Digital Commons Network^™

การประเมินผลของการซ่อมแซมดีเอ็นเอที่เสียหายจากกระบวนการ Cytosine Deamination ในตัวอย่าง Ffpe หลายชนิด, นรมน แซ่จิว

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

ตัวอย่างชิ้นเนื้อที่ฝังพาราฟิน (Formalin-fixed, paraffin-embedded; FFPE) เป็นวิธีมาตรฐานที่ใช้ในการรักษาสภาพชิ้นเนื้อสำหรับงานทางนิติพยาธิวิทยา สามารถเก็บรักษาได้ที่อุณหภูมิห้องได้เป็นระยะเวลานาน อย่างไรก็ตามสารเคมีจากกระบวนการตรึงฟอร์มาลินทำให้เกิดการเปลี่ยนแปลงของลำดับนิวคลีโอไทด์ อาทิเช่น DNA crosslinking, การแตกหักของสายดีเอ็นเอ และการเกิดดีอะมิเนชั่นบนเบสไซโตซีน ซึ่งส่งผลต่อความสำเร็จในการวิเคราะห์ลำดับนิวคลีโอไทด์ หลายงานวิจัยได้ศึกษาความเป็นไปได้ในการซ่อมแซมความเสียหายของดีเอ็นเอด้วยการใช้เอนไซม์เพื่อลดความเสียหายของดีเอ็นเอในตัวอย่าง FFPE ก่อนกระบวนการเพิ่มจำนวนดีเอ็นเอ แต่ปัจจุบันยังไม่มีรายงานถึงวิธีการที่เหมาะสมและมีประสิทธิภาพในการกู้คืนข้อมูลลำดับนิวคลีโอไทด์ที่ใช้สำหรับวิธี Sanger sequencing การศึกษานี้มีวัตถุประสงค์เพื่อประเมินความสามารถของ NEBNext® FFPE DNA Repair Kit ในการซ่อมแซมดีเอ็นเอในตัวอย่าง FFPE ภายใต้สภาวะการตรึงฟอร์มาลินที่ต่างกัน ประกอบด้วย 10% Neutral Buffered Formalin (10%NBF) เป็นเวลา 24 ชั่วโมง และ 20% Neutral Buffered Formalin (20%NBF) เป็นเวลา 1 เดือน โดยความเสียหายของดีเอ็นเอจะพิจารณาจากปริมาณและคุณภาพของดีเอ็นเอรวมถึงการเปลี่ยนแปลงเบสภายในดีเอ็นเอด้วยวิธี Sanger Sequencing จากผลการทดลองพบว่าตัวอย่าง 20%NBF มีปริมาณดีเอ็นเอที่สามารถวัดด้วยเทคนิค Real-time PCR น้อยกว่าตัวอย่าง 10%NBF และมีการแตกหักของดีเอ็นเอมากกว่า และยังพบว่าดีเอ็นเอที่สกัดจากอวัยวะบริเวณช่องอกและกะโหลกศีรษะมีคุณภาพดีกว่าอวัยวะบริเวณช่องท้อง นอกจากนี้ยังพบการเกิดไซโตซีนดีอะมิเนชั่นในตัวอย่าง 20%NBF ที่ระยะเวลา 1 เดือนเท่านั้น โดยมีอัตราการเกิดไซโตซีนดีอะมิเนชั่นอยู่ที่ 51.85% จึงเป็นที่น่าสังเกตว่าจำนวนร้อยละของฟอร์มาลินที่สูงขึ้นและระยะเวลาในการตรึงที่นานขึ้นส่งผลต่อการแตกหักและการเกิดไซโตซีนดีอะมิเนชั่นบนสายดีเอ็นเอ งานวิจัยนี้จึงเป็นประโยชน์เพื่อใช้เป็นแนวทางการประเมินและจัดการกับตัวอย่าง FFPE สำหรับการวิเคราะห์ดีเอ็นเอทางนิติวิทยาศาสตร์ นอกจากนี้ยังพบว่าชุดซ่อมแซมดีเอ็นเอ NEBNext® FFPE DNA Repair Kit ช่วยแก้ความเสียหายของการเกิดไซโตซีนดีอะมิเนชั่นแต่ไม่สามารถกู้คืนเบสเดิมได้อย่างสมบูรณ์ อย่างไรก็ตามควรมีการศึกษาวิจัยเพิ่มเติมในอนาคตเพื่อเพิ่มความถูกต้องและแม่นยำในการวิเคราะห์ลำดับนิวคลีโอไทด์จากตัวอย่าง FFPE ที่เสียหายจากกระบวนการเตรียมตัวอย่างในงานทางนิติวิทยาศาสตร์ต่อไป

การศึกษาการแสดงออกในระดับโปรตีนเพื่อทำนายการกลับมาเป็นซ้ำของมะเร็งช่องสายเสียง, ศิวะพร ธนสาร

