportion of sulphomucin present. Colonic biopsies and mucus brushings were obtained from 20 patients with active UC (AC), 14 with quiescent UC (QUC) …


การตรึงยีสต์จากน้ำทะเลย่อยสลายดีเซลบนเปลือกหอยแครงและการประยุกต์, สุรสิทธิ์ พฤกษวานิช 2019 คณะวิทยาศาสตร์

การตรึงยีสต์จากน้ำทะเลย่อยสลายดีเซลบนเปลือกหอยแครงและการประยุกต์, สุรสิทธิ์ พฤกษวานิช

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

จุลินทรีย์สายพันธุ์ SP21 ที่คัดแยกได้จากน้ำทะเลปนเปื้อนน้ำมัน จากอำเภอดอนสัก จังหวัดสุราษฎร์ธานี ลักษณะทางสัณฐานวิทยาและการเปรียบเทียบลำดับนิวคลิโอไทด์ 26s rDNA พบว่าสายพันธุ์ SP21 มีความใกล้เคียงกับยีสต์ Candida viswanathii 100% C. viswanathii สายพันธุ์ SP21 สามารถย่อยสลาย 1% ดีเซล ในน้ำทะเลสังเคราะห์ (SSW) ได้ 96.18 ± 1.2% ใน 7 วัน ในขณะที่ชุดควบคุมที่ไม่เติมยีสต์ดีเซลลดลงเพียง 11.80 ± 6.13% เมื่อตรึง C. viswanathii สายพันธุ์ SP21 บนเปลือกหอยแครง พบว่าสามารถตรึงเซลล์ได้ 5.70 log CFU/กรัม เมื่อบ่มเซลล์ร่วมกับเปลือกหอย 1 ชั่วโมง และสามารถตรวจพบเซลล์ตรึงโดยกล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอนแบบส่องกราด เซลล์ตรึงสามารถย่อยสลาย 1% ดีเซล ในอาหารน้ำทะเลสังเคราะห์ (SSW) ได้ 98.70 ± 0.57% ในขณะที่ชุดทดลองเปลือกหอยแครงที่ไม่ตรึงเชื้อดีเซลลดลงเพียง 1.65 ± 7.34% การตรึงเซลล์ช่วยเพิ่มประสิทธิภาพการย่อยสลายดีเซลที่ความเข้มข้นสูง 3% และ 5% ได้ 94.06 ± 5.94% และ 86.50 ± 13.70% ในเวลา 7 วัน ตามลำดับ ในขณะที่เซลล์อิสระสามารถย่อยสลายได้เพียง 85.12 ± 1.67% และ 51.69 ± 1.79% เซลล์ตรึงยังสามารถย่อยสลาย 1% ดีเซล ในน้ำกร่อยสังเคราะห์ (SBW) และน้ำจืดสังเคราะห์ (CFMM) ได้ 93.21 ± 0.76% และ 90.25 ± 6.93% …


Mine Reclamation Using Biofuel Crops: Insights Into The Microbial Ecology Of The Switchgrass (Panicum Virgatum) Microbiome, Brianna L. Mayfield 2019 West Virginia University

Mine Reclamation Using Biofuel Crops: Insights Into The Microbial Ecology Of The Switchgrass (Panicum Virgatum) Microbiome, Brianna L. Mayfield

Graduate Theses, Dissertations, and Problem Reports (ETD)

Bioenergy crop production has steadily increased due to growing political support for renewable energy, thus initiating a demand to find alternative agricultural land. An innovative option is the use of marginal soils, such as reclaimed mine lands, to produce bioenergy crops. Switchgrass (Panicum virgatum) is a promising bioenergy crop that can be grown on marginal lands due to its robust growth in various soil types and climates. However, little is known regarding plant-microbe interactions among switchgrass systems within reclaimed mine lands. A study conducted in 2008 grew switchgrass on high- and low- quality reclaimed mine sites (Hampshire and …


Soil Microbial Succession Following Surface Mining Is Governed Primarily By Deterministic Factors, Jennifer Lynne Kane 2019 West Virginia University

Soil Microbial Succession Following Surface Mining Is Governed Primarily By Deterministic Factors, Jennifer Lynne Kane

Graduate Theses, Dissertations, and Problem Reports (ETD)

Understanding the successional dynamics governing soil microbial community assembly is a promising way to advance development of remediation strategies for lands disturbed by anthropogenic activities. The environmental and ecological influences shaping these communities following soil disturbance remain only partially understood. One example of a physical anthropogenic disturbance is extraction of minerals such as coal by surface mining. Surface mining removes natural soils and these soils may be replaced immediately on adjacent reclaimed areas or they may be stored in piles for later use. During reclamation, the soil is replaced on the landscape and the site is re-vegetated with grasses and …


Context Is Everything: An Investigation Of Spanish River Carbonatite And Its Effects On Soil-Plant-Microorganism Systems, James MC Jones 2019 Wilfrid Laurier University

