Open Access. Powered by Scholars. Published by Universities.®
- Discipline
-
- Biochemistry, Biophysics, and Structural Biology (62)
- Biochemistry (54)
- Medicine and Health Sciences (35)
- Biology (31)
- Other Biochemistry, Biophysics, and Structural Biology (31)
-
- Physical Sciences and Mathematics (27)
- Cell and Developmental Biology (26)
- Engineering (26)
- Genetics and Genomics (25)
- Microbiology (19)
- Biomedical Engineering and Bioengineering (18)
- Molecular Biology (18)
- Molecular Genetics (18)
- Cell Biology (17)
- Genetics (16)
- Bioinformatics (12)
- Medical Sciences (12)
- Medical Specialties (12)
- Physics (11)
- Molecular, Cellular, and Tissue Engineering (10)
- Plant Sciences (10)
- Chemicals and Drugs (8)
- Chemistry (8)
- Cancer Biology (7)
- Ecology and Evolutionary Biology (7)
- Food Science (7)
- Integrative Biology (7)
- Physiology (7)
- Institution
-
- Universiti Brunei Darussalam (68)
- University of Nebraska - Lincoln (34)
- Chulalongkorn University (15)
- University of Dayton (7)
- University of Texas Rio Grande Valley (7)
-
- American University in Cairo (6)
- Clemson University (6)
- Munster Technological University (6)
- Universitas Indonesia (6)
- University of the Philippines Los Baños (6)
- University of Kentucky (5)
- University of Texas at Tyler (5)
- West Virginia University (4)
- City University of New York (CUNY) (3)
- Claremont Colleges (3)
- Purdue University (3)
- Technological University Dublin (3)
- Universitas Padjadjaran (3)
- University of the Pacific (3)
- Calvin University (2)
- Chinese Academy of Sciences (2)
- Kennesaw State University (2)
- Michigan Technological University (2)
- Old Dominion University (2)
- Salve Regina University (2)
- The Texas Medical Center Library (2)
- United Arab Emirates University (2)
- University of Arkansas, Fayetteville (2)
- University of Louisville (2)
- Western Kentucky University (2)
- Keyword
-
- Biotechnology (3)
- CRISPR-Cas9 (3)
- Photosynthesis (3)
- Wound healing (3)
- Abiotic stress (2)
-
- Antioxidant (2)
- Apoptosis (2)
- Arabidopsis thaliana (2)
- Biochemistry (2)
- Biocontrol (2)
- Biology (2)
- Biomaterials (2)
- Biomechanics (2)
- CRISPR (2)
- Callery pear (2)
- Cancer (2)
- Caspase-3 (2)
- Cell Culture (2)
- Drought (2)
- Expression analysis (2)
- Gene Editing (2)
- Genetics (2)
- Hydrogel (2)
- Hydroponics (2)
- Macrophages (2)
- Metabolomics (2)
- Microfluidics (2)
- Nanotechnology (2)
- Necroptosis (2)
- Pancreatic cancer (2)
- Publication
-
- ASEAN Journal on Science and Technology for Development (68)
- Department of Biochemistry: Faculty Publications (30)
- Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD) (15)
- Biology Faculty Publications (8)
- Theses and Dissertations (7)
-
- The Philippine Agricultural Scientist (6)
- All Dissertations (5)
- Biotechnology Theses (5)
- Makara Journal of Science (5)
- Research Symposium (5)
- Graduate Theses, Dissertations, and Problem Reports (ETD) (4)
- Nebraska Center for Biotechnology: Faculty and Staff Publications (4)
- Articles (3)
- Graduate Industrial Research Symposium (3)
- Jurnal Kultivasi (3)
- Markey Cancer Center Faculty Publications (3)
- ORBioM (Open Research BioSciences Meeting) (3)
- Publications (3)
- Bulletin of Chinese Academy of Sciences (Chinese Version) (2)
- College of Arts & Sciences Senior Theses (2)
- Dissertations, Master's Theses and Master's Reports (2)
- Dissertations, Theses, and Capstone Projects (2)
- Electronic Theses and Dissertations (2)
- Honors Theses (2)
- Hydroponic Center (2)
- Journal of Bioresource Management (2)
- KGI Theses and Dissertations (2)
- Pacific Undergraduate Research and Creativity Conference (PURCC) (2)
- Summer Research (2)
- Theses (2)
- Publication Type
- File Type
Articles 211 - 240 of 254
Full-Text Articles in Biotechnology
Ecological Risk Assessment Of Transgenic Conditional Lethality Systems For Genetic Biocontrol Strategies, Fernan Rodrigo Perez-Galvez
Ecological Risk Assessment Of Transgenic Conditional Lethality Systems For Genetic Biocontrol Strategies, Fernan Rodrigo Perez-Galvez
Theses and Dissertations--Entomology
Genetic strategies of insect pest control are receiving increased interest due to recent advances in genetic engineering. By introducing alleles that make males functionally sterile, genetically modified (GM) insects can be used in area-wide pest management programs similar to the Sterile Insect Technique (SIT). Genetic control strategies carry several potential benefits, including improved efficacy and specificity, lower operation costs, and reduced dependence on chemical insecticides, but their use is still controversial despite extensive technical documentation indicating their innocuity to humans and the environment. This hesitation is likely due to the novel nature of the approach.
