Life Sciences Commons^™

Development Of Antioxidant From Spent Coffee Ground And Its Appication, Chitinsee Paidech

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

Spent coffee grounds (SCG) are a by-product from coffee brewing process. SCG contains a considerable amount of organic compounds and is a great source of antioxidants. This research aimed to evaluate the antioxidant activities of SCG and SCG extracts by comparing different solvent (hexane and 60 - 90% ethanol) extractions, together with determining the effect of different concentration (5, 10, 15, 20 and 25%) of SCG extracts (SCG) and comparing these extracts with commercial antioxidants (BHA (A), BHT (T), tocopherol (TO)) for application to vegetable oil. The results showed that the total phenolic content (TPC) of SCG was 16.49 mg …

อิทธิพลของความเค็มต่อไมโครไบโอต้าและการแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องกับกรดไขมันไม่อิ่มตัวเชิงซ้อนของโคพีพอด Apocyclops Royi, ณัฐกนกพร ประยูรมณีรัตน์

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

โคพีพอด Apocyclops royi เป็นแพลงก์ตอนสัตว์ในกลุ่มครัสเตเชียนที่มีบทบาทสำคัญต่อการอนุบาลสัตว์น้ำวัยอ่อนเนื่องจากมีคุณค่าทางโภชนาการที่โดดเด่นและสามารถสังเคราะห์กรดไขมันสายยาวไม่อิ่มตัวเชิงซ้อน (LC-PUFA) ในงานวิจัยนี้ได้ศึกษาหน้าที่และการแสดงออกของยีน Fatty acid-binding protein (FABP) ซึ่งเป็นโปรตีนที่มีหน้าที่สำคัญในการขนส่งกรดไขมัน ผลจากการศึกษาลักษณะสมบัติของยีน ArFABP ของโคพีพอดสายพันธุ์ไทย A. royi-TH พบว่าประกอบด้วยบริเวณ open reading frame จำนวน 465 คู่เบส ซึ่งสามารถแปลรหัสเป็นโปรตีนขนาด 154 กรดอะมิโน โดยโปรตีน ArFABP ประกอบด้วยบริเวณ Lipocalin_7 domain ซึ่งมีความเหมือนกับโปรตีน FABP ในโคพีพอด Caligus rogercresseyi 55% จากการศึกษาหน้าที่ของยีน ArFABP ต่อความเกี่ยวข้องในการสังเคราะห์กรดไขมัน PUFA ในโคพีพอด ได้ทำการตรวจสอบการแสดงออกของยีน ArFABP ในตัวอย่างโคพีพอด A. royi-TH กลุ่มที่เลี้ยงด้วย Tetraselmis sp. (TET) เปรียบเทียบกับ Thalassiosira sp. (THA) พบว่าโคพีพอดกลุ่มที่เลี้ยงด้วย THA มีระดับการแสดงออกของยีน ArFABP สูงกว่าโคพีพอดกลุ่มที่เลี้ยงด้วย TET อย่างมีนัยสำคัญทางสถิติ ซึ่งสอดคล้องกับผลการวิเคราะห์องค์ประกอบของกรดไขมัน พบว่าโคพีพอดกลุ่มที่เลี้ยงด้วย THA มีสัดส่วนของกรดไขมัน LC-PUFA และกรดไขมัน arachidonic acid (ARA) สูงกว่ากลุ่มที่เลี้ยงด้วย TET อย่างมีนัยสำคัญทางสถิติ นอกจากนี้ผลจากงานวิจัยยังพบว่าระดับการแสดงออกของยีน ArFABP มีการแสดงออกสูงในโคพีพอดที่เลี้ยงในสภาวะความเค็ม 15 พีพีที (ความเค็มต่ำ) เปรียบเทียบกับกลุ่มโคพีพอดที่เลี้ยงในสภาวะความเค็ม 25 พีพีที (กลุ่มควบคุม) โดยพบว่าโคพีพอดกลุ่มความเค็ม 15 พีพีที มีสัดส่วนของกรดไขมัน ARA สูงกว่ากลุ่มความเค็ม 25 พีพีที อย่างมีนัยสำคัญทางสถิติ โดยจากผลการศึกษานี้แสดงให้เห็นว่ายีน ArFABP อาจมีบทบาทเกี่ยวข้องกับการขนส่งกรดไขมันในการสังเคราะห์กรดไขมัน LC-PUFA ในโคพีพอด และจากการศึกษาไมโครไบโอมพบว่าการเพาะเลี้ยงโคพีพอด A. …

การศึกษาลักษณะสมบัติและการแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องกับการสร้างไขมันในโคพีพอด Apocyclops Royi, ณัฐวรรณ เทพสุนทร

