Life Sciences Commons^™

Toward Collaborative Open Data Science In Metabolomics Using Jupyter Notebooks And Cloud Computing, Kevin M. Mendez, Leighton Pritchard, Stacey N. Reinke, David I. Broadhurst

Research outputs 2014 to 2021

Background

A lack of transparency and reporting standards in the scientific community has led to increasing and widespread concerns relating to reproduction and integrity of results. As an omics science, which generates vast amounts of data and relies heavily on data science for deriving biological meaning, metabolomics is highly vulnerable to irreproducibility. The metabolomics community has made substantial efforts to align with FAIR data standards by promoting open data formats, data repositories, online spectral libraries, and metabolite databases. Open data analysis platforms also exist; however, they tend to be inflexible and rely on the user to adequately report their methods …

Australian Vegetated Coastal Ecosystems As Global Hotspots For Climate Change Mitigation, Oscar Serrano, Catherine E. Lovelock, Trisha B. Atwood, Peter I. Macreadie, Robert Canto, Stuart Phinn, Ariane Arias-Ortiz, Le Bai, Jeff Baldock, Camila Bedulli, Paul Carnell, Rod M. Connolly, Paul Donaldson, Alba Esteban, Carolyn J. Ewers Lewis, Bradley D. Eyre, Matthew A. Hayes, Pierre Horwitz, Lindsay B. Hutley, Christopher R. J. Kavazos, Jeffrey J. Kelleway, Gary A. Kendrick, Kieryn Kilminster, Anna Lafratta, Shing Lee, Paul S. Lavery, Damien T. Maher, Núria Marbà, Pere Masque, Miguel A. Mateo, Richard Mount, Peter J. Ralph, Chris Roelfsema, Mohammad Rozaimi, Radhiyah Ruhon, Cristian Salinas, Jimena Samper-Villarreal, Jonathan Sanderman, Christian J. Sanders, Isaac Santos, Chris Sharples, Andrew D. L. Steven, Toni Cannard, Stacey M. Trevathan-Tackett, Carlos M. Duarte

Research outputs 2014 to 2021

Policies aiming to preserve vegetated coastal ecosystems (VCE; tidal marshes, mangroves and seagrasses) to mitigate greenhouse gas emissions require national assessments of blue carbon resources. Here, we present organic carbon (C) storage in VCE across Australian climate regions and estimate potential annual CO₂ emission benefits of VCE conservation and restoration. Australia contributes 5–11% of the C stored in VCE globally (70–185 Tg C in aboveground biomass, and 1,055–1,540 Tg C in the upper 1 m of soils). Potential CO₂ emissions from current VCE losses are estimated at 2.1–3.1 Tg CO₂-e yr^-1, increasing annual CO …

Variation In Sexual Dimorphism In A Wind-Pollinated Plant: The Influence Of Geographical Context And Life-Cycle Dynamics, Gemma Puixeu, Melinda Pickup, David L. Field, Spencer C. H. Barrett

Research outputs 2014 to 2021

Understanding the mechanisms causing phenotypic differences between females and males has long fascinated evolutionary biologists. An extensive literature exists on animal sexual dimorphism but less information is known about sex differences in plants, particularly the extent of geographical variation in sexual dimorphism and its life‐cycle dynamics.

Here, we investigated patterns of genetically based sexual dimorphism in vegetative and reproductive traits of a wind‐pollinated dioecious plant, Rumex hastatulus, across three life‐cycle stages using open‐pollinated families from 30 populations spanning the geographic range and chromosomal variation (XY and XY₁Y₂) of the species.