While the first field applications …
Elucidation Of The Role Of Agouti-Signaling Protein Throughout Folliculogenesis And Early Embryonic Development In Cattle, Heather L. Chaney
Elucidation Of The Role Of Agouti-Signaling Protein Throughout Folliculogenesis And Early Embryonic Development In Cattle, Heather L. Chaney
Graduate Theses, Dissertations, and Problem Reports (ETD)
The oocyte expresses certain genes during folliculogenesis to regulate the acquisition of oocyte competence. Oocyte competence, which refers to the presence of imperative molecular factors in the oocyte that are critical for high oocyte quality, is directly related to the ability of the oocyte to result in a successful pregnancy following fertilization. Over the past few decades, the development and optimization of assisted reproductive technologies, particularly in vitrofertilization, have enabled the beef and dairy industries to advance cattle genetics and productivity. However, only approximately 40% of bovine embryos will develop to the blastocyst stage in vitro. In addition, bovine embryos …
Exploring Ph Gradient Phenomena In Non-Linear Electrokinetic Microfluidic Devices, Azade Tahmasebi
Exploring Ph Gradient Phenomena In Non-Linear Electrokinetic Microfluidic Devices, Azade Tahmasebi
Dissertations, Master's Theses and Master's Reports
Electrokinetic microfluidics is a versatile technology utilized within lab on a chip (LOC) devices for diagnostic and analytical applications; advantages include reduced resource demands, flexibility, and simplicity of use. Dielectrophoresis (DEP) is a precision nonlinear electrokinetic tool utilized within microfluidic microdevices to induce polarization and control bioparticle motions for applications that range from hemoglobin separations to cancer cell isolation and detection. Despite promising results, undesired side phenomena can occur in electrokinetic systems which impede reproducibility and accuracy. These unfavorable phenomena have not been comprehensively explored in the literature. Prior preliminary research suggests the fundamental phenomena originate from microelectrodes utilized in …
การพัฒนาบล็อกคอนกรีตปูพื้นจากกากของเสียในกระบวนการเผาไหม้แบบฟลูอิไดซ์เบด, ณัฐวรรณ ดวงแก้ว
การพัฒนาบล็อกคอนกรีตปูพื้นจากกากของเสียในกระบวนการเผาไหม้แบบฟลูอิไดซ์เบด, ณัฐวรรณ ดวงแก้ว
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
งานวิจัยนี้ศึกษาการใช้ประโยชน์เถ้าลอย และทรายของเสีย (ขนาดละเอียดและหยาบ) จากกระบวนการเผาไหม้แบบฟลูอิไดซ์เบดเพื่อนำความร้อนมาใช้ในการอบแห้งในกระบวนการผลิตกระดาษ มาใช้เป็นวัตถุดิบในการเตรียมบล็อกคอนกรีต 2 ประเภทวัสดุ คือ คอนกรีตฐานปูนซีเมนต์ปอร์ตแลนด์ และคอนกรีตฐานจีโอพอลิเมอร์ สำหรับการเตรียมคอนกรีตฐานปูนซีเมนต์ปอร์ตแลนด์ ได้ศึกษาผลของการใช้เถ้าลอยทดแทนส่วนของปูนซีเมนต์ปอร์ตแลนด์ (วัสดุประสาน) และศึกษาอัตราส่วนของทรายของเสีย (มวลรวม) ต่อวัสดุประสาน ที่มีต่อสมบัติของคอนกรีต ขึ้นรูปด้วยวิธีการอัด บ่มชิ้นงานเป็นเวลา 1 7 และ 28 วัน พบว่าตัวอย่างที่มีเถ้าลอยทดแทนปูนซีเมนต์ปอร์ตแลนด์ร้อยละ 15 โดยน้ำหนักของวัสดุประสาน และมีอัตราส่วนของ มวลรวมต่อวัสดุประสาน เท่ากับ 1:1 โดยน้ำหนัก ที่อายุ 7 วัน มีค่ากำลังอัด 45 MPa เป็นไปตามมาตรฐาน มอก.827-2531 นอกจากนั้นยังได้นำส่วนผสมดังกล่าวมาเตรียมบล็อกประสานปูพื้นฐานปูนซีเมนต์ปอร์ตแลนด์ที่มีขนาดและรูปทรงตามมาตรฐานดังกล่าวด้วยเครื่องผลิตบล็อกคอนกรีต พบว่าสามารถเตรียมบล็อกประสานปูพื้นฐานปูนซีเมนต์ปอรต์แลนด์ที่มีเถ้าลอยทดแทนส่วนของปูนซีเมนต์ปอร์ตแลนด์ได้ ในส่วนของการศึกษาความเป็นไปได้ในการผลิตบล็อกฐานจีโอพอลิเมอร์เป็นการทดลองเตรียมจีโอพอลิเมอร์แบบส่วนเดียว โดยใช้เถ้าลอยร่วมกับสารแอลคาไลซึ่งประกอบด้วย โซเดียมซิลิเกตและโซเดียมไฮดรอกไซด์ (วัสดุประสาน) และผสมกับมวลรวมในสัดส่วนของวัสดุประสานต่อมวลรวมเท่ากับ 1:1 เช่นเดียวกับการเตรียมบล็อกคอนกรีตฐานซีเมนต์ ใช้อัตราส่วนผสมน้ำต่อวัสดุประสานเท่ากับ 0.31 ขึ้นรูปด้วยวิธีการอัด โดยศึกษาผลของสัดส่วนของเถ้าลอยต่อสารอัลคาไล และสัดส่วนของโซเดียมซิลิเกตต่อโซเดียมไฮดรอกไซด์ ที่มีต่อสมบัติของคอนกรีต พบว่าชิ้นงานที่ใช้เถ้าลอยร้อยละ 80 โดยน้ำหนักของวัสดุประสาน และใช้สารอัลคาไล (โซเดียมซิลิเกตต่อโซเดียมไฮดรอกไซด์เท่ากับ 60:40 โดยน้ำหนัก) ร้อยละ 20 โดยน้ำหนักของวัสดุประสาน ที่อายุ 28 วัน มีกำลังอัด 5.45 MPa ซึ่งเป็นค่าที่ต่ำกว่าค่าตามมาตรฐาน มอก.827-2531 จึงไม่สามารถใช้ทำบล็อกประสานปูพื้นได้ แต่ค่ากำลังอัดของบล็อกฐานจีโอพอลิเมอร์ก็สูงมากพอสำหรับผลิตบล็อกกลวงไม่รับน้ำหนักตาม มอก.58-2560
Generation Of Chimeric Rhinoviruses Presenting Sars-Cov-2 Broadly Neutralizing Epitopes And Their Antigenicity Characterization, Danish Ansari
Generation Of Chimeric Rhinoviruses Presenting Sars-Cov-2 Broadly Neutralizing Epitopes And Their Antigenicity Characterization, Danish Ansari
