Biostatistics Commons^™

Characteristics Associated With Willingness To Participate In A Randomized Controlled Behavioral Clinical Trial Using Home-Based Personal Computers And A Webcam, Hiroko H. Dodge, Yuriko Katsumata, Jian Zhu, Nora Mattek, Molly Bowman, Mattie Gregor, Katherine Wild, Jeffrey A Kaye

Biostatistics Faculty Publications

BACKGROUND: Trials aimed at preventing cognitive decline through cognitive stimulation among those with normal cognition or mild cognitive impairment are of significant importance in delaying the onset of dementia and reducing dementia prevalence. One challenge in these prevention trials is sample recruitment bias. Those willing to volunteer for these trials could be socially active, in relatively good health, and have high educational levels and cognitive function. These participants' characteristics could reduce the generalizability of study results and, more importantly, mask trial effects. We developed a randomized controlled trial to examine whether conversation-based cognitive stimulation delivered through personal computers, a webcam …

Statistical Inference For The Mean Outcome Under A Possibly Non-Unique Optimal Treatment Strategy, Alexander R. Luedtke, Mark J. Van Der Laan

U.C. Berkeley Division of Biostatistics Working Paper Series

We consider challenges that arise in the estimation of the value of an optimal individualized treatment strategy defined as the treatment rule that maximizes the population mean outcome, where the candidate treatment rules are restricted to depend on baseline covariates. We prove a necessary and sufficient condition for the pathwise differentiability of the optimal value, a key condition needed to develop a regular asymptotically linear (RAL) estimator of this parameter. The stated condition is slightly more general than the previous condition implied in the literature. We then describe an approach to obtain root-n rate confidence intervals for the optimal value …

Mediation Analysis Of Gestational Age, Congenital Heart Defects, And Infant Birth-Weight, Adane F. Wogu, Christopher A. Loffredo, Ionut Bebu, George Luta

GW Biostatistics Center

Background

In this study we assessed the mediation role of the gestational age on the effect of the infant’s congenital heart defects (CHD) on birth-weight.

Methods

We used secondary data from the Baltimore-Washington Infant Study (1981–1989). Mediation analysis was employed to investigate whether gestational age acted as a mediator of the association between CHD and reduced birth-weight. We estimated the mediated effect, the mediation proportion, and their corresponding 95% confidence intervals (CI) using several methods.

Results

There were 3362 CHD cases and 3564 controls in the dataset with mean birth-weight of 3071 (SD = 729) and 3353 (SD = 603) …

A More Efficient Nonparametric Test Of Symmetry Based On Overlapping Coefficient, Hani M. Samawi, Robert L. Vogel

Biostatistics: Faculty Publications

In this paper we provide a more efficient nonparametric test of symmetry based on the empirical overlap coefficient using kernel density estimation applied to an extreme order statistics, namely extreme ranked set sampling. Our simulation investigation reveals that our proposed test of symmetry is at least as powerful as currently available tests of symmetry. Intensive simulation is conducted to examine the power of the proposed test. An illustration is provided using cardiac output and body weight of neonates in a neonatal intensive care unit.

Methods For Identifying Regions Of Brain Activation Using Fmri Meta-Data, Meredith A. Ray

Theses and Dissertations

Functional neuroimaging is a relatively young discipline within the neurosciences that has led to significant advances in our understanding of the human brain and progress in neuroscientific research related to public health. Accurately identifying activated regions in the brain showing a strong association with an outcome of interest is crucial in terms of disease prediction and prevention. Functional magnetic resonance imaging (fMRI) is the most widely used method for this type of study as it has the ability to measure and identify the location of changes in tissue perfusion, blood oxygenation, and blood volume. In practice, the three-dimensional brain locations …

Simulation Based Evaluation Of Multiscale Small Area Health Models, Purbasha Dasgupta

Theses and Dissertations

The effects of scale on the analysis of spatial data, often referred to as the modifiable areal unit problem in spatial studies, is one of the issues often encountered in small area health models. These spatial effects of scale are also seen in the areas of disease mapping where data are usually available in counts. Often there is a need to consider the different scales of aggregation that exist within count data, since inferences based on analyses can vary if we change the definition of the unit of analysis. This thesis provides a framework that describes the distribution of relative …

