Genetics Commons^™

การหาความชุกและการกระจายสายพันธุ์ของเชื้อบลาสโตซิสติสในผู้ป่วยโรคเบาหวานและผู้ที่ไม่เป็นโรคเบาหวาน ณ อำเภอบางปะอิน จังหวัดพระนครศรีอยุธยา ประเทศไทย, นพพล โพธิ์พฤกษ์

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

โรคเบาหวานเป็นหนึ่งในปัญหาด้านสาธารณสุขทั่วโลกโดยพบผู้ป่วยโรคเบาหวานเพิ่มขึ้นอย่างต่อเนื่อง โรคเบาหวานเพิ่มความเสี่ยงต่อการติดเชื้อแบคทีเรีย เชื้อรา ไวรัสและปรสิต การศึกษาแบบภาคตัดขวางครั้งนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษาความชุก ชนิดสายพันธุ์ และปัจจัยเสี่ยงต่อการติดเชื้อบลาสโตซิสติสของผู้ป่วยโรคเบาหวานและผู้ที่ไม่เป็นโรคเบาหวานในพื้นที่อำเภอบางปะอิน จังหวัดพระนครศรีอยุธยา ในช่วงเดือนพฤศจิกายน พ.ศ. 2562 ถึงเดือนกุมภาพันธ์ พ.ศ. 2563 ตัวอย่างอุจจาระและแบบสอบถามเก็บรวบรวมจากผู้ป่วยโรคเบาหวาน 130 คนและผู้ที่ไม่เป็นโรคเบาหวาน 100 คน โดยนำตัวอย่างอุจจาระทั้งหมดมาตรวจหาเชื้อบลาสโตซิสติส ด้วยวิธี simple smear technique และตรวจหายีน small subunit ribosomal DNA ของเชื้อบลาสโตซิสติสด้วยเทคนิค nested PCR และจำแนกสายพันธุ์ด้วยเทคนิค Sanger sequencing วิเคราะห์ความสัมพันธ์ของปัจจัยเสี่ยงต่อการติดเชื้อบลาสโตซิสติสโดยใช้การทดสอบไคสแควร์และอัตราส่วน odds (odds ratio) ที่ช่วงเชื่อมั่น 95% ผลการศึกษาพบว่า พบผู้ติดเชื้อบลาสโตซิสติสจำนวน 25 คน จากตัวอย่างอุจจาระทั้งหมด 230 คน คิดเป็นความชุกของการติดเชื้อบลาสโตซิสติสร้อยละ 10.9 การติดเชื้อชนิดนี้ในกลุ่มผู้ป่วยโรคเบาหวานและผู้ที่ไม่เป็นโรคเบาหวานคิดเป็นร้อยละ 12.3 และร้อยละ 9 ตามลำดับ ในขณะที่สายพันธุ์ของเชื้อบลาสโตซิสติสที่ตรวจมากที่สุดประกอบด้วย สายพันธุ์ที่ 3 สายพันธุ์ที่ 1 และสายพันธุ์ที่ 4 ตามลำดับ การศึกษาปัจจัยเสี่ยง ได้แก่ ภาวะโรคเบาหวาน เพศ อายุ ระดับการศึกษา อาชีพ ประเภทห้องน้ำ การมีสัตว์เลี้ยง ความถี่ของการรับประทานอาหารสุกๆดิบๆ การล้างผักและผลไม้ก่อนรับประทาน การล้างมือก่อนและหลังทำกิจกรรมต่างๆ และการขับถ่ายโดยใช้ห้องส้วม ไม่มีความสัมพันธ์ต่อการติดเชื้อบลาสโตซิสติสอย่างมีนัยสำคัญทางสถิติ แต่พบว่ามีแนวโน้มการติดเชื้อบลาสโตซิสติสที่สูงในเพศชาย ผู้ที่มีอายุมากกว่าหรือเท่ากับ 65 ปี ผู้ที่เป็นโรคเบาหวาน ระยะเวลาการเป็นโรคเบาหวานตั้งแต่ 10 ปีขึ้นไป ผู้ที่ใช้ห้องส้วมแบบราดน้ำหรือนั่งยอง รวมทั้งผู้ที่มีสัตว์เลี้ยง ผลของการศึกษานี้เป็นข้อมูลสำคัญที่เป็นประโยชน์เพื่อใช้ในการกำหนดแนวทางการควบคุมและป้องกันการติดเชื้อดังกล่าวในกลุ่มผู้ป่วยโรคเบาหวานและผู้ที่ไม่เป็นโรคเบาหวานในชุมชนต่อไป