Context Is Everything: An Investigation Of Spanish River Carbonatite And Its Effects On Soil-Plant-Microorganism Systems, James Mc Jones

Theses and Dissertations (Comprehensive)

With growing concerns about agricultural sustainability and food security, the use of rock fertilizers and agrominerals is receiving renewed interest. A wide variety of geological resources have been proposed as crop nutrient sources, with silicate rocks the predominant focus. Carbonatite rocks are known to weather more readily than silicate rocks; yet, they have received relatively little attention as it is thought their high Ca and Mg contents hinder effective nutrient release. However, there is strong evidence that the nutrients within carbonatite rocks are easily accessible to plants, and that these rocks have noticable effects on crop plant growth. Here I …


Cationic Biaryl 1,2,3-Triazolyl Peptidomimetic Amphiphiles: Synthesis, Antibacterial Evaluation And Preliminary Mechanism Of Action Studies, Andrew J. Tague, Papanin Putsathit, Katherine A. Hammer, Steven M. Wales, Daniel R. Knight, Thomas V. Riley, Paul A. Keller, Stephen G. Pyne 2019 Edith Cowan University

Cationic Biaryl 1,2,3-Triazolyl Peptidomimetic Amphiphiles: Synthesis, Antibacterial Evaluation And Preliminary Mechanism Of Action Studies, Andrew J. Tague, Papanin Putsathit, Katherine A. Hammer, Steven M. Wales, Daniel R. Knight, Thomas V. Riley, Paul A. Keller, Stephen G. Pyne

Research outputs 2014 to 2021

Synthetic small molecular antimicrobial peptidomimetics represent a promising new class of potential antibiotics due to their membrane-disrupting ability and their decreased propensity for bacterial resistance. A library of 43 mono- and di-cationic biaryl 1,2,3-triazolyl peptidomimetics was designed and synthesized based upon previously established lead biarylpeptidomimetics and a known pharmacophore. A reliable, facile and modular synthetic pathway allowed for the efficient synthesis of multiple unique scaffolds which were subjected to divergent derivatization to furnish the amphiphilic compounds. In vitro testing revealed enhanced antibacterial efficacy against a range of pathogenic bacteria, including bacterial isolates with methicillin, vancomycin, daptomycin, or multi-drug resistance. Preliminary …


Structural Investigation Of Bcsc: Insight Into Periplasmic Transport During Cellulose Export, William Scott, Joel T. Weadge 2019 Wilfrid Laurier University

Structural Investigation Of Bcsc: Insight Into Periplasmic Transport During Cellulose Export, William Scott, Joel T. Weadge

Theses and Dissertations (Comprehensive)

A biofilm can be defined by a community of microbes coexisting within a self-produced protective polymeric matrix. Exopolysaccharide (EPS) is a key component in biofilms and a contributor to their virulence and pathogenicity. The cellulose bacterial synthesis complex is one such EPS system that is found in many Enterobacteriaceae,including Escherichia coli and Salmonella spp., and is responsible for the production and secretion of the EPS cellulose. BcsC is the periplasmic protein responsible for the export of the exopolysaccharide cellulose and was the focus of this research. Sequence homology comparisons and structural predictions between BcsC, and the previously characterized alginate …


Riparian Zone Soil Microbial Community Dynamics: Interactions With Nutrient Loadings, James Bannister 2019 Wilfrid Laurier University

Riparian Zone Soil Microbial Community Dynamics: Interactions With Nutrient Loadings, James Bannister

Theses and Dissertations (Comprehensive)

Riparian zones are a type of wetland described as the interface between land and a body of water such as a river or stream. Riparian zones are effective buffers against anthropogenic pollutants and nutrient loads from non-point sources that can greatly diminish water quality. Riparian zones can host a variety of plant species and associated microbial communities. The combined biological processes of plants, bacteria, and arbuscular mycorrhizal fungi (AMF) are key to nutrient cycling and nutrient removal in riparian zones. As such, understanding the factors that influence them is critical for watershed management. This research is targeted at obtaining a …


Biogeochemical Response To Vegetation And Hydrologic Change In An Alaskan Boreal Fen Ecosystem, Danielle L. Rupp 2019 Michigan Technological University

Biogeochemical Response To Vegetation And Hydrologic Change In An Alaskan Boreal Fen Ecosystem, Danielle L. Rupp

Dissertations, Master's Theses and Master's Reports

Boreal peatlands store approximately one third of the earth’s terrestrial carbon, locked away in currently waterlogged and frozen conditions. Peatlands of boreal and arctic ecosystems are affected increasingly by shifting hydrology caused by climate change. The consequences of these relatively rapid ecosystem changes on carbon cycling between the landscape and the atmosphere could provide an amplifying feedback to climate warming. Alternatively, the advancement of terrestrial vegetation into once waterlogged soils could uptake carbon as a sink. Previous work suggests that fens will become an increasingly dominant landscape feature in the boreal. However, studies investigating fens, their response to hydrologic and …


