Chemistry Commons^™

Modulatory Effects Of Deacetylated Sialic Acids (A Sugar Residue) In Nk-Mediated Cytotoxicity And Targeted Therapy By Receptor Tyrosine Kinase Inhibitors, Mathias Tawiah Anim

Electronic Theses and Dissertations

The complex nature of the biology of cancer is still an unraveling science, yielding several biomarkers that have served as molecular targets for detection and treatment of the disease. How sugars, glycans, play a role has remained relatively uninvestigated. Sialic acid (Sia), a sugar residue on the surface of cells, has been identified as a hallmark of cancer and its progression. Sialic acid can be highly functionalized, but we became interested in acetylated Sias. This functional group is modulated by Sialate O- acetylesterase (encoded by the gene SIAE) and Sialate O-acetyltransferase (encoded by CASD1), enzymes that play a crucial role …

Isolation And Identification Of Chlorate-Reducing Hafnia Sp. From Milk, William P. Mccarthy, Meghana Srinivas, Martin Danaher, Christine O'Connor, Tom F. O'Callaghan, Douwe Van Sinderen, John Kenny, John T. Tobin

Articles

Chlorate has become a concern in the food and beverage sector, related to chlorine sanitizers in industrial food production and water treatment. It is of particular concern to regulatory bodies due to the negative health effects of chlorate exposure. This study investigated the fate of chlorate in raw milk and isolated bacterial strains of interest responsible for chlorate breakdown. Unpasteurized milk was demonstrated to have a chlorate-reducing capacity, breaking down enriched chlorate to undetectable levels in 11 days. Further enrichment and isolation using conditions specific to chlorate-reducing bacteria successfully isolated three distinct strains of Hafnia paralvei . Chlorate-reducing bacteria were …

Design Of Block Copolymer With Tunable Hydrophobic/Hydrophilic/Fluorophilic Interactions, Tatiane De Fatima Dutra

Theses, Dissertations and Culminating Projects

Block copolymers (BCP) with balanced interactions and their resultant bulk-phase self-assembly have become increasingly important in advancing nanotechnology, separation, and energy applications. However, a few reports have addressed the synthesis challenge and bulk-phase self-assembly of such triblock copolymers. This thesis presents a facile route for preparing triblock copolymer via controlled radical and organocatalytic ring-opening polymerization that allows precise control over the incorporation of individual moieties in resultant polymer, responsible for balanced hydrophilic, hydrophobic/lipophilic, and fluorophilic interactions. Synthesized polymer with suggested self-assembled 2D lamellar nanostructure exhibits high-temperature stability. The long-term goal of this work is to selectively use this polymer class …

A Computational Study Of The Copper-Catalyzed Trifluoromethylation Of Boronic Acids, Kevin Nyhuis

Theses, Dissertations and Culminating Projects

This work is a computational study of a reaction mechanism for the trifluoromethylation of boronic acids. Three steps of the proposed reaction mechanism are studied, •CF₃ addition to a copper catalyst center, base promoted transmetalation between copper and aryl boronic acid, and bond forming reductive elimination in which the CF₃ and aryl substituent form a bond. Limited information is known about this mechanism. This study uses computational methods to attempt to elucidate the mechanism and provide the groundwork for potential improvement. Quantum chemical methods in conjunction with tight-binding based conformational sampling methods are used to investigate the possible …

Investigating The Roles Of Active Site Residues K59, K119 And E168 In M. Tuberculosis Indole-3-Glycerol Phosphate Synthase, Maryum M. Bhatti

Theses, Dissertations and Culminating Projects

Tuberculosis (TB) is a disease that is caused by a bacteria called Mycobacterium tuberculosis and primarily attacks the lungs but can spread to other areas of the body as well. TB can develop resistance to drugs that may be used to cure the disease. Multidrug resistant TB is especially a growing issue as it does not respond to the two most powerful anti-TB drugs, isoniazid and rifampicin. For this reason, finding new ways to target TB are critically needed. One possible way to do this is to target the enzymes in the tryptophan biosynthetic pathway of M. tuberculosis. Studies have …

Arginine-178 Is An Essential Residue For Itpa Function, Nicholas E. Burgis, Caitlin April, Kandise Vanwormer