การแสดงออกของโปรตีนจากเอ็กซ์ตราเซลลูลาร์เวสิเคิลของเซลล์แมคโครฟาจภายหลังการติดเชื้อ Neisseria Gonorrhoeae, สหรัฐ นันทวงค์

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

โรคหนองในเป็นโรคติดต่อทางเพศสัมพันธ์ที่เกิดจากการติดเชื้อไนซีเรีย โกโนเรีย (Neisseria gonorrhoeae) โดยมีอุบัติการณ์มากที่สุดในกลุ่มของโรคติดต่อทางเพศสัมพันธ์ในประเทศไทยและทั่วโลก จากการรายงานขององค์การอนามัยโลก ผู้ป่วยจำนวนมากไม่แสดงอาการของโรคโดยเฉพาะในผู้ป่วยหญิง ผู้ป่วยที่ไม่ได้รับการรักษาจะทำให้เกิดการติดเชื้อของระบบสืบพันธุ์ส่วนบนและนำไปสู่การเป็นหมันและการตั้งครรภ์นอกมดลูก พยาธิสภาพของโรคเกิดจากการเหนี่ยวนำให้เกิดการรวมกลุ่มของเซลล์ในระบบภูมิคุ้มกันและกระบวนการอักเสบโดยเซลล์แมคโครฟาจซึ่งเป็นเซลล์สำคัญในระบบภูมิคุ้มกันแบบกำเนิด การตอบสนองของเซลล์ต่อการติดเชื้อภายในเซลล์สามารถติดตามได้จากเอ็กต์ตราเซลลูลาร์เวสิเคิลที่ผลิตออกจากเซลล์แมคโครฟาจ เช่น การติดเชื้อวัณโรค ลิชมาเนีย และซัลโมเนลา ที่พบการเปลี่ยนแปลงส่วนประกอบโปรตีนของเซลล์แมคโครฟาจและของเชื้อภายในเซลล์ การปลดปล่อยเวสิเคิลนั้นจะมีผลต่อการกระตุ้นการทำงาน กระบวนการอักเสบ และปรับเปลี่ยนการทำงานของเซลล์ในระบบภูมิคุ้มกันได้ ในการศึกษานี้จึงมุ่งเน้นการแสดงออกและค้นหาโปรตีนในเอ็กต์ตราเซลลูลาร์เวสิเคิลจากเซลล์แมคโครฟาจทั้งชนิดติดเชื้อและไม่ติดเชื้อ N. gonorrhoeae โดยนำเซลล์เม็ดเลือดขาว THP-1 ที่ถูกกระตุ้นให้เป็นเซลล์แมคโครฟาจเกิดกระบวนการฟาโกไซโทซิสเชื้อ N. gonorrhoeae เข้าไปภายในเซลล์ ติดตามการแสดงออกของโปรตีนภายในเวสิเคิล และวิเคราะห์โปรตีนด้วย Tandem mass spectrometry ซึ่งพบการเปลี่ยนแปลงส่วนประกอบโปรตีนภายในเวสิเคิลที่ครอบคลุมโปรตีนของเซลล์แมคโครฟาจและของเชื้อ ทั้งยังพบว่ามีความแตกต่างกันทั้งชนิดและการแสดงออกจำเพาะในช่วงเวลาของการติดเชื้อ เมื่อนำผลวิเคราะห์เปรียบเทียบกับฐานข้อมูลชีวสารสนเทศทั้ง Vesiclepedia, PANTHER และ Uniprot database ศึกษาคุณสมบัติและหน้าที่ของโปรตีนภายในเวสิเคิล โปรตีนของมนุษย์ และโปรตีนของเชื้อ N. gonorrhoeae ตามลำดับ ทำให้บ่งชี้ถึงความสัมพันธ์และบทบาทต่อเซลล์แมคโครฟาจในช่วงเวลาที่ทดสอบ ผลการศึกษานี้สามารถนำไปเป็นข้อมูลเพื่อพัฒนาการตรวจติดตามเชื้อก่อโรคหนองในและองค์ความรู้ในความเข้าใจบทบาทของเอ็กต์ตราเซลลูลาร์เวสิเคิลต่อพยาธิสภาพและการดำเนินไปของโรคหนองใน

