Other Analytical, Diagnostic and Therapeutic Techniques and Equipment Commons^™

Halloween 2012 Jack O'Lanterns Trick Or Treat, George Mcnamara

George McNamara

Halloween 2012 makes trick or treating more visual and interactive than in past years.

the download is a ZIP file containing three files.

Print out the (unnumbered) image on as large and nice printer paper as possible - I used glossy 44" wide here in Miami (University of Miami, MillerSchool of Medicine, Calder Library, Biomedical Communications dept - I also made another print on "fabric", also 44" wide to take with me to an HHMI Janelia Farm conference on 'turning images into knowledge' that ends on Oct 31 - might stay up for a second conference, "GFP..." that start Nov …

Mcnamara 20120831fri-20120904tue Cosmic Ray Particles By Ccd Imaging, George Mcnamara

George McNamara

McNamara 20120831Fri-20120904Tue Cosmic Ray Particles by CCD imaging.zip contains image files in support of a Microscopy Today article - please see

http://www.microscopy-today.com/

Normalizing For Noise Removal From Electrocardiogram Signals, Dominique Diamond Brooks, Daniel J. Simon

Undergraduate Research Posters 2012

Electrocardiography (ECG) measures the electrical impulse of the heart over time using electrodes that attached to the body. Designing a computational program using a synthetic ECG to test Normalized Least Mean Square (NLMS) filter serves as a basis to remove noise from the signal.

Anti-Cancer Drug Screening Of Dual Tubulin And Hsp27 Inhibitors With 2d And 3d Lung Cancer Cell Assays, Janine Maria Naim, Rati Lama

Undergraduate Research Posters 2012

Cancer is the leading cause of death worldwide. The current treatment options available for lung cancer are limited and have drawbacks such as poor bioavailability, numerous side effects, poor efficacy and drug resistance. 3D model serve as a novel approach for drug screening purposes and the evaluation of compounds in the platform can help identify potent compounds for further in vivo xenograft studies.

Cosmic Ray Particles Images With Orca-Ii Erg, George Mcnamara

George McNamara

Cosmic ray particles image series acquired using a Hamamatsu ORCA-II ERG scientific grade CCD camera, cooled to -60 C. Each image is a consecutive 600 second (10 minute) exposure time with no light to the camera.

While processing the data, I discoverd that the background changed around planes 25 and 227 (see Excel file and jpeg screenshots), so I also processed only planes 025-227 (203 planes total, 2030 minutes, 33.83 hours). the CCD industry "rule of thumb" for a "typical" CCD sensor (i.e. 1/3" CCD) is that one cosmic ray particle strikes a sensor approximately every 30 seconds (assuming not …

Sleep Hygiene And Problem Behaviors In Snoring And Non- Snoring School-Age Children, Lisa A. Witcher, David Gozal, Dennis L. Molfese, Scott M. Salathe, Karen Spruyt, Valerie Mclaughlin Crabtree

Center for Brain, Biology, and Behavior: Faculty and Staff Publications

Objectives—The effects of sleep-disordered breathing, sleep restriction, dyssomnias, and parasomnias on daytime behavior in children have been previously assessed. However, the potential relationship(s) between sleep hygiene and children’s daytime behavior remain to be explored. The primary goal of this study was to investigate the relationship between sleep hygiene and problematic behaviors in non-snoring and habitually snoring children.

Methods—Parents of 100 5- to 8-year-old children who were reported to snore “frequently” to “almost always,” and of 71 age-, gender-, and ethnicity-matched children who were reported to never snore participated in this study. As part of a larger, ongoing study, …

Coherent Scatter Computed Tomography For Core Composition Analysis Of Intact Kidney Stones - Prospective Clinical Study, Cristian Dihel

Electronic Thesis and Dissertation Repository

Urolithiasis is the presence of urinary calculi (urinary stones) at any level along the excretory system. Establishing accurate and complete mineral composition of the stones is one of the main factors in deciding the best steps for therapy and recurrence prevention.