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

ในการศึกษาครั้งนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อเปรียบเทียบการแสดงออกของโปรตีนทั้งหมด 16 ชนิด ระหว่างกลุ่มผู้ป่วยโรคมะเร็งช่องสายเสียงที่กลับมาเป็นซ้ำและกลุ่มที่ไม่กลับมาเป็นซ้ำ โดยนำตัวอย่างชิ้นเนื้อเยื่อที่ฝังในพาราฟินบล็อกมาย้อมด้วยเทคนิคอิมมูโนฮิสโตเคมี (Immunohistochemistry) ด้วยแอนติบอดี pRb780, c-Met, Ki67, RPA32, CyclinD1, P53, HIF1alpha, Bcl2, BAX, BAK, Bclxl, PI3K, B-catenin, VEGF, CD44 และ P16 โดยการแสดงออกของโปรตีนจะถูกประเมินจากภาพถ่ายดิจิทัลโดยใช้ชุดซอฟต์แวร์ Imagescope v.10.2.2.2352 (Aperio Technologies, USA) นำมาคำนวณค่ามัธยฐาน H-score และใช้สถิติ Receiver operating characteristic (ROC) curve ในการเลือกจุดตัดที่เหมาะสม (cut off point) สำหรับแบ่งกลุ่มการแสดงออกของโปรตีนในผู้ป่วย จากนั้นหาความสัมพันธฺระหว่างข้อมูลส่วนบุคคล ข้อมูลทางคลินิก และการแสดงออกของโปรตีนกับอัตราการกลับมาเป็นซ้ำ ผลการศึกษาพบว่า ค่ามัธยฐาน H-score ของแอนติบอดี pRb780 เพิ่มขึ้นในกลุ่มผู้ป่วยที่กลับมาเป็นซ้ำ (p=0.0012) ในขณะที่การแสดงออกของโปรตีน c-Met ลดลงในกลุ่มผู้ป่วยที่กลับมาเป็นซ้ำอย่างมีนัยสำคัญทางสถิติ (p=0.0014) ในการวิเคราะห์ความสัมพันธ์ของปัจจัยต่างๆ กับการกลับมาเป็นซ้ำของมะเร็งช่องสายเสียง เมื่อทำการวิเคราะห์ด้วย Crude hazard ratio พบว่าการแสดงออกของโปรตีน pRb780 ร่วมกับ c-Met เป็นปัจจัยที่ส่งผลต่อการกลับมาเป็นซ้ำของมะเร็งช่องสายเสียงอย่างมีนัยสำคัญทางสถิติ (Hazard ratio=9.53, 95%CI=1.21-74.82) เมื่อวิเคราะห์ด้วย Adjusted hazard ratio พบว่า การแสดงออกของโปรตีน pRb780 ร่วมกับ c-Met มีความสัมพันธ์กับการกลับมาเป็นซ้ำของมะเร็งช่องสายเสียง อย่างมีนัยสำคัญทางสถิติ (Hazard ratio=8.73, 95%CI=1.09-69.75) กล่าวคือเมื่อผู้ป่วยที่มีการแสดงออกของโปรตีน pRb780 สูง ร่วมกับ การแสดงออกของโปรตีน c-Met ต่ำ จะมีโอกาสกลับมาเป็นซ้ำได้ถึง 8.73 เท่า เมื่อเทียบกับผู้ป่วยที่มีการแสดงออกของโปรตีน pRb780 ต่ำ ร่วมกับ การแสดงออกของโปรตีน …

ลักษณะพังผืดกล้ามเนื้อหัวใจในผู้ป่วยโรคหัวใจล้มเหลวชนิดไม่มีภาวะกล้ามเนื้อหัวใจขาดเลือดที่มีการฟื้นตัวของการบีบตัวของหัวใจ, ธนวินทร์ สุขสิริวรบุตร

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

ที่มา : เพื่อศึกษาเปรียบเทียบลักษณะของพังผืดในกล้ามเนื้อหัวใจจากการตรวจด้วยเครื่องตรวจคลื่นสะท้อนแม่เหล็กไฟฟ้าของหัวใจระหว่างผู้ป่วยโรคหัวใจล้มเหลวชนิดที่มีการฟื้นตัวของการบีบตัวของหัวใจ (HF-impEF) กับผู้ป่วยโรคหัวใจล้มเหลวชนิดที่ไม่มีมีการฟื้นตัวของการบีบตัวของหัวใจ (P-HF-rEF) ระเบียบวิจัย : เก็บรวบรวมข้อมูลย้อนหลังเกี่ยวกับลักษณะทางคลินิกของผู้ป่วย,ปริมาณขนาดยาควบคุมระบบประสาทและฮอร์โมนที่ได้รับ, ข้อมูลจากการตรวจหัวใจด้วยคลื่นเสียงความถี่สูงและลักษณะของพังผืดกล้ามเนื้อหัวใจเพื่อนำไปวิเคราะห์เปรียบเทียบกัน ผลการศึกษา : จากผู้ป่วยกลุ่ม HF-impEF 79 รายและผู้ป่วยกลุ่ม HF-impEF 21 ราย พบว่าตรวจพบพังผืดกล้ามเนื้อหัวใจ 29 ราย (38%) และ 14 ราย (67%) ของผู้ป่วย HF-impEF และ P-HF-rEF ตามลำดับ (p=0.020) โดยปริมาณของพังผืดพบต่ำกว่าในกลุ่ม HF-impEF เทียบกับ P-HF-rEF (3.1% กับ 8.5%, p = 0.004) และขนาดของเวนตริเคิลข้างซ้ายในขณะคลายตัว และ ปริมาณพังผืดของเวนตริเคิลข้างซ้าย นั้นสัมพันธ์กับภาวะฟื้นตัวของการบีบตัวของหัวใจอย่างมีนัยสำคัญทางสถิติ สรุป : ผู้ป่วยโรคหัวใจล้มเหลวที่มีการฟื้นตัวของการบีบตัวของหัวใจมีปริมาณพังผืดในกล้ามเนื้อหัวใจเวนตริเคิลข้างซ้ายน้อยกว่า โดยขนาดของเวนตริเคิลข้างซ้ายในขณะคลายตัว และ ปริมาณพังผืดของเวนตริเคิลข้างซ้ายนั้นเป็นตัวแปรสำคัญที่สัมพันธ์กับภาวะการฟื้นตัวของการบีบตัวของหัวใจ