The direction and degree of sexual …

Mating System Variation In Hybrid Zones: Facilitation, Barriers And Asymmetries To Gene Flow, Melinda Pickup, Yaniv Brandvain, Christelle Fraïsse, Sarah Yakimowski, Nicholas H. Barton, Tanmay Dixit, Christian Lexer, Eva Cereghetti, David L. Field

Research outputs 2014 to 2021

Plant mating systems play a key role in structuring genetic variation both within and between species. In hybrid zones, the outcomes and dynamics of hybridization are usually interpreted as the balance between gene flow and selection against hybrids. Yet, mating systems can introduce selective forces that alter these expectations; with diverse outcomes for the level and direction of gene flow depending on variation in outcrossing and whether the mating systems of the species pair are the same or divergent. We present a survey of hybridization in 133 species pairs from 41 plant families and examine how patterns of hybridization vary …

Studies Of Beta-Cardiotoxin From King Cobra Venom On Rat Cardiac Functions: Effect On Isolated Single Cardiomyocyte, Tuchakorn Lertwanakarn

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

Beta-cardiotoxin (ß-CTX), a novel protein isolated from the King cobra (Ophiophagus hannah) venom has previously been proposed as a beta-blocker candidate. However, cellular mechanisms of ß-CTX on cardiomyocyte is unknown. This study aimed to evaluate the impact of ß-CTX on isolated rat cardiomyocyte function and the cardiac myofibrillar activity, and to explore involvement of ß-adrenergic receptor (ß-AR) signaling pathway. ß-CTX was isolated and purified using two-step chromatographic method and confirmed by N-terminal sequencer. The function of ß-CTX on cardiomyocyte was compared to propranolol in 3 conditions, basal state, with isoproterenol (ISO), and with forskolin (FSK). ß-CTX exhibited more potency than …

Co-Expression Of Feedback Resistant Enzymes In Phenylalanine Biosynthesis Pathway To Increase Phenylalanine Production, Charintip Yenyuvadee

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

L-Phenylalanine (L-Phe) is an important commercial amino acid. It is widely used in food and pharmaceutical industries. Currently, the requirement of L-Phe is increased according to the great demand for the low-calorie sweetener, aspartame. In Escherichia coli, the synthesis of L-Phe is controlled by the multi-hierarchical regulations. AroG isoform of 3-deoxy- D-arabino-heptulosonate-7-phosphate synthase (DAHP synthase) and chorismate mutase/prephenate dehydratase (PheA), two important enzymes, are feedback inhibited by LPhe. Co-expression of feedback-resistant pheA (pheA[superscript L359D]) with other pivotal genes in L-Phe biosynthesis pathway: aroB, aroL, phedh, tktA, aroG, pheA, yddG, and glpF in pRSFDuet-1 (pPTFBLYA[superscript L359D]) elevated L-Phe production of E. …

Functional Characterization Of Cytosolic Ddx41 Sensor In Mediating Antiviral Immune Response In Black Tiger Shrimp Penaeus Monodon, Suthinee Soponpong

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 41 (DDX41), a receptor belonging to the DExD family, was recently identified as an intracellular DNA sensor in vertebrates. Here, we investigated the presence of cytosolic DNA sensing, DDX41 in shrimp Penaeus monodon. By searching for gene involved in DNA sensing cascade within the shrimp P. monodon EST database, 3 cDNA fragments exhibited similarity to DDX41 in various species were identified. Sequences assembly resulted in a complete ORF of Penaeus monodon DDX41 (PmDDX41) which has 1868-bp encoding a putative protein of 620 amino acid residues. The multiple sequence alignment of deduced amino acid sequence of PmDDX41 …

Fructooligosaccharide Synthesis By Immobilized Inulosucrase From Lactobacillus Reuteri 121 And Improvement Of Product Pattern Using Site-Directed Mutagenesis, Thanapon Charoenwongpaiboon

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

Inulin-type fructooligosaccharides (IFOS) are well-known prebiotics which can be produced from sucrose using bacterial inulosucrase (E.C. 2.4.1.9). However, the use of inulosucrase for IFOS synthesis has some limitations because it also synthesizes some polysaccharides and exhibits lower stability than the fungal enzymes. To overcome these limitations, improvement of inulosucrase was made by using enzyme immobilization and enzyme engineering. First, inulosucrase from Lactobacillus reuteri 121 was immobilized on a novel, high capacity core-shell chitosan beads using glutaraldehyde as a cross-linker. The results showed that both immobilized and free inulosucrase had the same optimum pH (5.5), while the optimum temperature was shifted …