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

อาหารที่มีคุณค่าทางโภชนาการสูงเป็นสิ่งสำคัญสำหรับการอนุบาลลูกสัตว์น้ำแรกเกิด ซึ่งจะส่งผลทำให้สิ่งมีชีวิตเติบโตได้อย่างมีประสิทธิภาพและช่วยเพิ่มอัตราการรอดของสัตว์น้ำวัยอ่อน โคพีพอด Apocyclops royi จัดอยู่ในกลุ่มของครัสเตเชียนขนาดเล็ก เป็นอาหารของสัตว์น้ำ ที่อุดมไปด้วยคุณค่าทางโภชนาการที่ดี เนื่องจากสามารถสังเคราะห์กรดไขมันไม่อิ่มตัวเชิงซ้อนสายยาว (LC-PUFA) ได้สูง โดยงานวิจัยมีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษาลักษณะสมบัติและบทบาทของยีน Sterol regulatory element-binding protein 1 (ArSREBP-1), ยีน Carbohydrate-responsive element-binding protein (ArChREBP) และยีน Max-like factor X (ArMLX) ในโคพีพอด Apocyclops royi สายพันธุ์ไทย (A. royi-TH) และศึกษาอิทธิพลขององค์ประกอบไขมันในอาหารต่างชนิดกันที่ส่งผลต่อปริมาณกรดไขมันในโคพีพอด A.royi-TH จากการศึกษาพบว่ายีน ArSREBP-1 มีความเหมือนกับยีน SREBP-1 ของ Tigriopus kingsejongensis เท่ากับ 64%, ยีน ArChREBP มีความเหมือนกับยีน ChREBP ของParacyclopina nana เท่ากับ 58% และ ยีน ArMLX มีความเหมือนกับยีน MLX ของ Paracyclopina nana เท่ากับ 62% จากผลการศึกษาการแสดงออกของยีน Delta 6 desaturase (ArD6D), ยีน ArSREBP-1, ยีน ArChREBP และ ยีน ArMLX ต่อความสำคัญในการสังเคราะห์กรดไขมันในโคพีพอด A. royi-TH โดยเลี้ยงโคพีพอดด้วยอาหารที่แตกต่างกัน 2 ชนิด คือ สาหร่าย Tetraselmis sp. (TET) และ Chlorella sp. (CH) พบว่าระดับการแสดงออกของยีน ArD6D, ยีน ArSREBP-1, ยีน ArChREBP และ ยีน ArMLX เพิ่มขึ้นอย่างมีนัยสำคัญทางสถิติ …

Electrochemical Dna Super-Sandwich Biosensor For Porcine Dna Adulteration Detection In Foods, Vasita Lapeee

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

Amid increasing concerns over meat adulteration and mislabeling, which impact consumer trust, especially among people who are forbidden from consuming certain meats due to religious, cultural, and health reasons, there is a need for reliable detection methods. Although standard methods for genetic material detection, such as DNA amplification, offer high sensitivity, they also present limitations in terms of cost, instrument complexity, and lengthy detection times. Addressing these limitations, this thesis focuses on developing an electrochemical DNA sensor for detecting porcine DNA contamination in food without prior DNA amplification. The proposed method is straightforward, rapid, and cost-effective. The detection process involves …

Development Of Duplex Loop-Mediated Isothermal Amplification (Dlamp) For Detection Of Carbapenem Antibiotic-Resistant Genes Kpc And Ndm, Nindi Syahputri Lubis

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

Carbapenems are regarded as a last-resort option for treating a wide range of Gram-positive and Gram-negative bacterial infections. Unfortunately, the prevalence of carbapenem-resistant genes has been on the rise among patients. Some factors contribute to this trend, including prolonged hospital stays, prior antibiotic usage, inappropriate or insufficient antibiotic treatment, and contamination through wounds or feces. The emergence of carbapenem-resistant (CR) genes gained significant attention, particularly after 2005. These CR genes are frequently carried on mobile genetic elements such as plasmids or transposons, enabling their transmission to other bacteria. Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC) and New delhi metallo-β-lactamase (NDM) stand out as …

การพัฒนาวิธีการตรวจออกซิไดซ์ไลโพโปรตีนชนิดความหนาแน่นต่ำ โดยใช้เทคนิคการตรวจวัดบนกระดาษร่วมกับ Immunogold Silver Enhancement, สุจิตรา ต๊ะยามัน