Currently, infrared spectroscopy (IRS) and x-ray diffractometry (XRD) provide bulk composition results of urinary calculi in powdered form. Clinicians use the results to prescribe medical and dietary measures to restore the physiologic chemical balance of urine or rather alter it for the purpose of decreasing the crystallization rate of single or multiple minerals. As current methods have been shown …

Flowcell Systems For Single Molecule Detection, John G. K. Williams, Gregory R. Bashford, Jiyan Chen, Dan Draney, Nara Narayanan, Bambi L. Reynolds, Pamela Sheaff

Biomedical Imaging and Biosignal Analysis Laboratory

The present invention provides compounds, methods and systems for sequencing nucleic acid using single molecule detection. Using labeled NPs that exhibit charge-switching behavior, single-molecule DNA sequencing in a microchannel sorting system is realized. In operation, sequencing products are detected enabling real-time sequencing as successive detectable moieties flow through a detection channel. By electrically sorting charged molecules, the cleaved product molecules are detected in isolation without interference from unincorporated NPs and without illuminating the polymerase-DNA complex.

Flatbed Scanner Report - Optical Density Dynamic Range, George Mcnamara

George McNamara

George McNamara (now at University of Miami) report for Hua Yu and Richard Jove, City of Hope National Medical Center, on optical density dynamic range of several flatbed scanners.

Targeted Intracellular Therapeutic Delivery Using Liposomes Formulated With Multifunctional Fast Proteins, Rae L. Nesbitt

Electronic Thesis and Dissertation Repository

Prostate cancer is the most common malignancy in North American men and there is no treatment currently available which offers a clear survival advantage to patients with prostate cancer. We studied liposomes formulated with the fusion-associated small transmembrane (FAST) protein, p14. In this study, we hypothesized that therapeutics delivered in molecular targeted fusogenic liposomes will increase intracellular delivery and specificity for prostate cancer. We demonstrated that liposomes formulated with p14-bombesin significantly increased the delivery of fluorescein isothiocyanate (FITC) into human prostate cancer (PC-3) cells compared to either standard liposomes or non-targeted fusogenic liposomes. Delivery of FITC to benign prostate hyperplasia …

Introduction To Nanoscopy Nano-Talk, George Mcnamara

George McNamara

T7-1 is the designation for the LMRG Nanoscopy session at ABRF in Orlando, FL, on March 20, 2012. The PDF file here is a draft of my presentation.

May not be very helpful since (1) would probably help to know what is in my head and each slide will [hopefully] prompt me to say, and (2) 10 minute talk so I am going to push the "next slide" button after saying very little.

__________________

Publisher statement:

The T7-1 Introduction to Nanoscopy Nano Talk is copyrighted (c) George McNamara, 2012. Except for (1) screenshots from research articles (which are copyrighted by …

Pubspectra - Open Data Access Fluorescence Spectra, George Mcnamara

George McNamara

The Internet is enabling greater access to spectral imaging publications, spectral graphs, and data than that was available a generation ago. The spectral imaging systems discussed in this issue of Cytometry work because reagent and hardware spectra are reproducible, reusable, and provide input to spectral unmixing and spectral components recognition algorithms. These spectra need to be readily available in order to determine what to purchase, how to use it, and what the output means. We refer to several commercially sponsored and academic spectral web sites and discuss our spectral graphing and data sites. Sites include fluorescent dye graph servers from …

Mcnamara 2011 Feature Extraction (Image Analysis), George Mcnamara

George McNamara

Feature Extraction presentation and movies in a ZIP file from a presentation I gave at ISAC 2011 in Baltomore, Md.

Feature extraction is one phrase for image analysis.

Rogers Pmn Movie - Background Information, George Mcnamara

George McNamara

Please see

http://mdc.custhelp.com/app/answers/detail/a_id/18689/~/metamatters-newsletters

for my series of MetaMorph MetaMatters articles in volume 2, numbers 3 through 6, on the Rogers PMN Panorama data set.

http://mdc.custhelp.com/app/answers/detail/a_id/18689/~/metamatters-newsletters

Brief summary (for more, see the Word doc)

Terahertz Imaging For Cancer Detection, Benjamin A. St. Peter

Masters Theses 1911 - February 2014

This project evaluates the ability of terahertz (THz) radiation to differentiate cancerous from non-cancerous human breast lumpectomy and mastectomy tissue. This is done by aiming a narrow-band THz beam at medical samples and measuring reflected power. THz images of specimens from Breast Conservation Surgery (BCS) were created using a gas laser source and mechanical scanning. The design and characterization of this system is discussed in detail. The images were correlated with optical histological micrographs of the same specimens and discrimination values of more than 70% were found for five of the six samples using Receiver Operating Characteristic (ROC) analysis.