Biotechnology Theses
The global COVID pandemic is not yet fully under control as there were over 21 million new cases of SARS-CoV-2 infections and over 50,000 deaths globally as of January of 2022. A heavily mutated variant of concern, Omicron is responsible for most of these cases which demands an urgency for a new vaccine. NIH reports over 180 vaccine candidates that use various strategies currently in development. However, a recurring concern with these vaccines is that the continuous viral mutations decrease the efficacy of vaccines. Therefore, we proposed to construct a human rhinovirus (HRV) based chimeric virus containing highly conserved, broadly …
Deep Learning-Based Technique For The Perception Of The Cervical Cancer, Aya Haraz, Hossam El-Din Moustafa, Abeer Twakol Khaleel, Ahmed H. Eltanboly
Deep Learning-Based Technique For The Perception Of The Cervical Cancer, Aya Haraz, Hossam El-Din Moustafa, Abeer Twakol Khaleel, Ahmed H. Eltanboly
Mansoura Engineering Journal
In third-world countries, cervical cancer is the most prevalent and leading cause of death. It is affected by a variety of factors, including smoking, poor nutritional status, immunological inadequacy, and prolonged use of contraception. The Pap smear test, which is intended to prevent cervical cancer, finds preneoplastic changes in cervical epithelial cells. This study framework classified cervical cancer cells from Pap smears into five specified cell types using machine learning-based classification algorithms. The SIPaKMeD database is used in this investigation. This public dataset, which was manually cropped from 966 cluster cell images taken from Pap smear slides, has 4045 isolated …
The Use Of Dynamic Light Scattering To Determine Mineral Precipitation In Bacteria., Isabella Manning
The Use Of Dynamic Light Scattering To Determine Mineral Precipitation In Bacteria., Isabella Manning
Williams Honors College, Honors Research Projects
Particulate calcium carbonate (PCC) is an important filler in industrial products, including paints, which are obtained through mining and sintering (heating to 1,100°C), which is responsible for up to 2% of global emissions. A potential solution to reduce these emissions is the use of calcium carbonate produced by bacteria from atmospheric , through a process called microbially induced carbonate precipitation (MICP). One of the primary uses of PCCs is in paint, requiring them to be a specific size (~700nm). When we have been collecting samples of PCCs produced by bacteria, which demonstrate clumping, making them too large for use in …
Genome-Wide Investigation Of Snrk2 Gene Family In Two Jute Species: Corchorus Olitorius And Corchorus Capsularis, Borhan Ahmed, Fakhrul Hasan, Anika Tabassum, Rasel Ahmed, Rajnee Hassan, Ruhul Amin, Mobashwer Alam
Genome-Wide Investigation Of Snrk2 Gene Family In Two Jute Species: Corchorus Olitorius And Corchorus Capsularis, Borhan Ahmed, Fakhrul Hasan, Anika Tabassum, Rasel Ahmed, Rajnee Hassan, Ruhul Amin, Mobashwer Alam
Department of Biochemistry: Faculty Publications
Background Sucrose non-fermenting-1 (SNF1)-related protein kinase 2 (SnRK2), a plant-specifc serine/threonine kinase family, is associated with metabolic responses, including abscisic acid signaling under biotic and abiotic stresses. So far, no information on a genome-wide investigation and stress-mediated expression profling of jute SnRK2 is available. Recent whole-genome sequencing of two Corchorus species prompted to identify and characterize this SnRK2 gene family.
Result We identifed seven SnRK2 genes of each of Corchorus olitorius (Co) and C. capsularis (Cc) genomes, with similar physico-molecular properties and sub-group patterns of other models and related crops. In both species, the SnRK2 gene …
Oligogalactolipid Production During Cold Challenge Is Conserved In Early Diverging Lineages, Allison C. Barnes, Jennifer L. Myers, Samantha M. Surber, Zhikai Liang, Jeffrey P. Mower, James Schnable, Rebecca Roston
Oligogalactolipid Production During Cold Challenge Is Conserved In Early Diverging Lineages, Allison C. Barnes, Jennifer L. Myers, Samantha M. Surber, Zhikai Liang, Jeffrey P. Mower, James Schnable, Rebecca Roston
Department of Biochemistry: Faculty Publications
Oligogalactolipid production is a response to severe cold in many land plant lineages. It occurs during times of membrane damage and can be reproduced in multiple species by cytosolic acidification.
