Immunology and Infectious Disease Commons^™

Investigating The Role Of Coyotes, Canis Latrans, In The Spread Of Parasites And Arthropod-Borne Diseases In Georgia, Usa., Ansleigh Banks

College of Graduate Studies: Theses & Dissertations

In order to analyze the role of coyotes, Canis latrans, as hosts of parasites and arthropod-borne diseases in the state of Georgia, USA, 38 coyotes representing 18 counties and multiple geographic regions of the state were dissected and analyzed for the presence of Dirofilaria immitis, intestinal parasites, ectoparasites, and tick-borne illnesses. Mosquitoes from the locations which the coyotes originated were trapped and analyzed for the presence of D. immitis larvae. In compliance with IACUC guidelines, coyotes were obtained from individuals who had previously hunted or trapped the coyotes for leisure. Parasites were identified based on morphological features with the use …

A Review Of Rat Lungworm Infection And Recent Data On Its Definitive Hosts In Hawaii, Chris N. Niebuhr, Susan I. Jarvi, Shane R. Siers

Human–Wildlife Interactions

Rat lungworm (Angiostrongylus cantonensis) is a zoonotic nematode that causes rat lungworm disease (angiostrongyliasis), a potentially debilitating form of meningitis, in humans worldwide. The definitive hosts for rat lungworm are primarily members of the genus Rattus, with gastropods as intermediate hosts. This parasite has emerged as an important public health concern in the United States, especially in Hawaii, where the number of human cases has increased in the last decade. Here we discuss the current knowledge of the rat lungworm, including information on the life cycle and host species, as well as updates on known infection levels. Three …

Characterizing Chromosomal Aberrations In Cells Deficient For Both Atm And Msh2, Yeliz Inalman

Dissertations and Theses

Ataxia telangiectasia mutated (ATM) and mutS homologue 2 (MSH2) are important DNA repair proteins that participate in DNA repair pathways to maintain genomic integrity. Mice deficient for ATM and MSH2 mice are viable. However, ATM^-/- mice show growth retardation, neurological defects, and spontaneous lymphomagenesis. MSH2^-/- mice suffer from aggressive lymphoid tumors between two to five months of age and have increased microsatellite instability, which predisposes MSH2^-/- mice to carcinomas. However, mice deficient in both ATM and MSH2 are unable to survive beyond postnatal day 21 (P21). The observed lethality in ATM^-/-MSH2^-/- mice may result …

Fluvastatin And Microrna-146a Alter Interleukin-33 Mediated Mast Cell Functions., Marcela Taruselli

Theses and Dissertations

Mast cells are tissue-resident immune cells known as effector cells for the innate and adaptive immune systems. Mast cells contribute to host defenses against parasites such as large roundworm parasites, bacterial pathogens, and toxins, and participate in wound healing, but they are mostly known for their role in allergic diseases. It has been well established that during allergic diseases, mast cells are stimulated by IgE cross-linkage to release proinflammatory mediators. However, a newly discovered cytokine, IL-33 has also been implicated in allergic disease. Recently, IL-33 has been implicated as a driver of several Type I sensitivities and previous studies have …

Stat5b And Stat5 Tetramers Are Essential For Ige-Mediated Mast Cell Function, Kasalina N. Kiwanuka

Theses and Dissertations

Signal Transducers and Activators of Transcription (STATs) are latent transcription factors that mediate several cellular responses. This protein family consists of seven members, STAT1 – 6 including two closely related molecules, STAT5a and STAT5b, that show 96% amino acid sequence homology and are critical for lymphoid, myeloid and erythroid cell development and function. Activated STAT proteins dimerize and translocate to the nucleus, where they bind to high-affinity DNA motifs to modulate gene expression. We recently identified STAT5b as the critical regulator of IgE-mediated cytokine production in mast cells. STAT5b knockout (KO) cells show decreased sensitivity to IgE-mediated passive systemic anaphylaxis …

Regulatory T Cells Promote Breast Cancer Progression Through Inhibiting Classical Activation Of Macrophages, Nicholas M. Clark

Theses and Dissertations

Transient ablation of regulatory T cells has been shown to be effective at hindering tumor growth and metastasis in murine breast cancer model. Based on our lab’s previous work, we have demonstrated that NK cells and CD8+ cytotoxic T cells were not required for the protective effect of Treg cell ablation. However, we also reported that CD4+ helper T cells and IFN-γ were required for the protective effect of Treg cell ablation. Furthermore, we observed that CD11B+ cells responded to Treg ablation therapy by up-regulating target genes of IFN-γ. Therefore, this study aimed to investigate the connection between the myeloid …

Investigating The Prevalence Of An Insecticide Resistance Gene In Culex Mosquito Populations Of Central Illinois, Kylee R. Noel

Masters Theses

The globalization of society has led to the spread of the vectors, mosquitoes, and diseases. Each year millions of people are killed by diseases vectored by mosquitoes. For example, West Nile Virus alone killed over 2,000 people in North America in 2017; 8 of those deaths being in Illinois. Two prominent vectors of West Nile Virus are Culex pipiens and Culex restuans; which are difficult to differentiate based upon morphological features. In this study, mosquitoes collected from two Illinois counties, Coles County and Champaign County, were first identified based upon morphology and this identification was then compared to probe-based …

Differences In The M1 And M2 Macrophage Subtypes Between The Sexes Determine Susceptibility To Francisella Tularensis Infection, Michelle Arlene Sanchez

Open Access Theses & Dissertations

Francisella tularensis is the causative agent of the human disease tularemia. It is highly infectious with as few as 10 microorganisms via inhalation causing a lethal infection. F. tularensis infects a variety of cell types, including macrophages and neutrophils, since it needs to enter, survive and proliferate in order to cause pathogenicity. Disease is the result of over activating the host's own inflammatory response initiated by the macrophage's response to infection.