Enhancement Of Biofuel Production In Microalgae By Genetic And Physiological Modification, Napisa Pattharaprachayakul

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

Microalgae are photosynthetic microorganisms, which could be used as potential microbial cell factories by directly converting CO2 into valuable bioproducts and biofuels. This study aims to improve the target biofuel feedstocks from the isolated green alga Chlorella sp. and the engineered cyanobacterium Synechococcus elongatus PCC 7942 in terms of the improvement on lipids (as precursors of FAMEs) and terpene (α-farnesene), respectively. The first part is concerned with the enhancement of lipids and the determination of FAMEs and biodiesel properties in Chlorella sp. under the phosphorus (P) limitation (0-50%) alone or in combination with heavy metals (Fe, Co, Pb) supplementation. The …

Antioxidant And Antibacterial Agents From Parmotrema Dilatatum (Vainio) Hale, Knema Angustifolia (Roxb.) Warb. And Persicaria Odorata Lour, Asshaima Paramita Devi

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

In the search of antioxidant and antibacterial agents, the extracts and isolated compounds from lichen Parmotrema dilatatum, Knema angustifolia full name, Persicaria odorata and Mansonia gagei. were examined. Nine compounds were isolated from lichen P. dilatatum including (E)-2,4-dihydroxy-6-methyl-3-(3-oxobut-1-en-1-yl)benzoate (PD.1), hopane-16ß,22-diol (PD.2), methyl orsellinate (PD.3), methyl haemmatomate (PD.4), methyl ß-orcinolcarboxylate (PD.5), 2-hydroxy-4-methoxy-3,6-dimethylbenzoic acid (PD.6), atranol (PD.7), atranorin (PD.8) and lecanorin (PD.9). The dichloromethane and acetone fractions, and atranol (PD.7) gave excellent activities as antioxidants. While in tyrosinase activity the dichloromethane fraction and atranorin (PD.8) showed the highest inhibition. For α-glucosidase inhibition activity, the methanol fraction and methyl haemmatommate (PD.4) revealed the …

Binding Kinetics Of Monoclonal Antibodies And Fluoroquinolone Derivatives, Patamalai Boonserm

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

Fluoroquinolones (FQs) are a group of antibiotics which have been extensively used against both Gram-negative and Gram-positive bacteria. Some of FQs antibiotics commonly used in livestock and fishery include norfloxacin, enrofloxacin, ciprofloxacin, and ofloxacin. However, misuse of these antibiotics may cause drug residues in food products. Therefore, to prevent consumers from getting residual antibiotics in food and the drug resistance of pathogens in humans. As a result, surveillance detection program of these drug residues must be in practice to ensure safety of the consumers in many countries. In general, detections based on immunological method include enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) has …

Development Of Oxidase Enzyme And Non-Enzyme Based Biosensors For Lactate And Creatinine Detection, Siraprapa Boobphahom

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

This dissertation focused on the development of electrochemical sensors based on metal oxides and graphene modified electrodes for clinical applications, which is divided into two parts. The first part is development of a biosensor based on lactate oxidase (LOx) immobilized on titanium dioxide sol (TiO2 sol)/graphene nanocomposite modified nickel (Ni) foam electrode for enzymatic electrochemical detection of lactate via hydrogen peroxide (H2O2) detection. A TiO2/graphene nanocomposite was simply synthesized by hydrolysis and coated on Ni foam electrode to develop a novel electrode in biosensor. The results showed that the well intercalation of TiO2 sol within graphene film covered on the …

Development Of Paper-Based 3d Cell Culture Devices And Real-Time Biosensing Applications, Naricha Pupinyo

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

Due to its micro fibrous pores, paper has gained traction in the use as a scaffold for 3D cell culture. To study melanoma mechanism, screening the amount of melanin production and invasion study are major keys for drug development. In this work, we developed paper-based devices for culturing melanoma cells. Through the development process, we obtained the optimal parameters, which were applied for 3 different projects; 1) Anti-melanogenic effect screening, 2) Impedance-based E-screen assay, and 3) A membrane insert for real-time invasion assay. As a result of melanin production from melanocytes, the cells can be easily observed after a few …

