Open Access. Powered by Scholars. Published by Universities.®
Articles 1 - 30 of 51
Full-Text Articles in Biochemistry
Production And Biological Activities Of Oligo Pectin From Early Immature Fruit Of Durio Zibethinus L., Aunchiya Pitaksa
Production And Biological Activities Of Oligo Pectin From Early Immature Fruit Of Durio Zibethinus L., Aunchiya Pitaksa
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
Early immature durian (EID) fruits, 30-45 days after anthesis with 6-12 cm in length, are considered agricultural waste from cultivation. It is known that durian rinds of mature fruits contain pectin, but there have been no reports on the pectin content of early immature durian (EID) fruits. Therefore, the objective of this study was to determine the pectin content in EID fruits. We extracted pectin from EID fruits using distilled water at different temperatures (25°C, 50°C, and 75°C) for 1 h to investigate pectin content. Instrumental analyses, including X-ray diffraction (XRD) and Fourier Transform Infrared Spectrometer (FT-IR), confirmed the presence …
Kinetic Mechanism Of Indigo-Producing Indole Monooxygenase From Acinetobacter Baumannii, Kanyarat Suksomjaisaman
Kinetic Mechanism Of Indigo-Producing Indole Monooxygenase From Acinetobacter Baumannii, Kanyarat Suksomjaisaman
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
Indole, a bicyclic compound comprising a fused benzene and pyrrole ring, serves as a fundamental component in numerous natural compounds. Additionally, indole holds significant importance in industrial applications, particularly in the production of pharmaceutical drugs and agrochemicals. Flavin-dependent indole monooxygenase is an enzyme responsible for hydroxylation of the indole ring. Indole monooxygenase is a two-components: flavoprotein reductase containing FAD as a cofactor, and monooxygenase. The reductase component utilizes NADH to catalyze flavin reduction and transfers the reduced flavin to the monooxygenase component. The hydroxylation of indole by monooxygenase reduced FAD and oxygen as substrates. In this study, we cloned the …
Anti-Neuroinflammatory Effects Of Auricularia Polytricha Extracts On Bisphenol A (Bpa)-Induced Microglial Cell Activation And Reduction Of Hippocampal Cell Damage, Chanin Sillapachaiyaporn
Anti-Neuroinflammatory Effects Of Auricularia Polytricha Extracts On Bisphenol A (Bpa)-Induced Microglial Cell Activation And Reduction Of Hippocampal Cell Damage, Chanin Sillapachaiyaporn
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
Bisphenol A (BPA) is widely used in the production of polycarbonate plastics, it has been reported that BPA can activate neuroinflammation. Neuroinflammation is a brain pathology that involves the high levels of pro-inflammatory mediators, including tumor necrosis factor-alpha (TNF-α). An excessive TNF-α expression could result in neuronal cell death and subsequently lead to neurodegeneration. Auricularia polytricha (AP) is an edible mushroom with several medicinal properties. Herein, the anti-neuroinflammatory effects of AP extracts against BPA-induced BV2 microglial inflammation were investigated. Hexane (APH) and ethanol (APE) extracts of AP inhibited BPA-induced neuroinflammation in BV2 cells by reducing the expression of pro-inflammatory cytokines. …
Expression And Characterization Of Dextransucrase From Leuconostoc Citreum Abk-1, Kakuttapun Bulan
Expression And Characterization Of Dextransucrase From Leuconostoc Citreum Abk-1, Kakuttapun Bulan
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
Dextransucrase is an enzyme in the glycoside hydrolase 70 family that catalyze the hydrolysis of sucrose to fructose and glucose, the glucose residues are transferred to synthesize dextran via transglycosylation reaction. Dextransucrase from Leuconostoc citreum ABK-1 (Lcdextransucrase ), which has 99.5% homology with dextransucrase in the NCBI database, was cloned, expressed, and purified. The size of the Lcdextransucrase was predicted by ExPASy and the result showed that its size was 168 kDa with a pI of 5.15. Protein expression was confirmed by western blot analysis. Lcdextransucrase was purified through Ni-sepharose coupled with DEAE anion exchange column chromatography to approximately 80% …
In Silico And In Vitro Studies On Inclusion Complexation Of Anthraquinone Derivatives With Beta-Cyclodextrin Derivatives, Amy Oo
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
