Open Access. Powered by Scholars. Published by Universities.®
- Discipline
-
- Biology (117)
- Medicine and Health Sciences (116)
- Virology (76)
- Environmental Microbiology and Microbial Ecology (74)
- Genetics and Genomics (74)
-
- Biochemistry, Biophysics, and Structural Biology (70)
- Cell and Developmental Biology (67)
- Bacteriology (63)
- Pathogenic Microbiology (62)
- Physical Sciences and Mathematics (50)
- Medical Specialties (47)
- Medical Sciences (45)
- Ecology and Evolutionary Biology (42)
- Molecular Biology (38)
- Cell Biology (35)
- Immunology and Infectious Disease (33)
- Plant Sciences (32)
- Infectious Disease (30)
- Medical Immunology (29)
- Biological Phenomena, Cell Phenomena, and Immunity (28)
- Diseases (28)
- Medical Pathology (28)
- Biotechnology (26)
- Biochemistry (24)
- Animal Sciences (22)
- Molecular Genetics (21)
- Bioinformatics (20)
- Genetics (20)
- Institution
-
- University of Nebraska - Lincoln (45)
- South Dakota State University (28)
- University of Malaya (19)
- University of Nevada, Las Vegas (19)
- University of Arkansas, Fayetteville (18)
-
- Old Dominion University (15)
- University of South Florida (15)
- City University of New York (CUNY) (12)
- The University of Southern Mississippi (12)
- Aga Khan University (11)
- University of Dayton (10)
- University of Louisville (10)
- Wright State University (9)
- East Tennessee State University (8)
- Loyola University Chicago (8)
- University of Connecticut (8)
- University of Dar es Salaam (8)
- Louisiana State University (7)
- Tennessee State University (7)
- Virginia Commonwealth University (7)
- Eastern Washington University (6)
- The University of Akron (6)
- University of Kentucky (6)
- Boise State University (5)
- Chulalongkorn University (5)
- West Virginia University (5)
- Augustana College (4)
- Calvin University (4)
- Munster Technological University (4)
- Portland State University (4)
- Keyword
-
- Bacteria (25)
- Microbiology (25)
- Microbiome (20)
- Antibiotic resistance (13)
- Antibiotics (9)
-
- 16S rRNA (8)
- Biofilm (8)
- Gene expression (7)
- Gut microbiome (7)
- HIV (7)
- SARS-CoV-2 (7)
- Antibiotic Resistance (6)
- Bioinformatics (6)
- Biological Sciences (6)
- Fungi (6)
- Biofilms (5)
- COVID-19 (5)
- Immunology (5)
- Pakistan (5)
- Soil (5)
- Soil microbes (5)
- Virus (5)
- Bacillus subtilis (4)
- Corn (4)
- Coronavirus (4)
- Cyanobacteria (4)
- E. coli (4)
- ESKAPE (4)
- Ecology (4)
- Genetics (4)
- Publication
-
- Electronic Theses and Dissertations (27)
- Nebraska Center for Virology: Faculty Publications (25)
- Student Works (2020-2029) (19)
- Graduate Theses and Dissertations (14)
- Biology Faculty Publications (13)
-
- Biology and Microbiology Graduate Students Plan B Research Projects (11)
- Life Sciences Faculty Research (11)
- Master's Theses (10)
- Undergraduate Honors Theses (10)
- Department of Pathology and Laboratory Medicine (9)
- Tanzania Journal of Science (8)
- Agricultural and Environmental Sciences Faculty Research (7)
- Biology Faculty Publications and Presentations (7)
