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A Whole-Plant Approach To Identifying Sites Of Auxin Biosynthesis In Populus, Daniel Evanich

Botany Honors Papers

The plant hormone auxin regulates many processes throughout plant growth and development. Aboveground auxin biosynthesis is thought to occur exclusively in the shoot apex, where it then moves via polar auxin transport (PAT) down through developing vasculature in the stem. In contrast to the canonical view of the shoot apex as the sole site of auxin production, there is some evidence to suggest that other tissues contribute auxin to the stem. Woody plants in particular may require additional sources of auxin to support the extensive vascular development in the woody stem, but very little is known about whole-plant auxin dynamics …

A Fistful Of Polemoniaceae: New Names And Combinations, J. Mark Porter, Robert W. Patterson

Aliso: A Journal of Systematic and Floristic Botany

New taxa, names, and combinations are provided for five genera in Polemoniaceae: Dayia, Giliastrum, Leptosiphon, Linanthus, and Loeselia. Combinations include the transfer to Dayia of two species formerly included in Ipomopsis and one in Bryantiella (Dayia glutinosa, D. havardii, and D. sonorae), as well as the return of Giliastrum stewartii to species rank. A new name is offered for Linanthus aureus when transferred into Leptosiphon: Leptosiphon chrysanthus and its subspecies, L. chrysanthus subsp. decorus. New combinations for infraspecific taxa are made available for Linanthus californicus (subspp. glandulosus and tomentosus …

Changes In Plant Species Composition And Structure In Two Peri-Urban Nature Preserves Over 10 Years, Rebecca W. Dolan, Jessica D. Stepens, Marcia E. Moore

Scholarship and Professional Work - LAS

Peri-urban natural areas, at the boundaries of cities and adjacent agricultural/rural land, are subject to ecological threats endemic to both land use types. We used permanent plots to document changes in habitat quality by monitoring herbaceous-layer plant species presence and cover over a decade (1996/97 and 2007) in two peri-urban nature preserves in central Indiana, U.S.A. The preserves are comprised of different forest community types: wet-mesic depressional forest and mesic upland forest. Habitat characteristics, based on Floristic Quality Assessment parameters, showed only a single change for either preserve between survey years: wetness values were lower in the wet-mesic depressional site …

An Evolutionary Perspective On Human Cross-Sensitivity To Tree Nut And Seed Allergens, Amanda E. Fisher, Annalise M. Nawrocki

Aliso: A Journal of Systematic and Floristic Botany

Tree nut allergies are some of the most common and serious allergies in the United States. Patients who are sensitive to nuts or to seeds commonly called nuts are advised to avoid consuming a variety of different species, even though these may be distantly related in terms of their evolutionary history. This is because studies in the literature report that patients often display sensitivity to multiple nut species (cross-sensitivity) if they have an existing nut allergy. These reports suggest that cross-sensitivity in patients with nut allergies may be caused by an IgE antibody reacting with epitopes present in the seed …

Rarity In Astragalus: A California Perspective, Philip W. Rundel, Thomas R. Huggins, Barry A. Prigge, M. Rasoul Sharifi

Aliso: A Journal of Systematic and Floristic Botany

Astragalus (Fabaceae), the largest genus of plants in the world with an estimated 3270 species, is known for large numbers of rare endemic species. An inventory of patterns of climatic, topographic, and edaphic diversity of Astragalus taxa in California (98 native species and 144 named taxa) provides a means to understand the occurrence of rarity in relation to climatic equitability and regional species richness of congeneric taxa. Most taxa in the genus have relatively small ranges of distribution, with 50% restricted geographically to a single Jepson Bioregion. The California Native Plant Society lists 51 Astragalus taxa (35% of the native …

Obituary For Robert F. Thorne

Aliso: A Journal of Systematic and Floristic Botany

No abstract provided.

Cyperus Sanguinolentus Vahl, Gordon C. Tucker, Vicky M. Tucker

Specimens by Name

No abstract provided.