Chemistry and Biochemistry Faculty Publications

The inosine triphosphate pyrophosphatase (ITPA) enzyme plays a critical cellular role by removing noncanonical nucleoside triphosphates from nucleotide pools. One of the first pathological ITPA mutants identified is R178C (rs746930990), which causes a fatal infantile encephalopathy, termed developmental and epileptic encephalopathy 35 (DEE 35). The accumulation of noncanonical nucleotides such as inosine triphosphate (ITP), is suspected to affect RNA and/or interfere with normal nucleotide function, leading to development of DEE 35. Molecular dynamics simulations have shown that the very rare R178C mutation does not significantly perturb the overall structure of the protein, but results in a high level of structural …

Impact Of Sample Conditions On Dna Phosphodiester Backbone Bi/Bii Conformational Equilibrium Dynamics, Autumn C. Pilarski

Graduate Theses/Dissertations

DNA damage, such as single base lesions and mismatches, is highly prevalent within cells. If these DNA damage events are not repaired, they could lead to mutations and thus disease and cancer. Intricate repair mechanisms are in place to fix these damage events, one such being Base Excision Repair (BER) and associated enzyme: Thymine DNA Glycosylase (TDG). The first step of this repair process, recognition of the lesion by TDG, is not well understood. The following thesis presents results to better understand the fundamental biophysical question of how a DNA lesion within a mismatch context is recognized in a million …

The Biological Responses Of Vitamin K2: A Comprehensive Review, Quanxiang Yan, Tao Zhang, Christine O'Connor, James W. Barlow, John Walsh, Gaia Scalabrino, Feng Xu, Helan Sheridan

Articles

Vitamin K1 (VitK1) and Vitamin K2 (VitK2), two important naturally occurring micronutrients in the VitK family, found, respectively, in green leafy plants and algae (VitK1) and animal and fermented foods (VitK2). The present review explores the multiple biological functions of VitK2 from recently published in vitro and in vivo studies, including promotion of osteogenesis, prevention of calcification, relief of menopausal symptoms, enhancement of mitochondrial energy release, hepato-and neuro-protective effects, and possible use in treatment of coronavirus disease. The mechanisms of action associated with these biological effects are also explored. Overall, the findings presented here suggest that VitK, especially VitK2, is …

Investigating Visinin-Like Protein 1 And Ubiquitinated Visinin-Like Protein 1 As Mild Traumatic Brain Injury Biomarkers, Yueming Wu

Theses and Dissertations--Chemistry

Traumatic brain injury (TBI) continues to be a significant cause of morbidity and mortality worldwide. Despite significant progress in understanding the complex pathophysiology of TBI, the underlying mechanisms remain poorly understood. The primary brain damage is acute and irreversible. However, secondary brain injuries often develop gradually over months to years, creating an opportunity for critical therapeutic interventions. In the past decade, research on TBI biomarkers has seen significant progress. This progress has been driven by the diverse nature of TBI pathologies and the challenges they present for evaluation, management, and prognosis. TBI biomarker proteins resulting from axonal, neuronal, or glial …

College Of Natural Sciences 2022 Year-End Publication, College Of Natural Sciences

College of Natural Sciences Newsletters and Reports

This is the 2022 issue of the annual College of Natural Sciences year-end publication.

Contents:
[Page] 2 Dean's message
[Page] 3 Department highlights
[Page] 4 Overview of Bold & Blue Campaign
[Page] 5 Dr. Edward Hogan recognition & endowment
[Page] 6 Career milestones
[Page] 7 Student travel and research
[Page] 8 $11 million COBRE grant
[Page] 9 Professional Science Masters & Research highlights
[Page]10 Outreach highlights throughout the state
[Page] 11 2022 events recap – join us in 2023!
[Page] 12 Updates on our VR initiative
[Page] 14 Overview of awards and recognitions from 2022

Creating Meaningful Connections With The Electr Eating Meaningful Connections With The Electron Transport Chain Beyond A Virtual Classroom, Lesley Ann Giddings

Chemistry: Faculty Publications

At the center of feminist pedagogy is community. Creating community within the classroom and between the class and local communities increases student engagement and access to knowledge. Communities can be a source of solidarity and further decenter authority in the classroom, empowering students, teachers, and the surrounding community to be co-learners. Amid the COVID-19 pandemic, remote teaching posed challenges to student engagement. Here, I describe an assignment used to build an inclusive community of co-learners within a virtual biochemistry class and our local communities. Oxidative phosphorylation is a cellular process used to create energy that depends on the electron transport …