Access To Hiv Prevention And Care For Hiv-Exposed And Hiv-Infected Children: A Qualitative Study In Rural And Urban Mozambique, Caroline De Schacht, Carlota Lucas, Caterina Mboa, Michelle Gill, Eugenia Macasse, Stelio A. Dimande, Emily A. Bobrow, Laura Guay

Epidemiology Faculty Publications

Background Follow-up of HIV-exposed children for the delivery of prevention of mother-to-child transmission services and for early diagnosis and treatment of HIV infection is critical to their survival. Despite efforts, uptake of postnatal care for these children remains low in many subSaharan African countries. Methods A qualitative study was conducted in three provinces in Mozambique to identify motivators and barriers to improve uptake of and retention in HIV prevention, care and treatment services for HIV-exposed and HIV-infected children. Participant recommendations were also gathered. Individual interviews (n=79) and focus group discussions (n=32) were conducted with parents/caregivers, grandmothers, community leaders and health …

Prognostic Value Of Lymphocyte Vascular Density And E-Cadherin In Inflammatory Breast Cancer, Paul H. Levine, Heather J. Hoffman, Audra Macneil, Salman Hashmi, Sherry X. Yang, Stephen Hewitt, Kenneth L. Van Golen, Sandra M. Swain

Epidemiology Faculty Publications

Background: We recently evaluated four laboratory assays, vascular endothelial growth factor D (VEGF-D), E-cadherin, lymphatic vessel density (LVD) measured by podoplanin, and intra-lymphatic tumor emboli (ILTE), which showed notable differences between inflammatory breast cancer (IBC) and non-inflammatory locally advanced breast cancer (LABC). In this study we investigated the potential of the three most quantitatively measured markers, E-cadherin, LVD and VEGF-D, to predict survival in the IBC patients.

Materials and Methods: This study involved the 100 cases identified in the Inflammatory Breast Cancer Registry (IBCR) whose tumors were previously evaluated for the four assays noted above. Living patients were recontacted and …

The Effectiveness Of Teleglaucoma Versus In-Patient Examination For Glaucoma Screening: A Systematic Review And Meta-Analysis, Sera-Melisa Thomas, Maya M Jeyaraman, Maya Jeyaraman, William G Hodge, Cindy Hutnik, John Costella, Monali S Malvankar-Mehta

Epidemiology and Biostatistics Publications

BACKGROUND: Glaucoma is the leading cause of irreversible visual impairment in the world affecting 60.5 million people worldwide in 2010, which is expected to increase to approximately 79.6 million by 2020. Therefore, glaucoma screening is important to detect, diagnose, and treat patients at the earlier stages to prevent disease progression and vision loss. Teleglaucoma uses stereoscopic digital imaging to take ocular images, which are transmitted electronically to an ocular specialist. The purpose is to synthesize literature to evaluate teleglaucoma, its diagnostic accuracy, healthcare system benefits, and cost-effectiveness.

METHODS: A systematic search was conducted to help locate published and unpublished studies. …

Identifying Change Points In A Covariate Effect On Time-To-Event Analysis With Reduced Isotonic Regression, Yong Ma, Yinglei Lai, John M. Lachin

GW Biostatistics Center

Isotonic regression is a useful tool to investigate the relationship between a quantitative covariate and a time-to-event outcome. The resulting non-parametric model is a monotonic step function of a covariate X and the steps can be viewed as change points in the underlying hazard function. However, when there are too many steps, over-fitting can occur and further reduction is desirable. We propose a reduced isotonic regression approach to allow combination of small neighboring steps that are not statistically significantly different. In this approach, a second stage, the reduction stage, is integrated into the usual monotonic step building algorithm by comparing …

Overview Of Inference About Roc Curve In Medical Diagnosis, Jingjing Yin

Biostatistics: Faculty Publications

Medical diagnosis aims to identify diseased individuals through the evaluation of the measurements of some biomarkers by performing a diagnostic test based on some biomarker measurements. Biomarkers are measured on either discrete or continuous scale and continuous biomarkers are utilized more often in medical practice. This article introduces the most popular tool for evaluating continuous biomarkers: the Receiver Operating Characteristic (ROC) curve.