Known differences exist in the intensity of the inflammatory response between the sexes which leads to differences in sensitivity to autoimmune and infectious disease. Males tend to be more …

Determination Of Transforming Growth Factor-Β Signaling Targets In Activated T Cells, Ramiah Jacks

Dissertations

T lymphocytes are a critical component of the adaptive immune system and their responses in pathogenic and steady state conditions require strict regulation. One mechanism involved in this regulation is Transforming Growth Factor-β (TGF-β) signaling. TGF-β can act on activated T cells to facilitate the differentiation of TGF-β dependent T helper subsets or the suppression of T cell activation and proliferation. However, the molecular mechanism(s) by which TGF-β signaling controls T cell differentiation vs T cell suppression remain poorly understood.TGF-β signaling is propagated by initially binding to the TGF-β type II receptor, which subsequently activates TGF-β type I receptor (TGF-βRI) …

Protection From Staphylococcus Aureus Bloodstream Infection By Probiotic Exopolysaccharide, Wonbeom Paik

Dissertations

Staphylococcus aureus is known to cause severe systemic infection with high mortality rates. Antibiotics are the only approved therapy for patients, but the widespread prevalence of antibiotic resistant strains limits treatment efficacy, and many patients succumb to the disease. Many probiotic agents are commercially available, but the mechanisms by which they benefit are not known. Understanding these mechanisms will help develop novel therapeutics that can improve healthcare, including systemic infections by S. aureus. Bacillus subtilis is a probiotic bacterium that produces an exopolysaccharide (EPS) that induces anti inflammatory macrophages (MΦ). We tested if EPS could be used for systemic S. …

Functional Analysis Of Bacillus Anthracis Aspartate Transcarbamoylase And Dihydroorotase, Katelyn Leigh Schwager Silva

Wayne State University Theses

There are many enzymes required for efficient and proper pyrimidine biosynthesis. The two that are most important and were discussed in this thesis are aspartate transcarbamoylase (ATCase) and dihydroorotase (DHOase). Both play an important role in not only pyrimidine biosynthesis production, but also mechanistic regulation of de novo synthesis. Anthrax is an infection caused by Bacillus anthracis. Here we studied ATCase and DHOase in Bacillus Anthracis. In this thesis we understood the effects of the enzymes ATCase and DHOase on pyrimidine biosynthesis. Adequate inhibitors of these enzymes would result in cell death and could pose as a cure to infection …

Investigating The Antiviral Effects Of Vig-3 From Rainbow Trout, Shanee Herrington-Krause

Theses and Dissertations (Comprehensive)

Rainbow trout is the most farmed fish in Ontario, and thus is economically important to the province. Despite this, there is a lack of understanding regarding fish innate immunity, specifically with regards to interferon-stimulated genes (ISGs) and their antiviral effector functions. ISGs are the workhorses of the innate antiviral response, operating together to limit each step of virus replication. The Viral Hemorrhagic Septicemia Virus (VHSV) induced gene (Vig)-3 is a newly identified ISG within many fish species and is homologous to ISG-15 in mammals. It is a small ubiquitin-like protein inducible by type I interferon (IFN-I), and is suggested to …

Evaluating The Effects Of Antibody-Conjugated Multi-Walled Carbon Nanotubes In Combination With Microwave Irradiation, Amy Chall

College of Graduate Studies: Theses & Dissertations

Cancer remains one of the largest public health concerns of our day, particularly in developed countries where technological advances have allowed populations to live well into their eighth decade. In America, those in their 80’s have a 1 in 2 chance of developing cancer in their lifetime. Prostate cancer, specifically is the second leading cause of cancer deaths in males. Traditional cancer therapies cause high levels of toxicity to the patient due to mechanisms of action that often attack cancer cells and healthy cells alike. The holy grail of cancer research is to find a treatment that targets the cancer …

Taxonomic Revision Of The Haemaphysalis (Rhipistoma) Spinulosa Subgroup, Parasites Of Carnivores And Other Mammals In Sub-Saharan Africa, Jackson A. Tomlinson

College of Graduate Studies: Theses & Dissertations

Nine new species of Haemaphysalis are here described based on a morphological analysis of 7,077 adult specimens stored in the U.S. National Tick Collection (Georgia Southern, Statesboro, USA) and collected from various carnivores (Carnivora: Canidae, Felidae, Herpestidae, Hyaenidae, Mustelidae, Nandiniidae, Viverridae) and hedgehogs (Erinaceomorpha: Erinaceidae); few specimens were found on hares (Lagomorpha: Leporidae), various rodents (Rodentia: Bathyergidae, Cricetidae, Muridae, Nesomyidae, Pedetidae, Sciuridae, Spalacidae) and other mammals (Artiodactyla, Chiroptera, Hyracoidea, Perissodactyla, Primates, and Soricomorpha) in 29 sub-Saharan African countries. In addition to descriptions of new species, 4 species, namely H. spinulosa Neumann, 1906, H. muhsamae Santos Dias, 1954, H …

