Immunology and Infectious Disease Commons^™

Interactions Between Hiv And Opioids On Antiretroviral Accumulation, The Blood Brain Barrier, And The Inflammatory Response In The Brain., Kara Rademeyer

Theses and Dissertations

The complex mechanisms related to HIV infection, neurodegeneration, and chronic neuroinflammation collectively describe neuroHIV (Hauser et al. 2007; Chang et al. 2014; Smith et al. 2014). Specifically, opioid abuse, poor penetration of antiretroviral (ARV) drugs, chronic inflammation and neuronal injury/degeneration are all implicated in neuroHIV (Fantuzzi et al. 2003; Letendre et al. 2004; Verani et al. 2005; Duncan and Sattentau 2011; Hong and Banks 2015; Simoes and Justino 2015; Olivier et al. 2018; Murphy et al. 2019; Osborne et al. 2020). For the first time, we demonstrate that morphine, fentanyl, and methadone in vivo alter the brain accumulation of ARVs, …

The Hepatic Immunological Pattern Shaped By Dominant-Subdominant Cellular Interactions Creates A Collective Function Beyond The Function Of Each Cellular Constituent To Orchestrate Progression Of Hepatocellular Carcinoma, Nicholas J. Koelsch

Theses and Dissertations

Abundance of data on the role of inflammatory immune responses in the progression or inhibition of hepatocellular carcinoma (HCC) has failed to offer a curative immunotherapy for HCC. This is largely because of taking reductionist approaches and missing the collective function of the hepatic immune system by focusing on specific immune cell types. To this end, we propose that focusing on the dominant-subdominant patterns of the immune cells would allow understanding of the mechanism by which a collective immune function emerges. To identify the collective immune function through a systems immunology perspective, we performed high-throughput analysis of snRNAseq data collected …

The Impact Of Hiv-1 Tat And Morphine On Spatial Distribution Of Drugs In The Brain., Austin M. Jones

Theses and Dissertations

Despite combination antiretroviral therapy effectively suppressing HIV within the periphery, the central nervous system (CNS) remains affected by the virus. Approximately half of people living with HIV will experience HIV-associated neurocognitive disorders (HAND) or neuroHIV. Concurrent opioid use exacerbates neuroHIV by promoting neuroinflammation, viral replication, and potentially altering the antiretroviral concentrations within the brain.

Using a transgenic mouse that expresses the HIV-1 Tat protein, we examined the effects of Tat and morphine on antiretroviral accumulation and distribution and the effects of Tat on morphine accumulation within the brain using infrared matrix-assisted laser desorption electrospray ionization with mass spectrometry imaging (IR-MALDESI-MSI). …

Age-Induced Changes In Anti-Tumor Immunity Alter The Tumor Immune Infiltrate And Impact Response To Immuno-Oncology Treatments, Suzanne I Sitnikova, Jennifer A Walker, Laura B Prickett, Michelle Morrow, Viia E Valge-Archer, Matthew J Robinson, Robert W Wilkinson, Simon J Dovedi

Faculty, Staff and Student Publications

INTRODUCTION: Immuno-oncology (IO) research relies heavily on murine syngeneic tumor models. However, whilst the average age for a cancer diagnosis is 60 years or older, for practical purposes the majority of preclinical studies are conducted in young mice, despite the fact that ageing has been shown to have a significant impact on the immune response.

METHODS: Using aged (60-72 weeks old) mice bearing CT26 tumors, we investigated the impact of ageing on tumor growth as well as the immune composition of the tumor and peripheral lymphoid organs.

RESULTS: We found many differences in the immune cell composition of both the …

Lactobacillus Metabolite Nc As An Inflammation Inhibitor, Drew Hahnnah Landrowski

Master's Theses

The human body contains a diverse ecosystem of microbes. Commensal bacteria have numerous mutually-beneficial relationships with their host. Not only do they assist in digestion and gut homeostasis, they are critical for development and function of the immune system. As such, hosts and microbes alike have evolved mechanisms to foster symbiosis. Gut barrier function, toll-like receptor signaling, and metabolites are all examples of how hosts interact with microbes to promote this mutually-beneficial relationship. Metabolites from commensal bacteria promote the generation of regulatory T-cells, capable of ameliorating inflammation. A number of inflammatory, allergic, and autoimmune conditions are associated with dysbiosis. Therefore, …

การศึกษารูปแบบของยีน Mgrb และความชุกของยีน Mcr-1 ถึง Mcr-10 ใน Escherichia Coli และ Klebsiella Pneumoniae ที่ดื้อยา Colistin จากสิ่งส่งตรวจของผู้ป่วยในโรงพยาบาลเลิดสิน, ขวัญชนม์ เจียรกิติวณิช