In this study, we investigated the cytotoxicity of 6 anthraquinones (ventilanone K, emodin, chrysophanol, aurantio-obtusin, 1-O-methyl-2-methyoxychrysophanol, and questin) toward A549 lung cancer cells and emodin (ED) exerted the most potent cytotoxicity with IC50 value of 34.27 ± 1.27 µM. The anti-cancer activity of ED has been well reported but its usage in practical applications has been restricted due to its poor solubility. To address this issue, we performed inclusion complexation of ED with βCD, hydroxypropyl-β-cyclodextrin (HPβCD), 2,6-di-O-methyl-β-cyclodextrin (DMβCD), and sulfobutylether-β-cyclodextrin (SBEβCD) theoretically using molecular dynamics simulations and experimentally using phase solubility study and cytotoxicity screening toward cholangiocarcinoma cell lines (KKU-213A …
In Silico And In Vitro Screening Of Newly Designed Compounds Against Coxsackivirus A16 And Enterovirus A71, Amita Sripattaraphan
In Silico And In Vitro Screening Of Newly Designed Compounds Against Coxsackivirus A16 And Enterovirus A71, Amita Sripattaraphan
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
Outbreaks of hand, foot, and mouth disease (HFMD) occur around the world. It is caused by the Coxsackievirus-A16 (CV-A16) and Enterovirus-A71 (EV-A71) that belong to the Enterovirus genus. Unfortunately, neither an anti-HFMD drug nor a vaccine is currently available. Rupintrivir, one of the drug candidates for HFMD treatment, has been attractive for the development of its analogs with broad biological activities. This drug is an inhibitor for 3C protease of CV-A16 and EV-A71, an enzyme that plays a crucial role in the viral replication process. ). In the present study, we focused on designing 50 novel rupintrivir analogs against CV-A16 …
Functional Characterization Of Rice Malate Synthase In Arabidopsis Responding To Salt Stress, Supisara Thanabut
Functional Characterization Of Rice Malate Synthase In Arabidopsis Responding To Salt Stress, Supisara Thanabut
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
Salt stress is one of the major abiotic stresses that seriously limit plant growth and development and can lead to a significant reduction in crop yield, especially rice. Salt stress affects plants via ionic toxicity and osmotic stress. Osmotic stress results in a reduction of water absorption ability. Ionic toxicity causes Na+ toxicity, which disrupts photosynthesis, protein synthesis, and enzyme activity. The previous study of KDML105 rice transcriptome profile and qRT-PCR revealed that rice malate synthase (OsMS) encoding malate synthase, which is one of the key enzymes in glyoxylate cycle was up-regulated under salt stress, so OsMS may involve in …
Substrate Binding Mechanism Of Glycerophosphodiesterase Towards Pesticides And Improvement Of Stability By Mutational Analysis, Nayana Bhat
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
Molecular dynamics studies have been providing a great number of atomistic details of biological systems to understand enzymatic activity and underlying reaction mechanisms. Herein, molecular dynamic (MD) simulations were employed to study the binding mechanisms of organophosphate pesticides towards two metallohydrolases, i.e., glycerophosphodiesterase (GpdQ) and methyl parathion hydrolase (MPH). OPH are the class of enzymes which breaks down harmful organophosphates, including the pesticides and warfare agents into less harmful byproducts. Hence, these enzymes are excellent candidates for bioremediation. In the present study, various nonspecific organophosphate pesticides were docked into GpdQ and MPH enzymes to construct the pesticide/protein complex for performing …
Protective Effects Of Tiger Milk Mushroom (Lignosus Rhinocerus) Extracts On Oxidative Stress-Induced Neurotoxicity And Aging In Ht22 Cells And C. Elegans, Parinee Kittimongkolsuk
Protective Effects Of Tiger Milk Mushroom (Lignosus Rhinocerus) Extracts On Oxidative Stress-Induced Neurotoxicity And Aging In Ht22 Cells And C. Elegans, Parinee Kittimongkolsuk
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
Lignosus rhinocerus (LR) or Tiger Milk Mushroom, a fork medicinal mushroom, has been reported for several pharmacological effects including asthma treatment, anti-inflammatory, anti-proliferative, immuno-modulating effects, promote neurite outgrowth in PC-12 cells, anti-HIV-1 activity, and antioxidants properties. However, the antioxidant properties have only focus on in vitro and no or few studies have reported their protective effects in mouse hippocampal (HT22) cells and Caenorhabditis elegans (C. elegans). This study aims to investigate the neuroprotective effect of three extracts of LR against oxidative stress in both HT22 cells and. C. elegans as well as longevity in C. elegans. In HT22 cells, we …