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

โรคหลอดเลือดแดงโคโรนารี (Coronary Artery Disease, CAD) เป็นโรคไม่ติดต่อชนิดเรื้อรังที่เกิดจากหลอดเลือดแดงที่กล้ามเนื้อหัวใจตีบหรือตัน สาเหตุหลักเกิดจากไขมันและเนื้อเยื่อสะสม มีผลทำให้เยื่อบุผนังหลอดเลือดชั้นในหนาตัวขึ้นและเกิดการอุดตัน จากการศึกษาที่ผ่านมาพบว่า ox-LDL เป็นจุดเริ่มต้นของโรคดังกล่าว เนื่องจากมีคุณสมบัติต่างจาก normal LDL โดยไม่สามารถจับได้กับ LDL receptor ได้ แต่สามารถจับได้กับ scavenger receptor ที่ผิวเซลล์แมคโคฟาจจึงทำให้ ox-LDL สามารถเข้าเซลล์ได้อย่างไม่มีสิ้นสุด เกิดเป็นโฟมเซลล์ (foam cells) สะสมอยู่ในผนังหลอดเลือดเกิดเป็นรอยขีดไขมัน (fatty streak) ประกอบกับการกระตุ้นเกล็ดเลือดและเซลล์อิมมูน ทำให้เกิดเป็นลิ่มเลือดอุดตันทางเดินของเส้นเลือด แม้ว่า ox-LDL จะเป็นสาเหตุสำคัญของการเกิดโรคแต่การตรวจวัดระดับไขมัน ox-LDL ยังไม่แพร่หลายในห้องปฏิบัติการเทคนิคการแพทย์ เนื่องจากชุดตรวจมีราคาแพง ใช้เวลาในการวิเคราะห์นาน และยังต้องใช้เครื่องมือที่มีความจำเพาะ ดังนั้นการศึกษาในครั้งนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อพัฒนาเทคนิคการตรวจวัดระดับ ox-LDL ด้วยเทคนิคการตรวจวัดบนฐานกระดาษร่วมกับ immunogold silver enhancement โดยออกแบบกระดาษกรองให้มีรูปแบบเป็น microtiter plate อาศัยเทคนิค wax printing ในการสร้างขอบเขต หาสภาวะที่เหมาะสมสำหรับออกซิไดซ์กระดาษ เพื่อให้มีคุณสมบัติเหมาะสมกับการตรึงแอนติบอดี โดยเปลี่ยนเซลลูโลสเป็นหมู่แอลดีไฮด์ งานวิจัยนี้ได้นำสารละลายลิเธียมคลอไรด์มาช่วยเพิ่มประสิทธิภาพการออกซิไดซ์ร่วมกับสารละลายโซเดียมเพอร์ริออเดท พบว่ากระดาษที่ออกซิไดซ์แล้วสามารถคงสภาพนาน 72 ชั่วโมง และแอนติบอดีที่ตรึงไว้คงสภาพนานที่สุด 4 ชั่วโมง ทดลองวิเคราะห์วัดปริมาณ std. ox-LDL และ ox-LDL ที่เตรียมเองในห้องปฏิบัติการด้วยสภาวะเทคนิคดังกล่าว พบว่าสีปฏิกิริยาที่เกิดขึ้นยังไม่ชัดเจน อันเนื่องมากจากข้อจำกัดของความจำเพาะของแอนติบอดี การทำให้เกิดสีด้วย silver enhancement ซึ่งยังคงต้องมีการพัฒนาต่อไปเพื่อให้ผลการวิเคราะห์มีความชัดเจน นอกจากนี้ได้พัฒนากล่องถ่ายภาพเพื่อใช้เก็บผลการวิเคราะห์บนฐานกระดาษ ที่สามารถถ่ายภาพด้วยแสงและระยะที่คงที่ สามารถเคลื่อนย้ายได้ง่ายในภาคสนาม อย่างไรก็ตามแม้การพัฒนาวิธีการวิเคราะห์ ox-LDL ยังไม่ประสบผลสำเร็จ แต่ยังพอได้แนวทางและต้นแบบในการศึกษาต่อไปในอนาคต

ประสิทธิภาพของยีน Tef ในการจัดจำแนกเชื้อ Aspergillus ที่เพาะได้จากผู้ป่วยไทย, ประภาพร คชพงษ์