La Prueba De Hartmann En Ciencias De La Visión, Yobani Mejía Barbosa

Ciencia y Tecnología para la Salud Visual y Ocular

En este artículo se muestran tres aplicaciones de la prueba de Hartmann en Ciencias de la Visión, desarrolladas en el laboratorio de diseño óptico del Departamento de Física de la Universidad Nacional de Colombia: lensómetro para lentes de adición progresiva, topógrafo corneal y aberrómetro tipo Hartmann-Shack. Primero se describe brevemente la prueba clásica de Hartmann para espejos astronómicos y luego se presentan tres variaciones de la prueba de Hartmann para optometría yoftalmología. En cada caso se describe el sistema óptico empleado y la geometría para deducir la aberración de frente de onda a partir de las aberraciones de rayo (patrones …

Two-Dimensional Blood Flow Velocity Estimation Using Apparent Speckle Pattern Angle Dependence On Scan Velocity, Tiantian Xu, Gregory R. Bashford

Biomedical Imaging and Biosignal Analysis Laboratory

An algorithm which measures the lateral component of blood flow velocity was developed in our previous studies based on the increase in speckle size due to relative motion between moving scatterers and spatial rate of scanner A-line acquisition (scan velocity). In this paper, the apparent dominant angle of the speckle pattern in a straight vessel was investigated and a new method of two-dimensional blood flow velocity estimation is introduced. Different scan velocities were used for data acquisition from blood flow traveling at an angle relative to the ultrasound beam. The apparent angle of the speckle pattern changes with different scan …

Monitoring Cerebral Hemodynamics With Transcranial Doppler Ultrasound During Cognitive And Exercise Testing In Adults Following Unilateral Stroke, Brian P. Watt, Judith M. Burnfield, Edward J. Truemper, Thad W. Buster, Gregory R. Bashford

Biomedical Imaging and Biosignal Analysis Laboratory

An observational study was performed as a preliminary investigation into the use of transcranial Doppler ultrasound (TCD) for recording cerebral hemodynamic changes during multiple tasks. TCD is a method of measuring cerebral blood flow (CBF) using ultrasound transducers in contact with the surface of the head. Using the maximum flow envelope of the Doppler spectrum returning from the middle cerebral artery (MCA), standard clinical flow indices can be calculated and displayed in real time providing information concerning perturbations in CBF and their potential cause. These indices as well as flow velocity measurements have been recognized as useful in measuring changes …

La Facultad De Ciencias De La Salud, Una Oportunidad De Incidencia Nacional, Jesús Ortega Bolaños

Ciencia y Tecnología para la Salud Visual y Ocular

No abstract provided.

Edema Corneal Durante El Uso Diario De Lentes De Contacto Blandos De Alta Y Baja Transmisibilidad, William Emigdio Malagón Cruz, Martha Fabiola Rodríguez Álvarez, Patricia Hernández Rodríguez

Ciencia y Tecnología para la Salud Visual y Ocular

Objetivo: determinar el comportamiento en el espesor corneal durante 30 días con lentes alta y baja transmisibilidad (Dk/t). Materiales y métodos: se estudiaron 26 ojos de 13 sujetos no usuarios de lentes de contacto, en el ojo derecho se adaptó un lente de alto Dk, lotrafilcon A y en el ojo izquierdo un lente de bajo Dk, vasurfilcon A, durante 30 días en uso diario. Antes de la adaptación se midió el espesor corneal con el Pentacam de Oculus, el examen se repitió durante elprimer día a las 4 y 8 horas y posteriormente a los 3, 8, 15, 20, …

Concordancia Entre El Test De Números De Snellen Y El Test De Números De Lea En Niños Entre Cuatro Y Siete Años, Julieth Peña, Deicy Rubiano, María Yolanda López Aguirre

Ciencia y Tecnología para la Salud Visual y Ocular

La evaluación de la agudeza visual en niños en edad escolar se realiza empleando las cartillas de visión. Las más empleadas en la práctica clínica son Snellen y Bailey Lovie. La manera en que se valora la visión en los niños no difiere demasiado de como se hace en los adultos; sin embargo, para poder seleccionar el test, se debe tener en cuenta el desarrollo cognitivo. Objetivo: determinar la concordancia entre el test de números de Snellen y el test de números de Lea en niñosentre cuatro y siete años de la ciudad de Bogotá. Materiales y métodos: la muestra …