Severe cold, defined as a damaging cold beyond acclimation temperatures, has unique responses, but the signaling and evolution of these responses are not well understood. Production of oligogalactolipids, which is triggered by cytosolic acidification in Arabidopsis (Arabidopsis thaliana), contributes to survival in severe cold. Here, we investigated oligogalactolipid production in species from bryophytes to angiosperms. Production of oligogalactolipids differed within each clade, suggesting multiple evolutionary origins of severe …
A Facile Strategy For The Fabrication Of Cell-Laden Porous Alginate Hydrogels Based On Two-Phase Aqueous Emulsions, Wen Xue, Donghee Lee, Yunfan Kong, Mitchell Kuss, Ying Huang, Taesung Kim, Soonkyu Chung, Andrew T. Dudley, Seung-Hyun Ro, Bin Duan
A Facile Strategy For The Fabrication Of Cell-Laden Porous Alginate Hydrogels Based On Two-Phase Aqueous Emulsions, Wen Xue, Donghee Lee, Yunfan Kong, Mitchell Kuss, Ying Huang, Taesung Kim, Soonkyu Chung, Andrew T. Dudley, Seung-Hyun Ro, Bin Duan
Department of Biochemistry: Faculty Publications
Porous alginate (Alg) hydrogels possess many advantages as cell carriers. However, current pore generation methods require either complex or harsh fabrication processes, toxic components, or extra purification steps, limiting the feasibility and affecting the cellular survival and function. In this study, a simple and cell-friendly approach to generate highly porous cell-laden Alg hydrogels based on two-phase aqueous emulsions is reported. The pre-gel solutions, which contain two immiscible aqueous phases of Alg and caseinate (Cas), are cross-linked by calcium ions. The porous structure of the hydrogel construct is formed by subsequently removing the Cas phase from the ion-cross-linked Alg hydrogel. Those …
Structural Basis Of Dna Binding By The Whib-Like Transcription Factor Whib3 In Mycobacterium Tuberculosis, Tao Wan, Magdaléna Horová, Vimmy Khetrapal, Shanren Li, Camden Jones, Andrew Schacht, Xinghui Sun, Limei Zhang
Structural Basis Of Dna Binding By The Whib-Like Transcription Factor Whib3 In Mycobacterium Tuberculosis, Tao Wan, Magdaléna Horová, Vimmy Khetrapal, Shanren Li, Camden Jones, Andrew Schacht, Xinghui Sun, Limei Zhang
Department of Biochemistry: Faculty Publications
Mycobacterium tuberculosis (Mtb) WhiB3 is an iron–sulfur cluster-containing transcription factor belonging to a subclass of the WhiB-Like (Wbl) family that is widely distributed in the phylum Actinobacteria. WhiB3 plays a crucial role in the survival and pathogenesis of Mtb. It binds to the conserved region 4 of the principal sigma factor (σA4) in the RNA polymerase holoenzyme to regulate gene expression like other known Wbl proteins in Mtb. However, the structural basis of how WhiB3 coordinates with σA4 to bind DNA and regulate transcription is unclear. Here we determined crystal structures …
Akkermansia Muciniphila And Its Membrane Protein Ameliorates Intestinal Inflammatory Stress And Promotes Epithelial Wound Healing Via Crebh And Mir‑143/145, Henry Wade, Kaichao Pan, Qihua Duan, Szczepan Kaluzny, Ekta Pandey, Linda Fatumoju, Viswanathan Saraswathi, Rongxue Wu, Edward N. Harris, Qiaozhu Su
Akkermansia Muciniphila And Its Membrane Protein Ameliorates Intestinal Inflammatory Stress And Promotes Epithelial Wound Healing Via Crebh And Mir‑143/145, Henry Wade, Kaichao Pan, Qihua Duan, Szczepan Kaluzny, Ekta Pandey, Linda Fatumoju, Viswanathan Saraswathi, Rongxue Wu, Edward N. Harris, Qiaozhu Su
Department of Biochemistry: Faculty Publications
Background The intestinal epithelial barrier is the interface for interaction between gut microbiota and host metabolic systems. Akkermansia muciniphila (A. muciniphila) is a key player in the colonic microbiota that resides in the mucus layer, whose abundance is selectively decreased in the faecal microbiota of inflammatory bowel disease (IBD) patients. This study aims to investigate the regulatory mechanism among A. muciniphila, a transcription factor cAMPresponsive element-binding protein H (CREBH), and microRNA-143/145 (miR-143/145) in intestinal inflammatory stress, gut barrier integrity and epithelial regeneration.
Methods A novel mouse model with increased colonization of A muciniphila in the intestine of CREBH knockout …
Factors Influencing Instructors’ Adoption And Continued Use Of Computing Science Technologies: A Case Study In The Context Of Cell Collective, Changsoo Song, Resa M. Helikar, Wendy M. Smith, Tomáš Helikar
Factors Influencing Instructors’ Adoption And Continued Use Of Computing Science Technologies: A Case Study In The Context Of Cell Collective, Changsoo Song, Resa M. Helikar, Wendy M. Smith, Tomáš Helikar
Department of Biochemistry: Faculty Publications
Acquiring computational modeling and simulation skills has become ever more critical for students in life sciences courses at the secondary and tertiary levels. Many modeling and simulation tools have been created to help instructors nurture those skills in their classrooms. Understanding the factors that may motivate instructors to use such tools is crucial to improve students’ learning, especially for having authentic modeling and simulation learning experiences. This study designed and tested a decomposed technology acceptance model in which the perceived usefulness and perceived ease of use constructs are split between the teaching and learning sides of the technology to examine …
Conformal Electrodeposition Of Antimicrobial Hydrogels Formed By Self-Assembled Peptide Amphiphiles, Gervasio Zaldivar, Jiachen Feng, Leonardo Lizarraga, Yafan Yu, Luana De Campos, Kelly Mari Pires De Oliveira, Kurt Piepenbrink, Martin Conda-Sheridan, Mario Tagliazucchi
Conformal Electrodeposition Of Antimicrobial Hydrogels Formed By Self-Assembled Peptide Amphiphiles, Gervasio Zaldivar, Jiachen Feng, Leonardo Lizarraga, Yafan Yu, Luana De Campos, Kelly Mari Pires De Oliveira, Kurt Piepenbrink, Martin Conda-Sheridan, Mario Tagliazucchi
Department of Biochemistry: Faculty Publications
The colonization of biomedical surfaces by bacterial biofilms is concerning because these microorganisms display higher antimicrobial resistance in biofilms than in liquid cultures. Developing antimicrobial coatings that can be easily applied to medically-relevant complex-shaped objects, such as implants and surgical instruments, is an important and challenging research direction. This work reports the preparation of antibacterial surfaces via the electrodeposition of a conformal hydrogel of self-assembling cationic peptide-amphiphiles (PAs). Hydrogels of three PAs are electrodeposited: C16K2, C16K3, and C18K2, where Cn is an alkyl chain of n methylene …
Genetic Control Of Photoprotection And Photosystem Ii Operating Efficiency In Plants, Seema Sahay, Marcin Grzybowski, James Schnable, Katarzyna Głowacka
Genetic Control Of Photoprotection And Photosystem Ii Operating Efficiency In Plants, Seema Sahay, Marcin Grzybowski, James Schnable, Katarzyna Głowacka
Department of Biochemistry: Faculty Publications
• Photoprotection against excess light via nonphotochemical quenching (NPQ) is indispensable for plant survival. However, slow NPQ relaxation under low light conditions can decrease yield of field-grown crops up to 40%.