บทบาทของปริมาณการกลายพันธุ์ของยีนอีจีเอฟอาร์ ต่อการตอบสนองต่อการรักษาด้วยยามุ่งเป้าในผู้ป่วยมะเร็งปอดชนิดเซลล์ไม่เล็กที่มีการกลายพันธุ์ของยีนอีจีเอฟอาร์, พรวสันต์ สิมสีแก้ว

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

ที่มา: การรักษามะเร็งปอดด้วยยามุ่งเป้าต่อยีนอีจีแอฟอาร์ในผู้ป่วยมะเร็งปอดชนิดไม่เล็กระยะลุกลามที่มีการกลายพันธุ์ของตัวรับชนิดอีจีแอฟอาร์เป็นการรักษาที่มีประสิทธิภาพดีที่สุดในปัจจุบันแต่อย่างไรก็ตาม การตอบสนองต่อการรักษามีความแตกต่างกันในแต่ละคน โดยบางคนมีระยะเวลาการรอดชีพโดยปราศจากโรค (PFS) 2-3 เดือน หรือบางคนมีระยะเวลาการรอดชีพโดยปราศจากโรคมากกว่า 12 เดือน ซึ่งการเดื้อยาเป็นปัญหาที่สำคัญในการรักษาและตอนนี้มียารักษาเฉพาะ แต่เนื่องจากความแตกต่างของกลายกลายพันธุ์ในเซลล์มะเร็งมะเร็งปอดชนิดไม่เล็ก การศึกษาความสัมพันธ์ของปริมาณการกลายพันธ์ของยีนอีจีแอฟและการตอบสนองต่อการรักษาด้วยยามุ่งเป้าอาจช่วยทำนายการตอบสนองต่อการรักษาด้วยยามุ่งเป้าชนิดอีจีแอฟอาร์ในผู้ป่วยมะเร็งปอดชนิดไม่เล็กที่มีการกลายพันธ์ของยีนอีจีแอฟอาร์ได้ วิธีการศึกษา: เป็นการศึกษาไปข้างหน้าโดยการติดตามผู้ป่วยที่ได้รับการวินิจฉัยว่าเป็นมะเร็งปอดชนิดไม่เล็กที่มีการกลายพันธ์ของยีนอีจีแอฟอาร์จากชนิดเนื้อพยาธิ ในโรงพยาบาลจุฬาลงกรณ์เป็นระยะเวลา 2 ปี โดยอาสาสมัครจะได้รับการรักษาด้วยยามุ่งเป้าต่อยีนอีจีแอฟอาร์ชนิดที่ 1 และในการศึกษาอาสาสมัครต้องรับการเจาะเลือดเพื่อตรวจการกลายพันธุ์ในเลือดทั้งก่อนและหลังการักษา โดยวัตถุประสงค์หลักของงานวิจัยเพื่อหาความสัมพันธ์ระหว่างปริมาณการกลายพันธุ์ของยีนอีจีเอฟอาร์ (EGFR mutation abundance) ต่อการตอบสนองต่อการรักษาด้วยยามุ่งเป้าในผู้ป่วยมะเร็งปอดชนิดเซลล์ไม่เล็กที่มีการกลายพันธุ์ของยีนอีจีเอฟอาร์ ผลการศึกษา: งานวิจัยนี้มีอาสาสมัครเข้ามร่วมงานวิจัย 83 คน ทุกคนได้รับการการรักษาด้วยยามุ่งเป้าต่อยีนอีจีแอฟอาร์ชนิดที่ 1และการตรวจการกลายพันธุ์ในเลือดด้วยเครื่อง IdyllaTM ctEGFR โดยอาสาสมัคร 41 คน (49.4%) ตรวจพบการกลายพันธ์ในเลือดก่อนเริ่มการรักษา จากการศึกษาพบว่าอาสาสมัครที่ตรวจไม่พบการกลายพันธุ์ในเลือดก่อนเริ่มการรักษามีอัตราการรอดชีวิตโดยปราศจากโรคยาวนานกว่ากลุ่มที่ตรวจพบการกลายพันธุ์ในเลือดก่อนเริ่มการรักษาอย่างมีนัยสำคัญทางสถติ 13.9 เดือน เทียบกับ 9.4 เดือน p.0.038 อาสาสมัครกลุ่มที่ตรวจพบการกลายพันธุ์ในเลือดก่อนเริ่มการรักษา พบว่าหากใช้ค่าความแตกต่างปริมาณการกลายพันธุ์ (deltaCq)ที่ 4.31 พบว่ากลุ่มที่มี DCq มากกว่าเท่ากับ 4.31 มีระยะเวลาการรอดชีวิตโดยปราศจากโรคยาวนานกว่ากลุ่มที่มี DCq น้อยกว่า 4.31อย่างมีนัยสำคัญทางสถิติ 10.9 เดือน เทียบกับ 6.9 เดือน P0.035 สรุปผล: จากการศึกษานี้สรุปได้ว่าการตรวจพบการกลายพันธุ์ของยีนอีจีเอฟอาร์ในเลือดก่อนเริ่มการรักษาเป็นปัจจัยการพยากรณ์โรคที่แย่กว่ากลุ่มที่ตรวจไม่พบการกลายพันธุ์ในเลือดก่อนเริ่มการรักษาด้วยยามุ่งเป้าชนิดที่ 1 ในผู้ป่วยโรคมะเร็งปอดชนิดไมเล็กที่มีการกลายพันธุ์ของยีนอีจีเอฟอาร์ และการตรวจการกลายพันธุ์ในเลือดแบบกึ่งปริมาณ ค่า deltaCq สามารถเป็นปัจจัยทำนายการตอบสนองต่อการรักษาด้วยยามุ่งเป้าชนิดที่ 1 ได้ แต่อาจต้องมีการศึกษาเพิ่มเติมเพื่อยืนยันผล