Efecto Del Suero Autólogo En La Reparación De La Superficie Ocular Asociada A Ojo Seco, Sandra Johanna Garzón Parra, Alejandro Santana Bonilla

Ciencia y Tecnología para la Salud Visual y Ocular

El daño de la superficie ocular asociado a la alteración de la película lagrimal causa múltiples síntomas y como tratamiento se usa el suero autólogo. Objetivos: comparar el efecto del suero autólogo sobre la reparación de la superficie ocular, preparado con dos concentraciones diferentes (80 y 20 %). Materiales y métodos: se realizó un estudio prospectivo cuasiexperimental en 25 pacientes diagnosticados con ojo seco, mediante el test de Schirmer, tbut y tinción con rosa de Bengala. Se administró colirio de suero autólogo al 80 % en el ojo derecho y al 20 % en el ojo izquierdo, y después de …

Valores De Normalidad De Sensibilidad Al Contraste En Niños Entre Cuatro Y Siete Años De La Localidad De Chapinero, Bogotá, María Yolanda López Aguirre, Luisa Fernanda Figueroa Olarte

Ciencia y Tecnología para la Salud Visual y Ocular

Las pruebas de sensibilidad al contraste (sc) son una poderosa herramienta para determinar la capacidad visual. Es importante conocer el desarrollo de esta función y tener parámetros precisos para el diagnóstico temprano de alteraciones. Objetivo: determinar los valores de normalidad para sc con el Functional Acuity Contrast Test (fact) en niños entre cuatro y siete años de la localidad de Chapinero en Bogotá. Materiales y métodos: estudio observacional descriptivo de corte transversal con 280 ojos. Se organizaron dos grupos: grupo 1, entre cuatro y cinco años, y grupo 2, entre seis y siete años, valorando contraste con el fact para …

Estudio Retrospectivo Del Estado Refractivo En Niños Prematuros De Tres A Cuatro Meses De Edad Corregida, Realizado En El Programa Madre Canguro Integral, Hospital San Ignacio, Bogotá, Jenny Maritza Sánchez Espinosa, María Susana Merchán Price

Ciencia y Tecnología para la Salud Visual y Ocular

El estado refractivo en los niños al nacer está dado por la asociación entre los parámetros ópticos y la longitud axial del globo ocular, que van cambiando con el desarrollo del niño hasta conseguir la emetropización. Objetivo: determinar el estado refractivo de niños prematuros de tres a cuatro meses de edad, corregido en el Programa Madre Canguro del Hospital San Ignacio. Materiales y métodos: se revisaron 4908 historias clínicas de pacientes atendidos entre el 1º de julio del 2004 y el 31 de junio del 2009. Resultados: 1731 historias clínicas cumplieron los criterios de inclusión (52,3 % hombres y 47,7 …

Cambios En La Superficie Ocular Y En La Película Lagrimal Durante 30 Días De Uso Diario De Lentes De Contacto Blandos De Hidrogel E Hidrogel De Silicona, Juanita Dávila, Yudiley Romero, Martha Rodríguez

Ciencia y Tecnología para la Salud Visual y Ocular

Los cambios fisiológicos y morfológicos inducidos por los lentes de contacto (LC) se deben principalmente a hipoxia, trauma mecánico y toxicidad, relacionados con el tiempo de uso de LC. Objetivo: determinar los cambios en la superficie ocular y en la película lagrimal durante 30 días de uso diario de LC de hidrogel e hidrogel de silicona. Materiales y métodos: 20 sujetos, neófitos en el uso de LC firmaron el consentimiento informado y se adaptaron con lotrafilcon A y vasurfilcon A. Antes de la adaptación y en cada uno de los controles (4 y 8 horas, días 3, 7, 11, 15, …

Lente Escleral En Paciente Con Quemadura Ocular Por Álcalis, Carlos Augusto Alfonso Rojas, Rosario Pizza Barrios