การแบ่งกลุ่มย่อยตามลักษณะทางคลินิกรูปแบบใหม่โดยอาศัยปัญญาประดิษฐ์ ร่วมกับการวิเคราะห์โอมิกส์แบบบูรณาการหลายระดับ เพื่อระบุกลุ่มตัวแทนสารบ่งชี้ทางชีวภาพสำหรับภาวะออทิซึมสเปกตรัม, กัลยภัสสร์ หัสเสม
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
โรคออทิซึมสเปกตรัมเป็นความผิดปกติเกี่ยวกับพัฒนาการในช่วงเริ่มแรกของระบบประสาทและสมองซึ่งมีอาการทางคลินิกที่หลากหลายมาก ปัจจุบันยังไม่มีสารบ่งชี้เพื่อช่วยในการวินิจฉัยและแบ่งผู้ป่วยเป็นกลุ่มย่อย แต่การวินิจฉัยที่รวดเร็วเป็นสิ่งสำคัญที่จะช่วยให้ผู้ป่วยออทิซึมสเปกตรัมสามารถได้รับการเรียนรู้และพัฒนาพฤติกรรมที่จำเป็นในการดำรงชีวิตได้ การวินิจฉัยโรคออทิซึมสเปกตรัมตามมาตรฐานสากลใช้แบบสอบถามที่มีความซับซ้อนและใช้เวลามาก ซึ่งในปัจจุบันมีการนำเอาเทคโนโลยีปัญญาประดิษฐ์มาประยุกต์ใช้ในการวิเคราะห์ข้อมูลขนาดใหญ่ที่มีความซับซ้อน อย่างไรก็ตามการนำเอาปัญญาประดิษฐ์มาใช้วิเคราะห์อาการทางคลินิกของผู้ป่วยออทิซึมสเปกตรัมยังไม่แพร่หลายนัก ในการศึกษานี้ผู้วิจัยต้องการนำเอาปัญญาประดิษฐ์มาใช้แบ่งผู้ป่วยออทิซึมสเปกตรัมจำนวน 85 ราย ออกเป็นกลุ่มย่อยตามอาการทางคลินิกจากข้อมูลแบบทดสอบในการวินิจฉัยผู้ป่วยออทิซึมสเปกตรัม ADI-R จำนวน 123 ข้อ จากนั้นได้ทำการสร้างโมเดลในการจัดกลุ่มและเปรียบเทียบประสิทธิภาพรวมถึงจำนวนข้อคำถามที่ใช้ในแต่ละโมเดล นอกจากนี้ผู้วิจัยได้ศึกษาหาสารบ่งชี้ทางชีวภาพที่เป็นตัวแทนของโรคออทิซึมสเปกตรัมกลุ่มย่อยจากลักษณะอาการทางคลินิกโดยอาศัยการบูรณาการโอมิกส์หลายระดับ จึงได้ดำเนินการวิเคราะห์รูปแบบทรานสคริปโตม และวิเคราะห์รูปแบบโปรตีโอมของผู้ป่วยออทิซึมสเปกตรัมโดยใช้เซลล์เพาะเลี้ยงชนิดลิมโฟบลาสต์เป็นต้นแบบ โดยใช้เทคนิคการแยกโปรตีนด้วยกระแสไฟฟ้า 2 มิติ (2D-GE) จากนั้นจะทำการระบุโปรตีนด้วยเทคนิค LC-MS/MS เพื่อหาโปรตีนที่ถูกรบกวนการทำงานอย่างมีนัยสำคัญ และบูรณาการข้อมูลเพื่อศึกษาความสอดคล้องและสัมพันธ์กันระหว่างการแสดงออกของโปรตีนและยีน และทำการยืนยันระดับการแสดงออกที่ผิดปกติไปของยีนด้วยเทคนิค Real-time qPCR และโปรตีนด้วยเทคนิค Western blot ในการศึกษาครั้งนี้จากผลการวิเคราะห์ข้อมูลลักษณะอาการทางคลินิกของผู้ป่วยออทิซึมสเปกตรัมจากแบบทดสอบ ADI-R 123 ข้อ พบว่าวิธี K-means clustering ที่แบ่งผู้ป่วยออกเป็น 4 กลุ่มย่อยนั้นให้ประสิทธิภาพในการแบ่งดีที่สุด และเมื่อทำการสร้างโมเดลในการจัดกลุ่มผู้ป่วยตามผลการแบ่งกลุ่มดังกล่าว พบว่าอัลกอริทึม Random forest ที่มีจำนวนต้นไม้ 10 ต้น โดยกระบวนการคัดเลือกข้อมูลแบบ Forward selection ให้ผลการทำนายถูกต้องมากที่สุด (100%) โดยใช้ข้อคำถาม ADI-R เพียง 5 ข้อ ในการแบ่งผู้ป่วยออกเป็นกลุ่มย่อย และจากการวิเคราะห์รูปแบบโปรตีโอมจากเซลล์เพาะเลี้ยงชนิดลิมโฟบลาสต์ของผู้ป่วยออทิซึมสเปกตรัมและออทิซึมสเปกตรัมกลุ่มย่อยด้วยเทคนิค 2D-GE ผู้วิจัยได้ทำการคัดเลือกจุดโปรตีนที่มีการแสดงออกผิดปกติอย่างมีนัยสำคัญและมีค่าสัดส่วนความเข้มแตกต่างกันอย่างน้อยสองเท่ามา 19 จุด เพื่อทำการระบุชนิดของโปรตีนด้วยเทคนิค LC-MS/MS โดยพบว่าจากโปรตีนทั้งหมด HNRNPA2B1 มีระดับการแสดงออกเพิ่มขึ้นในผู้ป่วยออทิซึมสเปกตรัมกลุ่มย่อยที่ไม่มีความผิดปกติด้านภาษารุนแรง โดยที่โปรตีน HNRNPA2B1 MDH2 DLD และ MSN มีระดับการแสดงออกลดลงในผู้ป่วยออทิซึมสเปกตรัมกลุ่มย่อยที่มีความผิดปกติด้านภาษารุนแรง ดังนั้นจากการศึกษาวิจัยในครั้งนี้ได้แสดงให้เห็นว่าการใช้เทคโนโลยีปัญญาประดิษฐ์ในการแบ่งผู้ป่วยออทิซึมสเปกตรัมออกเป็นกลุ่มย่อยตามลักษณะอาการทางคลินิกนั้น สามารถลดความหลากหลายตามลักษณะอาการที่แสดงออกของโรคออทิซึมสเปกตรัมในการวิเคราะห์รูปแบบทรานสคริปโตมและโปรตีโอม รวมถึงการค้นหาโปรตีนที่จำเพาะต่อผู้ป่วยออทิซึมสเปกตรัมกลุ่มย่อย ได้อย่างมีประสิทธิภาพมากขึ้น ซึ่งโปรตีนเหล่านี้อาจใช้เป็นโปรตีนบ่งชี้ในการศึกษาเชิงลึกในประชากรผู้ป่วย เพื่อพัฒนาเป็นสารบ่งชีทางชีวภาพ (Biomarker) หรือศึกษากลไกพยาธิสภาพในระดับชีวโมเลกุลของโรคออทิซึมสเปกตรัมได้ต่อไปในอนาคต
Controlled Release Of Fibroin Repeat-Tagged Proteins From Silk Hydrogel, Jaturong Promsuk
Controlled Release Of Fibroin Repeat-Tagged Proteins From Silk Hydrogel, Jaturong Promsuk
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
Protein-based biologic drugs such as growth factors are playing important roles in modern medicine. These proteins can be used to stimulate local tissue repair. Growth factors are often incorporated into a scaffold, such as a hydrogel, and then put into the desired area of the body to achieve therapeutic effects. However, diffusion of these growth factors outside of the designated area or inappropriate release time can have deleterious consequences, such as inducing tumors in other areas of the body or uncontrolled inflammation. Therefore, this project aims to create a model to study diffusion of protein from hydrogel by using green …
Roles Of Bacterial Toxin Receptor And Piwi-Interacting Rna Of Pacific White Shrimp Penaeus Vannamei In Response To Vibrio Parahaemolyticus-Causing Acute Hepatopancreatic Necrosis Disease Infection, Waruntorn Luangtrakul
Roles Of Bacterial Toxin Receptor And Piwi-Interacting Rna Of Pacific White Shrimp Penaeus Vannamei In Response To Vibrio Parahaemolyticus-Causing Acute Hepatopancreatic Necrosis Disease Infection, Waruntorn Luangtrakul