Impact Of Seasonal And Host-Related Factors On The Intestinal Microbiome And Cestode Community Of Sorex Cinereus And Sorex Monticola, Katelyn D. Cranmer

College of Graduate Studies: Theses & Dissertations

The intestinal microbiome of mammals plays a significant role in host health and response to environmental stimuli and can include both beneficial native bacteria as well as parasitic worms. In this study, I examined the intestinal cestode and bacterial communities of two closely related species of shrew, Sorex monticola and Sorex cinereus, over a six month period in 2016. Specimens were collected approximately every three weeks from May to October from the Sangre de Cristo Mountains in Cowles, New Mexico. A total of 79 shrews were prepared with the gastrointestinal tracts removed and flash-frozen in liquid nitrogen. An additional …

Characterization Of Ovine Monocytes In Response To Haemonchus Contortus Larvae In Vitro And A Novel Role Of Interleukin-13 Inducing Larval Paralysis, Elizabeth Shepherd

Graduate Theses, Dissertations, and Problem Reports (ETD)

Haemonchus contortus is a hematophagous, gastrointestinal parasite affecting small ruminants. Parasitism by H. contortus is the greatest concern of sheep producers in the United States and accounts for billions of dollars in economic loss worldwide. However, different breeds of sheep display differences n natural resistance to H. contortus. St. Croix hair sheep have a remarkable ability to clear H. contortus without the aid of anthelmintics and develop a robust T helper type 2 (Th2) immune response, preventing establishment of infective stage 3 larvae (L3), when compared to susceptible Suffolk sheep. However, the mechanism of development of immune response and …

Viral Emergence In Marine Mammals In The North Pacific May Be Linked To Arctic Sea Ice Reduction, Elizabeth Vanwormer, J. A.K. Mazet, A. Hall, V. A. Gill, P. L. Boveng, J. M. London, T. Gelatt, B. S. Fadely, M. E. Lander, J. Sterling, V. N. Burkanov, R. R. Ream, P. M. Brock, L. D. Rea, B. R. Smith, A. Jeffers, M. Henstock, M. J. Rehberg, K. A. Burek-Huntington, S. L. Crosby, J. A, Hammond, T. Goldstein

School of Veterinary and Biomedical Sciences: Faculty Publications

Climate change-driven alterations in Arctic environments can influence habitat availability, species distributions and interactions, and the breeding, foraging, and health of marine mammals. Phocine distemper virus (PDV), which has caused extensive mortality in Atlantic seals, was confirmed in sea otters in the North Pacific Ocean in 2004, raising the question of whether reductions in sea ice could increase contact between Arctic and sub-Arctic marine mammals and lead to viral transmission across the Arctic Ocean. Using data on PDV exposure and infection and animal movement in sympatric seal, sea lion, and sea otter species sampled in the North Pacific Ocean from …

Ehdv-2 Infection Prevalence Varies In Culicoides Sonorensis After Feeding On Infected White-Tailed Deer Over The Course Of Viremia, Sandra Y. Mendiola, Mary K. Mills, Elin Maki, Barbara S. Drolet, William C. Wilson, Roy D. Berghaus, David E. Stallknecht, Jonathan Breitenbach, D. Scott Mcvey, Mark G. Ruder

School of Veterinary and Biomedical Sciences: Faculty Publications

Epizootic hemorrhagic disease viruses (EHDVs) are arboviral pathogens of white-tailed deer and other wild and domestic ruminants in North America. Transmitted by various species of Culicoides, EHDVs circulate wherever competent vectors and susceptible ruminant host populations co-exist. The impact of variation in the level and duration of EHDV viremia in white-tailed deer (Odocoileus virginianus) on Culicoides infection prevalence is not well characterized. Here we examined how infection prevalence in a confirmed North American vector of EHDV-2 (Culicoides sonorensis) varies in response to fluctuations in deer viremia. To accomplish this, five white-tailed deer were experimentally infected with EHDV-2 and colonized C. …

The Prevotella Copri Complex Comprises Four Distinct Clades Underrepresented In Westernized Populations, Adrian Tett, Kun D. Huang, Francesco Asnicar, Hannah Fehlner-Peach, Edoardo Pasolli, Nicolai Karcher, Federica Armanini, Paolo Manghi, Kevin Bonham, Moreno Zolfo, Francesca De Filippis, Cara Magnabosco, Richard Bonneau, John Lusingu, John Amuasi, Karl Reinhard, Thomas Rattei, Fredrik Boulund, Lars Engstrand, Albert Zink, Maria Carmen Collado, Dan R. Littman, Daniel Eibach, Danilo Ercolini, Omar Rota-Stabelli, Curtis Huttenhower, Frank Maixner, Nicola Segata

Karl Reinhard Publications

Prevotella copri is a common human gut microbe that has been both positively and negatively associated with host health. In a cross-continent metaanalysis exploiting >6,500 metagenomes, we obtained >1,000 genomes and explored the genetic and population structure of P. copri. P. copri encompasses four distinct clades (>10% inter-clade genetic divergence) that we propose constitute the P. copri complex, and all clades were confirmed by isolate sequencing. These clades are nearly ubiquitous and co-present in non-Westernized populations. Genomic analysis showed substantial functional diversity in the complex with notable differences in carbohydrate metabolism, suggesting that multi-generational dietary modifications may be …