ความชุกและรูปแบบลายพิมพ์อาร์อีพีของยีน Blaoxa-51, Blandm-1, Blaadc, Apha6 และ Isaba125 ใน Acinetobacter Baumannii ที่แยกได้จากสิ่งส่งตรวจของผู้ป่วย จังหวัดพิษณุโลก, จริยา ศรชัย

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

Acinetobacter baumannii เป็นเชื้อที่สำคัญที่ก่อให้เกิดการติดเชื้อภายในโรงพยาบาลและมีการดื้อยาปฏิชีวนะหลายชนิดเพิ่มมากขึ้น โดยการสร้างเอนไซม์ทำลายยาเป็นกลไกการดื้อยาที่มีความสำคัญและพบได้บ่อย ในการศึกษาครั้งนี้ได้ทำในเชื้อ A. baumannii ที่แยกได้จากสิ่งส่งตรวจตั้งแต่เดือนกรกฎาคม 2561 ถึง กุมภาพันธ์ 2562 จำนวน 257 ตัวอย่าง นำมาตรวจหาความชุกของยีนที่สร้างเอนไซม์ beta-lactamase เอนไซม์ cephalosporinase เอนไซม์ aminoglycoside-modifying enzymes (AMEs) และอินเซอร์ชันซีเควน (ISAba125) โดยปฏิกิริยาลูกโซ่พอลิเมอเรส และหาความหลากหลายทางสายพันธุ์ของเชื้อด้วยวิธี repetitive element polymerase chain reaction (REP-PCR) ผลการศึกษาพบว่าเชื้อ A. baumannii 221 ตัวอย่าง (ร้อยละ 86.0) เป็นเชื้อที่ดื้อยาหลายชนิด (multidrug-resistant A. baumannii : MDR-AB) โดยเชื้อ A. baumannii 257 ตัวอย่าง ให้ผลบวกกับยีน blaOXA-51 คิดเป็นร้อยละ 100.0 รองลงมาได้แก่ ยีน blaADC ยีน blaNDM-1 ยีน ISAba125 และยีน aphA6 คิดเป็นร้อยละ 38.5, 8.2, 6.2 และ 2.3 ตามลำดับ โดยพบ blaOXA-51 ร่วมกับยีน blaADC มากที่สุดคิดเป็นร้อยละ 35.0 ในการศึกษาครั้งนี้สามารถจำแนกความหลากหลายทางสายพันธุ์ของเชื้อ A. baumannii ด้วยวิธี rep-pcr ได้ 18 กลุ่ม โดยพบว่ากลุ่มที่ 1 และ กลุ่มที่ 2 ซึ่งเป็นกลุ่มหลักที่ใหญ่ที่สุด กลุ่มที่ 1 พบยีน blaOXA-51 (ร้อยละ 59.7) และ blaOXA-51 ร่วมกับยีน …