Lead Induced Differences In Bone Properties In Osteocalcin +/+ And −/− Female Mice, G. Yildirim, W. C. Budell, O. Berezovska, S. Yagerman, S. S. Maliath, P. Mastrokostas, S. Tommasini, T. L. Dowd

Publications and Research

Lead (Pb) toxicity is a major health problem and bone is the major reservoir. Lead is detrimental to bone, affects bone remodelingand is associated with elderly fractures. Osteocalcin (OC) affects bone remodeling, improves fracture resistance and decreases with age and in some diseases. The effect of lead in osteocalcin depleted bone is unknown and of interest. We compared bone mineral properties of control and Pb exposed (from 2 to 6 months) femora from female adult C57BL6 OC+/+ and OC−/− mice using Fourier Transform Infrared Imaging (FTIRI), Micro-computed tomography (uCT), bone biomechanical measurements and serum turnover markers (P1NP, CTX). Lead significantly …

การพัฒนาบล็อกคอนกรีตปูพื้นจากกากของเสียในกระบวนการเผาไหม้แบบฟลูอิไดซ์เบด, ณัฐวรรณ ดวงแก้ว

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

งานวิจัยนี้ศึกษาการใช้ประโยชน์เถ้าลอย และทรายของเสีย (ขนาดละเอียดและหยาบ) จากกระบวนการเผาไหม้แบบฟลูอิไดซ์เบดเพื่อนำความร้อนมาใช้ในการอบแห้งในกระบวนการผลิตกระดาษ มาใช้เป็นวัตถุดิบในการเตรียมบล็อกคอนกรีต 2 ประเภทวัสดุ คือ คอนกรีตฐานปูนซีเมนต์ปอร์ตแลนด์ และคอนกรีตฐานจีโอพอลิเมอร์ สำหรับการเตรียมคอนกรีตฐานปูนซีเมนต์ปอร์ตแลนด์ ได้ศึกษาผลของการใช้เถ้าลอยทดแทนส่วนของปูนซีเมนต์ปอร์ตแลนด์ (วัสดุประสาน) และศึกษาอัตราส่วนของทรายของเสีย (มวลรวม) ต่อวัสดุประสาน ที่มีต่อสมบัติของคอนกรีต ขึ้นรูปด้วยวิธีการอัด บ่มชิ้นงานเป็นเวลา 1 7 และ 28 วัน พบว่าตัวอย่างที่มีเถ้าลอยทดแทนปูนซีเมนต์ปอร์ตแลนด์ร้อยละ 15 โดยน้ำหนักของวัสดุประสาน และมีอัตราส่วนของ มวลรวมต่อวัสดุประสาน เท่ากับ 1:1 โดยน้ำหนัก ที่อายุ 7 วัน มีค่ากำลังอัด 45 MPa เป็นไปตามมาตรฐาน มอก.827-2531 นอกจากนั้นยังได้นำส่วนผสมดังกล่าวมาเตรียมบล็อกประสานปูพื้นฐานปูนซีเมนต์ปอร์ตแลนด์ที่มีขนาดและรูปทรงตามมาตรฐานดังกล่าวด้วยเครื่องผลิตบล็อกคอนกรีต พบว่าสามารถเตรียมบล็อกประสานปูพื้นฐานปูนซีเมนต์ปอรต์แลนด์ที่มีเถ้าลอยทดแทนส่วนของปูนซีเมนต์ปอร์ตแลนด์ได้ ในส่วนของการศึกษาความเป็นไปได้ในการผลิตบล็อกฐานจีโอพอลิเมอร์เป็นการทดลองเตรียมจีโอพอลิเมอร์แบบส่วนเดียว โดยใช้เถ้าลอยร่วมกับสารแอลคาไลซึ่งประกอบด้วย โซเดียมซิลิเกตและโซเดียมไฮดรอกไซด์ (วัสดุประสาน) และผสมกับมวลรวมในสัดส่วนของวัสดุประสานต่อมวลรวมเท่ากับ 1:1 เช่นเดียวกับการเตรียมบล็อกคอนกรีตฐานซีเมนต์ ใช้อัตราส่วนผสมน้ำต่อวัสดุประสานเท่ากับ 0.31 ขึ้นรูปด้วยวิธีการอัด โดยศึกษาผลของสัดส่วนของเถ้าลอยต่อสารอัลคาไล และสัดส่วนของโซเดียมซิลิเกตต่อโซเดียมไฮดรอกไซด์ ที่มีต่อสมบัติของคอนกรีต พบว่าชิ้นงานที่ใช้เถ้าลอยร้อยละ 80 โดยน้ำหนักของวัสดุประสาน และใช้สารอัลคาไล (โซเดียมซิลิเกตต่อโซเดียมไฮดรอกไซด์เท่ากับ 60:40 โดยน้ำหนัก) ร้อยละ 20 โดยน้ำหนักของวัสดุประสาน ที่อายุ 28 วัน มีกำลังอัด 5.45 MPa ซึ่งเป็นค่าที่ต่ำกว่าค่าตามมาตรฐาน มอก.827-2531 จึงไม่สามารถใช้ทำบล็อกประสานปูพื้นได้ แต่ค่ากำลังอัดของบล็อกฐานจีโอพอลิเมอร์ก็สูงมากพอสำหรับผลิตบล็อกกลวงไม่รับน้ำหนักตาม มอก.58-2560