การศึกษาการตอบสนองทางภูมิคุ้มกันและความปลอดภัยของวัคซีนโควิด-19 ในผู้ป่วยโรคปอดอักเสบไอแอลดีที่ได้รับการรักษาด้วยยากดภูมิคุ้มกัน, ศศิพักตร์ นิธิวรนันท์

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

ที่มาของการศึกษา: วัคซีนโควิด-19 มีบทบาทสำคัญในการป้องกันการติดเชื้อโควิด-19 และการเกิดภาวะปอดอักเสบรุนแรง ปัจจุบันข้อมูลการศึกษาการตอบสนองทางภูมิคุ้ม ความปลอดภัย และประสิทธิภาพของวัคซีนโควิด-19 ชนิดใช้ไวรัสเป็นพาหะในผู้ป่วยโรคปอดอักเสบไอแอลดียังมีไม่มาก วิธีการศึกษา: ตรวจระดับแอนติบอดีและภูมิคุ้มกันแบบพึ่งเซลล์ในผู้ป่วยโรคปอดอักเสบไอแอลดีที่ได้รับการรักษาด้วยยากดภูมิคุ้มกันในรพ.จุฬาลงกรณ์ ศึกษาผลข้างเคียง การดำเนินโรค รวมถึงการติดเชื้อโควิด-19 ภายหลังได้รับวัคซีน ChAdOx1 ครบ 2 เข็ม ผลการศึกษา: มีผู้ป่วยเข้าร่วมการศึกษา 44 ราย อายุเฉลี่ย 63.8 ปี ผู้ป่วยส่วนใหญ่เป็นโรคปอดอักเสบไอแอลดีที่เกี่ยวข้องกับโรคเนื้อเยื่อเกี่ยวพัน ผู้ป่วยส่วนใหญ่ได้รับยาเพรดนิโซโลนขนาดเฉลี่ย 7.5 มิลลิกรัมต่อวัน หลังได้รับวัคซีน ChAdOx1 ครบ ที่ 4 สัปดาห์ผู้ป่วย 86% ตรวจพบแอนติบอดี (anti-S IgG) ต่อเชื้อโควิด-19 ที่ 12 สัปดาห์ผู้ป่วย 60.7% มีการตอบสนองแบบพึ่งเซลล์ต่อเชื้อโควิด-19 ผู้ป่วยที่ได้รับการปรับยากดภูมิคุ้มกันตามคำแนะนำของสมาคมโรครูมาติซั่มมีการตอบสนองทางภูมิคุ้มกันไม่แตกต่างกับกลุ่มที่ไม่ได้รับการปรับยา ผลข้างเคียงที่พบบ่อยคืออาการไข้ ผู้ป่วย 3 รายเกิดการกำเริบของโรคปอดอักเสบไอแอลดี ผู้ป่วย 1 รายติดเชื้อโควิด-19 สรุปผลการศึกษา: วัคซีน ChAdOx1 สามารถกระตุ้นภูมิคุ้มกันในผู้ป่วยโรคปอดอักเสบไอแอลดีที่ได้รับยากดภูมิคุ้มกันได้ และมีความปลอดภัยในผู้ป่วยกลุ่มนี้

Examining The Potential For Coronary Artery Calcium (Cac) Scoring For Individuals At Low Cardiovascular Risk., David Playford, Christian Hamilton-Craig, Girish Dwivedi, Gemma Figtree

Medical Papers and Journal Articles

Atherosclerosis is the commonest cause of death in Australia. Cardiovascular (CV) risk calculators have an important role in preventative cardiology, although they are are strongly age-dependent and designed to identify individuals at high risk of an imminent event. The imprecision around “intermediate” or “low” risk generates therapeutic uncertainty, and a significant proportion of patients presenting with myocardial infarction come from these groups, often with no warning. This highlights a conundrum: “Low” risk does not mean “no” risk.

A fresh approach may be required to address the clinical conundrum around CV preventative approaches in non-high-risk individuals. While probabilistic calculators do not …

Behavioural Phenotyping Of Thunder Mice With A Hypomorphic Mutation Of Heterogeneous Nuclear Ribonuclear Protein L-Like (Hnrnpll) And Reduced T Cell Function, Maarten Van Den Buuse, Paul Halley, Gerard Hoyne

Medical Papers and Journal Articles

Heterogeneous nuclear ribonuclear protein l-like (hnRNPLL) is an RNA binding protein that regulates alternative splicing of mRNA and is abundantly expressed in memory T lymphocytes of the immune system and in the brain. A hypomorphic allele of the gene encoding hnRNPLL (Hnrpllthunder) selectively reduces T cell accumulation in lymphoid tissues, but little is known about its effects in the brain. Therefore, we exposed Hnrpllthunder mice to a test battery with relevance for a range of psychiatric illnesses. Thunder mice showed enhanced immobility in the tail-suspension test for depression-related behaviours, impaired short-term spatial memory in the Y-maze and reduced …

Correlation Between Concentrations Of Four Heavy Metals In Cord Blood And Childhood Blood Of Jamaican Children, Mohammad H Rahbar, Maureen Samms-Vaughan, Manouchehr Hessabi, Jan Bressler, Shezeen Gillani, Megan L Grove, Sydonnie Shakspeare-Pellington, Katherine A Loveland

