Microbiology Commons^™

Molecular Candidates For Blocking The Transmission Of Vector-Borne Diseases, Ashish Naresh Vora

Biological Sciences Theses & Dissertations

Vector-borne diseases (VBDs) require urgent attention as they have a high mortality rate, with 700,000 people dying in a year as of 2017. So far, extremely few reliable vaccination strategies and solutions have emerged. Transmission blocking vaccines are one among many solutions available to manage the control of VBDs. These require identification of both vector and pathogen molecules that play important roles in the transmission, dissemination and establishment of VBDs. Our strategy is to characterize these candidates that play important roles in vector-host-pathogen interactions. This manuscript presents two such studies identifying the participation of two arthropod molecules in vector-host-pathogen interactions. …

Fourier Transform Infrared Spectroscopy For Analysis Of Kidney Stones, Aysha Habib Khan, Sheharbano Imran, Jamsheer Talati, Lena Jafri

Department of Pathology and Laboratory Medicine

Purpose:
To compare the results of a chemical method of kidney stone analysis with the results of Fourier transform infrared (FT-IR) spectroscopy.
Materials and Methods:
Kidney stones collected between June and October 2015 were simultaneously analyzed by chemical and FT-IR methods.
Results:
Kidney stones (n=449) were collected from patients from 1 to 81 years old. Most stones were from adults, with only 11.5% from children (aged 3-16 years) and 1.5% from children aged adults, the calcium oxalate stone type, calcium oxalate monohydrate (COM, n=224), was the most common crystal, followed by uric acid and calcium oxalate dihydrate (COD, n=83). In …

การเตรียมฟิล์มวัสดุเชิงประกอบทางชีวภาพระหว่างพอลิไฮดรอกซีบิวทิเรตจาก Cupriavidus Necator สายพันธุ์ A-04 และไมโครคริสตัลลีนเซลลูโลสจากใบสับปะรด, พิชญ์นันท์ สินสุขอุดมชัย

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

พอลิไฮดรอกซีบิวทิเรต (polyhydroxybutyrate, PHB) เป็นพอลิเอสเทอร์ชีวภาพในกลุ่มของพอลิไฮดรอกซีแอลคาโนเอต (polyhydroxyalkanoate, PHAs) ที่ได้รับความสนใจในการศึกษาเพื่อนำมาใช้เป็นวัสดุชีวภาพทางเลือกเพื่อแก้ไขปัญหาสิ่งแวดล้อมจากพลาสติกจากอุตสาหกรรมปิโตรเคมี แม้ว่าจะมีข้อดีที่มากมายแต่ยังมีอุปสรรคในการผลิต PHB ในระดับอุตสาหกรรม เนื่องจากต้นทุนการผลิตที่มีราคาสูง ในงานวิจัยนี้จึงมีจุดประสงค์เพื่อศึกษาการเตรียมฟิล์มวัสดุเชิงประกอบชีวภาพเพื่อลดต้นทุนการผลิต โดยเริ่มจากการผลิต PHB โดย Cupriavidus necator สายพันธุ์ A-04 ในระดับถังหมัก อัตราส่วนระหว่างคาร์บอนและไนโตรเจนเท่ากับ 200 โดยใช้น้ำตาลฟรักโทสเป็นแหล่งคาร์บอน และใช้แอมโมเนียมซัลเฟตเป็นแหล่งไนโตรเจน ได้ปริมาณ PHB สูงสุด 60.54±5.74 เปอร์เซ็นต์ที่ชั่วโมงที่ 60 จากนั้นนำสกัดเซลล์แห้งและทำบริสุทธิ์จะได้เป็นผง PHB บริสุทธิ์ จากนั้นเตรียมไมโครคริสตัลลีนเซลลูโลสจากใบสับปะรดซึ่งเป็นวัสดุเหลือทิ้งทางการเกษตร แต่ไมโครคริสตัลลีนเซลลูโลสละลายได้ในคลอโรฟอร์มใช้เป็นตัวทำละลายในการเตรียมฟิล์มวัสดุเชิงประกอบชีวภาพร่วมกับ PHB จึงต้องดัดแปรโครงสร้างของไมโครคริสตัลลีนเซลลูโลสด้วยปฏิกิริยาเอสเทอริฟิเคชันโดยใช้ลอโรอิลคลอไรด์เป็นสารดัดแปร พบว่าเซลลูโลสลอเรตสามารถละลายได้ในคลอโรฟอร์มและมีการเปลี่ยนแปลงของหมู่ฟังก์ชันเมื่อวิเคราะห์โครงสร้างด้วยเครื่อง FTIR จากนั้นนำผง PHB และเซลลูโลสลอเรตมาขึ้นรูปเป็นแผ่นฟิล์มด้วยวิธีการหล่อขึ้นรูปโดยใช้สารละลายคลอโรฟอร์มที่อัตราส่วนต่างๆ ได้แก่ 100:0, 95:5, 90:10, 85:15, 80:20 และ 0:100 พบว่าแผ่นฟิล์มวัสดุเชิงประกบอชีวภาพที่อัตราส่วนต่างๆ ไม่มีการเปลี่ยนแปลงสมบัติทางความร้อน ในขณะที่ค่ามอดุลัสของยังมีแนวโน้มลดลงอย่างมีนัยสำคัญเมื่อปริมาณของเซลลูโลสลอเรตเพิ่มขึ้น และเมื่อนำไปศึกษาควาสามารถในการย่อยสลายทางชีวภาพพบว่าอัตราส่วน 95:5 ย่อยสลายได้สูงที่สุดเท่ากับ 23.49 เปอร์เซ็นต์ ในวันที่ 35