Development Of Novel Cellular Assay Model And Therapeutic Deep Eutectic Solvents To Optimize The Activity Of Anticancer Agents, Nizam Uddin

Electronic Theses and Dissertations

Multidrug resistance (MDR) is the major burden behind chemotherapeutic treatment failure. It is the principal mechanism by which cancer cells evade chemotherapeutic treatment. As a result, aggressive cancer cells survive and continue uncontrolled cell division. Multidrug resistance affects survival rate of almost all types of cancer patients and death toll rises at an alarming rate. There are seven different mechanisms for evolving MDR. The most common mechanism in efflux activity of overexpressed ABC transporters. MRP1 is a prominent ABC transporter that pumps out a wide variety of anticancer drugs from the cells and thereby reduces intracellular drug concentrations and develops …

Exogenous Factors That Impact Huntingtin Aggregation, Adam Skeens

Graduate Theses, Dissertations, and Problem Reports (ETD)

While expansion of a polyglutamine (polyQ) domain is the immediate cause of huntingtin (htt) aggregation associated with Huntington’s Disease (HD), other cellular factors modify aggregation. These include interactions with cellular membranes, protein biding partners, molecular crowding, and proteinaceous seeds. Here, two important factors are biophysically characterized: 1) the interaction of htt with endomembranes and 2) proteinaceous seeds obtained from a variety of htt-derived peptides. In the first project, the aggregation of htt at bilayer interfaces and in the presence of divalent cations was investigated. A major cellular factor implicated in altered htt aggregation is the binding of lipids. Furthermore, the …

Sound The (Smaller) Alarm: The Triphosphate Magic Spot Nucleotide Pgpp, Areej Malik, Megan A. Hept, Erin B. Purcell

Chemistry & Biochemistry Faculty Publications

It has recently become evident that the bacterial stringent response is regulated by a triphosphate alarmone (pGpp) as well as the canonical tetra- and pentaphosphate alarmones ppGpp and pppGpp [together, (p)ppGpp]. Often dismissed in the past as an artifact or degradation product, pGpp has been confirmed as a deliberate endpoint of multiple synthetic pathways utilizing GMP, (p)ppGpp, or GDP/GTP as precursors. Some early studies concluded that pGpp functionally mimics (p)ppGpp and that its biological role is to make alarmone metabolism less dependent on the guanine energy charge of the cell by allowing GMP-dependent synthesis to continue when GDP/GTP has been …

Thermotrophy Exploratory Study, James Weifu Lee

Chemistry & Biochemistry Faculty Publications

The question of whether environmental heat energy could be utilized as a source of energy for biological metabolism is the center of this exploratory research. In 1979, this author postulated a hypothesis for the existence of thermotrophs that could isothermally utilize environmental heat energy as a source of their energy on Earth. According to this hypothesis, the thermotrophs could be the first primitive forms of life in the early Earth environment. The chemotrophs and phototrophs that we currently are all well familiar with might have been evolved somehow from the primitive thermotrophs. Furthermore, all the organisms currently regarded as the …