Faculty, Staff and Student Publications

This study investigated whether the concentrations of four metals [lead (Pb), mercury (Hg), manganese (Mn), and aluminum (Al)] are correlated in cord blood and childhood blood samples from Jamaican children. Cord blood samples were obtained from 21 pregnant women enrolled in the second Jamaican Birth Cohort Study from July 1, 2011 to September 30, 2011, and blood samples were drawn from their children who participated in a follow up study when the children were 4–8 years old. Correlations were assessed by the Pearson or the Spearman’s rank correlation coefficient. The mean ages of children at the childhood visit and their …

Endmt Regulation By Small Rnas In Diabetes-Associated Fibrotic Conditions: Potential Link With Oxidative Stress, Roberta Giordo, Yusra M A Ahmed, Hilda Allam, Salah Abusnana, Lucia Pappalardo, Gheyath K Nasrallah, Arduino Aleksander Mangoni, Gianfranco Pintus

Faculty, Staff and Student Publications

Diabetes-associated complications, such as retinopathy, nephropathy, cardiomyopathy, and atherosclerosis, the main consequences of long-term hyperglycemia, often lead to organ dysfunction, disability, and increased mortality. A common denominator of these complications is the myofibroblast-driven excessive deposition of extracellular matrix proteins. Although fibroblast appears to be the primary source of myofibroblasts, other cells, including endothelial cells, can generate myofibroblasts through a process known as endothelial to mesenchymal transition (EndMT). During EndMT, endothelial cells lose their typical phenotype to acquire mesenchymal features, characterized by the development of invasive and migratory abilities as well as the expression of typical mesenchymal products such as α-smooth …

History Repeats Itself: Horse Originated Hyperimmune Sera Production Against Sars Cov-2, Ahu Pakdemi̇rli̇, Elvi̇n Çalişkan, Sabri̇ Hacioğlu, Erdem Danyer, Özlem Kardoğan, Züleyha Ergün Kurt, Özcan Yildirim, Hakan Taşkaya, Bora Ündar, Yasemi̇n Sezgi̇n, Gencay Ergi̇n, Hi̇mmet Eki̇ci̇, Ufuk Ülker, Erkan Taçbaş, Şahi̇n Çakir

Turkish Journal of Medical Sciences

Background/aim: SARS-CoV-2 disease was announced as a pandemic by The World Health Organization in early 2020. It is still threatening the world population. Here, we aimed to produce hyperimmune sera that contain immunoglobulin G and F(ab')2 fragments sourced from horse antibodies as an urgent response to the pandemic. Materials and methods: SARS-CoV-2 was produced and inactivated with three different methods [formaldehyde (FA), formaldehyde, and binary ethylene amine (FA + BEI), and heat treatment]. After in vitro inactivation control, immunogens were mixed with Freund's adjuvant, thereafter horses (n: 2 for FA, 4 for FA + BEI, 2 for heat inactivation) and …

Association Of Physical Frailty With Cognitive Function And Mood In Older Adults Without Dementia And Depression, Rana Tuna Doğrul, Hacer Doğan Varan, Muhammet Cemal Kizilarslanoğlu, Mustafa Kemal Kiliç, Özgür Kara, Güneş Arik, Meltem Gülhan Hali̇l, Mustafa Cankurtaran, Burcu Balam Doğu

Turkish Journal of Medical Sciences

Background/aim: Physical frailty is thought to be related with a decline in cognitive function, mood, and social activities, especially in patients with depression and dementia. It is not clear whether or not physical frailty is associated with an impairment in cognitive function and mood in patients without dementia and depression. In this study, we evaluated the association of physical frailty with cognitive function and mood in geriatric patients without dementia and depression. Material and methods: In this study, 612 patients aged 65 years and over were evaluated. Physical frailty was assessed by using Fried criteria. Furthermore, comprehensive geriatric assessment was …

A Novel Marker Of Systemic Inflammation In Psoriasis And Related Comorbidities: Chitotriosidase, Bi̇lal İlanbey, Ömer Faruk Elmas, Eser Yildirim Sözmen, Ümran Günay, Abdullah Demi̇rbaş, Mustafa Atasoy, Ümi̇t Türsen, Torello Lotti̇

Turkish Journal of Medical Sciences

Background/aim: Chitotriosidase (ChT) is an enzyme secreted by activated macrophages and neutrophils in response to proinflammatory signals. There is growing evidence indicating that ChT activity reflects the systemic inflammatory status. This study aimed to investigate whether serum ChT activity increased in patients with psoriasis and related comorbidities. Materials and methods: This cross-sectional study included 53 (28 with associated comorbidities and 25 without comorbidities) patients with psoriasis and 52 healthy volunteers. All participants underwent laboratory investigations for serum ChT levels, complete blood count, erythrocyte sedimentation rate, C-reactive protein, and serum lipid levels. Results: The patients with psoriasis showed significantly higher levels …

Non-Adherence To Colchicine Treatment Is A Common Misevaluation In Familialmediterranean Fever, Emre Tekgöz, Seda Çolak, Fatma İlknur Çinar, Sedat Yilmaz, Muhammet Çinar

Turkish Journal of Medical Sciences

Background/aim: Familial Mediterranean fever (FMF) is a hereditary autoinflammatory disease that requires lifelong colchicine treatment. Colchicine is the mainstay of the treatment, which decreases the frequency and the severity of recurrent FMF attacks and prevents the development of amyloidosis. This study aimed to investigate the rates of colchicine treatment adherence in patients with FMF and the factors related to treatment non-adherence. Materials and methods: This observational study was conducted with 179 patients with FMF between November 2018 and April 2019 in a tertiary rheumatology outpatient clinic. The sociodemographic and clinical data were recorded. Compliance Questionnaire on Rheumatology (CQR) was used …