Assessing The Social And Ecological Factors That Influence Childhood Overweight And Obesity, Katie Callahan

Electronic Theses and Dissertations

The prevalence of childhood overweight and obesity is increasing at an alarming rate in the United States. Currently more than 1 in 3 children aged 2-19 are overweight or obese. This is of major concern because childhood overweight and obesity leads to chronic conditions such as type II diabetes and tracks into adulthood, where more severe adverse health outcomes arise. In this study I used the premise of the social ecological model (SEM) to analyze the common levels that a child is exposed to daily; the intrapersonal level, the interpersonal level, the school level, and the community level to better …

Pengaruh Rejimen Terhadap Ketidakpatuhan Berobat Tuberkulosis, Rizka Nur Fadila, Pandu Riono

Kesmas

Beban tuberkulosis di Indonesia termasuk lima tertinggi di dunia. Temuan kasus dan pengobatan adalah pilar utama program penanggulangan tuberkulosis. Survei nasional menunjukkan peningkatan penggunaan rejimen tidak standar dari 16,8% (2010) menjadi 55,6% (2013). Peningkatan penggunaan rejimen tidak standar diduga berpengaruh terhadap ketidakpatuhan berobat. Penelitian ini bertujuan untuk mempelajari ketidakpatuhan berobat pada orang dengan tuberkulosis yang menerima rejimen tidak standar dan rejimen standar. Penelitian menggunakan data sekunder Riset Kesehatan Dasar 2010. Analisis logistik multivariabel dilakukan pada sampel 971 orang dengan tuberkulosis yang selesai mendapatkan pengobatan. Hasil penelitian menunjukkan ada kecenderungan orang dengan tuberkulosis yang menerima rejimen tidak standar memiliki ketidakpatuhan berobat …

Annual Parasite Incidence Malaria Di Kabupaten Banyumas, Dwi Sarwani Sri Rejeki, Ruthi Armita Sari, Nunung Nurhayati

Kesmas

Kabupaten Banyumas merupakan kabupaten endemis malaria di Provinsi Jawa Tengah. Data Dinas Kesehatan Kabupaten Banyumas tahun 2008 - 2013 menunjukkan angka annual paracite incidence (API) yang selalu mengalami fluktuasi. Dari 27 kecamatan, 22 di antaranya termasuk dalam kategori medium case incidence (MCI) dan low case incidence (LCI). Faktor lingkungan, perilaku, sosial ekonomi, dan iklim berdampak pada tinggi rendahnya kejadian malaria. Tujuan penelitian adalah mengetahui faktor yang berhubungan dengan API di Kabupaten Banyumas. Data dikumpulkan dari Januari 2011 - Desember 2013 menggunakan penelitian analitik dengan rancangan penelitian potong lintang dan menggunakan data sekunder dari Dinas Kesehatan, Dinas Pertanian, dan Badan Pusat …

Riwayat Pemberian Air Susu Ibu Dengan Penyakit Infeksi Pada Balita, Abidah Nur, Nelly Marissa

Kesmas

Riset Kesehatan Dasar tahun 2013 menyebutkan angka insiden diare pada balita di Indonesia sebesar 6,7%. Aceh merupakan provinsi dengan insiden diare tertinggi, mencapai 10,2%. Profil Kesehatan Aceh menunjukkan bahwa secara umum terjadi peningkatan penyakit infeksi seperti influenza, tuberkulosis, dan diare dalam kurun waktu tujuh tahun (2006 - 2012). Penyakit tersebut dapat dicegah dengan pemberian ASI yang berperan dalam peningkatan kekebalan tubuh. Penelitian ini dilakukan untuk mengetahui hubungan riwayat pemberian ASI dengan penyakit infeksi pada balita. Penelitian ini menggunakan data sekunder dari Badan Pusat Statistik Provinsi Aceh, yaitu data Survei Sosial dan Ekonomi Nasional tahun 2012 dengan jumlah sampel 3.486 balita. …

Analisis Risiko Karakteristik, Sosial Ekonomi, Perilaku Dan Kondisi Lingkungan Rumah Terhadap Kejadian Malaria, Susy Sriwahyuni Sukiswo, Rinidar Rinidar, Sugito Sugito

Kesmas

Malaria merupakan penyakit menular yang menjadi perhatian global. Kecamatan Arongan Lambalek merupakan daerah rawan malaria di Kabupaten Aceh Barat dengan kategori Medium Incidence Area dengan nilai Annual Parasite Incidence (API) 3,67 per 1000 penduduk masih di atas target API Nasional pada fase eliminasi API kurang dari 1 per 1000 penduduk tahun 2013. Penelitian ini bertujuan menganalisis karakteristik, sosial ekonomi, perilaku, dan kondisi lingkungan rumah yang berpengaruh terhadap kejadian malaria di Kecamatan Arongan Lambalek, Kabupaten Aceh Barat. Jenis penelitian ini adalah observasional analitik dengan pendekatan kasus kontrol dengan metode penarikan sampel yaitu purposive sampling. Jumlah sampel dalam penelitian ini terdiri 33 …