Halogen Bonding Interactions Of Haloaromatic Endocrine Disruptors And The Potential For Inhibition Of Iodothyronine Deiodinases, Craig A. Bayse

Chemistry & Biochemistry Faculty Publications

Halogen bonding (XB) is a potential mechanism for the inhibition of the thyroid-activating/deactivating iodothyronine deiodinase family of selenoproteins through interactions with halogenated endocrine disrupting compounds (EDCs). Trends in XB interactions were examined using density functional theory for a series of polyhalogenated dibenzo-1,4-dioxins, biphenyls, and other EDCs with methylselenolate, a simple model of the Dio active site selenocysteine. The strengths of the interactions depend upon the halogen (Br>Cl), the degree of substitution, and the position of the acceptor. In terms of donor-acceptor energies, interactions at the meta position are often the strongest, suggesting a link to the topology of THs, …

Telp Theory: Elucidating The Major Observations Of Rieger Et Al. 2021 In Mitochondria, James Weifu Lee

Chemistry & Biochemistry Faculty Publications

The transmembrane-electrostatically localized protons (TELP) theory may represent a complementary development to Mitchell's chemiosmotic theory. The combination of the two together can now excellently explain the energetics in mitochondria. Our calculated transmembrane-attractive force between an excess proton and an excess hydroxide explains how TELP may stay within a 1-nm thin layer at the liquid-membrane interface. Consequently, any pH sensor (sEcGFP) located at least 2–3 nm away from the membrane surface will not be able to see TELP. This feature as predicted from the TELP model was observed exactly in the experiment of Rieger et al., 2021. In contrast to their …

Enhancing The Conformational Stability Of The Cl-Par-4 Tumor Suppressor Via Site-Directed Mutagenesis, Samjhana Pandey, Krishna K. Raut, Antoine Baudin, Lamya Djemri, David S. Libich, Komala Ponniah, Steven M. Pascal

Chemistry & Biochemistry Faculty Publications

Intrinsically disordered proteins play important roles in cell signaling, and dysregulation of these proteins is associated with several diseases. Prostate apoptosis response-4 (Par-4), an approximately 40 kilodalton proapoptotic tumor suppressor, is a predominantly intrinsically disordered protein whose downregulation has been observed in various cancers. The caspase-cleaved fragment of Par-4 (cl-Par-4) is active and plays a role in tumor suppression by inhibiting cell survival pathways. Here, we employed site-directed mutagenesis to create a cl-Par-4 point mutant (D313K). The expressed and purified D313K protein was characterized using biophysical techniques, and the results were compared to that of the wild-type (WT). We have …

How Akron Affects The Water Quality Of The Cuyahoga River, Allyson Darst

Williams Honors College, Honors Research Projects

The purpose of this study was to analyze whether the city of Akron had negative effects on the Cuyahoga river, and determine if the Cuyahoga River was naturally able to remediate these effects downstream. The pollutants measured in this study include hardness, bromine, residual chlorine, iron, copper, lead, nitrate, nitrite, ammonium chloride, total chlorine, fluoride, carbonate, pH, total alkalinity and cyanuric acid. This study was done using water testing strips (JNW Direct) to test the water at four different locations along the Cuyahoga River downstream (North) of Akron. This study found that the city of Akron does have a negative …

The Affect Of Dha Concentration On Lipid Membrane Fluidity, Elise Rezabeck

Williams Honors College, Honors Research Projects

My proposed project will be creating large unilaminar vesicles with varying concentrations of DHA in the vesicles. The diffusion in and out of these vesicles will be tracked by using singular lipid molecules. These singular lipid molecules will be tagged with fluorescence and viewed using an internal reflection fluorescence microscope. The data collected over the course of this project will then be analyzed using Matlab. The result of the project will be to find the specific lipid diffusion constant of these unilaminar vesicles. The relationship between the concentration of DHA and lipid diffusion and membrane fluidity will be found as …

Expanding Our Grasp Of Two-Component Signaling In Clostridioides Difficile, Orlando Berumen Alvarez, Erin B. Purcell

Chemistry & Biochemistry Faculty Publications

The intestinal pathogen Clostridioides difficile encodes roughly 50 TCS, but very few have been characterized in terms of their activating signals or their regulatory roles. A. G. Pannullo, B. R. Zbylicki, and C. D. Ellermeier (J Bacteriol 205:e00164-23, 2023, https://doi.org/10.1128/jb.00164-23) have identified both for the novel C. difficile TCD DraRS. DraRS responds to antibiotics that target lipid-II molecules in the bacterial cell envelope, and regulates the production of a novel glycolipid necessary for bacitracin and daptomycin resistance in C. difficile.