Effects And Mechanisms Of Caesalpinia Mimosoides Leaf Extract On Oxidative Stress Resistance And Anti-Aging Activity In Caenorhabditis Elegans And Neurite Outgrowth Activity In Neuro2a Cells, Panthakarn Rangsinth

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

World’s population of older people is rising, dietary supplements promoting healthy lifespan are needed. Moreover, Alzheimer’s disease (AD), an age-related degenerative disease, becomes a public health problem in aging society. Recent reports using cell culture models of AD suggest that amyloid precursor protein (APP), a protein causally related to AD, plays an important role as an inhibitor of neurite outgrowth. Medicinal herbs with neurite outgrowth stimulatory effect may help to prevent and cure AD. Moreover, studies suggest that dietary supplements from plant sources act in preventive nutrition, since they provide antioxidant action against oxidative stress, promote healthspan and prolong lifespan. …

Effects And Mechanisms Of Anacardium Occidentale And Glochidion Zeylanicum Leaf Extracts On Neuroprotective, Neuritogenesis, Oxidative Stress Resistance And Anti-Aging Properties., Chatrawee Duangjan

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

Aging is the primary risk factor for most neurodegenerative diseases and can negatively affect the quality of life. Neurodegenerative diseases are linked to neuronal cell death and neurite outgrowth impairment that are often caused by oxidative stress. As people want to live longer and healthier, healthy nutrition has been increasingly received much attention in recent years. Several studies reported a positive correlation between antioxidants in foods and longevity. Natural products from food supplements and medicinal plants with antioxidant properties could be promising candidates for fighting against various aging-related diseases and promoting longevity. Leaf extracts from A. occidentale (AO) and G. …

Development Of Functional Foods Based On Anthocyanin-Rich Riceberry Rice Extract (Oryza Sativa L.) And Its Effects On Postprandial Biochemical Parameters In Human., Tanisa Anuyahong

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

Riceberry rice (Oryza sativa L.), is a crossbreed of Kao Hom Nin, a local non-glutinous purple rice and Khoa Dawk Mali 105. Its pigment contains high amount of antioxidant compounds, especially anthocyanins. Previously, riceberry rice exhibited its food application with high antioxidant activity. However, the potential of food application of riceberry rice extract (RBE) in yogurt and beverage products and its postprandial effect on humans remains unknown. In this study, RBE was prepared from a mixture of riceberry rice and distilled water in 1:2 w/v ratio following the freeze-drying process. The results showed that RBE contained phenolic compounds and anthocyanins …

Effects Of Astaxanthin Supplementation On Biological Parameters In Thai Healthy Volunteers, Chuenjai Sratongfaeng

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

Astaxanthin, a powerful antioxidant, is widely used as a dietary supplement to promote several health benefits. However, the effects of long-term supplementation on general biological parameters in healthy adults is still insufficient. The objective of this study was to investigate the effects of 12-week astaxanthin supplementation on blood glucose, lipid profile and hematological parameters in healthy volunteers. Thirty-three healthy participants (16 in the experimental group and 17 in the placebo group) were enrolled in the study. The participants in the experimental group were supplemented with 4 mg/day of astaxanthin while those in the placebo group were supplemented with soybean oil …

Development Of Riceberry Cracker Supplementation With Unripe Papaya Flour, Napassorn Payantakom

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

The aim of this study was to investigate the effect of partial replacement of wheat flour with riceberry flour and unripe papaya flour on the physicochemical, functional properties and sensory evaluation of crackers. In the current study found that partial substitution of wheat flour with 5, 10, 15 and 20% riceberry flour (5, 10, 15 and 20%RBF) resulted in significantly increased in hardness and redness together with a decreased fracturability, lightness and yellowness of crackers. Researcher also found that substitution of wheat flour with riceberry flour resulted in an increase phenolic content from 2.03±0.36 (control cracker) to 8.78±0.19 (20%RBF) mg …

Development Of Composite Film Coating For Freeze-Dried Fruit Slices, Nichayarach Invichian