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
Acute hepatopancreatic necrosis disease (AHPND) or Early mortality syndrome (EMS) caused by virulent strains of Vibrio parahaemolyticus AHPND (VPAHPND) has been a leading cause of significant losses of shrimp production. In this study, we aim to explore the response and the role of immune-related gene/protein and small RNA in the VPAHPND-infected shrimp. This research was divided into 2 parts. In the first part, we identified candidate genes of VPAHPND toxin receptor and further confirmed its function as a VPAHPND toxin receptor. APN has been reported as a Cry toxin from Bacillus thuringiensis, whose structure is similar to VPAHPND toxin. Therefore, …
Anti-Tumor Activities Of Auricularia Polytricha Extracts In Hepatocellular Carcinoma Cell Line (Hepg2) And Breast Cancer Cell Lines (Mcf-7 And Mda-Mb-231), Sunita Nilkhet
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
Cancer is the disease that happens to occur in a high number of new cases each year. Even the choice of treatment is developing, but the adverse effects on cancer therapeutic drugs still challenging. To investigate the antitumor activities of Auricularia polytricha (AP) mushroom extract and active compounds, human cancer cell lines such as Hepatocellcular (HepG2) and Breast cancer cell lines (MCF-7 and MDA-MB-231) were interested. The crude hexane extract of AP (APH) and crude ethanol extract of AP (APE) were prepared by maceration and Soxhlet extraction, respectively. Both APE and APH were investigated for their compound compositions by GC-MS. …
ผลการปกป้องของสารสกัดใบรางจืดจากการเหนี่ยวนำความเป็นพิษด้วยกลูตาเมตในเซลล์ประสาท Ht-22 ผ่านวิถีออโตฟาจี, วุฒิพงษ์ วงศ์ทิพย์
ผลการปกป้องของสารสกัดใบรางจืดจากการเหนี่ยวนำความเป็นพิษด้วยกลูตาเมตในเซลล์ประสาท Ht-22 ผ่านวิถีออโตฟาจี, วุฒิพงษ์ วงศ์ทิพย์
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
หนึ่งในสาเหตุสำคัญของการเกิดโรคความเสื่อมของระบบประสาทนั้นเกิดได้จากภาวะเครียดออกซิเดชันภายในเซลล์ประสาท โดยพบว่าสารสื่อประสาทชนิดกลูตาเมตเมื่อมีระดับสูงผิดปกติสามารถเหนี่ยวนำให้เกิดอนุมูลอิสระและภาวะเครียดออกซิเดชันนำไปสู่การสูญเสียและการตายของเซลล์ประสาทได้ โดยเฉพาะการตายของเซลล์จากการเกิดกระบวนการออโตฟาจีมากเกินไป ซึ่งเป็นกระบวนการที่มีบทบาทสำคัญในการควบคุมการตายของเซลล์ผ่านวิถีอื่นๆ รางจืด (Thunbergia laurifolia) เป็นพืชสมุนไพรไทยมีสรรพคุณในการถอนพิษ ต้านการอักเสบ และ ต้านอนุมูลอิสระได้ดี จุดประสงค์ในการวิจัยครั้งนี้ คือ ศึกษาคุณสมบัติการต้านอนุมูลอิสระของสารสกัดหยาบจากใบรางจืด และการปกป้องการตายของเซลล์ประสาทผ่านวิถีออโตฟาจี จากการเหนี่ยวนำภาวะเครียดออกซิเดชันด้วยกลูตาเมตโดยทดสอบในเซลล์ประสาทส่วนฮิปโปแคมปัสของหนูชนิด HT-22 ใบรางจืดถูกนำมาสกัดด้วยเอทานอล จากผลการทดสอบพบว่าสารสกัดหยาบจากใบรางจืดมีความสามารถในการต้านอนุมูลอิสระ และมีปริมาณสารประกอบ ฟลาโวนอยด์และฟีนอลิกสูง โดยจากการวิเคราะห์ด้วยเครื่อง LC-MS และเปรียบเทียบผลที่ได้กับฐานข้อมูล METLIN-(CA, USA) พบสารออกฤทธิ์สำคัญที่ยังไม่มีรายงานในสารสกัดเอทานอลของใบรางจืด ได้แก่ Apigenin 7-O-glucoside และ 7-Hydroxycoumarin ยิ่งไปกว่านั้นสารสกัดหยาบจากใบรางจืดยังสามารถลดการตายของเซลล์ประสาทจากการเหนี่ยวนำความเป็นพิษด้วยกลูตาเมต โดยสามารถยับยั้งการเกิดอนุมูลอิสระภายในเซลล์ และเพิ่มการแสดงออกของยีนต้านอนุมูลอิสระที่ทำหน้าที่สำคัญในกระบวนการต้านอนุมูลอิสระในร่างกาย ได้แก่ superoxide dismutase 1 และ 2 (SOD1 and SOD2) catalase (CAT) และ glutathione peroxidase (GPx) ซึ่งสัมพันธ์กับการลดการเกิดกระบวนการออโตฟาจีภายในเซลล์และเพิ่มปริมาณ ไมโตคอนเดรียโปรตีน โดยพบว่าสารสกัดหยาบจากใบรางจืดสามารถลดอัตราส่วนการแสดงออกของโปรตีน LC3B-II/LC3B-I และเพิ่มการแสดงออกของไมโตคอนเดรียโปรตีน TOM20 เมื่อทำการตรวจหาตำแหน่งที่จำเพาะต่อการแสดงออกของโปรตีนในกระบวนการออโตฟาจี (LC3B) และไมโตคอนเดรียด้วยกล้องจุลทรรศน์ชนิดคอนโฟคอล พบว่า สารสกัดหยาบจากใบรางจืดสามารถลดการเกิด LC3-puncta ซึ่งเป็นลักษณะเด่นของการเกิดกระบวนการออโตฟาจี นอกจากนี้สารสกัดหยาบจากใบรางจืดยังลดการ colocalization ของ LC3B และไมโตคอนเดรีย จากผลการศึกษานี้เราพบสารออกฤทธิ์สำคัญใหม่ที่ยังไม่มีรายงานมาก่อนของใบรางจืด โดยสารออกฤทธิ์นี้มีความสามารถในการปกป้องเซลล์ประสาทชนิด HT-22 จากภาวะเครียดออกซิเดชันและเป็นปัจจัยสำคัญทำให้สารสกัดจากใบรางจืดมีความสามารถลดการตายของเซลล์ประสาทผ่านวิถีออโตฟาจีได้ ซึ่งอาจสามารถนำไปพัฒนาเป็นสมุนไพรทางเลือกหรือยาเพื่อใช้ในการป้องกันหรือรักษาการเกิดโรคความเสื่อมของระบบประสาทได้ในอนาคต
Co-Expression Of Feedback Resistant Enzymes In Phenylalanine Biosynthesis Pathway To Increase Phenylalanine Production, Charintip Yenyuvadee
Co-Expression Of Feedback Resistant Enzymes In Phenylalanine Biosynthesis Pathway To Increase Phenylalanine Production, Charintip Yenyuvadee
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