• Using semi-high-throughput assay, we quantified the kinetics of NPQ and photosystem II operating efficiency (ΦPSII) in a replicated field trial of more than 700 maize (Zea mays) genotypes across 2 yr. Parametrized kinetics data were used to conduct genome-wide association studies.
• For six candidate genes involved in NPQ and ΦPSII kinetics in maize the loss of function alleles of orthologous genes in Arabidopsis (Arabidopsis thaliana) …
Advancements In Computational Modelling Of Biological Systems: Seventh Annual Sysmod Meeting, Bhanwar Lal Puniya, Andreas Dräger
Advancements In Computational Modelling Of Biological Systems: Seventh Annual Sysmod Meeting, Bhanwar Lal Puniya, Andreas Dräger
Department of Biochemistry: Faculty Publications
The Computational Modelling of Systems Biology (SysMod) Community of Special Interest (COSI) convenes annually at the Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) conference to facilitate knowledge dissemination and exchange of research findings on systems modelling from interdisciplinary domains. The SysMod meeting 2022 was held in a hybrid mode in Madison, Wisconsin, spanning a 1-day duration centred on modelling techniques, applications, and single-cell technology implementations. The meeting showcased innovative approaches to modelling biological systems using cell-specific and multiscale modelling, multiomics data integration, and novel tools to develop systems models using single-cell and multiomics technology. The meeting also recognized outstanding research by …
Fusarium Graminearum Effector Fgnls1 Targets Plant Nuclei To Induce Wheat Head Blight, Guixia Hao, Todd A. Naumann, Hui Chen, Guihua Bai, Susan Mccormick, Hye-Seon Kim, Bin Tian, Harold N. Trick, Michael J. Naldrett, Robert Proctor
Fusarium Graminearum Effector Fgnls1 Targets Plant Nuclei To Induce Wheat Head Blight, Guixia Hao, Todd A. Naumann, Hui Chen, Guihua Bai, Susan Mccormick, Hye-Seon Kim, Bin Tian, Harold N. Trick, Michael J. Naldrett, Robert Proctor
Nebraska Center for Biotechnology: Faculty and Staff Publications
Fusarium head blight (FHB) caused by Fusarium graminearum is one of the most devastating diseases of wheat and barley worldwide. Effectors suppress host immunity and promote disease development. The genome of F. graminearum contains hundreds of effectors with unknown function. Therefore, investigations of the functions of these effectors will facilitate developing novel strategies to enhance wheat resistance to FHB. We characterized a F. graminearum effector, FgNls1, containing a signal peptide and multiple eukaryotic nuclear localization signals. A fusion protein of green fluorescent protein and FgNls1 accumulated in plant cell nucleiwhen transiently expressed in Nicotiana benthamiana. FgNls1 suppressed …
Bright Lights Swiss Chard Hydroponic Grow Guide, Jayla M. Anderson
Bright Lights Swiss Chard Hydroponic Grow Guide, Jayla M. Anderson
Hydroponic Center
This is a guide for growing Bright Lights variety of Swiss chard in the Hydroponic Lab. It states how the plant was grown from propagation, which system the plant was grown in, the plants optimal conditions (PPM, pH), time frame until fully grown, and average size of leaf.
Application Of Rule Learner Classifier For Studying Bioethanol Fuelled Spark Ignition Engine Out Emissions And Classification, D Y Dhande Mr., D P Gaikwad Mr, C S Choudhari
Application Of Rule Learner Classifier For Studying Bioethanol Fuelled Spark Ignition Engine Out Emissions And Classification, D Y Dhande Mr., D P Gaikwad Mr, C S Choudhari
ASEAN Journal on Science and Technology for Development
In this paper, preparation of ethanol from waste pomegranate fruit using fermentation and distillation method have discussed. The spark ignition engine out emissions were tested at various operating speeds using four different ethanol blends. Experimental results showed that the ethanol mixing in pure Gasoline increases quality of engine out emissions except Nitrogen Oxides. The 15% ethanol blend and 1500 rpm engine speed were found as optimal input values providing enhanced performance. Based on the experimental results, training datasets were prepared in which emission characteristics of engine were mapped with engine speed and ethanol combination with petrol. These datasets are used …
โปรตีนเข้มข้นจากโครงไก่: การเตรียมและการใช้ในผลิตภัณฑ์นักเก็ต, ชนากานต์ มณฑาทิพย์กุล
โปรตีนเข้มข้นจากโครงไก่: การเตรียมและการใช้ในผลิตภัณฑ์นักเก็ต, ชนากานต์ มณฑาทิพย์กุล
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
งานวิจัยนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษาภาวะที่เหมาะสมสำหรับการสกัดโปรตีนจากโครงไก่ เพื่อเตรียมโปรตีนเข้มข้นและนำมาศึกษาสมบัติทางเคมีกายภาพและสมบัติเชิงหน้าที่ของโปรตีนเข้มข้นจากโครงไก่และศึกษาผลของการเติมโปรตีนเข้มข้นต่อคุณภาพและเนื้อสัมผัสของผลิตภัณฑ์นักเก็ตไก่ ผลการศึกษาการสกัดโปรตีนด้วยสารละลายด่างที่ค่าความเป็นกรด-ด่าง 8.5 - 11.5 และระยะเวลาในการสกัด 30 - 300 นาที ด้วยวิธีพื้นผิวตอบสนองและการออกแบบการทดลองแบบส่วนผสมกลางพบว่าสมการการทำนายผลตอบสนองประสิทธิภาพในการผลิตโปรตีนเข้มข้นมีความเหมาะสมในการอธิบายความสัมพันธ์และทำนายค่าของตัวแปรอิสระให้มีความสัมพันธ์กับผลตอบสนองที่ต้องการ โดยค่าสัมประสิทธิ์การถดถอย (Regression coefficient) ของตัวแปรอิสระมีความสัมพันธ์กับประสิทธิภาพในการผลิตโปรตีนเข้มข้นในระบบฐานแห้ง (Dry basis) รวมถึงค่าสัมประสิทธิ์การตัดสินใจมีค่ามากกว่า 0.80 และมีค่า Root Mean Square Error (RMSE) ต่ำหมายความว่าค่าความแตกต่างเฉลี่ยกำลังสองระหว่างค่าที่ได้จากการทำนายกับค่าที่ได้จากการทดลองมีค่าต่ำ เมื่อพิจารณาค่า Adjusted r–Squared พบว่ามีค่าใกล้เคียงกับค่าสัมประสิทธิ์การตัดสินใจ การทำนายภาวะการสกัดโปรตีนจากโครงไก่จากการกำหนดเกณฑ์ของค่าประสิทธิภาพในการผลิตโปรตีนเข้มข้นสูงที่สุดพบว่าภาวะค่าความเป็นกรด-ด่างเท่ากับ 10.15 และระยะเวลาในการสกัดเท่ากับ 185 นาที เป็นภาวะที่เหมาะสมที่สุดสำหรับการสกัดโปรตีนจากโครงไก่ โดยค่าผลตอบสนองที่ได้จากการทำนายจากสมการมีความแตกต่างจากค่าที่ได้จากการทดลองเท่ากับ 12.67% เมื่อนำโปรตีนเข้มข้นที่ผลิตในภาวะที่เหมาะสมที่สุดมาทดสอบความสามารถในการอุ้มน้ำและค่าความสามารถในการเกิดอิมัลชันพบว่ายังมีความสามารถในการอุ้มน้ำต่ำกว่าเนื้อไก่ส่วนขาและส่วนอก (p < 0.05) จึงนำโปรตีนเข้มข้นมาพัฒนาสมบัติเชิงหน้าที่พบว่าการพัฒนาโปรตีนเข้มข้นด้วยกระบวนการปรับปรุงด้วยเกลือ ฟอสเฟตและความดันและการปรับปรุงด้วยเกลือ ฟอสเฟตและส่วนผสม (โปรตีนถั่วเหลืองไอโซเลท แป้งข้าวสาลี แป้งมันสำปะหลัง) และความดันส่งผลให้โปรตีนเข้มข้นมีความสามารถในการเกิดอิมัลชันและความสามารถในการคงตัวของอิมัลชันสูงกว่าโปรตีนเข้มข้นจากโครงไก่ที่ไม่ผ่านการปรับปรุงอยู่ในช่วงระหว่าง 6.03 - 12.27% และ 4.93 - 6.83% ตามลำดับ รวมถึงมีความสามารถในการละลายที่ดีกว่าเนื้อไก่ในช่วง pH เท่ากับ 6 - 7 เมื่อนำโปรตีนเข้มข้นเติมลงในผลิตภัณฑ์นักเก็ตไก่จะเห็นได้ว่าการเติมโปรตีนเข้มข้นที่สัดส่วนเท่ากับ 12.50% ส่งผลทำให้นักเก็ตไก่มีค่า Hardness, Gumminess และ Chewiness สูงกว่าสูตรปกติระหว่าง 3899.44 - 4324.59, 2676.22 - 3243.04 และ 2363.65 - 3011.87 g-force ในขณะที่ปริมาณโปรตีนและค่าสีของตัวอย่างนักเก็ตไม่มีความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญ (p ≥ 0.05) เมื่อเทียบกับสูตรควบคุม นอกจากนี้การใช้โปรตีนเข้มข้นมีส่งผลให้ประสิทธิภาพในการผลิตสูงกว่าสูตรปกติ โดยประสิทธิภาพในการผลิตของสูตรเติมโปรตีนเข้มข้นปรับปรุงด้วยเกลือ ฟอสเฟตและส่วนผสม (โปรตีนถั่วเหลืองไอโซเลท แป้งข้าวสาลี แป้งมันสำปะหลัง) และความดันมีค่าสูงที่สุดเท่ากับ 136.43% แต่อย่างไรก็ตามเมื่อพิจารณาจากต้นทุนในระดับ Commercial production scale พบว่าการเติมโปรตีนเข้มข้นด้วยกระบวนการปรับปรุงด้วยเกลือ ฟอสเฟตและความดันมีต้นทุนการผลิตต่ำที่สุด รวมถึงมีปริมาณโปรตีนและคุณภาพด้านสีไม่แตกต่างจากสูตรปกติ จึงเลือกโปรตีนเข้มข้นด้วยกระบวนการปรับปรุงด้วยเกลือ ฟอสเฟตและความดันเป็นกระบวนการปรับปรุงที่ดีที่สุด โดยในระยะเวลา 1 เดือนจะสามารถผลิตนักเก็ตไก่จากโปรตีนเข้มข้นได้ทั้งหมด 1250 กิโลกรัมและสามารถลดต้นทุนการผลิตได้ที่ 175 บาทต่อเดือน
Effects Of The Otx2ecr2 Enhancer & Prox1 Overexpression In Murine Retina Development, Erick J. Subillaga
Effects Of The Otx2ecr2 Enhancer & Prox1 Overexpression In Murine Retina Development, Erick J. Subillaga
Dissertations and Theses
There is a large subset of retinal progenitor cells that upregulate the OTX2 gene in the developing retina of the mouse. OTX2 is a homeobox transcription factor important for the development of photoreceptors and bipolar cells. If OTX2 is knocked out, photoreceptors and bipolar cells fail to differentiate. In order for OTX2 to be activated in certain retinal populations, it requires the activity of an enhancer called OTX2ECR2. Past studies demonstrated that retinal progenitor cells that had activity of OTX2ECR2 turned into horizontal cells, which require OTX2 for cell genesis and survival, and photoreceptors which require OTX2 for cell …
Analysis Of Biologically Effective Dose For Retroactive Yttrium-90 Trans-Arterial Radioembolization Treatment Optimization, Mj Lindsey
CMC Senior Theses
Trans-arterial radioembolization (TARE) is a protracted modality of radiation therapy where radionuclides labeled with Yttrium-90 (90Y) are inserted inside a patient's hepatic artery to treat hepatocellular carcinoma (HCC). While TARE has been shown to be a clinically effective and safe treatment, there is little understanding of the radiobiological relationship between absorbed dose and tissue response, and thus there is no dosimetric standard for treatment planning. The Biologically Effective Dose (BED) formalism, derived from the Linear-Quadratic model of radiobiology, is used to weigh the absorbed dose by the time pattern of delivery. BED is a virtual dose that can …