- Faculty Publications (7)
- Honors Scholar Theses (7)
- UCARE: Research Products (7)
- USF Tampa Graduate Theses and Dissertations (7)
- Dissertations (6)
- Honors Projects (6)
- Publications and Research (6)
- Williams Honors College, Honors Research Projects (6)
- Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD) (5)
- Theses and Dissertations (5)
- UNLV Theses, Dissertations, Professional Papers, and Capstones (5)
- Biological Sciences Faculty Publications (4)
- Biology Theses (4)
- Biomedical Sciences Theses & Dissertations (4)
- EWU Masters Thesis Collection (4)
- Graduate Theses, Dissertations, and Problem Reports (ETD) (4)
- Honors Theses (4)
- Publication Type
Articles 451 - 459 of 459
Full-Text Articles in Microbiology
Molecular And Functional Analyses Of Serine Protease Genes In Halophilic Cyanobacterium Halothece Sp. Pcc 7418, Tanutcha Patipong
Molecular And Functional Analyses Of Serine Protease Genes In Halophilic Cyanobacterium Halothece Sp. Pcc 7418, Tanutcha Patipong
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
Serine proteases are a class of important proteolytic enzymes that contain a common serine residue, which functions as a nucleophile in the catalytic triad at the active site. They are ubiquitous and abundant proteins found in all living organisms with a wide array of molecular, cellular and physiological functions. In cyanobacteria, the information on serine protease functions is very limited, especially in halotolerant species. This study focuses on comparative analyses of serine proteases in a halotolerant cyanobacterium Halothece sp. PCC 7418 (Halothece 7418) and the model freshwater cyanobacterium Synechococcus elongatus PCC 7942, regulation under salt-stress condition and functional characterization of …
การคัดกรองยีสต์โอลีจินัสและการผลิตน้ำมันจากทะลายปาล์มน้ำมันเปล่าเพื่อการผลิตไบโอดีเซล, ตฤณเศรษฐ์ วีระพันธุ์
การคัดกรองยีสต์โอลีจินัสและการผลิตน้ำมันจากทะลายปาล์มน้ำมันเปล่าเพื่อการผลิตไบโอดีเซล, ตฤณเศรษฐ์ วีระพันธุ์
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
คัดกรองยีสต์โอลีจินัส Naganishia cerealis สายพันธุ์ IN1S2.5 ซึ่งมีน้ำมันสะสมในเซลล์ 24.79% (กรัม/กรัมเซลล์แห้ง) เมื่อเพาะเลี้ยงในอาหารเลี้ยงเชื้อสังเคราะห์ที่มีอัตราส่วนคาร์บอนต่อไนโตรเจนสูง ได้จากยีสต์ 39 ไอโซเลตซึ่งคัดแยกจากตัวอย่างที่เก็บจากอุทยานแห่งชาติดอยอินทนนท์ จังหวัดเชียงใหม่ ผลการประเมินศักยภาพของทะลายปาล์มน้ำมันเปล่าในการเป็นวัตถุดิบสำหรับผลิตน้ำมันยีสต์ N. cerealis IN1S2.5 และการนำน้ำมันยีสต์ที่ผลิตได้ไปใช้ประโยชน์ พบว่าทะลายปาล์มน้ำมันเปล่าให้น้ำตาลกลูโคสสูงสุด 16.67 กรัม/ลิตร เมื่อถูกปรับสภาพโดยการแช่ในโซเดียมไฮดรอกไซด์เข้มข้น 2 โมลาร์ (16 ชั่วโมง) จากนั้นระเบิดด้วยไอน้ำขณะแขวนลอยในโซเดียมไฮดรอกไซด์เข้มข้น 2.4% (น้ำหนัก/ปริมาตร) ที่ 200°ซ ความดัน 200 psi เป็นเวลา 5 นาที แล้วย่อยด้วยเซลลูเลส (6 ชั่วโมง) N. cerealis IN1S2.5 ที่เพาะเลี้ยงในไฮโดรไลเสตทะลายปาล์มน้ำมันเปล่า ซึ่งเติมกลูโคส 75 กรัม/ลิตร โพแทสเซียมไดไฮโดรเจนฟอสเฟต 4 กรัม/ลิตร แคลเซียมคลอไรด์ไดไฮเดรต 0.05 กรัม/ลิตร และซิงค์ซัลเฟตเฮพตะไฮเดรต 0.02 กรัม/ลิตร พีเอช 4.0 ให้ผลผลิตน้ำมันสูงสุด 