ผลกระทบของยีน Flaa และ Flid ของเชื้อ Helicobacter Pylori ต่อการตายของเซลล์มะเร็งเยื่อบุกระเพาะอาหาร, ณัฐฐวุฒิ วิเวโก

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

เชื้อ Helicobacter pylori เป็นแบคทีเรียก่อโรคในระบบทางเดินอาหารของมนุษย์ที่มีความสำคัญทางคลินิก การติดเชื้อ H. pylori มีความสัมพันธ์กับการเกิดเป็นโรคมะเร็งกระเพาอาหาร เนื่องจากเชื้อมีปัจจัยความรุนแรงในการก่อโรคหลายชนิด อาทิ ความสามารถในการสร้างเอนไซม์ยูรีเอสปริมาณมาก การสร้างสารพิษประเภท CagA และ VacA การใช้แฟลเจลลาในการเคลื่อนที่แบบควงสว่านเข้าสู่ชั้นเยื่อเมือกของกระเพาะอาหาร การยึดเกาะกับเซลล์เยื่อบุกระเพาะอาหาร รวมทั้งการกระตุ้นให้เซลล์เกิดการตายแบบอะพอพโทซิสที่นำมาสู่การพัฒนากลายเป็นโรคมะเร็งกระเพาะอาหารได้ แฟลเจลลาของเชื้อ H. pylori มีส่วนช่วยในการเคลื่อนที่และเป็นสารที่ใช้ในการยึดเกาะที่สำคัญของเชื้อ อีกทั้งยังถูกสันนิษฐานว่าอาจมีส่วนกระตุ้นในการทำให้เซลล์เยื่อบุผิวเกิดการตาย การควบคุมการสร้างและการทำงานของแฟลเจลลาเกิดขึ้นจากการทำงานร่วมกันของยีนหลายชนิด โดยมียีน flaA ทำหน้าที่ควบคุมการสร้างโปรตีนแฟลเจลลินหลักของแฟลเจลลา และยีน fliD ทำหน้าที่ควบคุมการสร้าง capping protein หุ้มส่วนปลายของแฟลเจลลา การศึกษานี้มีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษาผลกระทบของยีน flaA และยีน fliD ของเชื้อ H. pylori ต่อการเคลื่อนที่ของเชื้อ การยึดเกาะและการกระตุ้นให้เกิดการตายแบบอะพอพโทซิสของเซลล์เยื่อบุผิว Human gastric adenocarcinoma (AGS) โดยทำการศึกษาลักษณะของสายแฟลเจลลาวิธีย้อมด้วยสี leifson-tannic acid fuchsin และด้วยกล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอนแบบส่องผ่าน เปรียบเทียบกันระหว่างเชื้อ H. pylori สายพันธุ์มาตรฐาน ATCC 43504 และเชื้อ H. pylori สายพันธุ์ที่มีการกลายพันธุ์ของยีน flaA และ ยีน fliD เชื้อดังกล่าวทั้งหมดยังถูกนำมาทดสอบการเคลื่อนที่ในอาหารกึ่งแข็งกึ่งเหลว และเพาะเลี้ยงร่วมกับเซลล์ AGS เพื่อทดสอบการยึดเกาะกับเซลล์ด้วยวิธี adhesion assay และการกระตุ้นให้เซลล์ที่ติดเชื้อตายด้วยการย้อมสี Annexin/ PI และวัดสัญญาณด้วย flow cytometry พบว่าเชื้อ H. pylori ที่มีการกลายพันธุ์ทั้งสองสายพันธุ์ไม่สามารถสร้างสายแฟลเจลลาที่มีรูปร่างสมบูรณ์ได้ ทั้งนี้เชื้อ H. pylori ที่มีการกลายพันธุ์ของยีน flaA มีความสามารถในการเคลื่อนที่และการยึดเกาะกับเซลล์ AGS ลดลงอย่างมีนัยสำคัญ ในขณะที่เชื้อ H. pylori ที่มีการกลายพันธุ์ของยีน fliD สามารถยึดเกาะเซลล์ AGS ได้มากขึ้นเมื่อเปรียบเทียบกับเชื้อ H. pylori สายพันธุ์มาตรฐาน …