Integrative Big Transcriptomics Data Analysis Implicates Crucial Role Of Muc13 In Pancreatic Cancer, Anupam Dhasmana, Swati Dhasmana, Shivangi Agarwal, Sheema Khan, Shafiul Haque, Meena Jaggi, Murali M. Yallapu, Subhash C. Chauhan
Integrative Big Transcriptomics Data Analysis Implicates Crucial Role Of Muc13 In Pancreatic Cancer, Anupam Dhasmana, Swati Dhasmana, Shivangi Agarwal, Sheema Khan, Shafiul Haque, Meena Jaggi, Murali M. Yallapu, Subhash C. Chauhan
School of Medicine Publications
Big data analysis holds a considerable influence on several aspects of biomedical health science. It permits healthcare providers to gain insights from large and complex datasets, leading to improvements in the understanding, diagnosis, medication, and restraint of pathological conditions including cancer. The incidences of pancreatic cancer (PanCa) are sharply rising, and it will become the second leading cause of cancer related deaths by 2030. Various traditional biomarkers are currently in use but are not optimal in sensitivity and specificity. Herein, we determine the role of a new transmembrane glycoprotein, MUC13, as a potential biomarker of pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) …
Development Of A Chemical Biology Approach To Uncover The Influence Of Sequence Variations On Ces1 Activity In Live Cells, Samuel James Knebel
Development Of A Chemical Biology Approach To Uncover The Influence Of Sequence Variations On Ces1 Activity In Live Cells, Samuel James Knebel
Masters Theses
Drug metabolism is the biochemical process of modifying drugs to detoxify and remove them through enzymatic transformations. These biotransformation’s occur primarily in the liver and are critical to understanding how pharmaceutical compounds are chemically altered inside the human body. Human carboxylesterases (CESs) catalyze the hydrolysis of esters, amides, thioesters, and carbamates. CES-mediated hydrolysis plays an important role in the metabolism of many drugs including the first FDA approved antiviral treatment for COVID-19, remdesivir (Veklury), the seizure control medication rufinamide (Banzel), and the flu antiviral drug oseltamivir (Tamiflu). CES activity is known to be influenced by a variety of factors including …
Assessing The Biocatalytic Promiscuity Of Pep- Transformations For Geminal-Difluorination, Eloy Jose Torres Garcia
Assessing The Biocatalytic Promiscuity Of Pep- Transformations For Geminal-Difluorination, Eloy Jose Torres Garcia
Theses and Dissertations (Comprehensive)
Fluorine is the most electronegative chemical element and can drastically change molecular properties, such as drug pharmacokinetics and agrochemical half-life. Although a great deal of progress is occurring in synthetic methods to access various organofluorines, these methods struggle with harsh conditions and limited substrate scope. Biocatalytic approaches offer the potential to access organofluorines that are difficult or impossible with the current methodology. Phosphoenolpyruvate (PEP) is a central metabolite and biosynthetic precursor for diverse molecules. Phosphoenol pyruvate mutase (Ppm) catalyses the interconversion of Phosphonopyruvate (PnPy) to Phosphoenolpyruvate (PEP). This research successfully expressed and …
Long-Range Aceo Phenomena In Microfluidic Channel, Diganta Dutta, Keifer Smith, Xavier Palmer
Long-Range Aceo Phenomena In Microfluidic Channel, Diganta Dutta, Keifer Smith, Xavier Palmer
Electrical & Computer Engineering Faculty Publications
Microfluidic devices are increasingly utilized in numerous industries, including that of medicine, for their abilities to pump and mix fluid at a microscale. Within these devices, microchannels paired with microelectrodes enable the mixing and transportation of ionized fluid. The ionization process charges the microchannel and manipulates the fluid with an electric field. Although complex in operation at the microscale, microchannels within microfluidic devices are easy to produce and economical. This paper uses simulations to convey helpful insights into the analysis of electrokinetic microfluidic device phenomena. The simulations in this paper use the Navier–Stokes and Poisson Nernst–Planck equations solved using COMSOL …
Evidence For A Single, Ancient Origin Of A Genus-Wide Alternative Life History Strategy, Kalle Tunström, Alyssa Woronik, Joseph J. Hanly, Pasi Rastas, Anton Chichvarkhin, Andrew D. Warren, Akito Kawahara, Sean D. Schoville, Vincent Ficarrotta, Adam H. Porter, Ward B. Watt, Arnaud Martin, Christopher W. Wheat
Evidence For A Single, Ancient Origin Of A Genus-Wide Alternative Life History Strategy, Kalle Tunström, Alyssa Woronik, Joseph J. Hanly, Pasi Rastas, Anton Chichvarkhin, Andrew D. Warren, Akito Kawahara, Sean D. Schoville, Vincent Ficarrotta, Adam H. Porter, Ward B. Watt, Arnaud Martin, Christopher W. Wheat