Imaging Coprolite Taphonomy And Preservation, Karl Reinhard, Morgana Camacho, Breyden Geyer, Samantha Hayek, Chase Horn, Kaitlin Otterson, Julia Russ

Karl Reinhard Publications

The impact of coprolite taphonomy on parasite remains and aDNA recovery has been recognized. In general, coprolites from sites protected by geologic features such as caves and rock shelters exhibit the best preservation. In contrast, coprolites from open sites can be badly affected by taphonomic processes as shown by analyses of parasite eggs. For eggs, the impact of mites and free living nematodes has been quantified. Mites are associated with poor pinworm egg preservation. In other studies, percolation of water through sediments has a negative impact on egg recovery. We note that dietary remains can also decompose at open sites. …

Scaphanocephalus-Associated Dermatitis As The Basis For Black Spot Disease In Acanthuridae Of St. Kitts, West Indies, Michelle M. Dennis, Adrien Izquierdo, Anne Conan, Kelsey Johnson, Solenne Giardi, Paul Frye, Mark A. Freeman

Harold W. Manter Laboratory of Parasitology: Library Materials

Acanthurus spp. of St. Kitts and other Caribbean islands, including ocean surgeonfish A. bahianus, doctorfish A. chirurgus, and blue tang A. coeruleus, frequently show multifocal cutaneous pigmentation. Initial reports from the Leeward Antilles raised suspicion of a parasitic etiology. The aim of this study was to quantify the prevalence of the disease in St. Kitts’ Acanthuridae and describe its pathology and etiology. Visual surveys demonstrated consistently high adjusted mean prevalence at 3 shallow reefs in St. Kitts in 2017 (38.9%, 95% CI: 33.8−43.9) and 2018 (51.5%; 95% CI: 46.2−56.9). There were no differences in …

Novel Information On The Morphology, Phylogeny And Distribution Of Camallanid Mematodes From Marine And Freshwater Hosts In South Africa, Including The Description Of Camallanus Sodwanaensis N. Sp., Roman Svitin, Marliese Truter, Olena Kudlai, Nico J. Smit, Louis Du Preez

Harold W. Manter Laboratory of Parasitology: Library Materials

Four species of previously known nematodes from the family Camallanidae were found from different hosts in South Africa: Batrachocamallanus xenopodis from the frog Xenopus muelleri, Paracamallanus cyathopharynx, and Procamallanus pseudolaeviconchus from the catfish Clarias gariepinus and Spirocamallanus daleneae from the catfish Synodontis zambezensis. In the material collected from various marine fishes, several specimens of nematodes from the genus Camallanus clearly differed from all previously known species. Based on morphological differences these specimens are assigned to a new species, C. sodwanaensis. Molecular data of 18S and 28S rDNA and COI sequences are provided for the collected species …

New Bathynellidae (Crustacea) Taxa And Their Relationships In The Fortescue Catchment Aquifers Of The Pilbara Region, Western Australia, Giulia Perina, Ana I. Camacho, Joel Huey, Pierre Horwitz, Annette Koenders

Research Datasets

In the past 20 years, the number of subterranean taxa discovered in Australia, especially in the Pilbara bioregion, has considerably increased due to incidental environmental surveys often associated with mining development. Bathynellidae are an important component of stygofauna and they occur in most Australian aquifers, but their collection and identification are difficult due to their habitat, and small and fragile bodies with conservative morphology. The study of Pilbaranella ethelensis in the upper Fortescue catchment contributed to a better understanding of the group at local scale, but knowledge at larger catchment scale is still limited. Abundant material collected by different environmental …

White-Nose Syndrome And Immune Responses In A Resistant Bat Species (Eptesicus Fuscus), Keslie Skye Naffa

Graduate Theses/Dissertations

White-nose syndrome (WNS) has had a large negative impact on bat populations across eastern North America since its arrival in 2006. Bats affected by WNS appear to die of starvation, possibly due to the increased arousals during hibernation when there is no food present to replace the energy used to arouse. During hibernation, the bat’s immune system should be suppressed. However, once a bat of a susceptible species is exposed to the fungus that causes WNS, Psuedogymnoascus destructans (Pd), the immune system seems to respond, potentially causing an elevation in metabolic rate, which may cause the bat to …

การพัฒนาเทคนิค Recombinase Polymerase Amplification เพื่อตรวจหาเชื้อ Mycobacterium Avium Complex ด้วยตาเปล่า, เทิดศักดิ์ สุธาตุ