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

Aspergillosis เป็นโรคติดเชื้ออันตรายถึงแก่ชีวิต มีสาเหตุมาจากเชื้อราในจีนัส Aspergillus การวินิจฉัยโรคในปัจจุบัน การเพาะแยกเชื้อและจัดกลุ่มตามลักษณะทางสัณฐานวิทยายังคงเป็นวิธีมาตรฐาน การตรวจหา galactomannan มักใช้ตรวจวินิจฉัยโรคในผู้ป่วยกลุ่มเสี่ยงเท่านั้น ในขณะที่เทคนิคทางอณูชีววิทยาอาศัยข้อมูลสารพันธุกรรมของ “its region” ในการจำแนกกลุ่มเชื้อระดับสปีชีส์ แต่อย่างไรก็ตามข้อมูลดังกล่าวถูกพิสูจน์ว่าสามารถจำแนกกลุ่มเชื้อราก่อโรคในคนในระดับสปีชีส์ได้ต่ำ ในด้านการรักษาสปีชีส์ของเชื้อ Aspergillus มักไม่ถูกนำมาพิจารณาร่วมเพื่อการเลือกกลุ่มยาแม้ว่ายังคงมีผู้ป่วยบางรายที่ตอบสนองต่อการรักษาไม่ดีเนื่องจากเชื้อสาเหตุดื้อต่อยาต้านเชื้อรา ด้วยเหตุดังกล่าวเพื่อศึกษาความสัมพันธ์ระหว่างสปีชีส์และรูปแบบความไวรับต่อยา การค้นหายีนที่สามารถจำแนกเชื้อ Aspergillus ในระดับสปีชีส์ได้อย่างแม่นยำจึงเป็นสิ่งจำเป็นยีน “tef-1α” เป็นสารพันธุกรรมที่ได้รับการพิสูจน์แล้วว่ามีคุณสมบัติสามารถจำแนกเชื้อราเส้นสายในระดับสปีชีส์ได้สูง ในงานวิจัยนี้ ผู้วิจัยได้เปรียบเทียบผลการจำแนกกลุ่มเชื้อ Aspergillus ที่แยกได้จากผู้ป่วยจำนวน 227 ตัวอย่าง โดยใช้ข้อมูลสารพันธุกรรม “its region” และ“tef-1α” จากผลการศึกษาพบว่าสารพันธุกรรมจากยีน“tef-1α” (D=0.8461) มีความสามารถในการจำแนกเชื้อในระดับสปีส์สูงกว่าบริเวณ “its” (D=0.796) โดยเฉพาะอย่างยิ่งใน section Fumigati ข้อมูลสารพันธุกรรมจาก “its region” สามารถแบ่งเชื้อกลุ่มดังกล่าวออกได้เพียง 1 สปีชีส์ คือ A. fumigatus ในขณะที่ยีน“tef-1α” สามารถแบ่งออกเป็น A. fumigatus และอีก 2 สปีชีส์ คือ A. lentulus และ A. udagawa ซึ่งเป็นเชื้อที่ดื้อต่อยา amphotericin B โดยกำเนิด โดยสรุป ผลจากงานวิจัยนี้ชี้ให้เห็นว่าการจำแนกสปีชีส์ของเชื้อ Aspergillus โดยใช้ยีนทุติยภูมิ “tef-1α” สามารถบ่งชี้กลุ่มยาที่เหมาะสมต่อการรักษาได้

Functional Characterization Of Pacific White Shrimp Litopenaeus Vannamei Heat Shock Protein 90 In Response To White Spot Syndrome Virus Infection, Warumporn Yingsunthonwattana

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

Heat shock proteins (HSPs) are host chaperones that can be used by viruses to facilitate various steps of viral infections. In this study, we found that Litopenaeus vannamei heat shock protein 90 (LvHSP90) is a viral-responsive protein, due to a significant transcriptional and translational upregulation following white spot syndrome virus (WSSV) infection. Suppression of LvHSP90 significantly reduced WSSV infection which was corresponded with significantly decreased expressions of viral genes, including the immediate-early genes and viral DNA polymerase. Conversely, injecting shrimp with WSSV that had been co-incubated with a recombinant LvHSP90 (rLvHSP90) promoted WSSV infection as evidenced by an increased cumulative …

Co-Expression Network Analysis Of Transcript Levels Under Salt-Stress Condition Of Thai Rice With Time-Series Data And Weighted Graph, Pajaree Sonsungsan

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

Rice (Oryza sativa) is a plant that is sensitive to salinity, which affects the growth of rice, leading to reduced rice production. The development of salt-tolerant rice varieties through the study of genes that can withstand salinity has long been an important task. Nevertheless, the mechanisms underlying salinity tolerance in rice remain complex. Hence, the study of mechanisms and genes related to salinity tolerance remains a crucial and demanding field in current research. This research presents a strategy for the analysis of gene expression data, employing Weighted Gene Co-expression Network Analysis (WGCNA) to pinpoint genes responsible for conferring salinity tolerance …

Biomarker Identification Of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Metastasis By Systems Biology Approach, Tanakamol Mahawan

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

Systems biology synergises biology with computational sciences, offering a holistic perspective and cutting-edge tools like machine learning (ML) to reveal disease biomarkers. ML can identify key molecular signals from omics data for biomarker candidate discovery. Effective ML demands practices avoiding data leakage and enhancing reproducibility. This study aimed to build a robust pipeline for biomarker candidates discovery using ML and applied it to pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC). PDAC is an aggressive pancreatic cancer with a poor prognosis. Over 80% of patients are diagnosed at late metastatic stages with no standard markers known for rapid and cost-effective metastasis diagnosis. Biomarkers for …

Bezlotoxumab Binding Specificity To Toxin B Of Clostridium Difficile, Kun Karnchanapandh

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

Clostridioides difficile infection (CDI) is one of the significant global health issues. Toxin B is the main target protein preventing CDI recurrence. Clinical research has shown that bezlotoxumab (Bez), a monoclonal antibody designed to prevent CDI recurrences, is less effective against the B2 strain compared to the B1 strain, resulting in a high recurrence rate. Bez functions by binding to the epitope 1 and 2 regions in the combined repetitive oligopeptide (CROP) domain. Some binding residues are distinctively different between B1 and B2 strains. In this work, our goal was to understand and compare the interaction of toxins B1 and …