Biology Faculty Publications
Understanding the evolutionary origins and factors maintaining alternative life history strategies (ALHS) within species is a major goal of evolutionary research. While alternative alleles causing discrete ALHS are expected to purge or fix over time, one-third of the ~90 species of Colias butterflies are polymorphic for a female-limited ALHS called Alba. Whether Alba arose once, evolved in parallel, or has been exchanged among taxa is currently unknown. Using comparative genome-wide association study (GWAS) and population genomic analyses, we placed the genetic basis of Alba in time-calibrated phylogenomic framework, revealing that Alba evolved once near the base of the genus and …
Antioxidant And Anticancer Activities Of Mushroom Phellinus Linteus And Khaao-Yen-Nuea Smilax Sp. Extract Mixture, Alvi Jauharotus Syukriya
Antioxidant And Anticancer Activities Of Mushroom Phellinus Linteus And Khaao-Yen-Nuea Smilax Sp. Extract Mixture, Alvi Jauharotus Syukriya
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
Recently, a number of alternative source including the bioactive compounds from plant and fungi are necessary to explore as therapeutic against cancer. This study aims to investigated the antioxidant and anticancer activities of Smilax sp. and Phellinus linteus (P. linteus) crude extract individually, also their mixture ratio variation including combination 1 (Smilax sp. 50%: P. linteus 50%), combination 2 (Smilax sp. 25%: P. linteus 75%), and combination 3 (Smilax sp. 75%: P. linteus 25%). The individually extract and its mixtures were investigated the physiochemical characterization such as total phenolic content and total polysaccharide compound. Furthermore, the antioxidant activities of extracted …
การพัฒนาระบบเซลล์สุริยะติดตั้งบนหลังคา เพื่อใช้งานในสายการผลิตยางคอมปาว์ด, อินทุอร ธรรมสอน
การพัฒนาระบบเซลล์สุริยะติดตั้งบนหลังคา เพื่อใช้งานในสายการผลิตยางคอมปาว์ด, อินทุอร ธรรมสอน
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
งานวิจัยนี้ได้ทำการศึกษา วิเคราะห์การใช้พลังงานของโรงงาน เพื่อออกแบบระบบเซลล์สุริยะบนหลังคา การกำหนดแผนงานติดตั้ง ศึกษาปัจจัยหลักที่ส่งผลกระทบต่อการผลิตไฟฟ้า และการประเมินประสิทธิภาพการใช้พลังงานไฟฟ้าจากเซลล์สุริยะจากการใช้งานเป็นแหล่งพลังงานสะอาดสำหรับกระบวนการผลิตยางคอมปาว์ด โดยออกแบบการใช้พลังงานไฟฟ้าให้เกิดประสิทธิภาพสูงสุดในอุตสาหกรรมผลิตยางคอมปาว์ด 2 โครงการ ระบบไฟฟ้าเซลล์สุริยะแบบออนกริดที่มีขนาดกำลังไฟฟ้าติดตั้งขนาด 865 กิโลวัตต์ และ 630 กิโลวัตต์ จากการศึกษาพบว่าทั้ง 2 โรงงานมีการใช้พลังงานไฟฟ้าในกระบวนการผลิตเป็นหลัก และความต้องการใช้พลังงานไฟฟ้าแปรผันตามยอดผลิตยางคอมปาว์ดร้อยละ 90 จากการวิเคราะห์ติดตามผลการใช้งานไฟฟ้าเซลล์สุริยะมีประสิทธิภาพต่ำกว่าร้อยละ 75 ในช่วงระยะ 5 เดือนหลัง เนื่องจากความต้องการใช้พลังงานไฟฟ้าของโรงงานลดลงและการจัดการโหลดการผลิตไม่เหมาะสมในช่วงกลางวัน และพบฝุ่นที่สะสมบนเซลล์สุริยะเป็น ผงคาร์บอน แคลเซียมคาร์บอนเนต และซิลิกาซึ่งเป็นส่วนผสมของการผลิตยางคอมปาว์ด จากการศึกษาพบว่า ฝุ่นจากกระบวนการผลิตส่งผลกระทบต่อการผลิตไฟฟ้าของเซลล์สุริยะร้อยละ 4 ดังนั้นระยะเวลาการล้างแผงเซลล์สุริยะของทั้ง 2 โครงการที่จุดสมดุลคือ ทุกๆ 3 เดือน จากการศึกษาข้อมูลการใช้ไฟฟ้าจากระบบเซลล์สุริยะนี้ชี้ให้เห็นว่า การผลิตไฟฟ้าของระบบเซลล์สุริยะแบบออนกริดนี้ มีปัจจัยหลักต่อการผลิตไฟฟ้าคือความต้องการใช้ไฟฟ้าของโรงงานเป็นหลัก เนื่องจากทั้ง 2 โรงงานมีการใช้ไฟฟ้าน้อยกว่ากำลังติดตั้งจึงทำให้เซลล์สุริยะผลิตไฟฟ้าน้อย แม้จะมีค่ารังสีดวงอาทิตย์สูงก็ตาม อย่างไรก็ตามระบบไฟฟ้าเซลล์สุริยะไม่สามารถจ่ายไฟฟ้าได้ตลอดเวลา ดังนั้นการบริหารจัดการโหลดการผลิตให้เหมาะสมจึงจำเป็นมาก เพื่อการใช้ไฟฟ้าจากเซลล์สุริยะให้มีประสิทธิภาพสูงสุด
Label-Free Electrochemical Immunosensor For Simultaneous Detection Of Norfloxacin And Enrofloxacin, Kittima Chomthong
Label-Free Electrochemical Immunosensor For Simultaneous Detection Of Norfloxacin And Enrofloxacin, Kittima Chomthong
Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)
Electrochemical immunosensors for the simultaneous detection of antibiotics have been of interest and have been reported previously. However, those methods still require difficult labeling for the reporting of electrochemical signals. This research aimed to develop a novel label-free electrochemical immunosensor with an origami paper-based analytical device (oPAD) for the simultaneous detection of quinolone antibiotics. Norfloxacin (Nor) and Enrofloxacin (Enr) are among the quinolone antibiotics, and they are used as models to study antibiotic detection. Nor and Enr antibodies were immobilized separately onto the functionalized oPAD. Thionine and ferrocenecarboxylic acid were coated onto the redox species area to detect Nor and …