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

โรคติดเชื้อที่มีสาเหตุมาจาก Mycobacterium avium complex (MAC) มีอุบัติการณ์เพิ่มสูงขึ้นทั่วโลกรวมทั้งในประเทศไทย เนื่องมาจากการเพิ่มขึ้นของจำนวนผู้ป่วยที่มีภาวะภูมิคุ้มกันของร่ายกายต่ำ การวินิจฉัยเชื้อ MAC ในปัจจุบันที่อาศัยการเพาะเลี้ยงเชื้อและทดสอบปฏิกิริยาชีวเคมี นอกจากใช้ระยะเวลานานแล้ว ยังไม่สามารถจำแนกเชื้อได้ถึงระดับสปีชี่ส์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งเชื้อ Mycobacterium avium และเชื้อ Mycobacterium intracellulare ซึ่งเป็นเชื้อ MAC ที่สำคัญและเพาะแยกได้บ่อยจากสิ่งส่งตรวจ ดังนั้นวัตถุประสงค์ของการศึกษาในครั้งนี้ คือการพัฒนาเทคนิค Recombinase Polymerase Amplification ร่วมกับการอ่านผลด้วยสี SYBR Green I (RPA/SYBR) ในการตรวจวินิจฉัยเชื้อ MAC ซึ่งอาศัยการเพิ่มปริมาณสารพันธุกรรมภายใต้อุณหภูมิคงที่ ร่วมกับไพรเมอร์ที่จำเพาะต่อเชื้อกลุ่ม MAC เชื้อ M. avium และเชื้อ M. intracellulare และอ่านผลที่เกิดขึ้นด้วยตาเปล่าได้ในทันทีภายหลังการเติมสี SYBR Green I ผลจากการทดสอบกับตัวอย่าง DNA ของเชื้อ MAC จำนวน 120 ตัวอย่าง พบว่าเทคนิค RPA/SYBR สามารถตรวจวินิจฉัยจำแนกสปีชี่ส์ของเชื้อ M. avium และเชื้อ M. intracellulare ได้อย่างมีประสิทธิภาพ โดยมีความไว 100% และความจำเพาะตั้งแต่ 80.7% ขึ้นไป ซึ่งจัดว่ามีความสอดคล้องในเกณฑ์ดีมากเมื่อเปรียบเทียบกับวิธีหาลำดับเบส (สถิติ Kappa มีค่าตั้งแต่ 0.801 ขึ้นไป) ในขณะที่เมื่อเปรียบเทียบกับเทคนิค PCR มีความไวตั้งแต่ 89.2% ขึ้นไปและความจำเพาะตั้งแต่ 97.5% ขึ้นไป และมีความสอดคล้องในเกณฑ์ดีมากเช่นเดียวกัน (สถิติ Kappa มีค่าตั้งแต่ 0.863 ขึ้นไป) นอกจากนี้เทคนิค RPA/SYBR ยังมีค่าความเข้มข้นของ DNA ต้นแบบน้อยที่สุดที่สามารถตรวจได้ เท่ากับ 1 ng/µl และไม่เกิดปฏิกิริยาข้ามกลุ่มกับเชื้อส่วนใหญ่ของ Mycobacterium แม้ว่าเทคนิค RPA/SYBR ที่ได้พัฒนาขึ้น มีขั้นตอนการทดสอบที่ทำง่าย …

ความหลากหลายทางพันธุกรรมของยีนบีเอซีอีวันและเอโปอี และระดับอะไมลอยด์เบต้าในเลือดของผู้ป่วยโรคไวรัสตับอักเสบบีเรื้อรังและตับอักเสบซีเรื้อรัง, ธัญรัตน์ ทองจรัส

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

อะไมลอยด์เบต้า 42 (Aβ42) เป็นของเสียที่เกิดจากการย่อยอะไมลอยด์เบต้าพรีเคอเซอร์โปรตีน อาจเสี่ยงต่อการเกิดโรคอัลไซเมอร์เมื่อสะสมที่สมอง โดยมียีนบีเอซีอีวัน (BACE1) ควบคุมการสร้างเอนไซม์เบต้าซีครีเตส เพื่อย่อยอะไมลอยด์เบต้าพรีเคอเซอร์โปรตีน และมียีนเอโปอี (ApoE) เป็นยีนที่ถอดรหัสเป็น Apolipoprotein E ทำหน้าที่ขนส่งอะไมลอยด์เบต้าไปกำจัดที่ตับ คาดว่าการติดเชื้อไวรัสตับอักเสบเรื้อรังอาจส่งผลให้การกำจัดของเสียลดลงด้วย งานวิจัยนี้จึงมีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษาระดับอะไมลอยด์เบต้า 42 ในเลือดด้วยหลักการ ELISA และศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของยีน BACE1 (rs638405) ด้วยหลักการ PCR-RFLP และยีน ApoE (rs429358 และ rs7412) ด้วยหลักการ real time PCR ในผู้ติดเชื้อไวรัสตับอักเสบบีเรื้อรัง (CHB, N=149) ซีเรื้อรัง (CHC, N=31) และคนปกติ (N=164) โดยเป็นผู้ติดเชื้อไวรัสตับอักเสบบีเรื้อรัง ซีเรื้อรังที่รักษา ณ โรงพยาบาลพระมงกุฎเกล้า และผู้บริจาคโลหิต ณ สถาบันพยาธิวิทยา ในช่วงเดือน สิงหาคม 2561 - มิถุนายน 2562 ผลการศึกษาพบว่าระดับอะไมลอยด์เบต้า 42 ในเลือดของผู้ป่วย CHB มีค่าสูงกว่าคนปกติ (CHB=46.86 pg/ml (N=22), CHC=43.27 pg/ml (N=15) และ คนปกติ =33.72 pg/ml (N=36), p-value=0.002) ข้อมูลจากกลุ่มตัวอย่างที่ตรวจวัดนี้มีจำนวนจำกัด จึงยังไม่สามารถนำไปอ้างอิงได้ นอกจากนี้ผู้วิจัยพบสัดส่วนของจีโนไทป์ของยีน BACE1 ในผู้ป่วย CHB (N=149), CHC (N=31) มีจีโนไทป์ C/G สูงกว่าในคนปกติ (N=164) (p-value = 0.044) และยีน ApoE ในผู้ป่วย CHB (N=149), CHC (N=31) มีจีโนไทป์ ε3ε4 สูงกว่าในคนปกติ (N=148) (p-value=0.001) …