The Effects Of Warming On Carbon And Microbial Community Wetland Dynamics At Turnbull National Wildlife Refuge, Washington, Marissa A. Medina 2019 Eastern Washington University

The Effects Of Warming On Carbon And Microbial Community Wetland Dynamics At Turnbull National Wildlife Refuge, Washington, Marissa A. Medina

EWU Masters Thesis Collection

Wetlands are biodiverse ecosystems that play a key role in the biogeochemical cycling of carbon. In the face of global warming, wetland hydroperiods could shift causing changes in their functionality. My field experiment surveyed 3 plots within 12 wetlands of each hydroperiod class (i.e. 12 permanent, 12 semi-permanent, 12 ephemeral). This survey was paired with a warming experiment by placing open top warming chambers on half of each wetland type. In chapter one, I compared carbon dynamics across hydroperiods and treatment by measuring soil organic carbon (in Summer 2018) and effluxes of carbon dioxide and methane (in Summer 2018, Fall …


Crystallographic Structure Determination Of Bacteriophage-Encoded Enzymes That Specifically Target Pathogenic Bacteria, Marta Sanz Gaitero 2019 Department of Biological Sciences, Cork Institute of Technology, Cork, Ireland.

Crystallographic Structure Determination Of Bacteriophage-Encoded Enzymes That Specifically Target Pathogenic Bacteria, Marta Sanz Gaitero

Theses

Antibiotic resistance is becoming a serious public health concern. Infections that some decades ago could be treated with antibiotics now sometimes do not respond to traditional treatment, causing higher mortality and economic losses. An alternative to the use of antibiotics are bacteria's natural predators, bacteriophages (or phages), and specifically their lytic enzymes. These proteins are produced by phages to degrade bacterial peptidoglycan to inject their genetic material into the bacteria (virion-associated peptidoglycan hydrolases) or to release their progeny once the infection is finished (endolysins). They can be applied exogenously to lyse Gram-positive bacteria or be genetically engineered to lyse Gram-negative …


Crystallographic Studies On Host-Interacting Proteins Of Phage K Virion, Antonio Pichel Beleiro 2019 Department of Biological Sciences, Cork Institute of Technology, Cork, Ireland

Crystallographic Studies On Host-Interacting Proteins Of Phage K Virion, Antonio Pichel Beleiro

Theses

Phage K is a lytic bacteriophage that infects a broad range of staphylococci, including some methicillin-resistant Staphylococcus aureus strains. Phage K attaches to its host via a baseplate. The contracted conformation of the baseplate contains a fiber and two receptorbinding proteins responsible for the interaction with the host. The native conformation of the baseplate also includes a tail central spike that shears off after contraction. The aim of the thesis is the structural characterization of phage K receptor-binding proteins and tail central spike. Experimentally, the thesis relies on crystallographic methods, which encompass: production of suitable sample, crystallization, diffraction, and data …


Phenotypic And Transcriptomic Characterization Of Colonial Phase Variation In The Cholera Pathogen Reveals A Novel Smooth Biofilm-Defective Form, Bliss Nicole Lambert 2018 Louisiana State University and Agricultural and Mechanical College

Phenotypic And Transcriptomic Characterization Of Colonial Phase Variation In The Cholera Pathogen Reveals A Novel Smooth Biofilm-Defective Form, Bliss Nicole Lambert

LSU Doctoral Dissertations

Biofilm formation, through the production of Vibrio polysaccharide (VPS), greatly enhances the environmental fitness and pathogenic success of Vibrio cholerae. As a result of phase variation, V. cholerae can switch from a smooth form to rugose, whose cells produce excess VPS, resulting in highly structured biofilms and greater resistance to stress. To further characterize the reversible process of phase variation, we isolated three colonial lineages. Each lineage began with a smooth parent, N16961, and contained a rugose variant derived from the parent, N16961R, as well as a smooth revertant of the rugose, N16961SD. We found clear phenotypic and transcriptomic …


Harnessing The Anopheles Microbiome To Conditionally Express Anti-Plasmodial Effectors During The Blood Meal, Jackie Shane 2018 Duquesne University

Harnessing The Anopheles Microbiome To Conditionally Express Anti-Plasmodial Effectors During The Blood Meal, Jackie Shane

Electronic Theses and Dissertations

The control of vector-borne diseases such as malaria has been an extremely important research subject for hundreds of years. Because of the complex lifecycles of the pathogens that cause these diseases, finding a comprehensive treatment or preventative strategy has proven extremely difficult. Malaria alone is responsible for almost half a million deaths annually, most of them children under 5 years old. This disease is caused by parasitic protists in the genus Plasmodium that are transmitted to humans from Anopheles sp. mosquitoes. Most preventative strategies that are in use today revolve around controlling the vectors, including bed nets, insecticides, and larval …


Digital Commons powered by bepress