L-Phenylalanine (L-Phe) is an important commercial amino acid. It is widely used in food and pharmaceutical industries. Currently, the requirement of L-Phe is increased according to the great demand for the low-calorie sweetener, aspartame. In Escherichia coli, the synthesis of L-Phe is controlled by the multi-hierarchical regulations. AroG isoform of 3-deoxy- D-arabino-heptulosonate-7-phosphate synthase (DAHP synthase) and chorismate mutase/prephenate dehydratase (PheA), two important enzymes, are feedback inhibited by LPhe. Co-expression of feedback-resistant pheA (pheA[superscript L359D]) with other pivotal genes in L-Phe biosynthesis pathway: aroB, aroL, phedh, tktA, aroG, pheA, yddG, and glpF in pRSFDuet-1 (pPTFBLYA[superscript L359D]) elevated L-Phe production of E. …
Functional Characterization Of Cytosolic Ddx41 Sensor In Mediating Antiviral Immune Response In Black Tiger Shrimp Penaeus Monodon, Suthinee Soponpong
Functional Characterization Of Cytosolic Ddx41 Sensor In Mediating Antiviral Immune Response In Black Tiger Shrimp Penaeus Monodon, Suthinee Soponpong
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 41 (DDX41), a receptor belonging to the DExD family, was recently identified as an intracellular DNA sensor in vertebrates. Here, we investigated the presence of cytosolic DNA sensing, DDX41 in shrimp Penaeus monodon. By searching for gene involved in DNA sensing cascade within the shrimp P. monodon EST database, 3 cDNA fragments exhibited similarity to DDX41 in various species were identified. Sequences assembly resulted in a complete ORF of Penaeus monodon DDX41 (PmDDX41) which has 1868-bp encoding a putative protein of 620 amino acid residues. The multiple sequence alignment of deduced amino acid sequence of PmDDX41 …
Fructooligosaccharide Synthesis By Immobilized Inulosucrase From Lactobacillus Reuteri 121 And Improvement Of Product Pattern Using Site-Directed Mutagenesis, Thanapon Charoenwongpaiboon
Fructooligosaccharide Synthesis By Immobilized Inulosucrase From Lactobacillus Reuteri 121 And Improvement Of Product Pattern Using Site-Directed Mutagenesis, Thanapon Charoenwongpaiboon
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
Inulin-type fructooligosaccharides (IFOS) are well-known prebiotics which can be produced from sucrose using bacterial inulosucrase (E.C. 2.4.1.9). However, the use of inulosucrase for IFOS synthesis has some limitations because it also synthesizes some polysaccharides and exhibits lower stability than the fungal enzymes. To overcome these limitations, improvement of inulosucrase was made by using enzyme immobilization and enzyme engineering. First, inulosucrase from Lactobacillus reuteri 121 was immobilized on a novel, high capacity core-shell chitosan beads using glutaraldehyde as a cross-linker. The results showed that both immobilized and free inulosucrase had the same optimum pH (5.5), while the optimum temperature was shifted …
Development Of Paper-Based 3d Cell Culture Devices And Real-Time Biosensing Applications, Naricha Pupinyo
Development Of Paper-Based 3d Cell Culture Devices And Real-Time Biosensing Applications, Naricha Pupinyo
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
Due to its micro fibrous pores, paper has gained traction in the use as a scaffold for 3D cell culture. To study melanoma mechanism, screening the amount of melanin production and invasion study are major keys for drug development. In this work, we developed paper-based devices for culturing melanoma cells. Through the development process, we obtained the optimal parameters, which were applied for 3 different projects; 1) Anti-melanogenic effect screening, 2) Impedance-based E-screen assay, and 3) A membrane insert for real-time invasion assay. As a result of melanin production from melanocytes, the cells can be easily observed after a few …
Effects And Mechanisms Of Caesalpinia Mimosoides Leaf Extract On Oxidative Stress Resistance And Anti-Aging Activity In Caenorhabditis Elegans And Neurite Outgrowth Activity In Neuro2a Cells, Panthakarn Rangsinth
Effects And Mechanisms Of Caesalpinia Mimosoides Leaf Extract On Oxidative Stress Resistance And Anti-Aging Activity In Caenorhabditis Elegans And Neurite Outgrowth Activity In Neuro2a Cells, Panthakarn Rangsinth
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