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

การดื้อยา colistin มีแนวโน้มเพิ่มสูงขึ้นในเชื้อแบคทีเรียกลุ่ม Enterobacterales เนื่องมาจากการนำยา colistin กลับมาใช้ในการรักษาเชื้อดื้อยาหลายขนาน โดยเฉพาะอย่างยิ่งเชื้อแบคทีเรียแกรมลบที่ดื้อยา carbapenem ประกอบกับการถ่ายทอดยีน mobile colistin-resistant (mcr) ผ่านทาง plasmid ซึ่งส่งผลให้การแพร่ระบาดของเชื้อดื้อยา colistin เกิดขึ้นในวงกว้างอย่างรวดเร็ว สถานการณ์เชื้อกลุ่ม Enterobacterales ที่ดื้อยา colistin ในประเทศไทยกำลังเป็นที่สนใจ เนื่องมาจากเริ่มพบอัตราเชื้อดื้อยาที่สูงขึ้นอย่างต่อเนื่องทั้งในภาคการปศุสัตว์และในโรงพยาบาล การศึกษาครั้งนี้ได้ศึกษาลักษณะจีโนมของเชื้อ E. coli และ K. pneumoniae ที่ดื้อยา colistin ที่เพาะแยกได้จากผู้ป่วยของโรงพยาบาลเลิดสิน กรุงเทพมหานคร ในช่วงระหว่างเดือนตุลาคม พ.ศ. 2564 ถึงเดือนกันยายน พ.ศ. 2565 และศึกษาความสัมพันธ์และการกระจายตัวของเชื้อในแผนกต่างๆ ของโรงพยาบาล เชื้อที่เก็บได้ทั้งหมดจำนวน 54 ตัวอย่าง ประกอบด้วยเชื้อ E. coli และ K. pneumoniae จำนวน 14 และ 40 ตัวอย่าง ตามลำดับ ซึ่งให้ผลดื้อยา colistin เมื่อทดสอบด้วยเครื่องอัตโนมัติ Sensititre™ Gram Negative MIC Plate เชื้อส่วนใหญ่เพาะแยกจากปัสสาวะ (46.30%, p-value=0.38) และเสมหะ (29.63%, p-value=0.63) โดยเพาะแยกเชื้อได้จากผู้ป่วยใน (81.48%) มากกว่าผู้ป่วยนอก (18.52%) อย่างมีนัยสำคัญ (p-value=0.000) ภายหลังนำเชื้อทั้งหมดไปวิเคราะห์ลำดับเบสด้วยเทคนิค Illumina whole genome sequencing (WGS) สามารถจำแนกสายพันธุ์ของเชื้อได้อย่างมีประสิทธิภาพ โดยเชื้อ E. coli และ K. pneumoniae มีรูปแบบยีนก่อโรคที่แตกต่างกันอย่างเห็นได้ชัด และพบยีน blaCTX-M, blaTEM, blaOXA ,blaSHV ,ยีน aac, ยีน qnr …

การพัฒนาวิธีการตรวจออกซิไดซ์ไลโพโปรตีนชนิดความหนาแน่นต่ำ โดยใช้เทคนิคการตรวจวัดบนกระดาษร่วมกับ Immunogold Silver Enhancement, สุจิตรา ต๊ะยามัน