The Spanish And Mexican Baseline Of California Tree And Shrubland Distributions Since The Late 18th Century, Richard A. Minnich, Brett R. Goforth, Richard Minnich

Aliso: A Journal of Systematic and Floristic Botany

Historical distributions of 31 tree species, chaparral, and coastal sage scrub described by Spanish land explorers in the late eighteenth and early nineteenth centuries (1769–1806) and in land grant diseños (1784–1846) are reconstructed at 634 localities across central and southern California. This baseline predates most formal botanical surveys by nearly a century, allowing for assessment of vegetation change over the broadest time frame for comparison with pre-historical evidences and future distributions. Spanish accounts are compared with historical sources in the Mexican era (1821–1848), American settlement (1848–1929), and modern range maps of the 1929–1934 Vegetation Type Map (VTM) survey. Among tree …

Phylogeny Of Dyschoriste (Acanthaceae), Noravit Chumchim, Lucinda A. Mcdade, Amanda E. Fisher

Aliso: A Journal of Systematic and Floristic Botany

The pantropical and poorly known genus Dyschoriste (Acanthaceae) is sister to Strobilanthopsis within subtribe Petalidiinae. The present study included 38 accessions of 28 species as sources of DNA data for one nuclear (nrITS) and four chloroplast (intergenic spacers: psbA-trnH, trnS-trnG, ndhF-rpl32, rpl32- trnL^(uag)) regions to provide an estimate of the phylogeny of the genus. We found that Dyschoriste is strongly supported as monophyletic inclusive of Apassalus, Chaetacanthus, and Sautiera. Within Dyschoriste, three geographically cohesive lineages were recovered with moderate to strong support: a mainland African clade, a Caribbean and southeastern United …

Riqueza De Helmintos Parásitos De Vertebrados Silvestres Del Estado De Hidalgo, México, Jorge Falcón-Ordaz, Scott Monks, Griselda Pulido-Flores, Luis García-Prieto, Georgina Lira-Guerrero

Estudios en Biodiversidad

La diversidad de helmintos parásitos de vertebrados del estado de Hidalgo, en México es poco conocida, a pesar de que su estudio se inició desde 1937. Asimismo, mucha de la información generada se ha publicado de manera dispersa, lo que dificulta aún más el establecer con precisión los valores actuales. Por ello, el objetivo de este trabajo fue determinar la riqueza de la fauna helmintológica asociada a vertebrados silvestres de Hidalgo. Para alcanzar dicho objetivo, se realizaron tres acciones: 1) recopilación bibliográfica retrospectiva de información; 2) consulta al acervo de diversas colecciones científicas nacionales e internacionales, e 3) incorporación de …

Calidad Del Agua En La Subcuenca Fluvial La Garita, Acapulco, Guerrero Por Monitoreo Con Insectos, Ana Yolanda Rosas-Acevedo, Audel Sánchez-Infante, José Luis Rosas-Acevedo

Estudios en Biodiversidad

La subcuenca La Garita (Región Hidrológica: Rh19Ac) ha sufrido la influencia del hombre, presenta escorrentía y momentos de estiaje, además de puntos aislados de contaminación por basura y descargas. Se realizó un monitoreo de insectos. Se exploró la posibilidad del uso del índice BMWP (Biological Monitoring Working Party), para arroyos y ríos, en la determinación de la calidad del agua y del ecosistema. En la parte alta o cabecera (BMWP=122) correspondió a excelente (ecosistema no impactado), en la zona media o de transferencia (BMWP-CR=118) fue buena (ecosistema no alterado de manera sensible) y en la parte baja o zona de …

Problemática De Contaminación En La Zona Agrícola De La Reserva De La Biosfera Barranca De Metztitlán, Hidalgo, México, Maritza López-Herrera, Leticia Romero-Bautista, Nahara Ayala-Sánchez, Irma E. Soria-Mercado, Amelia Portillo-López

Estudios en Biodiversidad

El presente trabajo se generó con el objetivo de dar a conocer la problemática que existe actualmente en una zona agrícola de gran importancia en el estado de Hidalgo, la “Vega de Metztitlán”, zona que forma parte de la Reserva de la Biosfera Barranca de Metztitlán, sitio declarado como reserva federal. El aporte de agua residual que se hace a través de los acuíferos que irrigan a la zona, ha generado que este sitio se vea expuesto a un gran riesgo de contaminación por metales pesados, hidrocarburos y demás contaminantes, los cuáles quedan biodisponibles para las plantas e indirectamente existe …

Los Hongos Poliporoides De La Subcuenca Del Río Metztitlán, Hidalgo, México, Leticia Romero-Bautista, Miguel Ángel Islas-Santillán, Maritza López-Herrera, Nahara Ayala-Sánchez, Irma Estela Soria-Mercado, Amelia Portillo-López, Tania Raymundo-Ojeda, Ricardo Valenzuela-Garza