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

Edible film coating on food before freeze-drying process can be used for food preservation, especially in heat-sensitive food such as fruits and vegetables. Previous studies have been reported that trehalose had the cryoprotective effect and unique properties such as non-reducing sugar and low hygroscopic. However, no research has been conducted on the use of trehalose as film coatings. Therefore, this study aimed to develop a composite film consisting of alginate and trehalose and to evaluate physical properties of freeze-dried ​​fruit slices coated with a composite film. The experiment was designed to prepare a composite film consisting of various concentrations of …

Effects Of Gardenia Jasminoides Fruit Extract On Helicobacter Pylori Induced Gastritis In Vitro And In Vivo Studies, Nattida Noonak

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

Helicobacter pylori (H. pylori) releases virulence factors to gastric epithelial cells causing an imbalance between aggressive factors and protective factors leading to gastritis inflammation. Gardenia jasminoides (G. jasminoides) fruit extract contains geniposide as a major bioactive compound that possesses anti-inflammatory effects. The present study aimed to investigate the effects of G. jasminoides fruit extract on gastric inflammation and protective mechanisms in H. pylori-induced gastritis. In an in vitro experiment, we demonstrated that G. jasminoides fruit extract could inhibit growth of H. pylori using disk diffusion method. The result showed that the inhibition zone was observed at geniposide ≥ 0.16 mg/disc. …

พฤติกรรมการเรียนรู้และการตอบสนองต่อ 2,4-ไดไนโตรโทลูอีนในผึ้งพันธุ์ Apis Mellifera Linnaeus, 1758 และผึ้งโพรง Apis Cerana Fabricius, 1793, ศิรัช เลิศจินตนากิจ