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

โรคหลอดเลือดแดงโคโรนารี (Coronary Artery Disease, CAD) เป็นโรคไม่ติดต่อชนิดเรื้อรังที่เกิดจากหลอดเลือดแดงที่กล้ามเนื้อหัวใจตีบหรือตัน สาเหตุหลักเกิดจากไขมันและเนื้อเยื่อสะสม มีผลทำให้เยื่อบุผนังหลอดเลือดชั้นในหนาตัวขึ้นและเกิดการอุดตัน จากการศึกษาที่ผ่านมาพบว่า ox-LDL เป็นจุดเริ่มต้นของโรคดังกล่าว เนื่องจากมีคุณสมบัติต่างจาก normal LDL โดยไม่สามารถจับได้กับ LDL receptor ได้ แต่สามารถจับได้กับ scavenger receptor ที่ผิวเซลล์แมคโคฟาจจึงทำให้ ox-LDL สามารถเข้าเซลล์ได้อย่างไม่มีสิ้นสุด เกิดเป็นโฟมเซลล์ (foam cells) สะสมอยู่ในผนังหลอดเลือดเกิดเป็นรอยขีดไขมัน (fatty streak) ประกอบกับการกระตุ้นเกล็ดเลือดและเซลล์อิมมูน ทำให้เกิดเป็นลิ่มเลือดอุดตันทางเดินของเส้นเลือด แม้ว่า ox-LDL จะเป็นสาเหตุสำคัญของการเกิดโรคแต่การตรวจวัดระดับไขมัน ox-LDL ยังไม่แพร่หลายในห้องปฏิบัติการเทคนิคการแพทย์ เนื่องจากชุดตรวจมีราคาแพง ใช้เวลาในการวิเคราะห์นาน และยังต้องใช้เครื่องมือที่มีความจำเพาะ ดังนั้นการศึกษาในครั้งนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อพัฒนาเทคนิคการตรวจวัดระดับ ox-LDL ด้วยเทคนิคการตรวจวัดบนฐานกระดาษร่วมกับ immunogold silver enhancement โดยออกแบบกระดาษกรองให้มีรูปแบบเป็น microtiter plate อาศัยเทคนิค wax printing ในการสร้างขอบเขต หาสภาวะที่เหมาะสมสำหรับออกซิไดซ์กระดาษ เพื่อให้มีคุณสมบัติเหมาะสมกับการตรึงแอนติบอดี โดยเปลี่ยนเซลลูโลสเป็นหมู่แอลดีไฮด์ งานวิจัยนี้ได้นำสารละลายลิเธียมคลอไรด์มาช่วยเพิ่มประสิทธิภาพการออกซิไดซ์ร่วมกับสารละลายโซเดียมเพอร์ริออเดท พบว่ากระดาษที่ออกซิไดซ์แล้วสามารถคงสภาพนาน 72 ชั่วโมง และแอนติบอดีที่ตรึงไว้คงสภาพนานที่สุด 4 ชั่วโมง ทดลองวิเคราะห์วัดปริมาณ std. ox-LDL และ ox-LDL ที่เตรียมเองในห้องปฏิบัติการด้วยสภาวะเทคนิคดังกล่าว พบว่าสีปฏิกิริยาที่เกิดขึ้นยังไม่ชัดเจน อันเนื่องมากจากข้อจำกัดของความจำเพาะของแอนติบอดี การทำให้เกิดสีด้วย silver enhancement ซึ่งยังคงต้องมีการพัฒนาต่อไปเพื่อให้ผลการวิเคราะห์มีความชัดเจน นอกจากนี้ได้พัฒนากล่องถ่ายภาพเพื่อใช้เก็บผลการวิเคราะห์บนฐานกระดาษ ที่สามารถถ่ายภาพด้วยแสงและระยะที่คงที่ สามารถเคลื่อนย้ายได้ง่ายในภาคสนาม อย่างไรก็ตามแม้การพัฒนาวิธีการวิเคราะห์ ox-LDL ยังไม่ประสบผลสำเร็จ แต่ยังพอได้แนวทางและต้นแบบในการศึกษาต่อไปในอนาคต

ประสิทธิภาพของยีน Tef ในการจัดจำแนกเชื้อ Aspergillus ที่เพาะได้จากผู้ป่วยไทย, ประภาพร คชพงษ์

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

Aspergillosis เป็นโรคติดเชื้ออันตรายถึงแก่ชีวิต มีสาเหตุมาจากเชื้อราในจีนัส Aspergillus การวินิจฉัยโรคในปัจจุบัน การเพาะแยกเชื้อและจัดกลุ่มตามลักษณะทางสัณฐานวิทยายังคงเป็นวิธีมาตรฐาน การตรวจหา galactomannan มักใช้ตรวจวินิจฉัยโรคในผู้ป่วยกลุ่มเสี่ยงเท่านั้น ในขณะที่เทคนิคทางอณูชีววิทยาอาศัยข้อมูลสารพันธุกรรมของ “its region” ในการจำแนกกลุ่มเชื้อระดับสปีชีส์ แต่อย่างไรก็ตามข้อมูลดังกล่าวถูกพิสูจน์ว่าสามารถจำแนกกลุ่มเชื้อราก่อโรคในคนในระดับสปีชีส์ได้ต่ำ ในด้านการรักษาสปีชีส์ของเชื้อ Aspergillus มักไม่ถูกนำมาพิจารณาร่วมเพื่อการเลือกกลุ่มยาแม้ว่ายังคงมีผู้ป่วยบางรายที่ตอบสนองต่อการรักษาไม่ดีเนื่องจากเชื้อสาเหตุดื้อต่อยาต้านเชื้อรา ด้วยเหตุดังกล่าวเพื่อศึกษาความสัมพันธ์ระหว่างสปีชีส์และรูปแบบความไวรับต่อยา การค้นหายีนที่สามารถจำแนกเชื้อ Aspergillus ในระดับสปีชีส์ได้อย่างแม่นยำจึงเป็นสิ่งจำเป็นยีน “tef-1α” เป็นสารพันธุกรรมที่ได้รับการพิสูจน์แล้วว่ามีคุณสมบัติสามารถจำแนกเชื้อราเส้นสายในระดับสปีชีส์ได้สูง ในงานวิจัยนี้ ผู้วิจัยได้เปรียบเทียบผลการจำแนกกลุ่มเชื้อ Aspergillus ที่แยกได้จากผู้ป่วยจำนวน 227 ตัวอย่าง โดยใช้ข้อมูลสารพันธุกรรม “its region” และ“tef-1α” จากผลการศึกษาพบว่าสารพันธุกรรมจากยีน“tef-1α” (D=0.8461) มีความสามารถในการจำแนกเชื้อในระดับสปีส์สูงกว่าบริเวณ “its” (D=0.796) โดยเฉพาะอย่างยิ่งใน section Fumigati ข้อมูลสารพันธุกรรมจาก “its region” สามารถแบ่งเชื้อกลุ่มดังกล่าวออกได้เพียง 1 สปีชีส์ คือ A. fumigatus ในขณะที่ยีน“tef-1α” สามารถแบ่งออกเป็น A. fumigatus และอีก 2 สปีชีส์ คือ A. lentulus และ A. udagawa ซึ่งเป็นเชื้อที่ดื้อต่อยา amphotericin B โดยกำเนิด โดยสรุป ผลจากงานวิจัยนี้ชี้ให้เห็นว่าการจำแนกสปีชีส์ของเชื้อ Aspergillus โดยใช้ยีนทุติยภูมิ “tef-1α” สามารถบ่งชี้กลุ่มยาที่เหมาะสมต่อการรักษาได้