การศึกษาฤทธิ์ต้านเชื้อแบคทีเรียของส่วนประกอบเลือดจากตัวเงินตัวทอง (Varanus Salvator), นันทวัฒน์ โฆษา

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

สถานการณ์การดื้อยาปฏิชีวนะของแบคทีเรียเป็นปัญหาใหญ่ที่ส่งผลกระทบไปทั่วโลก จึงจำเป็นต้องศึกษาเพื่อพัฒนาสารทดแทนยาปฏิชีวนะ ตัวเงินตัวทอง (Varanus salvator) เป็นสัตว์เลื้อยคลานมีความสามารถในการอยู่รอดจากสภาวะที่เสี่ยงต่อการติดเชื้อ อาจเนื่องจากสัตว์เหล่านี้มีระบบภูมิคุ้มกันโดยกำเนิดซึ่งมีวิวัฒนาการมาแต่โบราณจึงเป็นจุดเด่นที่น่าศึกษาวิจัย งานวิจัยนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษาฤทธิ์ต้านเชื้อแบคทีเรียขององค์ประกอบเลือดจากตัวเงินตัวทองและโปรตีนหรือเปปไทด์ที่มีคุณสมบัติต้านจุลชีพ ซึ่งข้อมูลของลำดับกรดอะมิโนของตัวเงินตัวทองที่ได้ในการศึกษาวิจัยครั้งนี้จะเป็นพื้นฐานที่สำคัญใน โดยนำพลาสมาและซีรัมจากตัวเงินตัวทองมาทดสอบคุณสมบัติการยับยั้งเชื้อแบคทีเรียที่ทำให้เกิดโรคด้วยเทคนิค agar diffusion พบว่าพลาสมาสามารถยับยั้งการเจริญของเชื้อแบคทีเรียได้ดีที่สุดมีขนาดเส้นผ่านศูนย์กลางของวงใสยับยั้งเชื้อ (inhibition zone) เท่ากับ 17-20 มิลลิเมตร เมื่อทำการทดสอบหาค่าความเข้มข้นต่ำสุดของพลาสมาและซีรัมที่สามารถยับยั้งเชื้อแบคทีเรีย (minimal inhibitory concentration, MIC) ด้วยวิธี broth dilution พบว่าสารสกัดหยาบพลาสมาให้ผลการทดสอบกับเชื้อได้ดีที่สุดโดยมีค่าความเข้มข้นต่ำสุดที่สามารถยับยั้งเชื้อแบคทีเรีย (MIC) เท่ากับ 125 ไมโครกรัมต่อมิลลิลิตร จากผลของการแยกบริสุทธิ์บางส่วนของพลาสมาและซีรัมโดยเทคนิค ion exchange chromatography ด้วย Q - sepharose คอลัมน์ พบว่าทั้งพลาสมาและซีรัมสามารถแยกโปรตีนแฟรคชันได้ 5 แฟรคชันเท่ากัน เมื่อวิเคราะห์ด้วยเทคนิค sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) พบขนาดโมเลกุลอยู่ระหว่าง 16 – 200 กิโลดัลตัน แต่เมื่อทดสอบคุณสมบัติการต้านเชื้อ พบบางแฟรกชันจากพลาสมา (P) และซีรั่ม (S) ซึ่งกำหนดเป็น P1 / P2 / P5 และ S1 / S2 / S4 ตามลำดับ ที่แสดงฤทธิ์ต้านเชื้อแบคทีเรีย เมื่อวิเคราะห์องค์ประกอบของสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพด้วยเทคนิค liquid chromatography mass spectrometry (LC-MS) สามารถระบุชนิดโปรตีนได้ทั้งหมด 33 ชนิดและพบโปรตีนที่มีศักยภาพเป็นเปปไทด์ต้านจุลชีพ 15 ชนิด มีเพียง 3 ชนิด จากส่วนของพลาสมา (P1) 2 ชนิด และ (P2) 1 ชนิด ที่มีโครงสร้างเป็น α-helical peptide …

องค์ประกอบทางพฤกษเคมีและผลกระทบของน้ำมันเสม็ดขาวต่อการแสดงออกของยีนดื้อยาหลักในเชื้อ Fluconazole-Resistant Candida Albicans ที่แยกได้ทางคลินิก, พิชญพงศ์ คีรีเดช