Estudios en Biodiversidad

Los hongos poliporoides son excelentes descomponedores de la madera, aunque también hay ectomicorrizógenos; su importancia ecológica radica en que ayudan a mantener el equilibrio del ciclo del carbono en la naturaleza. Además presentan potencial biotecnológico dadas sus características nutrimentales, medicinales y degradadoras, por su capacidad de producir metabolitos secundarios y ser potencialmente cultivables. Se analiza la importancia del impacto ambiental en los ecosistemas de la subcuenca del río Metztitlán y la diversidad de este grupo de hongos asociados a ellos. Se revisaron ejemplares de herbario y se realizaron exploraciones micológicas en 13 comunidades vegetales de 11 municipios, y 37 localidades …

Message From The Editorial Board, John R. Clark

Discovery, The Student Journal of Dale Bumpers College of Agricultural, Food and Life Sciences

No abstract provided.

Instructions For Authors, Discovery Editors

Discovery, The Student Journal of Dale Bumpers College of Agricultural, Food and Life Sciences

No abstract provided.

Testing Carbon Farming Opportunities For Salinity Management, Peter Ritson, Mike G. Clarke, Adele Killen, Sarah Jeffery

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An emerging prospect for farm revenue from revegetation of saline and other lands that are marginal or non-productive for agriculture is the sale of carbon credits. Australian Government schemes for carbon credits include the Carbon Farming Initiative (CFI) and the proposed Emissions Reduction Fund (ERF) Therefore, this study aimed to assess the potential for woody vegetation (trees and shrubs) established on and around salt-affected lands in the Northern Agricultural Region (NAR) to remove carbon dioxide from the atmosphere and store (sequester) the carbon in new growth. Revegetation plantings on six farms were selected for the study after the landowners expressed …

Indicadores Bióticos De Calidad Ambiental Del Sur Del Estado De Tamaulipas, México. Caso De Estudio: Aves, René Bernardo Elías Cabrera-Cruz, Marco Antonio González-González, Julio César Rolón-Aguilar, Juan Carlos Gaytán-Oyarzún

Estudios en Biodiversidad

Este trabajo plantea una evaluación de prioridad biológica para la conservación de aves en la región sur de Tamaulipas, México. La metodología empleada fue la técnica Evaluación Rápida de Prioridad Biológica (ERPBIO). Esta permite determinar las principales zonas y grupos a conservar en flora y fauna para amplias zonas de estudio de manera rápida y precisa. La región sur de Tamaulipas comprende los municipios de Aldama, Altamira, Ciudad Madero, González y Tampico, con una superficie total de 8,969.05 km2. Dentro de los resultados obtenidos se elaboró una base de datos por municipio, encontrando una amplia cantidad de estudios con un …

La Biodiversidad De Los Hongos Ectomicorrízicos Y Su Importancia Para La Conservación Del Bosque En La Zona Poblana Del Parque Nacional Malintzi, Marco Antonio Marín-Castro, Virginia Silva-Díaz, Gladys Linares-Fleites, Ana María Castagnino, José Antonio Ticante-Roldán

Estudios en Biodiversidad

El Parque Nacional Malintzi comprende una superficie de 45,852 hectáreas, de las cuales corresponden 14,544 al estado de Puebla. El deterioro a su riqueza forestal tiene sus inicios desde la época colonial y hasta nuestros días la presión sobre los recursos de este parque nacional aumenta debido a que los pobladores de la zona, tradicionalmente ven en la montaña su fuente de sustento mediante la agricultura y la extracción de madera, que aunadas a la tala clandestina inmoderada, han influido drásticamente en la pérdida de biodiversidad y cambio de uso del suelo. Los objetivos de este trabajo fueron describir la …

Los Hongos Agaricales De Las Áreas De Encino Del Estado De Baja California, México, Nahara Ayala-Sánchez, Irma E. Soria-Mercado, Leticia Romero-Bautista, Maritza López-Herrera, Roxana Rico-Mora, Amelia Portillo-López

Estudios en Biodiversidad

Se realizó una recopilación de las especies de hongos del orden Agaricales (regionalmente conocido como “agaricoides”) de los bosques Quercus spp. de la península de Baja California (México), con la pretensión de contar con un panorama de la diversidad de este grupo taxonómico en el área, su distribución y dinámica dentro de estos ecosistemas y el papel ecológico de cada una de las especies citadas. Para la realización del presente estudio se reunió la información obtenida de las especies recolectadas de las diferentes localidades de las áreas de encino del estado de Baja California desde 1996 hasta el presente, ejemplares …