A Monoadduct Generating Ru(Ii) Complex Induces Ribosome Biogenesis Stress And Is A Molecular Mimic Of Phenanthriplatin, Richard Joseph Mitchell, Sarah M. Kriger, Alexander D. Fenton, Dmytro Havrylyuk, Ankit Pandeya, Yang Sun, Tami Smith, Jason E. Derouchey, David K. Heidary, Edith C. Glazer

Markey Cancer Center Faculty Publications

Ruthenium complexes are often investigated as potential replacements for platinum-based chemotherapeutics in hopes of identifying systems with improved tolerability in vivo and reduced susceptibility to cellular resistance mechanisms. Inspired by phenanthriplatin, a non-traditional platinum agent that contains only one labile ligand, monofunctional ruthenium polypyridyl agents have been developed, but until now, few demonstrated promising anticancer activity. Here we introduce a potent new scaffold, based on [Ru(tpy)(dip)Cl]Cl (tpy = 2,20:60,200-terpyridine and dip = 4,7-diphenyl-1,10-phenanthroline) in pursuit of effective Ru(II )-based monofunctional agents. Notably, the extension of the terpyridine at the 40 position with an aromatic ring resulted in a molecule that …

Polycomb Deficiency Drives A Foxp2-High Aggressive State Targetable By Epigenetic Inhibitors, Fan Chen, Aria Byrd, Jinpeng Liu, Robert M. Flight, Tanner Ducote, Kassandra J. Naughton, Xiulong Song, Abigail R Edgin, Alexsandr Lukyanchuk, Danielle T. Dixon, Christian M. Gosser, Dave-Preston Esoe, Rani Jayswal, Stuart H. Orkin, Hunter N. B. Moseley, Chi Wang, Christine Fillmore Brainson

Markey Cancer Center Faculty Publications

Inhibitors of the Polycomb Repressive Complex 2 (PRC2) histone methyltransferase EZH2 are approved for certain cancers, but realizing their wider utility relies upon understanding PRC2 biology in each cancer system. Using a genetic model to delete Ezh2 in KRAS-driven lung adenocarcinomas, we observed that Ezh2 haplo-insufficient tumors were less lethal and lower grade than Ezh2 fully-insufficient tumors, which were poorly differentiated and metastatic. Using three-dimensional cultures and in vivo experiments, we determined that EZH2-deficient tumors were vulnerable to H3K27 demethylase or BET inhibitors. PRC2 loss/inhibition led to de-repression of FOXP2, a transcription factor that promotes migration and stemness, and FOXP2 …

โปรตีนเข้มข้นจากโครงไก่: การเตรียมและการใช้ในผลิตภัณฑ์นักเก็ต, ชนากานต์ มณฑาทิพย์กุล