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

งานวิจัยนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษาองค์ประกอบทางพฤกษเคมีและฤทธิ์ต้านเชื้อรา Candida albicans ของน้ำมันเสม็ดขาวจากใบและกิ่งอ่อนของ Melaleuca cajuputi Powell ที่พบในพื้นที่ภาคตะวันออกของประเทศไทย รวมทั้งประเมินผลกระทบของน้ำมันเสม็ดขาวต่อการแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องกับกลไกการดื้อยาฟลูโคนาโซลในเชื้อราทดสอบ การวิเคราะห์องค์ประกอบทางพฤกษเคมีด้วยวิธีแก๊สโครมาโทกราฟี-แมสสเปกโตรมิทรี (gas chromatography-mass spectrometry, GC-MS) พบว่าน้ำมันเสม็ดขาวมีองค์ประกอบหลัก 6 ชนิด ได้แก่ 1,8-Naphthyridine derivatives (ร้อยละ 10.46), alpha-Pyrone (ร้อยละ 10.11), Terpinolene (ร้อยละ 9.26), gamma-Terpinene (ร้อยละ 8.00), trans-Caryophyllene (ร้อยละ 6.36) และ beta-Elemene (ร้อยละ 5.09) จากการทดสอบฤทธิ์เบื้องต้นของน้ำมันเสม็ดขาวในการยับยั้ง C. albicans สายพันธุ์คลินิกที่ดื้อต่อยาฟลูโคนาโซล จำนวน 16 ไอโซเลท ด้วยวิธี Disc diffusion พบว่าดิสก์บรรจุน้ำมันเสม็ดขาว ขนาด 1 ไมโครลิตรต่อดิสก์ แสดงฤทธิ์ยับยั้งการเจริญของเชื้อทดสอบทุกไอโซเลท โดยมีขนาดเส้นผ่านศูนย์กลางบริเวณยับยั้งเชื้อเฉลี่ยอยู่ระหว่าง 6.67 ± 0.58 ถึง 10.00 ± 0.00 มิลลิเมตร เมื่อทำการทดสอบหาค่าความเข้มข้นต่ำสุดของน้ำมันเสม็ดขาวที่สามารถยับยั้งเชื้อทดสอบ (minimal inhibitory concentration, MIC) และฆ่าเชื้อทดสอบ (minimum fungicidal concentration, MFC) ด้วยวิธี Broth macrodilution พบว่าน้ำมันเสม็ดขาวแสดงฤทธิ์ฆ่าเชื้อราทดสอบทุกไอโซเลท โดยมีค่า MIC และ MFC อยู่ในช่วง 0.31-1.25 และ 0.63-2.5 ไมโครลิตรต่อมิลลิลิตร ตามลำดับ การทดสอบการเสริมฤทธิ์กันของสารผสมน้ำมันเสม็ดขาวและยาฟลูโคนาโซลในการต้านเชื้อราทดสอบด้วยวิธี Checkerboard microdilution พบว่าสารผสมดังกล่าวมีการเสริมฤทธิ์กันในการยับยั้งเชื้อราทดสอบส่วนใหญ่ (ร้อยละ 60) โดยค่า MIC ของยาฟลูโคนาโซลและน้ำมันเสม็ดขาวจะลดลงประมาณ 8-64 และ 8-16 เท่า ตามลำดับ …

การพัฒนาเทคนิค Helicase Dependent Amplification ควบคู่กับการอ่านผลด้วยตาเปล่าโดยใช้สี Sybr Green I (Hda/Sybr Green I) สำหรับการตรวจการปนเปื้อนเชื้อแบคทีเรียในผลิตภัณฑ์เกล็ดโลหิต, วรางคณา แย้มเกต

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

ผลิตภัณฑ์เกล็ดโลหิตที่มีการปนเปื้อนของเชื้อแบคทีเรีย อาจก่อให้การติดเชื้อในกระแสโลหิตที่รุนแรงและนำไปสู่การเสียชีวิตได้ ดังนั้นจึงมีการกำหนดมาตรฐานให้งานธนาคารโลหิต ทำการตรวจการปนเปื้อนเชื้อแบคทีเรียในผลิตภัณฑ์เกล็ดโลหิตก่อนนำไปใช้กับผู้ป่วย เพื่อลดอาการไม่พึงประสงค์ที่อาจเกิดขึ้น วิธีการตรวจการปนเปื้อนเชื้อแบคทีเรียในผลิตภัณฑ์เกล็ดโลหิตในปัจจุบันยังมีข้อจำกัดที่พบได้บางประการ อาทิเช่น การเพาะเลี้ยงเชื้อแบคทีเรียที่ไม่สามารถปฏิบัติได้ในห้องปฏิบัติการทางธนาคารโลหิต การทดสอบที่ใช้ระยะเวลานาน ซึ่งไม่เหมาะสมกับอายุการเก็บรักษาผลิตภัณฑ์เกล็ดโลหิตที่สั้นประมาณ 5 วัน และต้นทุนของการทดสอบที่มีราคาแพง วัตถุประสงค์ของการศึกษาครั้งนี้เพื่อพัฒนาเทคนิค Helicase dependent amplification ควบคู่กับการอ่านผลด้วยตาเปล่าโดยใช้สี SYBR Green I (HDA/SYBR Green I) สำหรับตรวจหาการปนเปื้อนเชื้อแบคทีเรียในผลิตภัณฑ์เกล็ดโลหิต โดยใช้ Primer ที่ถูกออกแบบให้จำเพาะต่อยีน 16s rRNA ซึ่งเป็น Universal gene ของเชื้อแบคทีเรีย ผลการทดสอบกับตัวอย่างผลิตภัณฑ์เกล็ดโลหิตที่ปนเปื้อนเชื้อแบคทีเรียแบบจำลอง ณ วันต่าง ๆ จำนวน 96 ตัวอย่าง พบว่าเทคนิค HDA/SYBR Green I มีความไวและความจำเพาะสูง เท่ากับ 96% และ 100% ตามลำดับ และมีความสอดคล้องกันในระดับดีมาก เมื่อเปรียบเทียบกับเทคนิค HDA/AGE เมื่อเปรียบเทียบกับเทคนิค PCR การนับจำนวนโคโลนี และเครื่องอัตโนมัติ BacT/Alert System พบว่าเทคนิค HDA/SYBR Green I มีความจำเพาะสูงเท่ากับ 100% แต่มีความไวอยู่ในช่วงระหว่าง 63-76% จึงทำให้มีความสอดคล้องกันในระดับปานกลางถึงดี อย่างไรก็ดี เมื่อนำเทคนิค HDA/SYBR Green I ตรวจการปนเปื้อนเชื้อแบคทีเรียในผลิตภัณฑ์เกล็ดโลหิตเฉพาะวันที่ 2 ถึง 5 ของการเก็บรักษา พบว่ามีความไวที่สูงขึ้น เท่ากับ 88% และมีความสอดคล้องกันในระดับดีมาก เทคนิค HDA/SYBR Green I มีค่าความเข้มข้นน้อยที่สุดของ DNA ต้นแบบที่สามารถตรวจได้ เท่ากับ 1 ng และไม่เกิดปฏิกิริยาข้ามกลุ่มกับสิ่งมีชีวิตอื่น ๆ ที่มีโอกาสพบการปนเปื้อนได้ในผลิตภัณฑ์เกล็ดโลหิต เทคนิค HDA/SYBR Green I …