2.46 กรัม/ลิตร จากการทำนายคุณสมบัติของไบโอดีเซลที่ผลิตได้ แสดงให้เห็นว่าน้ำมันยีสต์ N. cerealis IN1S2.5 มีศักยภาพที่จะเป็นวัตถุดิบสำหรับผลิตไบโอดีเซล นอกจากนี้ได้ประเมินศักยภาพของไฮโดรไลเสตทะลายปาล์มน้ำมันเปล่าในการเป็นวัตถุดิบสำหรับผลิตกรดปาล์มิโตเลอิกโดยใช้ยีสต์โอลีจินัส Cyberlindnera subsufficiens สายพันธุ์ NG8.2 การเพาะเลี้ยง Cy. subsufficiens NG8.2 ในไฮโดรไลเสตทะลายปาล์มน้ำมันเปล่าที่ผสมกับไฮโดรไลเสตแป้งมันสำปะหลัง เพื่อทำให้ความเข้มข้นของน้ำตาลในไฮโดรไลเสตทะลายปาล์มน้ำมันเปล่าสูงขึ้น ทำให้ได้น้ำมันที่มีกรดปาล์มิโตเลอิกสูงกว่า การเพาะเลี้ยงในไฮโดรไลเสตทะลายปาล์มน้ำมันเปล่าซึ่งทำให้ความเข้มข้นของน้ำตาลสูงขึ้นโดยการนำเอาสารละลายกลูโคสมาผสม การเติมโพแทสเซียมไดไฮโดรเจนฟอสเฟต 1 กรัม/ลิตร แมกนีเซียมซัลเฟตเฮพตะไฮเดรต 0.5 กรัม/ลิตร และแคลเซียมคลอไรด์ไดไฮเดรต 0.1 กรัม/ลิตร ลงในสารละลายผสมระหว่างไฮโดรไลเสตทะลายปาล์มน้ำมันเปล่ากับไฮโดรไลเสตแป้งมันสำปะหลัง ที่พีเอช 5.0 ทำให้ผลผลิตน้ำมันเพิ่มขึ้นเป็น 1.96 กรัม/ลิตร การลดอุณหภูมิการบ่มจาก 30°ซ เป็น 25°ซ ทำให้กรดปาล์มิโตเลอิกในน้ำมันเพิ่มขึ้นจาก …
การคัดกรองยีสต์ผลิตน้ำมันและการหาภาวะเหมาะที่สุดของการผลิตน้ำมันจากไฮโดรไลเสตของใบอ้อย, พัชราภรณ์ หุ่นดี
การคัดกรองยีสต์ผลิตน้ำมันและการหาภาวะเหมาะที่สุดของการผลิตน้ำมันจากไฮโดรไลเสตของใบอ้อย, พัชราภรณ์ หุ่นดี
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
ยีสต์ 223 ไอโซเลต ที่คัดแยกได้จาก 223 ตัวอย่าง ที่เก็บจากแหล่งธรรมชาติ 9 แห่งในประเทศไทย ถูกนำมาคัดกรองยีสต์ที่สะสมน้ำมันในเซลล์สูง การคัดกรองเบื้องต้นโดยการย้อมเซลล์ด้วยสีไนล์เรด พบว่ามียีสต์ 16 สายพันธุ์ที่มีขนาดหยดน้ำมันภายในเซลล์ใหญ่กว่าครึ่งหนึ่งของขนาดเซลล์ ผลการวิเคราะห์ปริมาณน้ำมันสะสมภายในเซลล์ยีสต์เหล่านี้โดยเลี้ยงในอาหารผลิตน้ำมันที่ทราบองค์ประกอบทางเคมี ซึ่งมีกลูโคส 50 กรัม/ลิตร เป็นแหล่งคาร์บอน และบ่มที่อุณหภูมิ 30 องศาเซลเซียส เขย่า 200 รอบต่อนาที เป็นเวลา 6 วัน พบว่า Papiliotrema laurentii N-16.2, Rhodotorula (Rh.) sphaerocarpa 11-14.4, Saitozyma (Sait.) podzolica 11-11.3.1 และ Sait. podzolica N-8.4 เป็นยีสต์อุดมน้ำมัน การศึกษาการผลิตน้ำมันจากไฮโดรไลเสตใบอ้อย (sugarcane leaves hydrolysate, SLH) ของยีสต์อุดมน้ำมันที่คัดกรองได้ พบว่าทุกสายพันธุ์สามารถผลิตน้ำมันในไฮโดรไลเสตใบอ้อย โดย Rh. sphaerocarpa 11-14.4 ให้ผลผลิตน้ำมันสูงที่สุด (0.98 กรัม/ลิตร) การหาภาวะเหมาะที่สุดต่อการผลิตน้ำมันของ Rh. sphaerocarpa 11-14.4 ในไฮโดรไลเสตใบอ้อย พบว่าเมื่อใช้กล้าเชื้อที่เลี้ยงใน SLH ที่ผ่านการปรับด่างเกิน (overliming) (6% -DSLH) ที่เติมสารสกัดจากเซลล์ยีสต์ 3 กรัม/ลิตร และเพปโทน 3 กรัม/ลิตร และผลิตน้ำมันใน 12%-SLH (อัตราส่วนคาร์บอน/ไนโตรเจน เท่ากับ 24) ที่เติมโพแทสเซียมไดไฮโดรเจนฟอสเฟต (KH2PO4) 5 กรัม/ลิตร พีเอช 4.5 บ่มที่อุณหภูมิ 30 องศาเซลเซียส เขย่า 200 รอบต่อนาที เป็นเวลา 4 วัน ที่ภาวะดังกล่าวนี้ Rh. sphaerocarpa 11-14.4 …
Dna Analysis And The Postmortem Submersion Interval From The Microbiome Of Waterlogged Sus Scrofa Skeletal Remains, Claire Cartozzo
Dna Analysis And The Postmortem Submersion Interval From The Microbiome Of Waterlogged Sus Scrofa Skeletal Remains, Claire Cartozzo
Theses and Dissertations