Evaluation Of Serum Neutrophil Gelatinase-Associated Lipocalin (Ngal), Asymmetricdimethylarginine (Adma) And Symmetric Dimethylarginine (Sdma) Levels, And Theirrelations With Disease Type And Activity In Inflammatory Bowel Diseases, Hüseyi̇n Korkmaz, Mehmet Asil, Tuncer Temel, Bahadir Öztürk, Levent Kebapcilar

Turkish Journal of Medical Sciences

Background/aim: Inflammatory bowel disease (IBD) mainly encompass two entities called ulcerative colitis (UC) and Crohn's disease (CD), both of which are chronic, progressive and, inflammatory conditions of the gastrointestinal tract. Various indicators and noninvasive markers have been sought and used in IBD patients to help assessing disease activity and treatment effectiveness although none of them are proven to yield definite results in full correlation with the clinical, endoscopic, and histopathological examinations. The aim of the current study was to investigate the relationship of serum neutrophil gelatinase-associated lipocalin (NGAL), asymmetric dimethylarginine (ADMA), and symmetric dimethylarginine (SDMA) levels with disease type and …

Cross-Cultural Adaptation, Reliability, And Validity Of The Turkish Version Of The Obesityspecific Quality Of Life Questionnaire: Quality Of Life, Obesity, And Dietetics (Qolod)Rating Scale, Ni̇metcan Mehmet Yağma, Egemen Ünal, Mehmet Enes Gökler, Sali̇h Mollahali̇loğlu

Turkish Journal of Medical Sciences

Background/aim: Obesity is one of the main public health issues in many countries including Turkey. The aim of the study is to test cross-cultural adaptation, reliability, and validity of QOLOD rating scale in the Turkish language. Materials and methods: This methodological study was conducted among the overweight and obesity people between February-March, 2018 in Ankara Atatürk Training and Research Hospital. The data was collected through self-report and face to face interviews. The QOLOD rating scale has 36 items, a 5-point Likert scale (1-5) is used for each question. Results: In the study, of the 180 participants, 101 (56.1%) were female, …

Assessment Of Fragmented Qrs Formation And Its Relationship With Left Ventricularhypertrophy In Nonhypertensive Acromegaly Patients, Muhammet Dural, Göknur Yorulmaz, Eli̇f Sevi̇l Alagüney, Kadi̇r Uğur Mert, Ezgi̇ Çamli, Ahmet Toygar Kalkan, Aysen Akalin, Medi̇ne Nur Kebapçi, Ahmet Serdar Yilmaz, Selda Murat, Fatma Belgi̇n Efe

Turkish Journal of Medical Sciences

Background/aim: It is known that the presence of fragmented QRS (fQRS) on electrocardiography (ECG) is associated with cardiovascular events. The aim of this study was the evaluation of fQRS formation and its relationship with the left ventricular hypertrophy (LVH) parameters in acromegaly patients. Materials and methods: In total, 47 previously diagnosed with non-hypertensive acromegaly patients and 48 control subjects were included in the study. ECG and transthoracic echocardiography (TTE) were performed for each participant. Acromegaly patients were divided into two groups according to the fQRS formation on the ECG. Left ventricular wall thicknesses, and left atrial diameter (LAD), left ventricular …

Quantitative Analysis Of Distal Femoral Epiphysis Blood Supply In Healthy Infants Withsuperb Microvascular Imaging: A Pilot Study, Emi̇ne Çalişkan, Muhammed Samed Cansiz, Hati̇ce Ariöz Habi̇bi̇, Mehmet Öztürk

Turkish Journal of Medical Sciences

Background/aim: This study aimed to determine the blood supply of the distal femoral epiphysis (DFE) using superb microvascular imaging in newborns and infants, and to investigate the correlation with ossification center (OC) length, sex, and age. Materials and methods: A total of 140 cases were evaluated in this study. The cases were divided into 2 groups of less than 90 days and over 90 days. Cartilage blood supply was measured with vascularity index (%) (VI). Results: The mean OC length and median VI values were measured as 10.20 ± 3.72 mm and 0.80% (0.58-1.50) for boys and 10.03 ± 3.36 …

1,25-Dihydroxyvitamin D3 Regulates T Helper And B Lymphocyte Responsessubstantially In Drug-Naive Primary Sjögren's Syndrome Patients' Mononuclear Cells, Deni̇z Genç, Merve Sezer Kürkçü, Burcu Günaydin, Emi̇ne Fi̇gen Tarhan

Turkish Journal of Medical Sciences

Background/aim: A correlation between vitamin D deficiency and primary Sjögren's syndrome (pSS) has already been described. The limited data has been reported regarding the pathological relevance of vitamin D in primary Sjögren's syndrome. In this study, the peripheral blood mononuclear cells were cocultured with 1,25-dihydroxyvitamin D3 to determine the modulatory effect of vitamin D3 on T and B lymphocyte phenotypes in pSS. Materials and methods: Venous blood samples were collected from 11 patients in the treatment phase and 9 drug-naive pSS patients. Peripheral blood mononuclear cells (PBMC) were isolated and separately cultured in the presence and absence of 1,25- dihydroxyvitamin …

The Effects Of Vitamin D Supplemantation On Prognosis In Patients With Mildobstructive Sleep Apnea Syndrome, Feri̇de Ayyildiz, Hi̇lal Yildiran, Nigar Afandiyeva, Özlem Gülbahar, Oğuz Köktürk