การเปลี่ยนแปลงของ Vglut1 ในสมองส่วนฮิปโปแคมปัส และเซลล์ประสาทโดปามีนในสมองส่วนซับสแตนเชีย ไนกรา ของหนูเมาส์สายพันธุ์ Balb/C ที่เหนี่ยวนำให้เกิดโรคลูปัสโดยพริสเทน, ทิพย์ภากร อินทรคช

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

การศึกษาวิจัยในครั้งนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษาการแสดงออกของ VGLUT1 ในสมองส่วนฮิปโปแคมปัส ที่ส่งผลต่อพฤติกรรมการรู้คิดบกพร่อง และศึกษาการสูญเสียของเซลล์ประสาทโดปามีนในสมองส่วนซับสแตนเชีย ไนกรา ที่ส่งผลต่อพฤติกรรมการเคลื่อนไหวบกพร่องในหนูเมาส์ที่ถูกเหนี่ยวนำให้เกิดโรคลูปัสโดยพริสเทน โดยการทดลองในครั้งนี้ศึกษาในหนูเมาส์ BALB/cAJcl เพศเมีย จำนวน 30 ตัว โดยแบ่ง เป็น 2 กลุ่ม ได้แก่ หนูเมาส์กลุ่ม sham และหนูเมาส์กลุ่ม pristane-induced lupus หนูที่เมาส์กลุ่ม sham จะได้รับการฉีด saline ขนาด 0.5 มิลลิลิตร และหนูเมาส์กลุ่ม pristane-induced lupus ที่ได้รับการฉีด pristane ขนาด 0.5 มิลลิลิตร ผ่านทางช่องในวันที่ 1 เช่นเดียวกัน โดยในทุก ๆ 1 เดือน หนูเมาส์ทั้ง 2 กลุ่ม ถูกชั่งน้ำหนักและเก็บเลือด หลังจากนั้นในเดือนที่ 4 หนูเมาส์ทั้ง 2 กลุ่ม จะได้รับการทดสอบพฤติกรรม ได้แก่ open field test, novel object recognition test, และ pole test หลังจากทดสอบพฤติกรรมหนูเมาส์ทั้ง 2 กลุ่ม ถูกผ่าตัดเก็บชิ้นเนื้อสมองไปย้อม microglia และ astrocytes ในสมองส่วนฮิปโปแคมปัส และในสมองส่วนซับสแตนเชีย ไนกรา ย้อม VGLUT1 ในสมองส่วนฮิปโปแคมปัส และย้อม Tyrosine Hydroxylase (TH) ในสมองส่วนซับสแตนเชีย ไนกรา ด้วยวิธี immunohistochemistry ผลการทดลองพบว่าหนูเมาส์กลุ่ม pristane-induced lupus มีการเพิ่มขึ้นของ anti-dsDNA antibody ในซีรั่ม และมีม้ามโต ซึ่งคล้ายกับการเกิดโรคลูปัสในมนุษย์ นอกจากนี้ยังพบว่าหนูเมาส์กลุ่ม pristane-induced lupus มีการเพิ่มขึ้นของ …

Antioxidant And Anticancer Activities Of Mushroom Phellinus Linteus And Khaao-Yen-Nuea Smilax Sp. Extract Mixture, Alvi Jauharotus Syukriya

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

Recently, a number of alternative source including the bioactive compounds from plant and fungi are necessary to explore as therapeutic against cancer. This study aims to investigated the antioxidant and anticancer activities of Smilax sp. and Phellinus linteus (P. linteus) crude extract individually, also their mixture ratio variation including combination 1 (Smilax sp. 50%: P. linteus 50%), combination 2 (Smilax sp. 25%: P. linteus 75%), and combination 3 (Smilax sp. 75%: P. linteus 25%). The individually extract and its mixtures were investigated the physiochemical characterization such as total phenolic content and total polysaccharide compound. Furthermore, the antioxidant activities of extracted …

Microencapsulation Of Lactobacillus Plantarum Mb001 And Its Probiotic Effect On Growth Performance And Gut Integrity Of Broile Rs, Sasi Vimon

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

The objectives of this work were 1) to study the preparation and characterization of LPMB001/AG-AL, 2) todetermine the characteristics, stability and viability of LPMB001/AG-AL against simulated gastrointestinal tract, high temperature and storage conditions and 3) To evaluate the supplementation of LPMB001/AG-AL on growth performance,ileal digestibility, intestinal morphology and microbiome in broiler chickens. The present work declared microcapsule networks based on polymer matrices (sodium alginate, AL and agar, AG) and charges under ionic crosslink aw emulsion to encapsulate probiotics for extensive stability in adverse conditions. The microcapsule was studied on physicochemicalcharacteristics, swelling efficiency as well as release pertormance and viability under …