การประยุกต์ใช้เทคนิคการเรียนรู้ของคอมพิวเตอร์เพื่อพัฒนาตัวแบบทางเหมืองข้อมูลสำหรับพยากรณ์ระดับฮีโมโกลบินของผู้บริจาคโลหิต, สาธิต เทศสมบูรณ์

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

ปริมาณโลหิตและส่วนประกอบโลหิตที่เพียงพอในธนาคารเลือดนั้นมีความสำคัญในการรักษาผู้ป่วย ดังนั้นธนาคารเลือดทุกแห่งต้องส่งเสริมให้ผู้บริจาคโลหิตมีสุขภาพดีและมีคุณสมบัติเหมาะสมในการบริจาคโลหิตอย่างสม่ำเสมอจากข้อมูลของศูนย์บริการโลหิตแห่งชาติ สภากาชาดไทยพบผู้ถูกปฏิเสธการบริจาคโลหิตประมาณร้อยละ 15-20 จากจำนวนผู้ประสงค์จะบริจาคโลหิตทั้งหมด ส่วนใหญ่มีสาเหตุจากค่าฮีโมโกลบิน (hemoglobin; Hb) ไม่ผ่านเกณฑ์ นำไปสู่ความผิดหวังความไม่พอใจเพราะผู้บริจาคโลหิตต้องเสียเวลา ค่าใช้จ่ายในการเดินทางแต่ไม่ได้บริจาคโลหิตและส่งผลกระทบต่อการจัดหาโลหิตโดยตรง หากสามารถพยากรณ์ผลตรวจ Hb ได้ล่วงหน้าจะช่วยลดผลกระทบปัญหา เป็นประโยชน์ทั้งต่อผู้บริจาคโลหิต ธนาคารเลือดและผู้ป่วย การศึกษานี้มีวัตถุประสงค์เพื่อพัฒนาและเปรียบเทียบประสิทธิภาพเทคนิคการเรียนรู้ของคอมพิวเตอร์ในการพยากรณ์จำแนกกลุ่มผลตรวจ Hb ของผู้บริจาคโลหิต โดยเก็บข้อมูล 44 ตัวแปรของผู้บริจาคโลหิตจำนวน 2,180 รายจากภาคบริการโลหิตแห่งชาติ 12 แห่งและสถานีกาชาดหัวหินเฉลิมพระเกียรติตั้งแต่ 1 ต.ค. 2561 ถึง 31 พ.ค. 2562 นำมากลั่นกรองข้อมูล คัดเลือกตัวแปร พัฒนาตัวแบบทางเหมืองข้อมูลได้แก่ ต้นไม้ตัดสินใจ ซัพพอร์ตเวกเตอร์แมชชีน การจำแนกแบบเบส์อย่างง่ายและโครงข่ายประสาทเทียม จากนั้นเปรียบเทียบประสิทธิภาพการจำแนกกลุ่มของตัวแบบพยากรณ์ พบว่าต้นไม้ตัดสินใจเป็นตัวแบบการจำแนกกลุ่มที่เหมาะสมที่สุดโดยให้ค่าความถูกต้อง ค่าความไว ค่าความจำเพาะ ค่าการพยากรณ์ผลบวก ค่าการพยากรณ์ผลลบสูงที่สุดและค่า AUC เท่ากับร้อยละ 92.20, 82.98, 94.74, 81.25, 95.29 และ 0.943 ตามลำดับ ซึ่งต้นไม้ตัดสินใจที่ได้จากศึกษานี้อาจนำไปพัฒนาต่อเป็นระบบประเมินออนไลน์ก่อนเดินทางมาบริจาคโลหิตได้