Turkish Journal of Medical Sciences

Background/aim: The aim of this study was to investigate the effect of vitamin D on the disease prognosis and biochemical parameters in patients with mild obstructive sleep apnea syndrome (OSAS). Materials and methods: Nineteen adult male individuals (18-65 years) who were diagnosed with mild OSAS after polysomnography and had low vitamin D levels were included in the study. Each week, patients took 50.000 IU Vitamin D3 supplementation for 8 weeks. Polysomnography, biochemical parameters FBG (fasting blood glucose), lipid profile (TG, TC, LDL-C, HDL-C, VLDL-C), calcium, phosphorus, parathormone, calcitonin, serum 25(OH)D, insulin, CRP, TNF-α, IL-6, and IL-10 of patients were evaluated …

Serum Antiganglioside Antibodies In Patients With Autoimmune Limbic Encephalitis, Ayla Çulha Oktar, Özlem Selçuk, Cansu Tunç, Şenol Işildak, Eli̇f Şanli, Vuslat Yilmaz, Bi̇rgül Baştan Tüzün, Murat Kürtüncü, Ayşe Özlem Çokar, Erdem Tüzün

Turkish Journal of Medical Sciences

Background/aim: Ganglioside antibodies are identified not only in patients with inflammatory neuropathies but also several central nervous system disorders and paraneoplastic neuropathies. Our aim was to investigate whether ganglioside antibodies are found in autoimmune encephalitis patients and may function as a diagnostic and prognostic biomarker. Materials and methods: Sera and cerebrospinal fluid (CSF) samples of 33 patients fulfilling the criteria for probable autoimmune encephalitis were collected within the first week of clinical manifestation. None of the patients had evident symptoms and findings of peripheral polyneuropathy. Well-characterized antineuronal and paraneoplastic antibodies were investigated in sera and CSF and antiganglioside (antiGM1, GM2, …

Mefv Mutation Frequencies In A Turkish Cohort With Low Prevalence Of Familialmediterranean Fever, Necati̇ Çakir, Hülya Azakli, Duran Üstek, Ömer Uysal, Eren Gözke

Turkish Journal of Medical Sciences

Background/aim: Familial Mediterranean fever (FMF) is a genetically recessive autoinflammatory disease caused by mutations in the Mediterranean fever (MEFV) gene. The aim of this study was to investigate the frequencies of the most common MEFV mutations among a sample of healthy individuals from the Havsa population of European Turkey, where FMF is less prevalent compared to Asian Turkey. Materials and methods: The study group consisted of 263 unrelated healthy adults. All of the participants were analyzed for the M694V, V726A, M680I, and E148Q mutations in the MEFV gene. Results: In total, 25 of the 263 individuals carried MEFV mutations (9.5%). …

Country-Based Report: The Safety Of Omalizumab Treatment In Pregnant Patients Withasthma, Bi̇lun Gemi̇ci̇oğlu, Arzu Di̇dem Yalçin, Yavuz Havlucu, Gül Karakaya, Levent Özdemi̇r, Meti̇n Keren, Sevi̇m Bavbek, Dane Edi̇ger, İpek Kivilcim Oğuzülgen, Zeynep Ferhan Özşeker, Ayşe Arzu Yorgancioğlu

Turkish Journal of Medical Sciences

Background/aim: We aimed to report outcomes of pregnant patients with asthma under omalizumab treatment and their infants in our country. Materials and methods: Patients with asthma who received omalizumab for at least 6 months and at least one dose during their pregnancy were retrospectively evaluated using a questionnaire regarding their disease and therapy and the health of their infants. Results: Twenty pregnant patients and their 23 infant's data were analyzed. The mean delivery age was 31.8 ± 7.4 years. They received omalizumab for 28.9 ± 21.8 months. Eight (36.4%) patients showed exacerbation of the disease during pregnancy. Forced expiratory volume …

Risk Of Autism Spectrum Disorder In Children With A History Of Hospitalization Forneonatal Jaundice, Gaffari̇ Tunç, Ayla Uzun Çi̇çek, Fati̇h Kiliçbay

Turkish Journal of Medical Sciences

Background/aim: Limited research has focused explicitly on the association between neonatal jaundice and autism spectrum disorder (ASD), and inconclusive evidence exists in the literature within this framework. This study aimed specifically to investigate whether neonatal jaundice is a potential risk factor for ASD and whether there is a connection between the types of neonatal jaundice and the severity of ASD. Materials and method: This study involved 119 children with ASD [90 males (75.6%), 29 females (24.4%), mean age: 45.39 ± 11.29 months] and 133 healthy controls [100 males (75.2%), 33 females (24.8%), mean age: 46.92 ± 11.42 months]. Psychiatric disorders …

Relationship Between C-Reactive Protein To Albumin Ratio And Coronary Artery Calciumscore And Cad-Rads Scores With Coronary Computed Tomography Angiography, Mehmet Aki̇f Erdöl, Kadri̇ye Gayretli̇ Yayla

Turkish Journal of Medical Sciences

Background/aim: C-reactive protein (CRP) to albumin ratio (CAR) is predictive marker of systemic inflammatory state in atherosclerotic coronary diseases when compared to predictive value of these two markers separately. We aimed to evaluate the relationship between CAR and the coronary artery calcium (CAC) score, Coronary Artery Disease-Reporting and Data System (CAD-RADS) score in patients' unknown diagnosis of coronary artery disease (CAD) underwent coronary CTA (Computed Tomography Angiography) and were classified by CAD-RADS scores. Materials and methods: A total of 187 patients consecutively referred for the evaluation of their chest pain underwent coronary CTA were included retrospectively. Results: CRP, CAR, and …

The Role Of Circadian Rhythm In The Regulation Of Cellular Protein Profiles In The Brain, Mustafa Caglar Beker, Ertuğrul Kiliç