Screening Of Lactate Utilizing Bacteria And Their Beneficial Properties To Improve Energy Balance, Production And Ruminal Fermentation In Crossbred Dairy Goats, Saranporn Poothong

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

Sixty-three strains were isolated from ruminal fluid of crossbred dairy goats. Based on phenotype and 16S rRNA gene, sixteenbacterial groups were identified and two novel species of Selenomonas were purposed in this study. The strain mPRGC5 was purposed as Selenomonas runimis and the strain mPRGC8 was named Selenomonas caprae. The antimicrobial activity of all the strains was determined.Ligilactobacillus salivarius MP3 showed antibacterial activity against Cutibacterium acnes subsp. acnes DSM 1897' and Kocuria thizophila Mill. The antimicrobial substance was genomically identified as enterolysin A. Furtherniore, L. salivarius MP3 presented probiotic properties and the potential antimicrobial activity against pathogens. The fourteen strains …

Investigating Of Candidate Genes Affecting Milk Production In Dairy Cattle Using Systematic Review And Whole Genome Sequencing Database, Xiaoxian Su

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

Milk production traits in dairy cattle, such as milk yield, fat content, and protein levels, are pivotal to the economic success of the dairy industry. These traits not only determine the quality and quantity of milk produced but also directly impact the profitability of dairy operations. Consequently, a deep understanding of the genetic architecture underlying these traits is essential for the development of effective breeding programs aimed at enhancing milk production and quality. The purpose of this study is to identify potential candidate genes related to milk production in Thai dairy cattle through systematic review of genome wide association study …

Prioritization Of Candidate Genes For Mastitis Resistance Trait In Genome-Wide Association Studies (Gwas) Utilizing Multiple Methodologies In Thai Dairy Cattle, Nhu Le Uyen Vo

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

Mastitis affects milk yield in dairy cattle worldwide, leading to economic losses. Recognized as a polygenic trait, mastitis resistance is influenced by genetic, environmental, and physiological factors. This study aimed to enhance the genetic architecture and selection of the candidate for mastitis resistance traits in Thai dairy cattle by several methods. The study consisted of two parts. In Part 1, the study is divided into 1A) collecting genes from a systematic review of published GWAS, 1B) Analyzing the gene list with the Thai dairy cattle whole genome sequencing database, and 1C) Performing pathway enrichment analysis to identify candidate genes. Further …

Neuroanatomical Correlates Of The Late Positive Potential In Youth With Pediatric Bipolar Disorder, Alessio Simonetti, Marijn Lijffijt, Sherin Kurian, Johanna Saxena, Delfina Janiri, Marianna Mazza, Giulio Carriero, Lorenzo Moccia, Benson Mwangi, Alan C Swann, Jair C Soares

Faculty, Staff and Student Publications

BACKGROUND: The late positive potential (LPP) could be a marker of emotion dysregulation in youth with pediatric bipolar disorder (PBD). However, the neuroanatomical correlates of the LPP are still not clarified.

OBJECTIVE: To provide cortical and deep gray matter correlates of the LPP in youth, specifically, youth with PBD.

METHODS: Twenty-four 7 to 17 years-old children with PBD and 28 healthy controls (HC) underwent cortical thickness and deep gray matter volumes measurements through magnetic resonance imaging and LPP measurement elicited by passively viewing emotional faces through electroencephalography. T-tests compared group differences in LPP, cortical thickness, and deep gray matter volumes. …

Figure Set Update: An Inquiry-Based Module Aligned With The 4dee Framework For Teaching About Functional Responses And Biological Control, Rosny Jean, Linda Auker, Suann Yang, Jeremy Hsu

Open Educational Resources

THE ISSUE

Biological control agents are used in a wide range of contexts to limit damage from pests. However, the broader ecological consequences of such agents often are unclear before ecological risk assessments are performed. This Figure Set guides students to think through potential consequences of using biological control agents, and then uses a specific study to challenge students to interpret results from laboratory and caged field experiments. This Figure Set also introduces the concept of functional responses to students.