ผลของเซลลูโลสดัดแปรต่อสมบัติทางกายภาพและความสามารถในการย่อยสลายทางชีวภาพของฟิล์มวัสดุเชิงประกอบชีวภาพที่เตรียมจากพอลิไฮดรอกซีบิวทิเรตผลิตโดย Cupriavidus Necator สายพันธุ์ A-04 และไมโครคริสตัลลีนเซลลูโลสจากกากมันสำปะหลัง, ภัสราภรณ์ ธีระสีมาธรรม

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

งานวิจัยนี้มีวัตถุประสงค์ในการเตรียมแผ่นฟิล์มวัสดุเชิงประกอบชีวภาพระหว่าง PHB ซึ่งผลิตโดย Cupriavidus necator สายพันธุ์ A-04 และไมโครคริสตัลลีนเซลลูโลสที่เตรียมจากกากมันสำปะหลังเพื่อปรับปรุงเสถียรภาพทางความร้อนและสมบัติเชิงกลของ PHB เริ่มจากการเพาะเลี้ยง C. necator สายพันธุ์ A-04 ในระดับถังหมัก ได้ปริมาณ PHB เท่ากับ 59.66 ± 5.92 เปอร์เซ็นต์ต่อน้ำหนักเซลล์แห้ง จากนั้นสกัดและทำบริสุทธิ์ PHB จากเซลล์แห้ง แล้วนำไปวิเคราะห์หมู่ฟังก์ชันในโครงสร้างและสมบัติทางความร้อนของ PHB ที่สกัดได้พบว่า PHB มีหมู่ฟังก์ชันและสมบัติความร้อนที่สอดคล้องกับ PHB มาตรฐาน จึงยืนยันได้ว่าเป็นพอลิเมอร์ชนิด PHB ต่อมาเตรียมไมโครคริสตัลลีนเซลลูโลสและดัดแปรโครงสร้างทางเคมีด้วยปฏิกิริยาเอสเทอริฟิเคชันโดยใช้บิวทิริลคลอไรด์เป็นสารดัดแปรพบว่าไมโครคริสตัลลีนเซลลูโลสบิวทิเรตมีการเปลี่ยนแปลงของหมู่ฟังก์ชันเนื่องจากมีการแทนที่ของสายโซ่อะลิฟาติกในหมู่ไฮดรอกซิล มีขนาดของอนุภาคที่ใหญ่ขึ้นและสามารถละลายได้ในตัวทำละลายคลอโรฟอร์ม จากนั้นเตรียมแผ่นฟิล์มวัสดุเชิงประกอบระหว่าง PHB และไมโครคริสตัลลีนเซลลูโลสบิวทิเรต โดยแปรผันอัตราส่วนของไมโครคริสตัลลีนเซลลูโลสบิวทิเรตพบว่าแผ่นฟิล์มวัสดุเชิงประกอบมีการเปลี่ยนแปลงสมบัติทางความร้อนและมีการเพิ่มขึ้นของค่าความทนแรงดึงและการยืดตัว ณ จุดขาดของแผ่นฟิล์มวัสดุเชิงประกอบชีวภาพที่อัตราส่วน 95 ต่อ 5 และ 90 ต่อ 10 หลังการทดสอบการย่อยสลายทางชีวภาพในดินของแผ่นฟิล์มวัสดุเชิงประกอบชีวภาพพบว่าแผ่นฟิล์มวัสดุเชิงประกอบชีวภาพยังคงมีความสามารถในการย่อยสลายทางชีวภาพ