Mutu Pelayanan Puskesmas Perawatan Yang Berstatus Badan Layanan Umum Daerah, Putu Ayu Indrayathi, Rina Listyowati, Ni Made Sri Nopiyani, Luh Putu Sinthya Ulandari

Kesmas

Kebijakan pusat pelayanan kesehatan masyarakat (puskesmas) sebagai Badan Layanan Umum Daerah (BLUD) diimplentasikan untuk meningkatkan kualitas pelayanan kesehatan dasar. Kebijakan BLUD puskesmas telah diterapkan di Kabupaten Gianyar sejak tahun 2010 dan berlaku pada puskesmas perawatan maupun nonperawatan. Pelaksanaan BLUD puskesmas tidak selalu meningkatkan mutu layanan. Penelitian ini bertujuan mengetahui gambaran mutu pelayanan puskesmas perawatan yang berstatus BLUD di Kabupaten Gianyar. Penelitian ini merupakan penelitian potong lintang dengan pendekatan kuantitatif dan kualitatif. Tempat dan waktu penelitian ini dilakukan di Kabupaten Gianyar, Agustus hingga Desember 2013. Data kuantitatif dikumpulkan melalui penyebaran kuesioner kepada 105 pengguna layanan di empat puskesmas yang dipilih dengan …

Kondisi Kesehatan Lingkungan Pesantren Dan Perilaku Hidup Bersih Dan Sehat Siswa Dengan Kejadian Hepatitis, Ii Sumarni, Dewi Susanna

Kesmas

Kejadian luar biasa hepatitis A di Kabupaten Ciamis telah terjadi beberapa kali, satu di antaranya terjadi di Pondok Pesantren X. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis kondisi kesehatan lingkungan serta perilaku hidup bersih dan sehat dengan kejadian hepatitis A siswa/siswi di Pondok Pesantren X Kabupaten Ciamis. Rancangan penelitian menggunakan desain kasus kontrol dengan jumlah kasus 40 orang dan kontrol 80 orang, total sampel 120 orang. Populasi penelitian adalah siswa/siswi madrasah tsanawiyah dan madrasah aliyah negeri yang tinggal di asrama pondok pesantren. Data kasus merupakan data sekunder yang diperoleh dari Tim Surveilans Kabupaten Ciamis, dengan hasil pemeriksaan serologis positif. Sedangkan kontrol berdasarkan …

Determinants Of Multimorbidity Among The Elderly Population In Indonesia, Yeni Mahwati

Kesmas

Multimorbiditas adalah kehadiran dua atau lebih penyakit kronis pada satu orang. Prevalensi multimorbiditas meningkat dengan usia, terutama pada lanjut usia (lansia). Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui prevalensi dan determinan multimorbiditas pada lansia di Indonesia. Data diambil dari survei keempat Indonesian Family Life Survey (IFLS) yang diadakan pada tahun 2007. IFLS adalah survei sosial ekonomi dan kesehatan longitudinal di Indonesia. Sampel yang digunakan dalam analisis adalah 2.960 lansia (³ 60 tahun). Regresi logistik dilakukan untuk menentukan prevalensi dan determinan multimorbiditas pada lansia. Hasil penelitian menunjukkan prevalensi multimorbiditas sebesar 15,8%, dengan prevalensi lebih tinggi pada lansia yang overweight/obesitas, tingkat pendidikan rendah, tidak …

Pemakaian Kelambu Berinsektisida Pada Anak Usia 0-4 Tahun Terhadap Kejadian Malaria, Raden Ayu Aisyah, Dewi Susanna

Kesmas

Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui hubungan pemakaian kelambu berinsektisida dengan kejadian malaria pada anak usia 0-4 tahun di wilayah Puskesmas Galang Kecamatan Galang Kota Batam tahun 2013. Desain penelitian adalah potong lintang pada 132 responden. Hasil penelitian membuktikan bahwa pada tingkat signifikansi 5% terdapat hubungan bermakna antara jenis kelambu (OR = 4,6), lama pemakaian kelambu (OR = 2,9), cara pencucian kelambu (OR = 3,6), cara menjemur kelambu (OR = 2,8), dan pencelupan ulang kelambu (OR = 3,6) memiliki hubungan yang bermakna dengan kejadian malaria. Pendidikan (OR = 2,9), pekerjaan (OR = 2,8), dan lama bermukim (OR = 3,1) memiliki hubungan …