Following water-related deaths, soft tissue on victims’ remains may be entirely absent after a temperature dependent period of time. Due to their physical and chemical components, which protect them from environmental deterioration and biological attack, bones preserve DNA for longer periods of time. Therefore, the ability to both identify an individual and estimate the postmortem submersion interval (PMSI) may depend on DNA obtained from skeletal remains. The goals of the dissertation were to examine differences in both the degradation of skeletal DNA and the microbiome inhabiting bone in freshwater aquatic environments (e.g., Henley Lake and the James River). At each …
The Pseudomonas Aeruginosa Interactome: Insights Into Srna-Mediated Regulatory Networks, Christine M. Van Duyn
The Pseudomonas Aeruginosa Interactome: Insights Into Srna-Mediated Regulatory Networks, Christine M. Van Duyn
Theses and Dissertations
Pseudomonas aeruginosa is a Gram-negative bacterium found in various environmental niches including soil, water, hospital environments, and within a broad range of hosts. It is well known for its metabolic versatility and intrinsic and acquired resistance to a variety of antimicrobial agents. Moreover, this bacterium has a remarkable ability to adapt and survive in suboptimal environments by altering its transcriptional profile in response to nutrient deprivation, changes in temperature and pH, osmotic stress, the presence of reactive oxygen species (ROS), and exposure to antibiotics and host defenses. P. aeruginosa colonizes individuals with compromised immune systems and severe burn injuries and …
Development Of A Screening Assay For Type Iii Secretion System Inhibitors And High Throughput Screening Campaign Of Inhibitors Of Prp Of Staphylococcus Aureus, Heather A. Pendergrass
Development Of A Screening Assay For Type Iii Secretion System Inhibitors And High Throughput Screening Campaign Of Inhibitors Of Prp Of Staphylococcus Aureus, Heather A. Pendergrass
Theses and Dissertations
Antibiotics inhibit the growth or survival of bacteria by targeting their essential functions.1 Due to weaknesses in traditional antibiotics and the increasing prevalence of antibiotic resistance genes, virulence factors are being targeted for therapeutic treatment of bacterial infection.2 We have developed an assay to quantify and observe type III secretion system (T3SS) activity. The type III secretion system (T3SS) is a virulence factor present in some Gram-negative pathogens including enteropathogenic and enterohemorrhagic E. coli (EPEC and EHEC, respectively),3 and others.4–9 The T3SS between EPEC and EHEC are highly conserved and share over 90% sequence identity with …
Genomic And Taxonomic Studies Of An Antarctic Psychrotolerant Quorum Quenching Bacterium, Planococcus Versutus L10.15t, See-Too Wah Seng
Genomic And Taxonomic Studies Of An Antarctic Psychrotolerant Quorum Quenching Bacterium, Planococcus Versutus L10.15t, See-Too Wah Seng
Student Works (2020-2029)