Masks, Misinformation, And Making Do: Appalachian Health-Care Workers And The Covid-19 Pandemic, Wendy Welch

Ohio University Press Open Access Books

The firsthand pandemic experiences of rural health-care providers—who were already burdened when COVID-19 hit—raise questions about the future of public health and health-care delivery.

This volume comprises the COVID-19 pandemic experiences of Appalachian health-care workers, including frontline providers, administrators, and educators. The combined narrative reveals how governmental and corporate policies exacerbated the region’s injustices, stymied response efforts, and increased the death toll.

Beginning with an overview of the SARS-CoV-2 virus and its impact on the body, the essays in the book’s first section provide background material and contextualize the subsequent explosion of telemedicine, the pandemic’s impact on medical education, and …

The Use Of A Habitat Quality Stress Index To Evaluate Stress As An Analog For Proximate Fitness In The American Crow Within A Matrix Of Landcover Characteristics To Assess Its Potential Contribution To Disease Etiologies, Theodore Lee Grabarz

Antioch University Dissertations & Theses

All organisms occur within spatial and temporal environments to maximize proximate fitness (health) and thus life history outcomes. Previous work has examined the temporal and behavioral aspects of proximate fitness on life history outcomes particularly regarding highly perturbed environments (i.e., climate and land use change, resource extraction, agricultural erosion, etc.). My work focuses on the less examined spatial aspect of these perturbed environments. More specifically, this dissertation examines habitat selection and quality as the basis for understanding stress response (negative and positive feedback mechanisms) to environmental stressors within the larger context of regional or gamma (ɣ) biodiversity. Through the lens …

Dna Methylation And The Response To Infection In Introduced House Sparrows, Melanie Gibson

College of Graduate Studies: Theses & Dissertations

Epigenetics is the study of molecular modification of a genome without changing its base pairs. The most studied type of epigenetic mechanism is DNA methylation, which is capable of turning a gene “on” or “off.” Epigenetic potential is the capacity to which an individual can have methylation on its genome. The more CpGs available, the greater the epigenetic potential. In invasive species, genetic variation has been observed to be paradoxical: not much of it exists on a genomic level, but epigenetically, phenotypic variation can occur. The focus on shift in gene expression in this study is on Toll-Like Receptor 4 …

Identifying Host-Intrinsic Resistance Mechanisms To Therapeutic Anti-Tumor Antibody, James Edward Glassbrook

Wayne State University Dissertations

The use of monocloncal antibodies (mAbs) directed at tumor-associated antigens (TAA), often termed “targeted immunotherapy” has revolutionized cancer treatment, markedly improving patient outcomes. As a prime example, the mAb trastuzumab targets human epidermal growth factor 2 (HER2). Like many targeted immunotherapies, only a subset of patients with HER2+ cancer exhibit long-term benefit from trastuzumab. In addition to tumor-intrinsic factors, such as HER2 heterogeneity, we hypothesize that host genetics may influence subsequent immune activation after treatment. To model this interaction, we utilized the genetically heterogeneous Diversity Outbred (DO) mouse model in an F1 cross with BALB/c (producing DOCF1 mice). This cohort …

A Picture Worth A Thousand Words: Factors Influencing Disability Accommodations, Alicia E. Martin