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

งานวิจัยนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษาภาวะที่เหมาะสมสำหรับการสกัดโปรตีนจากโครงไก่ เพื่อเตรียมโปรตีนเข้มข้นและนำมาศึกษาสมบัติทางเคมีกายภาพและสมบัติเชิงหน้าที่ของโปรตีนเข้มข้นจากโครงไก่และศึกษาผลของการเติมโปรตีนเข้มข้นต่อคุณภาพและเนื้อสัมผัสของผลิตภัณฑ์นักเก็ตไก่ ผลการศึกษาการสกัดโปรตีนด้วยสารละลายด่างที่ค่าความเป็นกรด-ด่าง 8.5 - 11.5 และระยะเวลาในการสกัด 30 - 300 นาที ด้วยวิธีพื้นผิวตอบสนองและการออกแบบการทดลองแบบส่วนผสมกลางพบว่าสมการการทำนายผลตอบสนองประสิทธิภาพในการผลิตโปรตีนเข้มข้นมีความเหมาะสมในการอธิบายความสัมพันธ์และทำนายค่าของตัวแปรอิสระให้มีความสัมพันธ์กับผลตอบสนองที่ต้องการ โดยค่าสัมประสิทธิ์การถดถอย (Regression coefficient) ของตัวแปรอิสระมีความสัมพันธ์กับประสิทธิภาพในการผลิตโปรตีนเข้มข้นในระบบฐานแห้ง (Dry basis) รวมถึงค่าสัมประสิทธิ์การตัดสินใจมีค่ามากกว่า 0.80 และมีค่า Root Mean Square Error (RMSE) ต่ำหมายความว่าค่าความแตกต่างเฉลี่ยกำลังสองระหว่างค่าที่ได้จากการทำนายกับค่าที่ได้จากการทดลองมีค่าต่ำ เมื่อพิจารณาค่า Adjusted r–Squared พบว่ามีค่าใกล้เคียงกับค่าสัมประสิทธิ์การตัดสินใจ การทำนายภาวะการสกัดโปรตีนจากโครงไก่จากการกำหนดเกณฑ์ของค่าประสิทธิภาพในการผลิตโปรตีนเข้มข้นสูงที่สุดพบว่าภาวะค่าความเป็นกรด-ด่างเท่ากับ 10.15 และระยะเวลาในการสกัดเท่ากับ 185 นาที เป็นภาวะที่เหมาะสมที่สุดสำหรับการสกัดโปรตีนจากโครงไก่ โดยค่าผลตอบสนองที่ได้จากการทำนายจากสมการมีความแตกต่างจากค่าที่ได้จากการทดลองเท่ากับ 12.67% เมื่อนำโปรตีนเข้มข้นที่ผลิตในภาวะที่เหมาะสมที่สุดมาทดสอบความสามารถในการอุ้มน้ำและค่าความสามารถในการเกิดอิมัลชันพบว่ายังมีความสามารถในการอุ้มน้ำต่ำกว่าเนื้อไก่ส่วนขาและส่วนอก (p < 0.05) จึงนำโปรตีนเข้มข้นมาพัฒนาสมบัติเชิงหน้าที่พบว่าการพัฒนาโปรตีนเข้มข้นด้วยกระบวนการปรับปรุงด้วยเกลือ ฟอสเฟตและความดันและการปรับปรุงด้วยเกลือ ฟอสเฟตและส่วนผสม (โปรตีนถั่วเหลืองไอโซเลท แป้งข้าวสาลี แป้งมันสำปะหลัง) และความดันส่งผลให้โปรตีนเข้มข้นมีความสามารถในการเกิดอิมัลชันและความสามารถในการคงตัวของอิมัลชันสูงกว่าโปรตีนเข้มข้นจากโครงไก่ที่ไม่ผ่านการปรับปรุงอยู่ในช่วงระหว่าง 6.03 - 12.27% และ 4.93 - 6.83% ตามลำดับ รวมถึงมีความสามารถในการละลายที่ดีกว่าเนื้อไก่ในช่วง pH เท่ากับ 6 - 7 เมื่อนำโปรตีนเข้มข้นเติมลงในผลิตภัณฑ์นักเก็ตไก่จะเห็นได้ว่าการเติมโปรตีนเข้มข้นที่สัดส่วนเท่ากับ 12.50% ส่งผลทำให้นักเก็ตไก่มีค่า Hardness, Gumminess และ Chewiness สูงกว่าสูตรปกติระหว่าง 3899.44 - 4324.59, 2676.22 - 3243.04 และ 2363.65 - 3011.87 g-force ในขณะที่ปริมาณโปรตีนและค่าสีของตัวอย่างนักเก็ตไม่มีความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญ (p ≥ 0.05) เมื่อเทียบกับสูตรควบคุม นอกจากนี้การใช้โปรตีนเข้มข้นมีส่งผลให้ประสิทธิภาพในการผลิตสูงกว่าสูตรปกติ โดยประสิทธิภาพในการผลิตของสูตรเติมโปรตีนเข้มข้นปรับปรุงด้วยเกลือ ฟอสเฟตและส่วนผสม (โปรตีนถั่วเหลืองไอโซเลท แป้งข้าวสาลี แป้งมันสำปะหลัง) และความดันมีค่าสูงที่สุดเท่ากับ 136.43% แต่อย่างไรก็ตามเมื่อพิจารณาจากต้นทุนในระดับ Commercial production scale พบว่าการเติมโปรตีนเข้มข้นด้วยกระบวนการปรับปรุงด้วยเกลือ ฟอสเฟตและความดันมีต้นทุนการผลิตต่ำที่สุด รวมถึงมีปริมาณโปรตีนและคุณภาพด้านสีไม่แตกต่างจากสูตรปกติ จึงเลือกโปรตีนเข้มข้นด้วยกระบวนการปรับปรุงด้วยเกลือ ฟอสเฟตและความดันเป็นกระบวนการปรับปรุงที่ดีที่สุด โดยในระยะเวลา 1 เดือนจะสามารถผลิตนักเก็ตไก่จากโปรตีนเข้มข้นได้ทั้งหมด 1250 กิโลกรัมและสามารถลดต้นทุนการผลิตได้ที่ 175 บาทต่อเดือน