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

ผึ้งให้น้ำหวานเป็นสิ่งมีชีวิตต้นแบบสําหรับการศึกษาการตอบสนองต่อกลิ่นโดยใช้วิธีการเรียนรู้แบบมี เงื่อนไข (classical conditioning) ผ่านทางพฤติกรรมการแลบลิ้นหรือ Proboscis Extension Response (PER) ซึ่งมีรายงานอย่างกว้างขวางในผึ้งพันธุ์หรือผึ้งให้น้ำหวานสายพันธุ์ยุโรป (A. mellifera) ในขณะที่การศึกษาในผึ้งโพรงหรือผึ้งให้น้ำหวานสายพันธุ์เอเชีย (A. cerana) กลับยังมีการศึกษาอยู่น้อยมาก ทั้งที่มีความสําคัญในการเป็นแมลงผสมเกสรในภูมิภาคเอเชียและในประเทศไทย ในการศึกษาครั้งนี้ วิธีการ PER ถูกนํามาใช้เพื่อเป็นตัวประเมินความสามารถในการเรียนรู้และตอบสนองต่อสาร 2,4–ไดไนโตรโทลูอีน (DNT, สารตั้งต้นวัตถุระเบิด) โดยทําการเปรียบเทียบความสามารถของการเรียนรู้และตอบสนองระหว่างผึ้งทั้งสองชนิด การศึกษานี้ทดลองในช่วงระหว่างเดือนพฤษภาคม 2561 ถึงเดือนมีนาคม 2563 ผึ้งที่มีหน้าที่หาอาหารจะถูกจับและนําไปฝึกให้เกิดการเรียนรู้แบบมีเงื่อนไขระหว่างสารละลายน้ำตาลซูโครสความเข้มข้น 50% w/v (ใช้เป็นรางวัล) และ DNT ความเข้มข้น 25 มิลลิกรัมต่อลิตร (ใช้เป็นสิ่งเร้าเงื่อนไข) การฝึกให้ผึ้งเกิดการเรียนรู้แบบมีเงื่อนไขนั้นจะทําการฝึกผึ้งทั้งหมด 6 ครั้ง ในช่วงเวลา 13:00–15:00 น. เพื่อที่จะสามารถประเมินได้ว่าผึ้งมีความสามารถในการเรียนรู้และจดจํากลิ่น DNT ได้หรือไม่ ผลการศึกษาแสดงให้เห็นว่า ผึ้งพันธุ์ (N=61) สามารถเกิดการเรียนรู้แบบมีเงื่อนไขระหว่างกลิ่นและน้ำตาลซูโครสได้ โดยมีการแสดงพฤติกรรม PER เพิ่มขึ้นจาก 9.84±3.84% (การฝึกครั้งที่ 1) เป็น 47.54±6.44% (การฝึกครั้งที่ 6) ในขณะที่ผึ้งโพรง (N=36) สามารถเกิดการเรียนรู้แบบมีเงื่อนไขระหว่างกลิ่นและน้ำตาลซูโครสได้เช่นกัน เกิดการแสดงพฤติกรรม PER เพิ่มขึ้นจาก 2.78±2.78% (การฝึกครั้งที่ 1) เป็น 47.22±8.44% (การฝึกครั้งที่ 6) จากผลการศึกษายังระบุอีกว่า ผึ้งพันธุ์มีความสามารถในการเรียนรู้และตอบสนองต่อ DNT (49.18±6.45%) ได้ดีกว่าผึ้งโพรง (16.67±6.30%) ในช่วงที่สองของการฝึก (P<0.01) สําหรับการทดสอบความสามารถในการจดจํา (memory retention test) พบว่า ผึ้งพันธุ์ยังคงสามารถตอบสนองต่อ DNT และแสดงพฤติกรรม PER ได้ 46.00±3.68%, 67.34±4.83% และ 52.03±3.77% ในขณะที่ผึ้งโพรงก็สามารถแสดงพฤติกรรม PER ได้ 55.50±6.10%, 50.50±7.09% และ 44.50±6.37% หลังจากที่เวลาผ่านไป 10 นาที 24 ชั่วโมงและ 48 ชั่วโมงหลังการฝึกตามลําดับ อย่างไรก็ตามความสามารถในการจดจําต่อกลิ่น DNT ของผึ้งทั้งสองชนิดนี้ไม่ได้แตกต่างกันอย่างมีนัยสําคัญทางสถิติ (P>0.05) จากผลการศึกษานี้ ผู้วิจัยพบว่าผึ้งทั้งสองชนิดมีความจําระยะยาว (long-term memory) ที่ยังคงสามารถแสดงพฤติกรรม PER และตอบสนองต่อกลิ่น DNT ได้แม้ว่าเวลาจะผ่านไปแล้ว 48 ชั่วโมงก็ตาม ความสามารถในการเรียนรู้และจดจําที่แตกต่างกันระหว่างผึ้งให้หวานทั้งสองชนิดนี้อาจจะเป็นผลมาจากคัดเลือกทางธรรมชาติเนื่องจากผึ้งทั้งสองชนิดมีถิ่นที่อยู่อาศัยที่มีสภาพภูมิอากาศแตกต่างกัน การศึกษาเพิ่มเติมเพื่อประเมินความสามารถในการเรียนรู้และการจดจําของผึ้งให้น้ําหวานสายพันธุ์เอเชียชนิดอื่น ๆ จะช่วยให้ข้อมูลที่เป็นประโยชน์เพิ่มขึ้นในการศึกษาเชิงเปรียบเทียบระหว่างผึ้งที่อาศัยในเขตอบอุ่นกับในเขตร้อนชื้น

Effects Of Gardenia Jasminoides Fruit Extract On Helicobacter Pylori Induced Gastritis In Vitro And In Vivo Studies, Nattida Noonak

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

Helicobacter pylori (H. pylori) releases virulence factors to gastric epithelial cells causing an imbalance between aggressive factors and protective factors leading to gastritis inflammation. Gardenia jasminoides (G. jasminoides) fruit extract contains geniposide as a major bioactive compound that possesses anti-inflammatory effects. The present study aimed to investigate the effects of G. jasminoides fruit extract on gastric inflammation and protective mechanisms in H. pylori-induced gastritis. In an in vitro experiment, we demonstrated that G. jasminoides fruit extract could inhibit growth of H. pylori using disk diffusion method. The result showed that the inhibition zone was observed at geniposide ≥ 0.16 mg/disc. …