Cal Poly Humboldt theses and projects

Because not all disabilities look the same it is difficult to label a person with disabilities just by looking at them. Given that our knowledge, attitudes, and perceptions impact how we interpret our world and our willingness to act, people, including professors, may be biased toward providing accommodations for those with easily recognizable disabilities and biased against those with non-recognizable disabilities, and this may impact the disabled person’s ability to learn. This thesis aims to address whether professors’ disability-related attitudes, perceptions of accommodation reasonableness, and willingness to provide accommodations differ when the disability is recognizable (student is pictured in a …

Small Molecule Inhibitor Of Tau Self-Association In A Mouse Model Of Tauopathy: A Preventive Study In P301l Tau Jnpl3 Mice, Eliot J Davidowitz, Patricia Lopez, Heidy Jimenez, Leslie Adrien, Peter Davies, James G Moe

Faculty, Staff and Student Publications

Advances in tau biology and the difficulties of amyloid-directed immunotherapeutics have heightened interest in tau as a target for small molecule drug discovery for neurodegenerative diseases. Here, we evaluated OLX-07010, a small molecule inhibitor of tau self-association, for the prevention of tau aggregation. The primary endpoint of the study was statistically significant reduction of insoluble tau aggregates in treated JNPL3 mice compared with Vehicle-control mice. Secondary endpoints were dose-dependent reduction of insoluble tau aggregates, reduction of phosphorylated tau, and reduction of soluble tau. This study was performed in JNPL3 mice, which are representative of inherited forms of 4-repeat tauopathies with …

Autologous T Cell Therapy For Mage-A4+ Solid Cancers In Hla-A*02+ Patients: A Phase 1 Trial, David S Hong, Brian A Van Tine, Swethajit Biswas, Cheryl Mcalpine, Melissa L Johnson, Anthony J Olszanski, Jeffrey M Clarke, Dejka Araujo, George R Blumenschein, Partow Kebriaei, Quan Lin, Alex J Tipping, Joseph P Sanderson, Ruoxi Wang, Trupti Trivedi, Thejo Annareddy, Jane Bai, Stavros Rafail, Amy Sun, Lilliam Fernandes, Jean-Marc Navenot, Frederic D Bushman, John K Everett, Derin Karadeniz, Robyn Broad, Martin Isabelle, Revashnee Naidoo, Natalie Bath, Gareth Betts, Zohar Wolchinsky, Dzmitry G Batrakou, Erin Van Winkle, Erica Elefant, Armin Ghobadi, Amanda Cashen, Anne Grand'maison, Philip Mccarthy, Paula M Fracasso, Elliot Norry, Dennis Williams, Mihaela Druta, David A Liebner, Kunle Odunsi, Marcus O Butler

Faculty, Staff and Student Publications

Affinity-optimized T cell receptors can enhance the potency of adoptive T cell therapy. Afamitresgene autoleucel (afami-cel) is a human leukocyte antigen-restricted autologous T cell therapy targeting melanoma-associated antigen A4 (MAGE-A4), a cancer/testis antigen expressed at varying levels in multiple solid tumors. We conducted a multicenter, dose-escalation, phase 1 trial in patients with relapsed/refractory metastatic solid tumors expressing MAGE-A4, including synovial sarcoma (SS), ovarian cancer and head and neck cancer ( NCT03132922 ). The primary endpoint was safety, and the secondary efficacy endpoints included overall response rate (ORR) and duration of response. All patients (N = 38, nine tumor types) experienced …

The Interplay Between Neoantigens And Immune Cells In Sarcomas Treated With Checkpoint Inhibition, Irantzu Anzar, Brandon Malone, Pubudu Samarakoon, Ioannis Vardaxis, Boris Simovski, Hugues Fontenelle, Leonardo A Meza-Zepeda, Richard Stratford, Emily Z Keung, Melissa Burgess, Hussein A Tawbi, Ola Myklebost, Trevor Clancy

Faculty, Staff and Student Publications

INTRODUCTION: Sarcomas are comprised of diverse bone and connective tissue tumors with few effective therapeutic options for locally advanced unresectable and/or metastatic disease. Recent advances in immunotherapy, in particular immune checkpoint inhibition (ICI), have shown promising outcomes in several cancer indications. Unfortunately, ICI therapy has provided only modest clinical responses and seems moderately effective in a subset of the diverse subtypes.