Analysis Of ‘Touch’ Dna Recovered From Metal Substrates: An Investigation Into Cfdna-Metal Interactions And The Efficacy Of Different Collection Techniques On Dna Yield, Jessica E. Thornton

Graduate Theses, Dissertations, and Problem Reports (ETD)

While several improvements have been made in recent years to optimize the recovery of ‘touch’ DNA, relatively little research has been conducted to understand the relationship between ‘touch’ DNA and the binding affinity of that DNA to metal surfaces, specifically those with a significant copper presence. Furthermore, characterization of cell-free DNA (cfDNA) and its contribution to ‘touch’ samples and those cfDNA-metal interactions from objects commonly identified at crime scenes (cartridge casings, knives, doorknobs) have been lacking. Research has identified the tendency of copper ions to intercalate with DNA helices, resulting in sample degradation among other damaging conformational changes; however, while …

Cup Is Essential For Oskar Mrna Translational Repression During Early Drosophila Oogenesis, Livia V. Bayer, Samantha Milano, Stephen K. Formel, Harpreet Kaur, Rishi Ravichandran, Juan A. Cambeiro, Lizaveta Slinko, Irina E. Catrina, Diana P. Bratu

Publications and Research

Study of the timing and location for mRNA translation across model systems has begun to shed light on molecular events fundamental to such processes as intercellular communication, morphogenesis, and body pattern formation. In D. melanogaster, the posterior mRNA determinant, oskar, is transcribed maternally but translated only when properly localized at the oocyte’s posterior cortex. Two effector proteins, Bruno1 and Cup, mediate steps of oskar mRNA regulation. The current model in the field identifies Bruno1 as necessary for Cup’s recruitment to oskar mRNA and indispensable for oskar’s translational repression. We now report that this Bruno1-Cup interaction leads …

C-Glycopyranosyl Aldehydes: Emerging Chiral Synthons In Organic Synthesis, Sandeep Kumar, Vinod Khatri, Priyanka Mangla, Rajni Johar Chhatwal, Virinder S. Parmar, Ashok K. Prasad

Publications and Research

Herein, we have summarized the vast array of synthetic processes that have been developed for the synthesis of C-glycopyranosyl aldehydes and diverse C-glycoconjugates derived from them by covering the literature reported from 1979 to 2023. Notwithstanding its challenging chemistry, C-glycosides are considered stable pharmacophores and are used as important bioactive molecules. The discussed synthetic methodologies to access C-glycopyranosyl aldehydes take advantage of seven key intermediates, viz. allene, thiazole, dithiane, cyanide, alkene, and nitromethane. Furthermore, the integration of complex C-glycoconjugates derived from varied C-glycopyranosyl aldehydes involves nucleophilic addition/substitution, reduction, condensation, oxidation, cyclo condensation, coupling, and …

Molecular Mechanism Behind The Safe Immunostimulatory Effect Of Withania Somnifera, Kriti Kalpana, Shen Yap, Moriya Tsuji, Akira Kawamura

Publications and Research

Withania somnifera (L.) Dunal (family Solanaceae) is a medicinal plant known for, among many pharmacological properties, an immune boosting effect. Our recent study revealed that its key immunostimulatory factor is lipopolysaccharide of plant-associated bacteria. This is peculiar, because, although LPS can elicit protective immunity, it is an extremely potent pro-inflammatory toxin (endotoxin). However, W. somnifera is not associated with such toxicity. In fact, despite the presence of LPS, it does not trigger massive inflammatory responses in macrophages. To gain insights into the safe immunostimulatory effect of W. somnifera, we conducted a mechanistic study on its major phytochemical constituent, …