Quorum quenching (QQ) has been suggested as an alternative to antibiotic treatments for pathogenic infections as it does not affect the viability of the pathogen and imposes minimum selection pressure promoting drug resistance. During an ecological survey for quorum quenching (QQ) bacteria from soil collected in Lagoon Island (Ryder Bay, Adelaide Island, Antarctica), a bacterial strain was isolated and identified as Planococcus species, L10.15T, based on 16S rRNA gene analysis. The genomic, phylogenetic, chemotaxonomic and phenotypic data obtained showed that L10.15T represents a novel species for which the name Planococcus versutus sp. nov. is proposed. Previously, QQ activity of L10.15T …
In Vivo Activity Of Copper(Ii), Manganese(Ii), And Silver(I) 1,10-Phenanthroline Chelates, Rafael M. Ghandra, Pauraic Mccarron, Livia Viganor, Mariana Farias Fernandes, Kevin Kavanagh, Malachy Mccann, Marta H. Branquinha, André L.S. Santos, Orla L. Howe, Michael Devereux
In Vivo Activity Of Copper(Ii), Manganese(Ii), And Silver(I) 1,10-Phenanthroline Chelates, Rafael M. Ghandra, Pauraic Mccarron, Livia Viganor, Mariana Farias Fernandes, Kevin Kavanagh, Malachy Mccann, Marta H. Branquinha, André L.S. Santos, Orla L. Howe, Michael Devereux
Articles
Candida haemulonii is an emerging opportunistic pathogen resistant to most antifungal drugs currently used in clinical arena. Metal complexes containing 1,10-phenanthroline (phen) chelating ligands have well-established anti-Candida activity against different medically relevant species. This study utilized larvae of Galleria mellonella, a widely used model of in vivo infection, to examine C. haemulonii infection characteristics in response to different copper(II), manganese(II), and silver(I) chelates containing phen, which had demonstrated potent anti-C. haemulonii activity in a previous study. The results showed that C. haemulonii virulence was influenced by inoculum size and incubation temperature, and the host G. mellonella immune …
Use Of Pefloxacin As A Surrogate Marker To Detect Ciprofloxacin Susceptibility In Salmonella Enterica Serotypes Typhi And Paratyphi A, Safia Moin, Mohammad Zeeshan, Sidra Laiq, Ahmed Raheem, Afia Zafar
Use Of Pefloxacin As A Surrogate Marker To Detect Ciprofloxacin Susceptibility In Salmonella Enterica Serotypes Typhi And Paratyphi A, Safia Moin, Mohammad Zeeshan, Sidra Laiq, Ahmed Raheem, Afia Zafar
Department of Pathology and Laboratory Medicine
Objective: To determine the use of pefloxacin as a surrogate marker to detect fluoroquinolone (ciprofloxacin) susceptibility against Salmonella enterica serotypes Typhi and Paratyphi A.
Methods: The prospective, descriptive cross-sectional study was conducted at the Aga Khan University Hospital, Karachi, from September 2016 to March 2018, and comprised Salmonella Typhi and Paratyphi A isolates of blood cultures. Disk susceptibility tests and broth microdilution to test minimum inhibitory concentration were performed as per standard guidelines. Data was analysed using SPSS 21.
Results: Of the 138 isolates, 91(66%) were intermediate resistant to ciprofloxacin but were resistant to pefloxacin, 42(30%) were resistant to both …