Ciencia y Tecnología para la Salud Visual y Ocular

Se presenta el caso de un paciente que sufrió una quemadura química ocular con álcalis (cal) en el ojo derecho y que fue tratado por el servicio de córnea y enfermedades externas con inyección subconjuntival de bevacizumab y posterior transplante de células limbales de tipo autólogo. En la evaluación por el servicio de contactología, 4 años después, se presentó agudeza visualisminuida, con astigmatismo irregular alto y aberraciones corneanas de alto orden elevadas que no podían ser corregidas con anteojos; así mismo, en la biomicroscopía se observó conjuntivilización entre las 3 y las 9 en la región superior, con opacidad difusa …

Variaciones En El Grado De Aberraciones Ópticas Corneales De Alto Orden En Pacientes Diagnosticados Con Ectasias Corneales Implantados Con Anillos Intraestromales, Rosario Vidal Olarte

Ciencia y Tecnología para la Salud Visual y Ocular

Objetivo: identificar si existen variaciones significativas en el grado de aberraciones corneales de alto orden después del implante de los anillos intraestromales, en pacientes diagnosticados con ectasias corneales. Materiales y métodos: se realizó un estudio analítico y longitudinal de intervención en pacientes mayores de 18 años. Se valoró el estado refractivo; la agudeza visual medida con log mar; la queratometría topográfica; las aberraciones ópticas corneales coma, trifoid, esférica y el Root Mean Square High Order (rms Ho), mediante el topógrafo Keratron Scout, y la calidad visual por medio de la prueba de letras de Mars para la sensibilidad al contraste. …

Efecto De La Neurotoxicidad En La Función Visual De Trabajadores De Lavado En Seco, Ingrid Astrid Jiménez Barbosa, Sieu Khuu, Mei Ying Boon

Ciencia y Tecnología para la Salud Visual y Ocular

Los trabajadores de limpieza en seco están expuestos a los disolventes orgánicos como el percloroetileno (perc). Este puede afectar el Sistema Nervioso Central (snc), provocar neurotoxicidad y asociarse con alteraciones visuales-neurológicas relacionadas con la función visual de sensibilidad al contraste (fsc) y la pérdida de la visión del color. Objetivo: determinar los déficits de sensibilidad al contraste (sc) por frecuencia espacial en un grupo de trabajadores de lavanderíaexpuestos a niveles ocupacionales de perc y su relación con síntomas neurotóxicos. Materiales y métodos: estudio de casos y controles en 40 trabajadores de lavandería y en 35 personas normales no expuestas a …

Tratamiento Con Clorhidrato De Epinastina Al 0,05 % En Pacientes Con Síndrome De Disfunción Lagrimal Moderado, Marcelo Carrizosa Murcia, Martha Fabiola Rodríguez Álvarez

Ciencia y Tecnología para la Salud Visual y Ocular

Antihistamínicos como el clorhidrato de epinastina tienen actividad antinflamatoria y podrían usarse como tratamiento del síndrome de ojo seco. Objetivo: evaluar los cambios en la sintomatología, película lagrimal y superficie ocular antes y después del tratamiento con clorhidrato de epinastina en pacientes con síndrome de ojo seco. Materiales y métodos: se realizó un estudio piloto doble ciego en 20 pacientes con diagnóstico clínico de ojo seco moderado. Un ojo de cada paciente recibió tratamiento con clorhidrato de epinastina al 0,05 % y el otro recibió hialuronato de sodio al 0,4 %. Los dos ojos recibieron suplemento lagrimal con hialuronato de …

Adaptación De Lentes Esclerales En Pacientes Con Queratocono, Comparación Entre El Método Tradicional Y Un Modelo Matemático, Myriam Teresa Mayorga Corredor, Sandra Milena Bravo Vanegas, Gerardo Avendaño Prieto

Ciencia y Tecnología para la Salud Visual y Ocular

La adaptación de lentes esclerales en el manejo del queratocono puede ser una buena alternativa. Objetivo: comparar la adaptación de lentes rígidos gas permeables esclerales en pacientes con queratocono, calculados matemáticamente con base en datos del visante oct (optical tomography coherence) y el método tradicional (ensayo y error). Materiales y métodos: se realizó investigación observacional descriptiva. A ocho pacientes (16 ojos) con diagnóstico de queratocono se les adaptaronlentes de contacto rígidos esclerales, usando dos métodos de cálculo: el tradicional, de ensayo y error, y calculando los parámetros de los lentes mediante un modelo matemático, a partir de los datos de …