Los Agaves Mezcaleros Del Altiplano Potosino Y Zacatecano, Edgar León Esparza-Ibarra, Juan Violante-González, Scott Monks, Jorge Cadena Iñiguez, Cuauhtémoc Araujo-Andrade, Erich Dietmar Rössel-Kipping

Estudios en Biodiversidad

En el Altiplano Potosino y Zacatecano, los agaves mezcaleros son un componente socioeconómico importante ya que se pueden aprovechar desde el punto de vista económico, ya que tiene valor en el mercado para la producción de bebidas espirituosas como el mezcal; social, ya que su producción y modo de empleo genera jornales disminuyendo la migración; en la salud, por la producción de aguamiel, jarabes e inulinas como complemento nutricional; científico, por los aportes al conocimiento en la variación biológica de los agaves; debido a la diversidad y su plasticidad para enfrentar temperaturas extremas y sequías prolongadas, entre otros. Es por …

El Arbolado De Los Espacios Públicos Abiertos De La Zona De Monumentos Del Centro Histórico De La Ciudad De Puebla, Víctor Gutiérrez-Pacheco, Sonia Emilia Silva-Gómez, José Silvestre Toxtle-Tlamani, J. Santos Hernández-Zepeda

Estudios en Biodiversidad

Los conglomerados humanos, presentan espacios públicos abiertos (EPA´s), sobre todo arbolados, con funciones estéticas, sociales y ambientales. Se requiere información e indicadores con un enfoque ecológico, para que su atención descanse sobre una planeación documentada. Así, se pretende conocer la composición arbórea, su distribución y la biodiversidad en los Espacios Públicos Abiertos (EPA´s) de la Zona de Monumentos del Centro Histórico de la Ciudad de Puebla (ZMCHP). Por tanto, se contaron los especímenes, se ubicaron en los EPA´s y se identificaron. Para determinar la biodiversidad se aplicó el Índice de Diversidad de Shannon-Wiener (H´). En 25 EPA´s, se censaron 1,120 …

Two Hundred Years Of Forest Change: Effects Of Urbanization On Tree Species Composition And Structure, Rebecca W. Dolan

Scholarship and Professional Work - LAS

Despite their importance, the dynamics of urban floras are not well understood and quantitative historical data are rare. The current study used three data sets for trees in Indianapolis/Marion County, Indiana, U.S., to document change over 200 years to the original beech-maple forest and to examine future implications of contemporary tree planting efforts in light of these changes. Data on tree composition and size collected before significant settlement in the early 1800s are compared with recent surveys of trees in remnant natural areas and with trees found on city streets and rights-of-way. All the species recorded in historical surveys are …

Robert Folger Thorne—A Botanical Legacy

Aliso: A Journal of Systematic and Floristic Botany

Robert F. Thorne, distinguished botanist and former curator of the herbarium at Rancho Santa Ana Botanic Garden, left a rich botanical legacy. Contributions featured include a list of his articles appearing in Aliso: A Journal of Systematic and Evolutionary Botany, as well a list of plant taxa named for him.

The Vascular Flora Of Boyle County, Ky, Heidi M. Braunreiter

Online Theses and Dissertations

The vascular flora of Boyle County, Kentucky, was conducted from March 2013 to March 2015. Boyle County is located in central Kentucky and is part of the Bluegrass Physiographic Section. A total of 127 families, 392 genera, and 722 species, varieties, and subspecies were documented from Boyle County. Twelve plant communities were described: acidic mesophytic forest, acidic sub-xeric forest, acidic xeric forest, Bluegrass woodland, bottomland ridge/terrace forest, calcareous mesophytic forest, calcareous sub-xeric forest, depression pond/mudflat, dry limestone cliff/outcrops, riparian forest, wet prairie/meadow, and one rare state-listed plant community, the shale/siltstone glade. Five rare species with state rankings were discussed: American …

A Comparison Of Management Strategies For The Federally Endangered Running Buffalo Clover (Trifolium Stoloniferum) On The Blue Grass Army Depot, Ky, Alexi David Dart-Padover

Online Theses and Dissertations

Running buffalo clover (Trifolium stoloniferum) is a federally endangered plant that appears to depend on habitat disturbance, although proposed management strategies such as cattle grazing, mowing, and herbicide application have never been compared in a controlled study. We evaluate the efficacy of these techniques on the Blue Grass Army Depot (BGAD) in Madison County, KY, where one of T. stoloniferum’s largest populations occurs. Fifty-nine patches of T. stoloniferum on the BGAD were treated annually between 2012 and 2014 with combinations of mowing and grass-specific herbicide. Patches of T. stoloniferum also were exposed to one of three types of cattle exposure …