Efek Samping Obat Terhadap Kepatuhan Pengobatan Antiretroviral Orang Dengan Hiv/Aids, Fachri Latif, Ida Leida Maria, Muhammad Syafar

Kesmas

Tingkat kepatuhan pengobatan antiretroviral di Indonesia sangat rendah, yaitu 40 - 70%, yang masih di bawah target nasional dengan tingkat kepatuhan 95%. Berbeda dengan rata-rata nasional, Puskesmas Jumpandang Baru justru memiliki tingkat kepatuhan pengobatan antiretroviral pasien HIV/AIDS di atas 95%. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis faktor yang paling berpengaruh terhadap kepatuhan pengobatan antiretroviral orang dengan HIV/AIDS (ODHA). Jenis penelitian bersifat observasional analitik dengan pendekatan potong lintang. Populasi penelitian adalah 121 ODHA yang aktif menjalani pengobatan antiretroviral di Puskesmas Jumpandang Baru yang dipilih dengan menggunakan teknik exhaustive sampling. Sampel dalam penelitian ini adalah 121 sampel. Penelitian dilakukan pada 22 April hingga …

Prevalensi Sindrom Metabolik Pada Pekerja Perusahaan, Zahtamal Zahtamal, Yayi Suryo Prabandari, Lientje Setyawati

Kesmas

Sindrom metabolik adalah masalah kesehatan yang prevalensinya cenderung meningkat pada pekerja. Penelitian ini bertujuan memaparkan prevalensi kasus sindrom metabolik yang terjadi pada pekerja perusahaan. Penelitian ini dilakukan pada tahun 2014 pada dua perusahaan di Provinsi Riau dengan rancangan potong lintang. Sumber data adalah rekam medis pekerja yang melakukan medical check up periode Oktober 2013 hingga Februari 2014. Populasi adalah pekerja yang menderita sindrom metabolik sebanyak 131 orang. Sampel penelitian dipilih dengan cara total sampling yakni 131 orang. Instrumen adalah kuesioner, international physical activity questionnaire, tabel 24 hours food recall, dan tabel bantu pencatatan komponen sindrom metabolik. Pengelolaan data dilakukan secara …

Perubahan Pola Konsumsi Pangan Sumber Zat Goitrogenik Sianida Dan Cara Pengolahannya Melalui Penyuluhan Gizi, Farida Wahyu Ningtyias, Ahmad Husain Asdie, Madarina Julia, Yayi Suryo Prabandari

Kesmas

Kabupaten Jember masih menghadapi masalah gizi gangguan akibat kekurangan iodium (GAKI), sebagian besar kecamatannya termasuk dalam kategori daerah endemik GAKI. Salah satu penyebabnya adalah faktor goitrogenik sianida yang mengganggu pembentukan hormon tiroid. Keberadaannya pada beberapa sayuran yang biasa dikonsumsi masyarakat menyebabkan diperlukannya pola konsumsi dan proses pengolahan yang baik agar aman dikonsumsi. Penelitian ini bertujuan mengubah pola konsumsi goitrogenik sianida dan cara pengolahannya melalui penyuluhan gizi dan demonstrasi cara pengolahan pangan sumber goitrogenik sianida yang benar. Penelitian ini adalah sebuah penelitian kuasi eksperimental dengan rancangan pretest-posttest control design. Jumlah sampel sebanyak 196 ibu rumah tangga, terdiri dari 98 orang di …

Upaya Peningkatan Status Gizi Balita Malnutrisi Akut Berat Melalui Program Home Care, Titih Huriah, Laksono Trisnantoro, Fitri Haryanti, Madarina Julia