เทคนิคใหม่ทางคอมพิวเตอร์ในการอ่านผล Treponema Pallidum Particle Agglutination Test (Tppa), ภาคภูมิ เดชหัสดิน

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

ซิฟิลิสเป็นโรคติดเชื้อที่มีสาเหตุมาจากเชื้อแบคทีเรีย Treponema pallidum ผ่านทางกระแสโลหิต สารคัดหลั่งของร่างกาย ซึ่งสามารถติดต่อจากมารดาไปยังทารกในครรภ์ อีกทั้งสามารถติดต่อทางเพศสัมพันธ์ได้ ซึ่งการติดเชื้อดังกล่าวส่งผลกระทบต่อพยาธิสภาพของร่างกายหลายระบบ นอกจากนี้ซิฟิลิสยังสามารถถ่ายทอดผ่านการรับโลหิตและผลิตภัณฑ์ของโลหิตจากผู้บริจาคที่ติดเชื้อ ด้วยเหตุนี้งานทางธนาคารโลหิตจึงจำเป็นต้องตรวจคัดกรองซิฟิลิสในโลหิตของผู้บริจาคโลหิตทุกราย โดยนิยมใช้เทคนิคการตรวจทางภูมิคุ้มกันวิทยา การศึกษาครั้งนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อสร้างเครื่องต้นแบบบันทึกภาพและซอฟต์แวร์ที่ออกแบบโดยใช้ภาษา C# ที่สามารถบันทึกภาพ อ่านและแปลผลผลปฏิกิริยา ของการทดสอบทางภูมิคุ้มกันวิทยาด้วยวิธี Treponema pallidum Particle Agglutination (TPPA) และเปรียบเทียบประสิทธิภาพการอ่านและแปลผลระหว่างเครื่องต้นแบบ กับการอ่านและแปลผลด้วยตาเปล่าโดยผู้ปฏิบัติงาน การศึกษาใช้ตัวอย่างพลาสมาของผู้ป่วยที่เข้ารับการรักษาที่คลีนิคนิรนาม ศูนย์วิจัยโรคเอดส์ สภากาชาดไทย และพลาสมาของผู้บริจาคโลหิต ที่ได้รับความอนุเคราะห์จาก ศูนย์บริการโลหิตแห่งชาติ สภากาชาดไทย จำนวนทั้งสิ้น 65 ตัวอย่าง ซึ่งทั้งหมดได้ผ่านการตรวจซิฟิลิสด้วยวิธี Chemiluminescent Microparticle Immunoassay (CMIA) พบว่า เมื่อนำเครื่องบันทึกภาพต้นแบบและซอฟท์แวร์ที่พัฒนาขึ้น มาอ่านปฏิกิริยา TPPA เปรียบเทียบกับการอ่านผลด้วยตาเปล่าโดยเจ้าหน้าที่ผู้ปฏิบัติงาน พบว่าให้ผลตรงกันในแต่ละระดับของปฏิกิริยาจำนวน 60 ตัวอย่าง และไม่ตรงกันในแต่ละระดับของปฏิกิริยาจำนวน 5 ตัวอย่าง ส่งผลให้มีความสอดคล้องของทั้งสองเมื่อวิเคราะห์ด้วยสถิติ Kappa = 0.88 แสดงให้เห็นถึงความสอดคล้องในระดับดีมาก อย่างไรก็ตามหากพิจารณาเฉพาะการอ่านผล reactive โดยมิได้คำนึงถึงระดับปฏิกิริยา พบว่าทั้งสองวิธีอ่านให้ผลปฏิกิริยาตรงกัน 64 ตัวอย่าง และไม่ตรงกันจำนวนเพียง 1 ตัวอย่าง ส่งผลให้มีความสอดคล้องของทั้งสองเมื่อวิเคราะห์ด้วยสถิติ Kappa = 0.98 แสดงให้เห็นถึงว่าความสอดคล้องในระดับดีมาก ดังนั้น เครื่องบันทึกภาพต้นแบบและซอฟท์แวร์ที่พัฒนาขึ้น สามารถช่วยอ่านและแปลผลปฏิกิริยาของการทดสอบด้วยวิธี TPPA ในการตรวจวินิจฉัยโรคซิฟิลิสได้อย่างมีประสิทธิภาพ ใช้เวลาอ่านผลที่รวดเร็วกว่าการอ่านผลโดยผู้ปฏิบัติงาน ไม่มีความคลาดเคลื่อนในการอ่านผลที่อาจเกิดจากปัจจัยของผู้ปฏิบัติงาน ใช้วัสดุอุปกรณ์ราคาถูก สามารถนำไปพัฒนาต่อยอดและประยุกต์ใช้ยังห้องปฏิบัติการทั่วไปได้

