Open Access. Powered by Scholars. Published by Universities.®

Genetics Commons™

Open Access. Powered by Scholars. Published by Universities.®

2024

Discipline
Institution
Keyword
Publication
Publication Type
File Type

Articles 211 - 218 of 218

Full-Text Articles in Genetics

Evaluating The Utility Of Tracers To Characterize Environmental Dna Transport And Inform Detection Of Fishes In Small Streams, Gavin B. Bandy Jan 2024

Evaluating The Utility Of Tracers To Characterize Environmental Dna Transport And Inform Detection Of Fishes In Small Streams, Gavin B. Bandy

Cal Poly Humboldt theses and projects

This study was motivated by the need to develop a noninvasive and highly sensitive monitoring tool for determining local occupancy of an endangered aquatic species To make inference into the occupancy of fishes within small stream sites, we developed a method to determine whether environmental DNA (eDNA) concentrations from a target species were elevated relative to a tracer, formulated to mimic eDNA and introduced at a single location. We examined patterns in the observed distribution of the tracer to account for the effects of site-specific transport processes and sampling on distributions of naturally occurring eDNA at small spatial scales (400 …


Csn-5: A Tumor's Friend Or Foe In The C. Elegans Germline?, Kellie C. Kuch Jan 2024

Csn-5: A Tumor's Friend Or Foe In The C. Elegans Germline?, Kellie C. Kuch

Graduate Student Theses, Dissertations, & Professional Papers

The COP9 signalosome is a highly conserved eukaryotic complex regulating protein degradation via deneddylation of Cullin-RING E3 ligases. CSN5, the COP9’s fifth component, contains the catalytically active domain for CSN deneddylation. The complex is inactive without CSN5; however, CSN5 engages in COP9-independent binding with several other proteins, typically promoting either destruction or stabilization of its partners. Many of its confirmed interaction partners are also implicated in tumorigenesis (prominent examples being p27 and p53) and a complex cancer interactome has been established for CSN5. Additionally, CSN5 overexpression has been documented in a staggering array of cancers of diverse origins. This discovery …


Chemical Synthesis Of Sensitive Dna, Komal Chillar Jan 2024

Chemical Synthesis Of Sensitive Dna, Komal Chillar

Dissertations, Master's Theses and Master's Reports

Over the past decades, researchers have tried various chemical methods to synthesize modified oligodeoxynucleotides (ODNs, i.e. short segments of DNAs). Traditional ODN synthesis methods require strong basic, and nucleophilic conditions for the deprotection and cleavage of the ODN from the solid support. However, the sensitive ODNs containing labile functionalities are vulnerable to such harsh conditions. Sensitive ODNs have a wide range of applications in research and pharmaceuticals. To synthesize sensitive ODNs, researchers devised different strategies but no practical methods have been developed. To overcome these challenges, we developed alkyl Dim alkyl Dmoc technology. This innovative technology uses weakly basic and …


A Multimolecular Perspective On The Success Of Wolf Recovery And Relocation, Samuel D. Hervey Jan 2024

A Multimolecular Perspective On The Success Of Wolf Recovery And Relocation, Samuel D. Hervey

Dissertations, Master's Theses and Master's Reports

With global biodiversity in decline and many species isolated in fragmented habitats, conservation efforts increasingly rely on natural recolonization and translocation to restore ecosystems. These strategies face challenges such as genetic erosion and habitat limitations, highlighting the need for effective monitoring practices. This research assesses the success of wolf recovery initiatives by examining long-term genetic and genomic health using both traditional and advanced molecular methods. First, we investigated the genetic health of 19 gray wolves (Canis lupus) relocated to Isle Royale National Park to restore ecosystem balance. Initial genetic assessments with microsatellites found that these wolves had genetic diversity metrics …


ฤทธิ์ของสารสกัดจากมะกรูดต่อภาวะเครียด Oxidative Stress ในหนอน Caenorhabditis Elegans, ณัฐพงศ์ นพโลหะ Jan 2024

ฤทธิ์ของสารสกัดจากมะกรูดต่อภาวะเครียด Oxidative Stress ในหนอน Caenorhabditis Elegans, ณัฐพงศ์ นพโลหะ