Investigating The Role Of Parp-1 In Hiv-1 Replication, Sara Garcia

Open Access Theses & Dissertations

Poly (ADP-ribose) Polymerase 1 (PARP-1) is a cellular protein that that has multiple roles in the cell including DNA repair and transcription. PARP-1 has also proven by our laboratory to impair HIV-1 replication in T cells infected with HIV-1 strains entering via CD4/CXCR4. The goal of my Thesis is to increase our understanding of the mechanism implicated in the anti-HIV-1 activity of PARP-1. Initially, I focused my research in deciphering the impact of PARP-1 on the replication of HIV-1 strains entering the cell through the alternative pathway CD4/CCR5. However, technical difficulties prevented answering this question. Nevertheless, aided by the technical …

Abundance Of Methanosaeta Concilii-Like Species In The Sediment Of Ledbetter Creek Embayment Of Kentucky Lake, Juanita Von Dwingelo

Murray State Theses and Dissertations

Reservoirs, including Kentucky Lake, are unique in that they do not follow a natural cycle of rising during the rainy seasons and dropping during the dry summers. The lake is manipulated, mainly for flood control and transportation, so that the water level is increased during the summer months and decreased during the winter months. This manipulation leaves the littoral sediment of the lake submerged in the summer and exposed in the winter. The seasonal water level, along with other factors, like farming practices in the watershed, contributes to the availability of nutrients for organisms inhabiting the sediment of the lake. …

Market Integration Predicts Human Gut Microbiome Attributes Across A Gradient Of Economic Development, Keaton Stagaman, Tara J. Cepon-Robins, Melissa A. Liebert, Theresa E. Gildner, Samuel S. Urlacher, Felicia C. Madimenos, Karen Guillemin, J. Josh Snodgrass, Lawrence C. Sugiyama, Brendan J. M. Bohannan

Publications and Research

Economic development is marked by dramatic increases in the incidence of microbiome-associated diseases, such as autoimmune diseases and metabolic syndromes, but the lifestyle changes that drive alterations in the human microbiome are not known. We measured market integration as a proxy for economically related lifestyle attributes, such as ownership of specific market goods that index degree of market integration and components of traditional and nontraditional (more modern) house structure and infrastructure, and profiled the fecal microbiomes of 213 participants from a contiguous, indigenous Ecuadorian population. Despite relatively modest differences in lifestyle across the population, greater economic development correlated with significantly …

Pulmonary Alveolar Proteinosis- A Case Report, Renee M. Horner, Douglas S. Gardenhire, Ralph D. Zimmerman

Internet Journal of Allied Health Sciences and Practice

ABSTRACT

Background: Pulmonary Alveolar Proteinosis (PAP) is a rare pulmonary disorder caused by a congregation of excessive lipoproteinaceous material in the alveolar spaces due to impaired surfactant metabolism. The congregation of the protein in the alveolar space leads to difficulty in breathing, impaired pulmonary immunity, and susceptibility to both opportunistic and acquired pulmonary infections. Although Pulmonary Alveolar Proteinosis is rare, there are potential treatments. Whole-lung lavage is the most widely accepted therapy and course of treatment. An additional form of therapy, GM-CSF stimulating therapy, uses recombinant deoxyribonucleic acid (DNA) technology to increase white cell production.

Purpose: The purpose …