FOUR DIMENSIONAL ECOLOGY EDUCATION (4DEE) FRAMEWORK

• Core Ecological Concepts:
• Organisms
• Resources and regulators
• Communities
• Predation
• Ecology Practices:
• Quantitative reasoning and …

Correction To: Genetic Characterization And Expression Analysis Of Wheat (Triticum Aestivum) Line 07or1074 Exhibiting Very Low Polyphenol Oxidase (Ppo) Activity, S. M. Hystad, J. M. Martin, R. A. Graybosch, M. J. Giroux

Department of Agronomy and Horticulture: Faculty Publications

The above mentioned article was published in 2015 with an error in the naming of one of the allele sequences for the PPO gene on the D genome. The PPO-D1f allele was incorrectly named as it is identical to the PPO-D1c allele previously published in GenBank by the authors on March 11th, 2014. An alignment between the previously published PPOD1c allele and a resequencing of the parental line 07OR1074 shows that the PPO-D1f allele is identical to the PPO-D1c allele. The allele in the paper referred to as PPO-D1f should be treated as PPO-D1c and can be accessed at NCBI …

Estimating The Genetic Parameters Of Yield-Related 1 Traits Under Different Nitrogen Conditions In Maize, Semra Palali Delen, Gen Xu, Jenifer Velazquez-Perfecto, Jinliang Yang

Department of Agronomy and Horticulture: Faculty Publications

Understanding the genetic basis responding to nitrogen (N) fertilization in crop production is a long-standing research topic in plant breeding and genetics. Albeit years of continuous efforts, the genetic architecture parameters, such as heritability, polygenicity, and mode of selection, underlying the N responses in maize remain largely unclear. In this study, about n = 230 maize inbred lines were phenotyped under high N (HN) and low N (LN) conditions for two consecutive years to obtain six yield-related traits. Heritability analyses suggested that traits highly responsive to N treatments were less heritable. Using publicly available SNP genotypes, the genome-wide association study …

Zonal Application Of Plant Growth Regulator In Cotton To Reduce Variability And Increase Yield In A Highly Variable Field, Carlos M.P. Vaz, Júlio C. Franchini, Eduardo A. Speranza, Ricardo Y. Inamasu, Lúcio A. De C. Jorge, Ladislau M. Rabello, Ivani De O.N. Lopes, Sérgio Das Chagas, Jefferson L.R. De Souza, Márcio De Souza, Amandio Pires, James Schepers

Department of Agronomy and Horticulture: Faculty Publications

Variable-rate application has great potential to reduce variability and increase yield by spatially optimizing agricultural inputs. In cotton, plant growth regulators (PGRs) control excessive growth and provide suitable plant height for harvest operations. This study evaluates the effect of variable-rate PGR application compared to constant-rate application to reduce yield spatial variability and increase yield. The variable-rate approach was carried out in 2020 based on zonal applications defined by clustering analysis using soil electrical conductivity, vegetation indexes, and yield maps. Application doses and timings were determined by integrating plant height measurements for the whole field in 2019 and by zone in …

Interaction Of Quizalofop-P-Ethyl With 2,4-D Choline And/Or Glufosinate For Control Of Volunteer Corn In Corn Resistant To Aryloxyphenoxypropionates, Mandeep Singh, Vipan Kumar, Stevan Z. Knezevic, Suat Irmak, John L. Lindquist, Santosh Pitla, Amit J. Jhala

Department of Agronomy and Horticulture: Faculty Publications

Corn resistant to aryloxyphenoxypropionates (FOPs) (Enlist™ corn) enables the use of quizalofop-p-ethyl (QPE) as a selective postemergence (POST) herbicide for control of glufosinate/glyphosate-resistant corn volunteers. Growers usually mix QPE with 2,4-D choline and/or glufosinate to achieve broad-spectrum weed control in Enlist™ corn. The objectives of this study were to (1) evaluate the efficacy of QPE applied alone or mixed with 2,4-D choline and/or glufosinate for control of glufosinate/glyphosate-resistant corn volunteers in Enlist™ corn and (2) determine the impact of application time (V3 or V6 growth stage of volunteer corn) of QPE-based treatments on volunteer corn control as well as Enlist™ …

The Biggest Grower: A Youth Gardening Competition For Growing Specialty Crops And Urban Farmers, Stacy A. Adams, Terri James

Department of Agronomy and Horticulture: Faculty Publications

Youth today have tendencies for unhealthy lifestyles, being sedentary, consuming high fat diets low in fruits and vegetables, all contributing to child obesity, Type 2 diabetes, hypertension, and precedence for life-long health concerns. For rural and economically disadvantaged urban households, poor diet is directly attributed to the inaccessibility of fresh produce, affordability and understanding of preparation of various specialty crops. Through a grant from the NE Specialty Crop Block Funding Program, The Biggest Grower Competition (BGC) was developed as a summer extension education program for youth in 8^th through 12^th grade. Project goals included; provide educational materials on …

The Use Of Diatoms (Amphora Sp.) As Immunostimulant In Pacific White Shrimp (Litopenaeus Vannamei) Diet, Ekthida Thongdet

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

Amphora sp. is one of the interesting microalgae due to its rapid growth, high lipid content, ranging from 40-60% of dry biomass, suitability as live food for commercial aquatic animal larvae such as shrimp and abalone. The objective of this study is to evaluate the potential of Amphora sp. isolated from four different locations in the Gulf of Thailand: Sichang Island (ASC), Samae Sarn Island (ASS), Pranburi (APB), and Laem Yai (ALY) as immunostimulant in Pacific white shrimp (Litopenaeus vannamei) diet. Four Amphora sp. isolations were cultured and compared productivity. The results showed that ASC and ALY had higher productivity, …