METHODS: To explore the immune parameters governing ICI therapy resistance or immune escape, we performed whole exome sequencing (WES) on tumors and their matched normal blood, in addition to RNA-seq from tumors of 31 sarcoma patients treated with pembrolizumab. …

Association Of Immune-Related Adverse Events With The Outcomes Of Immune Checkpoint Inhibitors In Patients With Dmmr/Msi-H Metastatic Colorectal Cancer, Vincenzo Nasca, Francesco Barretta, Francesca Corti, Sara Lonardi, Monica Niger, Maria Elena Elez, Marwan Fakih, Priya Jayachandran, Aakash Tushar Shah, Massimiliano Salati, Elisabetta Fenocchio, Lisa Salvatore, Chiara Cremolini, Javier Ros, Margherita Ambrosini, Giacomo Mazzoli, Rossana Intini, Michael J Overman, Rosalba Miceli, Filippo Pietrantonio

Faculty, Staff and Student Publications

BACKGROUND: Immune checkpoint inhibitors (ICIs) show a tremendous activity in microsatellite instability-high (MSI-H) metastatic colorectal cancer (mCRC), but a consistent fraction of patients does not respond. Prognostic/predictive markers are needed. Despite previous investigations in other tumor types, immune-related adverse events (irAEs) have not been well evaluated in patients with MSI-H cancers treated with ICIs.

METHODS: We conducted an international cohort study at tertiary cancer centers collecting clinic-pathological features from 331 patients with MSI-H mCRC treated with ICIs. Of note, the irAEs were summarized using a 'burden score' constructed in a way that the same score value could be obtained by …

Targeting Immunosuppressive Ly6c+ Classical Monocytes Reverses Anti-Pd-1/Ctla-4 Immunotherapy Resistance, B Leticia Rodriguez, Limo Chen, Yanli Li, Shucheng Miao, David H Peng, Jared J Fradette, Lixia Diao, Jessica M Konen, Frank R Rojas Alvarez, Luisa M Solis, Xiaohui Yi, Aparna Padhye, Laura A Gibson, Joshua K Ochieng, Xiaofei Zhou, Jing Wang, Don L Gibbons

Faculty, Staff and Student Publications

Introduction: Despite significant clinical advancement with the use of immune checkpoint blockade (ICB) in non-small cell lung cancer (NSCLC) there are still a major subset of patients that develop adaptive/acquired resistance. Understanding resistance mechanisms to ICB is critical to developing new therapeutic strategies and improving patient survival. The dynamic nature of the tumor microenvironment and the mutational load driving tumor immunogenicity limit the efficacy to ICB. Recent studies indicate that myeloid cells are drivers of ICB resistance. In this study we sought to understand which immune cells were contributing to resistance and if we could modify them in a way …

Hepatozoon Spp. Infection In Wild Canids In The Eastern United States, Eliza Baker, Alex Clemson, Debra Miller, Kayla Buck Garrett, Christopher A. Cleveland, Justin Brown, Kyle Van Why, Richard W. Gerhold Jr.

United States Department of Agriculture Wildlife Services: Staff Publications

Background Hepatozoon spp. are apicomplexan parasites known to cause musculoskeletal disease in a variety of animals. Two species are known to infect wild and domestic canids in the United States: Hepatozoon canis and H. americanum.

Methods In this study, blood, heart, and/or spleen samples were collected from 278 wild canids (180 coyotes, 93 red foxes, and 5 gray foxes) in the eastern US and tested via PCR for Hepatozoon. Histology slides of heart and skeletal muscle were assessed for Hepatozoon cysts and associated inflammation when fresh tissue was available (n = 96).

Results Hepatozoon spp. were …

“Revisiting The Past”: A Redescription Of Physaloptera Retusa (Nemata, Physalopteridae) From Material Deposited In Museums And New Material From Amazon Lizards = “Revisitando O Passado”: Uma Redescrição De Physaloptera Retusa (Nemata, Physalopteridae) A Partir De Material Depositado Em Museus E Novo Material De Lagartos Amazônicos, Lílian Cristina Macedo, Yuri Willkens, Leandro Maurício Oliveira Da Silva, Scott Lyell Gardner, Francisco Tiago De Vasconcelos Melo, Jeannie Nascimento Dos Santos

Scott L. Gardner Publications

Abstract

Physaloptera Rudolphi, 1819 is a genus of nematodes that includes approximately 100 species parasitic in vertebrates around the world. From these, approximately 30 occur in the Neotropical region, with nine reported from neotropical reptiles. Physaloptera spp. are recognized by their distinct morphology of the apical end and characters of the reproductive system. However, despite the fact that the morphological characters for species diagnosis have been firmly established, we frequently find identification problems regarding poorly detailed descriptions and poorly preserved specimens. These may lead to taxonomic incongruencies. Physaloptera retusa (Rudolphi, 1819) is the most common species of the genus and …

Helminth And Protozoan Parasites Of Subterranean Rodents (Chordata, Mammalia, Rodentia) Of The World, Altangerel Tsogtsaikhan Dursahinhan, Daniel A. Kenkel, Scott Lyell Gardner