Turkish Journal of Medical Sciences

Background/aim: Circadian rhythm plays a significant role in the regulation of almost all kinds of physiological processes. In addition, it may also have a direct or indirect effect on the neurodegenerative processes, including Alzheimer's disease, Parkinson's disease, and ischemic stroke. Therefore, the identification of circadian rhythm-related proteins is crucial to be able to understand the molecular mechanism of the circadian rhythm and to define new therapeutic target for the treatment of degenerative disorders. Materials and methods: To identify the light and dark regulated proteins, 8-12 weeks, male Balb/C mice were used at two different time points (morning (Zeitgeber time-0 (ZT0)) …

The Protective Effect Of Boric Acid On Cholestatic Rat Liver Ischemia Reperfusion Injury, Serkan Güler, Ari̇f Aslaner, Hami̇t Yaşar Elli̇dağ, Şenay Yildirim, Tuğrul Çakir

Turkish Journal of Medical Sciences

Background/aim: To evaluate the potential protective effects of boric acid (BA) in experimental cholestatic liver ischemia reperfusion (IR) injury model. Materials and methods: The study included 24 female rats which were divided into 3 groups each containing 8 rats. The control group (Group 1) only received laparotomy. In the IR group (Group 2) biliary tract ligation was applied and 1 week later 45 min ischemia and 1 h reperfusion with relaparotomy without any treatment was implemented. In the treatment BA+IR group (Group 3). 1 week after the biliary ligation intraperitoneal administration of 200 mg/kg BA was given 10 min before …

What Is The Restorative Effect Of Vegf Inhibitor Bevacuzimab Against Subarachnoidhemorrhage In An Experimental Model?, Adnan Yalçin Demi̇rci̇, Yahya Güvenç, Ersi̇n Özeren, Çeti̇n Akyol, Pinar Bayram, Deni̇z Bi̇llur, Sevi̇m Aydin, Hakan Seçki̇n, Kazim Yi̇ği̇tkanli

Turkish Journal of Medical Sciences

Background/aim: This study investigated the effect of vascular endothelial growth factor (VEGF) inhibitor bevacuzimab (BVZ) on the rabbit basilar artery using an experimental subarachnoid hemorrhage (SAH) model. Materials and methods: Eighteen adult male New-Zealand white rabbits were randomly divided into three groups: a control group (n = 6), SAH group (n = 6), and SAH+BVZ group (n = 6). Experimental SAH was created by injecting autologous arterial blood into the cisterna magna. In the treatment group, the subjects were administered a daily dose of 10 mg/kg, intravenous BVZ for 2 days after the SAH. Basilar artery diameters were measured with …

Antiinflammatory Effects Of Adalimumab, Tocilizumab, And Steroid Onlipopolysaccharide-Induced Lung Injury, Nurhan Sarioğlu, Fatma Bahar Sunay, Arzu Hanim Yay, Oğuzhan Korkut, Fuat Erel, Adnan Adi̇l Hi̇şmi̇oğullari, Mehmet Köse, Betül Yalçin

Turkish Journal of Medical Sciences

Background/aim: Acute lung injury (ALI) is a major cause of death in the intensive care unit. Lipopolysaccharide (LPS) induced lung injury is the most widely used experimental ALI model and provides opportunities for new targeting therapy. In this study, we investigated the effects of tocilizumab, adalimumab, and methylprednisolone in LPS-induced acute lung injury. Materials and methods: Lung injury was established by intratracheal instillation of LPS. The rats were randomly divided into six groups: LPS, control, and treatment groups (adalimumab, tocilizumab, methylprednisolone, adalimumab + tocilizumab). Bronchoalveolar lavage (BAL) and lung tissues were collected at 48 h and 96 h following LPS …

An Immunohistochemical Examination Of Cinnamon Extract Administration Ondistribution Of Ngf (Nerve Growth Factor) And Trk-A (Tyrosine Kinase-A) Receptor Fordiabetic Rats With Pancreatic Tissue, Şükran Yedi̇el Aras, Ebru Karadağ Sari

Turkish Journal of Medical Sciences

Background/aim: The aim of this study was to investigate the administration of cinnamon extract that is known to be effective in decreasing the high blood glucose and the distribution of NGF and Trk-A receptor in pancreas with immunohistochemistry way. Materials and methods: The experimental groups were defined as control, sham, cinnamon, diabetes, and diabetes-cinnamon. At the end of the experiment, the pancreatic tissue samples were obtained for the rats. The hematoxylin-eosin and triple staining were used to examine histology. The immunohistochemical methods were performed on the sections of pancreatic tissue. In all groups, the body weight and fasting blood glucose …

The Protective Effects Of Anakinra In A Neonatal Rat Model Of Necrotizing Enterocolitis, Hati̇ce Güneş, Sevcan İpek, Sadik Yurttutan, Tuncay Kuloğlu, Fatma İnanç Tolun, Ülkü Kazanci, Adem Doğaner

Turkish Journal of Medical Sciences

Background/aim: Necrotizing enterocolitis (NEC) is a commonly seen life-threatening condition in newborns characterized by ischemic necrosis. This study aimed to investigate anakinra's effects, an interleukin-1 receptor antagonist, on oxidative stress, inflammation, and tissue necrosis in an NEC rat model. Materials and methods: Forty Wistar albino pups were divided into four groups randomly as follows; group 1, control group; group 2, anakinra-treated control group; group 3, NEC group; and group 4, NEC and anakinra treatment group. The rats were given hyperosmolar formula feeding, and they were exposed to hypoxia after cold stress at +4 °C and oxygen in order to create …