Colorectal Surveillance Outcomes From An Institutional Longitudinal Cohort Of Lynch Syndrome Carriers, Gabriel Del Carmen, Laura Reyes-Uribe, Daniel Goyco, Kyera Evans, Charles M Bowen, Jennifer L Kinnison, Valerie O Sepeda, Diane M Weber, Julie Moskowitz, Maureen E Mork, Selvi Thirumurthi, Patrick M Lynch, Miguel A Rodriguez-Bigas, Melissa W Taggart, Y Nancy You, Eduardo Vilar

Faculty, Staff and Student Publications

OBJECTIVE: Lynch Syndrome (LS) carriers have a significantly increased risk of developing colorectal cancer (CRC) during their lifetimes. Further stratification of this patient population may help in identifying additional risk factors that predispose to colorectal carcinogenesis. In most LS patients CRC may arise from adenomas, although an alternative non-polypoid carcinogenesis pathway has been proposed for

DESIGN: We collected demographics, genetic, colonoscopy, and pathology results from a total of 163 LS carriers who obtained regular screening care at MD Anderson Cancer Center. Data were extracted from the electronic health records into a REDCap database for analysis. Logistic regressions were performed to …

Green Synthesis Of Lead Oxide Nanoparticles For Photo-Electrocatalytic And Antimicrobial Applications, Zia Ul Haq Khan, Noor Shad Gul, Faisal Mehmood, Sana Sabahat, Nawshad Muhammad, Abdur Rahim, Jibran Iqbal, Syed Khasim, Mohamed Abdel Salam, Taj Malook Khan, Jianbo Wu

All Works

Synthesis of nanoparticles (NPs) for many different uses requires the development of environmentally friendly synthesis protocols. In this article, we present a simple and environmentally friendly method to synthesize lead oxide (PbO) NPs from the plant material of the Mangifera indica. Analytical techniques such as spectroscopy, X-ray diffraction, and microscopy were used to characterize the synthesized PbO NPs, and their photo-electrocatalytic and antifungal properties were also evaluated. H2O2 was used to investigate the efficacy of removing methylene blue dye. At a range of pH values, H2O2 was used to study the role of hydroxyl radicals in the breakdown of methylene …

Indigenously Produced Biochar Retains Fertility In Sandy Soil Through Unique Microbial Diversity Sustenance: A Step Toward The Circular Economy, Munawwar Ali Khan, Alsayeda Zahra Salman, Shams Tabrez Khan

All Works

Introduction: Agricultural productivity in the arid hot desert climate of UAE is limited by the unavailability of water, high temperature, and salt stresses. Growing enough food under abiotic stresses and decreasing reliance on imports in an era of global warming are a challenge. Biochar with high water and nutrient retention capacity and acid neutralization activity is an attractive soil conditioner. This study investigates the microbial community in the arid soil of Dubai under shade house conditions irrigated with saline water and the shift in the microbial community, following 1 year of amendment with indigenously prepared biochar from date palm waste. …

Association Of The Gut Microbiota With Clinical Variables In Obese And Lean Emirati Subjects, Manal Ali Ahmad, Mirey Karavetian, Carole Ayoub Moubareck, Gabi Wazz, Tarek Mahdy, Koen Venema

All Works

Background: Growing evidence supports the role of gut microbiota in obesity, yet exact associations remain largely unknown. Specifically, very little is known about this association in the Emirati population. Methods: We explored differences in gut microbiota composition, particularly the Firmicutes/Bacteroidetes (F/B) ratio, between 43 obese and 31 lean adult Emirate counterparts, and its association with obesity markers, by using V3-V4 regions of 16 S ribosomal RNA gene sequencing data. Furthermore, we collected anthropometric and biochemical data. Results: The two major phyla in obese and lean groups were Firmicutes and Bacteroidetes. We observed a significantly lower alpha diversity (Shannon index) in …

Design Of Block Copolymer With Tunable Hydrophobic/Hydrophilic/Fluorophilic Interactions, Tatiane De Fatima Dutra

Theses, Dissertations and Culminating Projects

Block copolymers (BCP) with balanced interactions and their resultant bulk-phase self-assembly have become increasingly important in advancing nanotechnology, separation, and energy applications. However, a few reports have addressed the synthesis challenge and bulk-phase self-assembly of such triblock copolymers. This thesis presents a facile route for preparing triblock copolymer via controlled radical and organocatalytic ring-opening polymerization that allows precise control over the incorporation of individual moieties in resultant polymer, responsible for balanced hydrophilic, hydrophobic/lipophilic, and fluorophilic interactions. Synthesized polymer with suggested self-assembled 2D lamellar nanostructure exhibits high-temperature stability. The long-term goal of this work is to selectively use this polymer class …