Scott L. Gardner Publications

Published studies and ten new unpublished records included herein reveal that approximately 174 species of endoparasites (helminths and protozoans) are known from 65 of 163 species of rodents that occupy the subterranean ecotope globally. Of those, 94 endoparasite species were originally described from these rodents. A total of 282 host-parasite associations are summarized from four major zoogeographic regions including Ethiopian, Palearctic/Oriental, Nearctic, and Neotropical. Thirty-four parasite records from the literature have been identified to only the level of the genus. In this summary, ten new records have been added, and the most current taxonomic status of each parasite species is …

Filling The Gap In Distribution Ranges And Conservation Status In Ctenomys (Rodentia: Ctenomyidae), Diego A. Caraballo, Sabrina Laura Lopez, Sebastian Botero-Cañola, Scott Lyell Gardner

Scott L. Gardner Publications

South American subterranean rodents of the genus Ctenomys (Rodentia, Ctenomyidae, tuco-tuco) are one of the most diverse genera among mammals. Recently described species, new taxonomic revisions, and new distribution range delimitation made the revision of distribution areas and conservation status of these mammals mandatory. Implementing the first part of the DAMA protocol (document, assess, monitor, act), here we compile updated sets of species distribution range maps and use these and the number of collection localities to assess the conservation status of ctenomyids. We integrate potential for conservation in protected areas, and levels of habitat transformation to revise previous conservation status …

Tapping Into Natural History Collections To Assess Latitudinal Gradients Of Parasite Diversity, Sebastian Botero-Cañola, Scott Lyell Gardner

Scott L. Gardner Publications

Parasites are key components of the biosphere not only due to their huge diversity, but also because they exert important influences on ecological processes. Nevertheless, we lack an understanding of the biogeographical patterns of parasite diversity. Here, we tap into the potential of biodiversity collections for understanding parasite biogeography. We assess species richness of supracommunities of helminth parasites infecting mammal assemblages in the Nearctic, and describe its relation to latitude, climate, host diversity, and land area. We compiled data from parasitology collections and assessed parasite diversity in Nearctic ecoregions for the entire parasite supracommunity of mammals in each ecoregion, as …

A New Species Of Mathevotaenia (Cestoda: Anoplocephalidae) From The Andean Tuco-Tuco, Ctenomys Opimus (Rodentia: Ctenomyidae), On The Altiplano Of Bolivia, Scott Lyell Gardner, Bennett A. Grappone, Alex Lai

Scott L. Gardner Publications

A new species of Mathevotaenia Akumyan, 1946 (Cestoda: Anoplocephalidae) is described from the Andean tuco-tuco, Ctenomys opimus Wagner 1848 (Rodentia: Ctenomyidae), collected in 1984 on the Altiplano of Bolivia. This is the second species of anoplocephalid cestode recorded from rodents of the genus Ctenomys, the first being Monoecocestus torresi Olsen 1976 from the Maule tuco-tuco, Ctenomys maulinus Philippi 1872, documented in southwestern Argentina. The new species of Mathevotaenia described here has more testes per segment than any other described species of the same genus from South America. The description of a new species from a decades-old specimen highlights the …

Mites [Of Dogs And Cats], Susan E. Little, Roberto Cortinas

School of Veterinary and Biomedical Sciences: Faculty Publications

Veterinary parasitology: 20,000-word article details recognition and treatments for mite infestations of dogs and cats. Mite species reviewed include:

Cheyletiella spp. (“Walking Dandruff”)

Demodex spp. (Hair Follicle Mites, Red Mange, Demodicosis, Demodectic Mange)

Sarcoptes scabiei (Itch Mite, Scabies, Sarcoptic Mange)

Notoedres cati (Feline Head and Neck Mange)

Otodectes cynotis (Ear Mites)

Pneumonyssoides caninum (Nasal Mite)

Lynxacarus radovskyi (Fur Mite, Hair Clasping Mite)

Trombiculid Mites (Chiggers, Red Bugs, Berry Bugs, Harvest Mites, Scrub Itch or Grass Itch Mites)

Discussions include Etiology and epidemiology, Pathogenesis, Clinical features, Diagnosis, Treatment and prognosis, Immunity, Prevention, and Public health aspects.

Complete with 209 references.