Wading In A Glycan Sea: Investigations Of, And Developing Bioinformatic Tools For, Carbohydrate Active Enzymes And Gene Clusters In Prokaryotes, Catherine Ann Ausland

Graduate Research Theses & Dissertations

Carbohydrates are immensely important biomolecule found in all organisms on earth, serving roles in structure, energy storage, protection and/or cell signaling. Carbohydrates are composed of an immense diversity of linkages, monosaccharide moieties and substitutions making them likely the most diverse biomolecule on earth, as well as the most abundant, being synthesized by plants and algae. Carbohydrates are synthesized and degraded by all organisms on earth through the expression of carbohydrate active enzymes, or ‘CAZymes’. In bacteria, CAZymes have been characterized to cluster in with transporters, regulators and/or other genes in so-called ‘polysaccharide utilization loci’, or PULs, to degrade carbohydrate substrates …

Association Between Maoa U Vntr Genetic Polymorphism And Aggression, Gender, And Race In Adolescents, Almaz Adair Johnson

Walden Dissertations and Doctoral Studies

A genetic polymorphism found in the upstream region of the monoamine oxidase A (MAOA) gene upstream variable number tandem repeat (u VNTR) has been shown to have an influence on aggression with mixed results. The purpose of this quantitative study was to examine the association between the u VNTR genetic polymorphism of the MAOA gene and aggression in an adolescent population 13–18 years of age. The conceptual framework was based on the biosocial model of antisocial behavior that indicates genes can influence aggressive behaviors with or without environmental influences. Data (N = 2506) from the National Longitudinal Adolescents and Adult …

Dna Methylation Patterns Of Repetitive Elements On Hc21, Navy Neang

Master's Theses

Cancer is one of the most prominent diseases resulting in death, thus the need for early detection remains essential to its treatments. It is usually associated with DNA methylation changes during tumorigenesis. While many studies focus on euchromatin, some studies have looked at the methylation changes in heterochromatin, since the methylation changes of repetitive elements is common and they contribute to karyotypic instability leading to enhanced chances for more mutations in tumor progression. Using bisulfite PCR and HC21 as a model, this study examines the DNA methylation changes of three repetitive elements in prostate cancer, NBL2, satellite I subfamilies, and …

Optimization And Validation Of The Neurolux Wireless Optoelectronics System For Optogenetics, Karis Courey, Su Hyun Lee Ph.D., Adam Smith Ph.D., Nicholas Cilz Ph.D., Sarah K. Williams Avram Ph.D., Adi Cymerblit-Sabba Ph.D., June Song, Nicholas Leipzig Ph.D., W. Scott Young M.D., Ph.D.