Characterization Of Novel Sorghum Brown Midrib Mutants From An Ems-Mutagenized Population, Scott E. Sattler, Ana Saballos, Zhanguo Xin, Deanna L. Funnell-Harris, Wilfred Vermerris, Jeffrey F. Pedersen

Department of Agronomy and Horticulture: Faculty Publications

Reducing lignin concentration in lignocellulosic biomass can increase forage digestibility for

ruminant livestock and saccharification yields of biomass for bioenergy. In sorghum (Sorghum bicolor (L.) Moench) and several other C4 grasses, brown midrib (bmr) mutants have been shown to reduce lignin concentration. Putative bmr mutants isolated from an EMS-mutagenized population were characterized and classified based on their leaf midrib phenotype and allelism tests with the previously described sorghum bmr mutants bmr2, bmr6, and bmr12. These tests resulted in the identification of additional alleles of bmr2, bmr6, and bmr12, and, in addition, six bmr …

Assessment Of Rice Self-Sufficiency In 2025 In Eight African Countries, P. A.J. Van Oort, K. Saito, E. Amovin-Assagba, Lenny G.J. Van Bussel, Justin Van Wart, Hugo De Groot, Martin K. Van Ittersum, Kenneth Cassman, M. C.S. Wopereis

Department of Agronomy and Horticulture: Faculty Publications

Most African countries are far from self-sufficient in meeting their rice consumption; in eight countries the production: consumption ratio, ranged from 0.16 to 1.18 in 2012. We show that for the year 2025, with population growth, diet change and yield increase on existing land (intensification), countries cannot become fully self-sufficient in rice. This implies that for the future, a mixture of area expansion and imports will be needed on top of yield gap closure. Further research is needed for identification of most suitable new land for rice area expansion and areas that should be protected.

Patch Burning: Implications On Water Erosion And Soil Properties, Altingul Ozaslan Parlak, Mehmet Parlak, Humberto Blanco-Canqui, Walter H. Schacht, John A. Guretzky, Martha Mamo

Department of Agronomy and Horticulture: Faculty Publications

Patch burning can be a potential management tool to create grassland heterogeneity and enhance forage productivity and plant biodiversity, but its impacts on soil and environment have not been widely documented. In summer 2013, we studied the effect of time after patch burning (4 mo after burning [recently burned patches], 16 mo after burning [older burned patches], and unburned patches [control]) on vegetative cover, water erosion, and soil properties on a patch-burn experiment established in 2011 on a Yutan silty clay loam near Mead, NE. The recently burned patches had 29 ± 8.0% (mean ± SD) more bare ground, 21 …

Presencia De Metales Pesados En La Reserva De La Biosfera Barranca De Metztitlán, Hidalgo, México, Irving Giovanny González-Salazar, Maritza López-Herrera, Scott Monks, Griselda Pulido-Flores

Estudios en Biodiversidad

La Reserva de la Biosfera Barranca de Metztitlán es un área natural protegida por la gran diversidad de flora y fauna existente en la misma. La zona es atravesada por un río de gran longitud que se extiende desde el municipio de Tulancingo hasta su desembocadura en la Laguna de Metztitlán, en la zona núcleo de la reserva. A lo largo del cauce del río se ubican algunos asentamientos humanos y zonas industriales, que vierten aguas residuales domésticas e industriales. Además, el agua del río es un recurso natural utilizado como agua de riego para las zonas agrícolas, que con …

Percepción De Calidad De Vida, Contaminación Y Riesgo En Localidades Rurales Del Municipio De Tecoanapa, Guerrero, Rocío López-Velasco, América Rodríguez-Herrera, Humberto González-González, Branly Olivier-Salomé, Consuelo Montalvo-Marques

Estudios en Biodiversidad

En el presente trabajo se realizó un análisis sobre la percepción de calidad de vida, contaminación y riesgo en nueve comunidades rurales del Municipio de Tecoanapa, Guerrero. Para ello, se seleccionaron nueve comunidades que cumplieran con tres aspectos: rezago social (muy alto, medio y muy bajo); ubicación (cerca de ríos); y vivencias en conflictos y embates ambientales. Se levantó una encuesta a jefes de familia en febrero de 2014. Registrando que el 70% de los habitantes afirmaron tener una buena calidad de vida. Al cuestionarlos sobre contaminación, el 59.9% consideró que si existe y está asociada al agua. El 52.0% …