Kesmas

Malnutrisi pada balita masih merupakan permasalahan di Indonesia termasuk di Daerah Istimewa Yogyakarta. Berdasarkan indikator berat badan menurut tinggi badan, 2,6% balita mengalami malnutrisi akut berat. Pada beberapa dekade terakhir, telah terjadi pergeseran paradigma dalam penanganan balita malnutrisi, yang sebelumnya berbasis pendekatan fasilitas kesehatan bergeser menjadi pendekatan berbasis komunitas. Tujuan penelitian ini adalah untuk menganalisis pengaruh program home care terhadap peningkatan status gizi balita malnutrisi pada anak usia 6-60 bulan. Penelitian menggunakan desain kuasi eksperimen dengan pretest dan posttest control group melalui tiga tahap pendampingan yaitu intensif, mandiri, dan penguatan dengan pendekatan asuhan keperawatan. Sampel adalah 56 balita malnutrisi akut …

Perbedaan Pendidikan Kelompok Sebaya Tentang Pendewasaan Usia Perkawinan Di Perkotaan Dan Perdesaan, Willa Follona, Ardini S. Raksanagara, Benny Hasan Purwara

Kesmas

Remaja berisiko terhadap pernikahan usia dini namun informasi tentang pendewasaan usia perkawinan masih kurang. Pendidikan kelompok sebaya merupakan metode pendidikan kesehatan yang sesuai untuk remaja, namun belum terlaksana di lingkungan masyarakat baik perkotaan maupun perdesaan. Selain itu, belum terfokus pada pendewasaan usia perkawinan, sehingga perlu diketahui perbedaan pengetahuan dan sikap tentang pendewasaan usia perkawinan setelah pendidikan kelompok sebaya pada remaja di perkotaan dan perdesaan. Tujuan penelitian ini adalah untuk menganalisis perbedaan pendidikan kelompok sebaya tentang pengetahuan dan sikap mengenai pendewasaan usia perkawinan antara remaja di wilayah perkotaan dan perdesaan. Penelitian ini merupakan eksperimen semu dengan desain pretest-posttest pada 60 remaja …

Tempat Penampungan Air Dan Kepadatan Jentik Aedes Sp. Di Daerah Endemis Dan Bebas Demam Berdarah Dengue, Wanti Wanti, Menofeltus Darman

Kesmas

Tingkat kepadatan jentik merupakan indikasi diketahuinya kepadatan nyamuk Aedes sp yang akan menularkan virus dengue sebagai penyebab penyakit demam berdarah dengue (DBD) dan juga sebagai salah satu indikator keberhasilan kegiatan pengendalian vektor. Penelitian ini bertujuan mengetahui karakteristik tempat penampungan air (TPA) dan perbedaan kepadatan jentik House Index, Container Index, Breatau Index (HI, CI, BI) di Kelurahan Alak sebagai daerah endemis dan Kelurahan Belo sebagai daerah bebas DBD di Kota Kupang Tahun 2011. Penelitian observasional analitik ini menggunakan rancangan studi potong lintang. Variabel penelitian adalah jenis, kondisi, letak, bahan TPA dan kepadatan jentik Aedes sp. Data dikumpulkan dengan observasi langsung pada …

Quantifying An Adherence Path-Specific Effect Of Antiretroviral Therapy In The Nigeria Pepfar Program, Caleb Miles, Ilya Shpitser, Phyllis Kanki, Seema Meloni, Eric J. Tchetgen Tchetgen

Harvard University Biostatistics Working Paper Series

No abstract provided.

On The Restricted Mean Survival Time Curve Survival Analysis, Lihui Zhao, Brian Claggett, Lu Tian, Hajime Uno, Marc A. Pfeffer, Scott D. Solomon, Lorenzo Trippa, L. J. Wei

Harvard University Biostatistics Working Paper Series

No abstract provided.

A Review Of Software For Analyzing Molecular Sequences, Haema Nilakanta, Kimberly L. Drews, Suzanne Firrell, Mary A. Foulkes, Kathleen A. Jablonski

GW Biostatistics Center

Background Over the past ten years, there has been an explosion of microbiome research. Many software packages for analyzing microbial sequences such as the 16S gene from 454 sequencers and Illumina platforms are available. But for a new researcher, it is difficult to know which package to choose. We present a systematic review of packages for the analysis of molecular sequences used to describe and compare microbial communities. This review gives students and researchers information to help choose the best analytic pipeline for their project. To the best of our knowledge, this is the first review of such software.

Findings …

Constrained Bayesian Estimation Of Inverse Probability Weights For Nonmonotone Missing Data, Baoluo Sun, Eric J. Tchetgen Tchetgen

Harvard University Biostatistics Working Paper Series

No abstract provided.