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

ภาวะโรคไม่ติดต่อเรื้อรัง หรือ Non-Communicable Disease (NCDs) เป็นภาวะโรคที่ไม่ได้ติดต่อจากคนสู่คนได้รวมถึงไม่ได้เกิดจากการติดเชื้อโรค โดยสาเหตุหนึ่งของภาวะกลุ่มโรคนี้คือการเกิดภาวะ oxidative stress ที่ทำให้ร่างกายมีปริมาณของสารอนุมูลอิสระไม่สมดุล โดยที่ผ่านมาจำนวนผู้ป่วยในโรคนี้มีจำนวนเพิ่มขึ้นอย่างต่อเนื่อง ซึ่งแนวทางการรักษาส่วนใหญ่มักจะมาจากการรักษาตามอาการ ดังนั้นการแก้ปัญหาโรคนี้ให้ได้ผลมากที่สุดคือการป้องกันการเกิดโรคมากกว่าการรักษา ผู้วิจัยจึงสนใจที่จะนำมะกรูดที่มีสรรพคุณต้านอนุมูลอิสระมาทดสอบ โดยมีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษาฤทธิ์ของสารสกัดจากใบมะกรูดและผิวมะกรูด ในการช่วยลดการเกิดภาวะ oxidative stress สำหรับการช่วยยืดอายุของ C. elegans ที่ถูกชักนำให้เกิดภาวะ oxidative stress โดยแบ่งการศึกษาออกเป็น 4 ขั้นตอน ได้แก่ ตอนที่ 1 ศึกษาฤทธิ์ของสารสกัดจากมะกรูดต่อ E.coli OP50 ที่เป็นอาหารของ C. elegans พบว่าสารสกัดจากใบมะกรูดและผิวมะกรูดไม่มีผลในการยับยั้งการเจริญของ E.coli OP50 เมื่อเทียบกับการยับยั้งการเจริญเติบโตของยา Penicillin-Streptomycin ที่ใช้เป็นกลุ่มควบคุม จึงสามารถใช้สารสกัดจากใบมะกรูดและผิวมะกรูดในการทดสอบได้ โดยที่ไม่มีผลต่อ E.coli OP50 ที่ใช้เป็นอาหารของ C. elegans ตอนที่ 2 การศึกษาฤทธิ์ของสารสกัดจากใบมะกรูดและผิวมะกรูดที่มีผลต่อการรอดชีวิตของ C. elegans ที่ถูกชักนำให้เกิดภาวะ oxidative stress พบว่าสารสกัดจากใบมะกรูดและผิวมะกรูดที่ความเข้มข้น 50 , 100 และ 200 ug/ml มีอัตราการรอดชีวิตของ C. elegans เมื่อเทียบกับ C. elegans ที่ไม่ได้ให้สารสกัดจากใบมะกรูดและผิวมะกรูด แตกต่างกันอย่างมีนัยสำคัญทางสถิติ 0.05 และตอนที่ 3 การศึกษาฤทธิ์ของสารสกัดจากใบมะกรูดและผิวมะกรูดต่อการยับยั้งปริมาณ ROS ของ C. elegans ที่ถูกชักนำให้เกิดภาวะ oxidative stress โดยพบว่าใบมะกรูดและผิวมะกรูดที่ความเข้มข้น 50 , 100 และ 200 ug/ml มีค่าปริมาณสาร ROS ของ C. elegans ที่ให้สารสกัดจากใบมะกรูดและผิวมะกรูด เมื่อเทียบกับ C. elegans ที่ไม่ให้สารสกัดจากใบมะกรูดและผิวมะกรูด …


การปรับสมดุลไมโครไบโอมในลำไส้ด้วยเชื้อ Lactobacillus Rhamnosus Gg ช่วยบรรเทาความรุนแรงจากการติดเชื้อในกระแสเลือด ในหนูที่ถูกเหนี่ยวนำให้เกิดความชราโดยน้ำตาล D-Galactose และกระตุ้นภาวะติดเชื้อในกระแสเลือดโดยวิธีการผูกและเจาะลำไส้ใหญ่ส่วนต้น, ชาลิสา พินิจจันทร์ Jan 2024

การปรับสมดุลไมโครไบโอมในลำไส้ด้วยเชื้อ Lactobacillus Rhamnosus Gg ช่วยบรรเทาความรุนแรงจากการติดเชื้อในกระแสเลือด ในหนูที่ถูกเหนี่ยวนำให้เกิดความชราโดยน้ำตาล D-Galactose และกระตุ้นภาวะติดเชื้อในกระแสเลือดโดยวิธีการผูกและเจาะลำไส้ใหญ่ส่วนต้น, ชาลิสา พินิจจันทร์