World’s population of older people is rising, dietary supplements promoting healthy lifespan are needed. Moreover, Alzheimer’s disease (AD), an age-related degenerative disease, becomes a public health problem in aging society. Recent reports using cell culture models of AD suggest that amyloid precursor protein (APP), a protein causally related to AD, plays an important role as an inhibitor of neurite outgrowth. Medicinal herbs with neurite outgrowth stimulatory effect may help to prevent and cure AD. Moreover, studies suggest that dietary supplements from plant sources act in preventive nutrition, since they provide antioxidant action against oxidative stress, promote healthspan and prolong lifespan. …
Effects And Mechanisms Of Anacardium Occidentale And Glochidion Zeylanicum Leaf Extracts On Neuroprotective, Neuritogenesis, Oxidative Stress Resistance And Anti-Aging Properties., Chatrawee Duangjan
Effects And Mechanisms Of Anacardium Occidentale And Glochidion Zeylanicum Leaf Extracts On Neuroprotective, Neuritogenesis, Oxidative Stress Resistance And Anti-Aging Properties., Chatrawee Duangjan
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
Aging is the primary risk factor for most neurodegenerative diseases and can negatively affect the quality of life. Neurodegenerative diseases are linked to neuronal cell death and neurite outgrowth impairment that are often caused by oxidative stress. As people want to live longer and healthier, healthy nutrition has been increasingly received much attention in recent years. Several studies reported a positive correlation between antioxidants in foods and longevity. Natural products from food supplements and medicinal plants with antioxidant properties could be promising candidates for fighting against various aging-related diseases and promoting longevity. Leaf extracts from A. occidentale (AO) and G. …
Functional Characterization Of White Spot Syndrome Virus-Responsive Mir-750 In Black Tiger Shrimp Penaeus Monodon, Nichaphat Kanoksinwuttipong
Functional Characterization Of White Spot Syndrome Virus-Responsive Mir-750 In Black Tiger Shrimp Penaeus Monodon, Nichaphat Kanoksinwuttipong
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
In the RNA interference (RNAi) process, small RNAs called microRNAs (miRNAs) modulate gene expression post-transcriptionally by acting as guides to direct Argonaute (Ago)-containing RNA-induced silencing complexes (RISCs) to targeted mRNAs. The Penaeus monodon miR-750 was previously reported as the highly upregulated miRNA during white spot syndrome virus (WSSV) infection. In this study, the computational program and 2D gel electrophoresis technique were used to identify miR-750 target genes. Bioinformatic analysis suggested that the predicted target mRNAs of miR-750 were ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1 gene (UbcQ1), Actin1 (Act1) and Sarcoplasmic calcium-binding protein (Scp). Furthermore, the alteration of protein expression in the stomach …
Anticancer Activity Of Mansonone G Derivatives Against Human Non-Small Cell Lung Cancer: Computational And Mechanistic Study, Panupong Mahalapbutr
Anticancer Activity Of Mansonone G Derivatives Against Human Non-Small Cell Lung Cancer: Computational And Mechanistic Study, Panupong Mahalapbutr
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
Epidermal growth factor receptor (EGFR) and DNA topoisomerase II (Topo II) are the key molecular targets for non-small cell lung cancer (NSCLC) due to its major contribution to complex signaling cascades modulating the survival of cancer cells. In the present study, mansonone G (MG), a naturally occurring quinone-containing compound, and its semi-synthetic ether derivatives were subjected to theoretically and experimentally investigate the anticancer effects on EGFR/Topo II-mediated signaling pathways in NSCLC cell lines expressing wild-type EGFR (A549) and mutant EGFR (H1975). In vitro cytotoxicity screening results demonstrated that butoxy MG (MG3) was more susceptible to H1975 mutant cells (IC50 of …
Synergistic Effect Of Smac-Mimetic And Poly (I:C) On Apoptosis Of Cholangiocarcinoma Cells, Thanpisit Lomphithak
Synergistic Effect Of Smac-Mimetic And Poly (I:C) On Apoptosis Of Cholangiocarcinoma Cells, Thanpisit Lomphithak
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
Cholangiocarcinoma (CCA), a malignancy transformed from cholangiocytes in the bile ducts is more common in Asia and has the highest incidence rate in Thailand. CCA is an aggressive malignancy which has high mortality, high recurrence rate and poor prognosis due to late diagnosis and lack of effective treatment, therefore identification of novel therapeutic targets could lead to the development of more efficient therapy. CCA is associated with chronic inflammation that could upregulate Toll-like receptor 3 (TLR3) in CCA cells. TLR3 agonist, poly(I:C) has been reported to directly induce apoptosis in selected cancers and also activates anti-tumor immunity. However, in some …