More People, More Cats, More Parasites: Human Population Density And Temperature Variation Predict Prevalence Of Toxoplasma Gondii Oocyst Shedding In Free-Ranging Domestic And Wild Felids, Sophie Zhu, Elizabeth Vanwormer, Karen Shapiro

School of Veterinary and Biomedical Sciences: Faculty Publications

Toxoplasma gondii is a ubiquitous zoonotic parasite that can infect warm-blooded vertebrates, including humans. Felids, the definitive hosts, drive T. gondii infections by shedding the environmentally resistant stage of the parasite (oocysts) in their feces. Few studies characterize the role of climate and anthropogenic factors in oocyst shedding among free-ranging felids, which are responsible for the majority of environmental contamination. We determined how climate and anthropogenic factors influence oocyst shedding in free-ranging domestic cats and wild felids using generalized linear mixed models. T. gondii oocyst shedding data from 47 studies were systematically reviewed and compiled for domestic cats and six …

Chemical Characterization And Biological Evaluation Of Epilobium Parviflorum Extracts In An In Vitro Model Of Human Malignant Melanoma, Sotiris Kyriakou, Venetia Tragkola, Ioannis Paraskevaidis, Mihalis Plioukas, Dimitrios T. Trafalis, Rodrigo Franco, Aglaia Pappa, Mihalis I. Panayiotidi

School of Veterinary and Biomedical Sciences: Faculty Publications

Malignant melanoma is an aggressive type of skin cancer characterised by high metastatic capacity and mortality rate. On the other hand, Epilobium parviflorum is known for its medicinal properties, including its anticancer potency. In this context, we aimed to (i) isolate various extracts of E. parviflorum, (ii) characterize their phytochemical content, and (iii) determine their cytotoxic potential in an in vitro model of human malignant melanoma. To these ends, we utilized various spectrophotometric and chromatographic (UPLC-MS/MS) approaches to document the higher content of the methanolic extract in polyphenols, soluble sugars, proteins, condensed tannins, and chlorophylls -a and -b as …

Detection Of Mannheimia Haemolytica-Specific Igg, Igm And Iga In Sera And Their Relationship To Respiratory Disease In Cattle, Korakrit Poonsuk, Carita Kordik, Matthew M. Hille, Ting-Yu Cheng, William B. Crosby, Amelia R. Woolums, Michael L. Clawson, Carol G. Chitko-Mckown, Bruce Brodersen, John Dustin Loy

School of Veterinary and Biomedical Sciences: Faculty Publications

Mannheimia haemolytica is one of the major causes of bovine respiratory disease in cattle. The organism is the primary bacterium isolated from calves and young cattle affected with enzootic pneumonia. Novel indirect ELISAs were developed and evaluated to enable quantification of antibody responses to whole cell antigens using M. haemolytica A1 strain P1148. In this study, the ELISAs were initially developed using sera from both M. haemolytica-culture-free and clinically infected cattle, then the final prototypes were tested in the validation phase using a larger set of known-status M. haemolytica sera (n = 145) collected from feedlot cattle. The test …

First Gene-Edited Calf With Reduced Susceptibility To A Major Viral Pathogen, Aspen M. Workman, Michael P. Heaton, Brian L. Vander Ley, Dennis A. Webster, Luke Sherry, Jonathan R. Bostrom, Sabrina Larson, Theodore S. Kalbfleisch, Gregory P. Harhay, Erin E. Jobman, Daniel F. Carlson, Tad S. Sonstegard

School of Veterinary and Biomedical Sciences: Faculty Publications

Bovine viral diarrhea virus (BVDV) is one of the most important viruses affecting the health and well-being of bovine species throughout the world. Here, we used CRISPR-mediated homology-directed repair and somatic cell nuclear transfer to produce a live calf with a six amino acid substitution in the BVDV binding domain of bovine CD46. The result was a gene-edited calf with dramatically reduced susceptibility to infection as measured by reduced clinical signs and the lack of viral infection in white blood cells. The edited calf has no off-target edits and appears normal and healthy at 20 months of age without obvious …

Does Swab Type Matter? Comparing Methods For Mannheimia Haemolytica Recovery And Upper Respiratory Microbiome Characterization In Feedlot Cattle, William B. Crosby, Lee Pinnell, John T. Richeson, Cory Wolfe, Jake Castle, John Dustin Loy, Sheryl P. Gow, Keun Seok Seo, Sarah F. Capik, Amelia R. Woolums, Paul S. Morley

School of Veterinary and Biomedical Sciences: Faculty Publications

Background: Bovine respiratory disease (BRD) is caused by interactions among host, environment, and pathogens. One standard method for antemortem pathogen identification in cattle with BRD is deep-guarded nasopharyngeal swabbing, which is challenging, costly, and waste generating. The objective was to compare the ability to recover Mannheimia haemolytica and compare microbial community structure using 29.5 inch (74.9 cm) deep-guarded nasopharyngeal swabs, 16 inch (40.6 cm) unguarded proctology swabs, or 6 inch (15.2 cm) unguarded nasal swabs when characterized using culture, real time-qPCR, and 16S rRNA gene sequencing. Samples for aerobic culture, qPCR, and 16S rRNA gene sequencing were collected from the …