Williams Honors College, Honors Research Projects

Utilizing light and genetic engineering, optogenetics permits the manipulation of events within cells via light using the light-sensitive properties of single-component microbial opsins. Microbial opsins are activated by a light source, such as lasers, light-emitting diodes, and incandescent sources that deliver light to the region of interest either directly or indirectly, such as through fiberoptics. In classical in vivo optogenetics, the wiring of optic fibers necessitates tethering of animals by the optic fiber to the light source. The novel NeuroLux wireless optoelectronic system for optogenetics circumvents issues pertaining to classical optogenetics by utilizing near-field power transfer via magnetic coil antennae …

Spatial And Temporal Genetic Structure Of Winter-Run Steelhead (Oncorhynchus Mykiss) Returning To The Mad River, California, Steven R. Fong

Cal Poly Humboldt theses and projects

Distinct populations of steelhead in the wild are in decline. The propagation of steelhead in hatcheries has been used to boost population numbers for recreational fisheries and for use in conservation. However, hatchery breeding practices of steelhead can result in changes in genetic structure. I investigated the genetic structure of winter-run steelhead (Oncorhynchus mykiss) returning to the Mad River, California, where a hatchery has been used enhance production for recreational fisheries since 1971. Genetic variability in Mad River steelhead was evaluated using 96 single nucleotide polymorphisms (SNPs) among 4203 individuals, including the Mad River and nearby locations, and …

Conospermum Undulatum: Insights Into Population Genetics And Pollination Ecology Of A Threatened Species, Nicola Delnevo

Theses: Doctorates and Masters

Fragmentation of natural vegetation is currently one of the largest threats to biodiversity. Within the southwest Australia global biodiversity hotspot, the Swan Coastal Plain was historically cleared for agriculture and forestry and is now experiencing extensive land clearing for urbanisation. The wavy-leaved smokebush Conospermum undulatum is a rare species endemic to the Swan Coastal Plain, and its future persistence is threatened by urban expansion.

Throughout this research, I investigated the pollination ecology of this species and found a specific association between C. undulatum and native bees for pollination. I also demonstrated that C. undulatum has evolved pollen with resistance to …

Current Dog Breeding Practices Impacts On Health And Preservation Of Purebred Dogs, Bridget E. Baker

Honors Theses and Capstones

No abstract provided.

Genetic Variation Within A Broadly Distributed Chewing Louse Genus (Thomomydoecus), Clarissa Elizabeth Bruns

Honors Program Theses

No broad study has been conducted to examine the genetics of Thomomydoecus species and their patterns of geographic variation. Chewing lice and their parasite-host relationships with pocket gophers have been studied as a key example of cophylogeny (Demastes et al., 2012). Despite this, genetic data on interspecific and intraspecific variation in Thomomydoecus is unexplored, and prior studies consisted within the narrow frame of one complex or species and its relative host gopher. This project collected, and analyzed genetic data, then generated phylogenetic trees. Many of the existing relationships between Thomomydoecus species was confirmed, and there were a number of unexpected …

Evidence Of Y Chromosome Long Non-Coding Rnas Involved In The Radiation Response Of Male Non-Small Cell Lung Cancer Cells, Tayvia Brownmiller

Graduate Theses, Dissertations, and Problem Reports (ETD)

Non-small cell lung cancer (NSCLC) is the number one cause of cancer related mortality in the United States and worldwide. Advanced and therapeutically resistant lung tumors contribute to the high rate of mortality from NSCLC, therefore there is a need for new methods of diagnosing and treating this disease. Long non-coding RNAs (lncRNAs) have been shown to be a crucial component of human molecular biology, regulating nearly every cellular pathway from chromatin condensation to transcription and translation. Furthermore, many lncRNAs have been classified as oncogenes or tumor suppressors, highlighting the various molecular mechanisms they are involved in regarding the formation …

Monitoring Mammal Community Shifts Across Silvicultural Treatments Utilizing Camera Traps And The Development Of Invertebrate- Derived Dna In Hardwood Forests Of North America, Shallen Gurtler