Production And Purification Of Mannan Oligosaccharide And Its Role In Tight Junction Assembly In Epithelial Cells, Chatchai Nopvichai
Production And Purification Of Mannan Oligosaccharide And Its Role In Tight Junction Assembly In Epithelial Cells, Chatchai Nopvichai
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
Mannan Oligosaccharide (MOS) is well-known as prebiotic supplement that help increasing life quality of livestocks and animals. Many reports revealed that MOS supplement can help improve intestinal morphology, enhancing growth performance, raising body weight, and increasing metabolic and stress response. MOS feeding also affected several biological processes in peripheral blood mononuclear cells in pigs and modulates expression of many immune-related genes that helps to prevent and reduce the severity of viral infection. However, the mechanism of action of MOS is remained unclear and the production, purification, identification of bioactive MOS molecular type is needed. In this study, we developed a …
Effect Of Feedback-Resistant Arog Overexpression On L-Phenylalanine Production In Escherichia Coli, Maria Ulfah
Effect Of Feedback-Resistant Arog Overexpression On L-Phenylalanine Production In Escherichia Coli, Maria Ulfah
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
L-Phenylalanine (L-Phe) is one of the most important amino acids in food and pharmaceutical industries. It is widely used as a nutritional supplement and a precursor for the synthesis of food additives. The market of L-Phe has been stimulated by increasing demand for the low-calorie sweetener, aspartame. In Escherichia coli, the key enzyme which catalyzes the first committed step of aromatic amino acid biosynthesis pathway is 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate-7- phosphate synthase (DAHP-synthase). The enzyme has 3 isoforms, AroG, AroF and AroH, which are feedback inhibited by L-Phe, L-Tyr and L-Trp, respectively. AroG, encoded by aroG, is the major isoform contributed about 80% …
Functional Characterization Of Inhibitor Of Kappa B Kinase In Black Tiger Shrimp Penaeus Monodon Antiviral Signaling Pathway, Zittipong Nhnhkorn
Functional Characterization Of Inhibitor Of Kappa B Kinase In Black Tiger Shrimp Penaeus Monodon Antiviral Signaling Pathway, Zittipong Nhnhkorn
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
The IKK-NF-κB signaling cascade is one of the crucial responsive mechanisms in inflammatory and immune responses. The key kinase proteins called inhibitor of kappa B kinases (IKKs) serve as the core elements involved in cascade activation. Here, the complete open reading frames of IKK homologs including PmIKKβ, PmIKKε1 and PmIKKε2, from the black tiger shrimp Penaeus monodon were identified and characterized for their functions in shrimp antiviral responses. The PmIKK transcripts were widely expressed in various examined tissues and the PmIKKε protein was detected in all three types of shrimp hemocytes. Only the PmIKKε1 and PmIKKε2 were responsive to white …
การพัฒนาแบบจำลองเซลล์ลำไส้ของมนุษย์บนกระดาษที่มีการดัดแปรพื้นผิวและต้นแบบไบโอเซนเซอร์ไร้สายสำหรับตรวจวัดการเจริญของจุลชีพก่อโรค, ปัณณวิชญ์ ถิรบวรกิจพิธาน
การพัฒนาแบบจำลองเซลล์ลำไส้ของมนุษย์บนกระดาษที่มีการดัดแปรพื้นผิวและต้นแบบไบโอเซนเซอร์ไร้สายสำหรับตรวจวัดการเจริญของจุลชีพก่อโรค, ปัณณวิชญ์ ถิรบวรกิจพิธาน
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
วิทยานิพนธ์นี้เป็นการนำเสนองานวิจัย การพัฒนาวิธีการใหม่เพื่อควบคุมและเฝ้าระวังโรคติดเชื้อ โดยประกอบด้วยเนื้อหาสำคัญสองส่วน ได้แก่ (i) การพัฒนาแบบจำลองเซลล์ลำไส้ของมนุษย์ที่เพาะเลี้ยงบนกระดาษที่มีการดัดแปรพื้นผิว เพื่อใช้ประโยชน์ในการศึกษากลไกการบุกรุกของเชื้อจุลชีพก่อโรคในระบบทางเดินอาหาร และ (ii) การพัฒนาต้นแบบไบโอเซนเซอร์แบบไร้สายเพื่อการตรวจติดตามการเจริญของเชื้อจุลชีพก่อโรค โดยในส่วนแรก เซลล์ลำไส้ของมนุษย์ HT-29 จำนวน 200,000 เซลล์ ถูกเพาะเลี้ยงในบริเวณชอบน้ำของกระดาษกรอง Whatman No.1 โดยกระดาษถูกดัดแปรพื้นผิวด้วยสารแมทริกซ์นอกเซลล์ (Extracellular matrix: ECM) ชนิดต่าง ๆ ได้แก่ Matrigel, Collagen-1 และ Laminin พื้นที่เพาะเลี้ยงเซลล์มีขนาด 12.56 ตารางมิลลิเมตร ภายใต้สภาวะที่เหมาะสม เซลล์ HT-29 ที่ถูกเพาะเลี้ยงบนกระดาษ มีชีวิตรอดได้ถึง 28 วัน และแสดงลักษณะของเซลล์ที่เจริญเต็มที่ โดยมีการแสดงออกของวิลไล (villi) ที่ผิวเซลล์ด้านบน (apical) และมีการแสดงออกของโปรตีน ZO-1 ซึ่งแสดงถึงเซลล์มีการสร้างไทต์จังก์ชันเกิดขึ้น จากการใช้สารเชื่อมพันธะสำหรับเชื่อมพันธะ ECM แต่ละชนิด พบว่าเมื่อใช้สารเจนิพินในการเชื่อมพันธะ เซลล์มีชีวิตรอดทั้งหมด (100 -112.8%) ในขณะที่มีเพียง 1.1 - 67.3 % ของเซลล์รอดชีวิต หากใช้สารกลูตารัลดีไฮด์ในการเชื่อมพันธะ แต่การใช้สารเชื่อมพันธะทั้งสองชนิด ทำให้เซลล์ไม่สามารถแบ่งตัวมีรูปร่างแบบสามมิติได้ เมื่อสังเกตด้วย SEM เซลล์มีลักษณะแบน การดัดแปรพื้นผิวกระดาษด้วยสาร ECM ชนิด Matrigel ส่งผลให้เซลล์มีชีวิตรอดมากที่สุดและสาร ECM ชนิด Laminin ทำให้เซลล์เกิดการแปรสภาพ (cell differentiation) ได้ดีที่สุด งานวิจัยส่วนที่ 2 เป็นการพัฒนาไบโอเซนเซอร์ไร้สายสำหรับติดตามการเจริญของเชื้อจุลชีพก่อโรค ได้แก่ เชื้อ Escherichia coli, Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa, Streptococcus gordonii และ Candida albicans พบว่าเชื้อดังกล่าวสามารถสร้างไบโอฟิล์มบนผิวของขั้วไฟฟ้าคาร์บอนอสัณฐาน (glassy carbon electrode) และสามารถให้ค่าศักย์ไฟฟ้าที่เป็นลบได้ …