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

การเสียสมดุลของจุลินทรีย์ในลำไส้อาจทำให้เกิดภาวะลำไส้รั่ว เกิดการติดเชื้อในกระแสเลือดตามมาได้ ซึ่งสภาวะดังกล่าวมักพบมากในผู้สูงอายุ การศึกษาก่อนหน้านี้พบว่าโพรไบโอติกสามารถลดการเสียสมดุลของจุลินทรีย์ในลำไส้ แต่การศึกษาเรื่องผลของการรับประทานเชื้อโพรไบโอติดต่อของการลดความรุนแรงจากการติดเชื้อในกระแสเลือด รวมทั้งภาวะ Sepsis-associated encephalopathy (SAE) ในผู้สูงอายุนั้นยังไม่มีการศึกษาที่ชัดเจน วัตถุประสงค์ของการศึกษา เพื่อทดสอบความสามารถของเชื้อโพรไบโอติกสายพันธุ์ Lacticaseibacillus rhamnosus GG (LGG) ในการช่วยลดความรุนแรงของการติดเชื้อในกระแสเลือดในหนูที่ถูกเหนี่ยวนำให้เกิดสภาวะชราโดยการใช้น้ำตาลกาแลคโตส ผู้วิจัยทำการให้เชื้อ LGG ทางปากกับหนูทดลอง เปรียบเทียบกับกลุ่มควบคุม และทดสอบความแตกต่างของจุลินทรีย์ในลำไส้ในอุจจาระของหนูด้วยวิธี 16S RNA sequencing พร้อมวัดสภาวะความชราของหนูด้วยเทคนิค Histochemistry ในอวัยวะภายใน จากนั้นหนูทั้ง 2 กลุ่มจะถูกกระตุ้นให้เกิดการติดเชื้อในกระแสเลือดโดยวิธีการผูกและเจาะลำไส้ใหญ่ส่วนต้น (CLP) และวัดความรุนแรงของการติดเชื้อในกระแสเลือดโดยการวัดอัตราการตาย ระดับ creatinine (Scr), Alanine transaminase (ALT), cytokines (IL-6 TNF-α IL-10 และ IL-1ß) ในซีรัมโดยเทคนิค Enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) การตรวจวัด Sepsis encephalopathy ผู้วิจัยใช้ค่ามาตรฐาน SHIRPA เพื่อช่วยในการวัด นอกจากนี้เพื่อหาสาเหตุของการลดความรุนแรงจากการติดเชื้อในกระแสเลือดด้วยเชื้อโพรไบโอติก ผู้วิจัยนำ Lactobacillus condition media (LCM) ร่วมกับ Lipopolysaccharide (LPS) มาใช้ในการกระตุ้นเซลล์ RAW 264.7 , เซลล์ BV-2 และเซลล์ HT-22 จากนั้นทำการวัดปริมาณ Inflammatory cytokines ด้วยเทคนิค ELISA และวัดการแสดงออกของยีน IL-6 TNF-α IL-10 IL-1ß Fizz Arg-1 NF-kB TLR-4 และยีน iNOS ด้วยเทคนิค Quantitative real-time PCR (qPCR) จากผลการวิเคราะห์จุลินทรีย์ในอุจจาระ แสดงให้เห็นว่าหนูชรามีการสูญเสียสมดุลของจุลินทรีย์ในลำไส้ และพบการเกิดพังผืดในปอด ไต และตับ ซึ่งเชื้อ …


Quantitative Trait Loci Influencing Elemental Content In Grapevine Leaves, Jesse L. Krokower Jan 2024

Quantitative Trait Loci Influencing Elemental Content In Grapevine Leaves, Jesse L. Krokower

Graduate Theses/Dissertations

In grapevine, the influence of the plant’s elemental composition (the ionome) on fruit and wine quality is well established, but its genetic underpinnings have received limited scientific attention. In this study, I analyzed the leaf ionome of 131 interspecific F1 hybrid progeny plants from a cross between a Vitis rupestris Scheele (♀) and a Vitis riparia Michx (♂) parents, which were replicated in four different environments: Southwest Missouri, Central Missouri, South Dakota, and New York. I sampled leaves at three different times during the growing season at all four locations and had the concentration of 20 elements measured using ICP-MS. …


Do Duckweeds Adapt To Water And Microbes?, Ava M. Rose Jan 2024

Do Duckweeds Adapt To Water And Microbes?, Ava M. Rose

Honors Theses and Capstones

Organisms in their home environment sometimes outperform transplanted individuals native to other areas, in a phenomenon termed local adaptation. While local adaptation is traditionally considered to be driven by the abiotic factors of an environment, scientists have recently increased consideration of biotic factors. Specifically, of interest to many is host-associated microbiomes, which can alter host trait expression. As the desire to commercialize microbiome treatments for agriculture and medicine grows, it is important to analyze the potential value of local microbiomes, which may be adapted to their hosts, or to which local hosts may have adapted. Using Lemna minor (duckweed) as …