Dissertations, Master's Theses and Master's Reports

Mammal distribution and diversity is quickly changing as humans modify the landscape. In particular, silviculture, which is the practice of controlling the growth, structure, and quality of forests to meet the needs of society and the landowner, influences the habitat usage of mammals. Utilizing camera traps, I monitored shifts in mammal communities across different silviculture treatments in the northern hardwood forests of the Great Lakes region in North America. I assessed the community composition across six canopy treatments and three understory treatments with a total of 2,018 active camera trap nights with 3,321 detections over the course of 147 days. …

Genetic Evidence, Maoa, And State V. Yepez, Nita A. Farahany, Roderick T. Kennedy, Brandon L. Garrett

Faculty Scholarship

No abstract provided.

Peroxiredoxin 6 And Inflammation In Alzheimer's Disease, Jared Ferrell-Penniman

Biological Sciences Theses and Dissertations

Alzheimer’s disease (AD) is known for its debilitating symptoms and poor prognosis. However, despite intense research into neurodegenerative diseases, there are few therapies targeted at the underlying mechanisms of the disease. Oxidative stress (OS) and inflammation are cellular phenomena thought to be key to the progression of the disease. Critically, peroxiredoxin 6 (Prx6), an antioxidant protein with multiple functions, has been identified from mammalian studies as a potential regulator of both OS and inflammation that may have a specific effect on AD. This project seeks to elucidate the role of Prx6 in AD as well as the underlying mechanisms. Drosophila …

The Role Of Histone Chaperone Fact Complex In Base Excision Repair Pathway And Its Therapeutic Potential In Colon Cancer And Medulloblastoma, Heyu Song

Theses & Dissertations

Base excision repair (BER) pathway is required for the removal of damaged bases caused by alkylation, oxidation and ring-saturation. Human apurinic/apyrimidinic endonuclease 1 (APE1) plays a central role in BER pathway. Although repair of damaged bases by recombinant APE1 has been well investigated in vitro, how APE1 gains access to damaged bases in the context of chromatin is largely unknown. A prominent member of the histone chaperone family, FACT (Facilitates Chromatin Transcription) is thought to reorganize nucleosomes through the destabilization of multiple intra-nucleosome contacts. FACT complex is composed of two polypeptides identified as SPT16 (Suppressor of Ty 16) and SSRP1 …

Genetic And Biochemical Analysis Of A Conserved, Multi-Gene System Regulation Spore-Associated Proteins In Streptomyces Coelicolor, Joseph Sallmen

Electronic Theses and Dissertations

Streptomyces coelicolor is a Gram positive, filamentous soil dwelling bacterium that exhibits a complex life cycle including the transition from a vegetative mycelium to a sporulating, aerial mycelium. Early genetic studies identified two classes of genes that resulted in developmental blocks, bald and white. The bald (bld) phenotype occurs when colonies cannot produce aerial hyphae. White (whi) colonies exhibit incomplete sporulation and/or loss of production of the concurrently produced grey pigment. While some of the original mutants have been explored, the developmental functions of many of the identified genes are not well understood. Of particular interest …

A "Choose-Your-Own" Classroom-Based Activity That Promotes Scientific Inquiry About Rna Interference, Jeremy L. Hsu

Biology, Chemistry, and Environmental Sciences Faculty Articles and Research

RNA interference (RNAi), the process that results in the degradation of a target gene’s mRNA, is a fundamental part of eukaryotic gene regulation and is also an important molecular technique that allows for experimental manipulation of gene expression without altering DNA sequences. Despite the importance of RNAi, there have been relatively few lecture-based activities designed to teach about the consequences of this process and counter common misconceptions. I present here an inquiry-based activity that is centered around a “choose your own experiment” design where students generate hypotheses and critically evaluate their ideas by choosing several simulated experiments. The activity presents …