การพัฒนาอุปกรณ์วิเคราะห์ฐานกระดาษสำหรับหาปริมาณสารเพรดนิโซโลนและเดกซาเมทาโซนที่ปลอมปนในผลิตภัณฑ์สมุนไพรด้วยวิธีเคมีไฟฟ้า, วิศรุต พริ้มพราย
การพัฒนาอุปกรณ์วิเคราะห์ฐานกระดาษสำหรับหาปริมาณสารเพรดนิโซโลนและเดกซาเมทาโซนที่ปลอมปนในผลิตภัณฑ์สมุนไพรด้วยวิธีเคมีไฟฟ้า, วิศรุต พริ้มพราย
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
การปลอมปนของสารสเตียรอยด์ชนิดเดกซาเมทาโซนและเพรดนิโซโลนในผลิตภัณฑ์สมุนไพรเป็นปัญหาสำคัญที่ก่อผลเสียร้ายแรงต่อสุขภาพของผู้ใช้ ในหลาย ๆ ประเทศทั่วโลก โดยเฉพาะอย่างยิ่งในประเทศกำลังพัฒนา งานวิจัยนี้ ประสบความสำเร็จในการพัฒนาอุปกรณ์สำหรับแยกและตรวจวัดปริมาณการปลอมปนของสารสเตียรอยด์ดังกล่าว โดยใช้อุปกรณ์ตรวจวิเคราะห์ฐานกระดาษและใช้หลักการทางเคมีไฟฟ้า (electrochemical paper-based analytical device หรือ ePAD) ซึ่งประกอบด้วยกระดาษ Whatman SG81 ตลับพลาสติกจากการพิมพ์สามมิติ และขั้วไฟฟ้าชนิด screen printed electrode โดยกระดาษ Whatman SG81 ใช้สำหรับแยกสารสเตียรอยด์ชนิดเดกซาเมทาโซนและเพรดนิโซโลน โดยใช้วัฏภาคเคลื่อนที่เป็นสารละลาย 60% ethyl acetate ใน cyclohexane ซึ่งผลการศึกษาพบว่าสามารถแยกสารสเตียรอยด์ดังกล่าวออกจากสิ่งเจือปนต่าง ๆ ได้ภายใน 7 นาที สารสเตียรอยด์ที่แยกออกจากกันบนกระดาษ นำมาวัดปริมาณด้วยเทคนิคเคมีไฟฟ้าชนิด differential pulse voltammetry โดยใช้ตลับพลาสติกจากการพิมพ์สามมิติที่ถูกออกแบบทำให้สารละลายอิเล็กโทรไลต์ถูกขังอยู่บนกระดาษ ทำให้สามารถตรวจวัดสัญญาณทางเคมีไฟฟ้าได้คงที่ ซึ่งอุปกรณ์ที่พัฒนาขึ้นสามารถตรวจวัดปริมาณปลอมปนของสารสเตียรอยด์ทั้งชนิดเดกซาเมทาโซนและ เพรดนิโซโลนได้ในช่วงความเข้มข้นระหว่าง 10 ถึง 500 µg/mL โดยมีค่าสัมประสิทธิ์สหสัมพันธ์เท่ากับ 0.988 และ 0.994 ตามลำดับ มีขีดจำกัดในการตรวจวิเคราะห์เชิงคุณภาพเท่ากับ 3.59 µg/mL และ 6.00 µg/mL ตามลำดับ และขีดจำกัดในการตรวจวิเคราะห์เชิงปริมาณมีค่าเท่ากับ 11.98 µg/mL และ 20.02 µg/mL ตามลำดับ การตรวจวัดปริมาณปลอมปนของสารสเตียรอยด์ทั้งสองชนิดในสิ่งตัวอย่างผลิตภัณฑ์สมุนไพรจริงด้วยวิธีที่พัฒนาขึ้นมีค่าสอดคล้องกับผลที่ตรวจด้วยวิธี HPLC และเป็นวิธีที่ใช้งานง่าย มีต้นทุนต่ำ รวดเร็ว และมีศักยภาพนำไปใช้ตรวจหาสิ่งตัวอย่างผลิตภัณฑ์สมุนไพรที่สงสัยว่ามีการปลอมปนของสารสเตียรอยด์ ในระดับภาคสนาม
Polyamine Accumulation And Responses Of Mango Fruit To Postharvest Polyamine Application, Bussarin Wonnabussapawich
Polyamine Accumulation And Responses Of Mango Fruit To Postharvest Polyamine Application, Bussarin Wonnabussapawich
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
Mango (Mangifera indicia L.) is a popular tropical fruit which has a great value in both domestic and international markets. Mango is a climacteric fruit which ethylene production increases dramatically, thus leading to a quick ripening process and a short postharvest life. Polyamines (PAs) have been reported to be involved in fruit ripening. Changes in endogenous free polyamines accumulation were measured in two mango cultivars; ‘Nam Dok Mai No.4’ and ‘Nam Dok Mai Si Tong’. Mangoes were allowed to ripen at 25±1 ºC after harvest. It was found that ‘Nam Dok Mai No.4’ mango exhibited higher ethylene production, respiration rate, …
Functional Characterization Of Heat Shock Proteins During Stress Response In Pacific White Shrimp Penaeus Vannamei And Brine Shrimp Artemia Franciscana, Wisarut Junprung
Functional Characterization Of Heat Shock Proteins During Stress Response In Pacific White Shrimp Penaeus Vannamei And Brine Shrimp Artemia Franciscana, Wisarut Junprung
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
Acute hepatopancreatic necrosis disease (AHPND) caused by the bacterium Vibrio parahaemolyticus carrying toxin produced plasmid (VPAHPND), has led to severe mortalities in farmed penaeid shrimp throughout Asia. Our studies demonstrated that a chronic non-lethal heat shock (chronic-NLHS) could enhance resistance of the Pacific white shrimp Penaeus vannamei to VPAHPND infection. Shrimp exposed to chronic-NLHS (28 °C to 38 °C, 5 min for 7 days) had higher survival rate (>50%) than that of the control non-heated shrimp (20%) when they were challenged with VPAHPND. The qRT-PCR analysis revealed that the expression of heat shock proteins, LvHSP70 and LvHSP90, as well …