การชักนำแคลลัสและผลของเอลิสิเทอร์ต่อฤทธิ์ต้านออกซิเดชันของแคลลัสฟักข้าวMomordica Cochinchinensis (Lour.) Spreng. ที่เลี้ยงในอาหารเหลว, สุพรรษา พลายเปี่ยม

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

ฟักข้าว (Momordica cochinchinensis (Lour.) Spreng) หรือแก็ก (gac) เป็นพืชไม้เลื้อยที่อยู่ในวงศ์ Cucurbitaceae โดยฟักข้าวนั้นมีสารปฐมภูมิและสารทุติยภูมิสะสมอยู่ในทุกส่วนของต้น ประกอบไปด้วยแคโรทีนอยด์ กรดไขมัน วิตามินอี โพลีฟีนอล และ ฟลาโวนอยด์ ซึ่งทำให้การใช้ประโยชน์ของฟักข้าวถูกบันทึกลงในการแพทย์แผนโบราณของหลายประเทศ ในปัจจุบันมีการใช้เอลิสิเทอร์หลากหลาย เช่น ไคโทซาน และ เมทิลแจสโมเนต (MeJA) เพื่อเพิ่มปริมาณสารทุติยภูมิในพืช ดังนั้นในงานวิจัยนี้จึงมีวัตถุประสงค์เพื่อพัฒนาการชักนำแคลลัสฟักข้าวและศึกษาผลของไคโทซานน้ำหนักโมเลกุลสูง (HMC) ไคโทซานน้ำหนักโมเลกุลต่ำ (LMC) ความเข้มข้น 10 และ 20 mg/l MeJA ความเข้มข้น 100 และ 150 µM ต่อฤทธิ์ต้านออกซิเดชันของแคลลัสฟักข้าวที่เลี้ยงในอาหารเหลว สำหรับการทดลองชักนำการเกิดแคลลัส ได้นำส่วนยอดและส่วนข้อของต้นฟักข้าวปลอดเชื้อมาเลี้ยงในอาหารแข็งสูตร MS ที่ประกอบไปด้วย 2,4-D และ BA พบว่าในสูตรอาหารที่ประกอบด้วย 0.8 mg/l 2,4-D + 0 mg/l BA 0.8 mg/l 2,4-D + 0.4 mg/l BA และ 0.8 mg/l 2,4-D + 0.8 mg/l BA สามารถชักนำการเกิดแคลลัสได้ดีที่สุด ในส่วนของการศึกษาผลของเอลิสิเทอร์ต่อฤทธิ์ต้านออกซิเดชันของแคลลัสฟักข้าว HMC, LMC หรือ MeJA ถูกเติมลงในอาหารวันที่ 18 ของการเพาะเลี้ยงแคลลัสในอาหารเหลว และเก็บตัวอย่างแคลลัสในวันที่ 20 และ 22 ของการเพาะเลี้ยงเพื่อศึกษาฤทธิ์ต้านออกซิเดชัน ผลการทดลองพบว่าเอลิสิเทอร์ไม่มีผลเพิ่มฤทธิ์ต้านออกซิเดชันของแคลลัสฟักข้าวที่เวลาดังกล่าว ยกเว้นในชุดการทดลองที่เติม 150 µM MeJA พบว่าในวันที่ 22 ของการเพาะเลี้ยงแคลลัสมีปริมาณของแคโรทีนอยด์มากกว่าชุดควบคุมและชุดทดลองอื่นๆอย่างมีนัยสำคัญ

การวิเคราะห์การกลายพันธุ์ของยีน Cyp21a2 ในผู้ป่วยไทยที่มีภาวะพร่องเอนไซม์ 21-ไฮดรอกซิเลส, นิธิพัฒน์ ตันติรักษ์ธรรม

Chulalongkorn University Theses and Dissertations (Chula ETD)

โรคต่อมหมวกไตชั้นนอกโตผิดปกติตั้งแต่กำเนิด เป็นโรคทางพันธุกรรมที่พบได้บ่อยที่สุดในกลุ่มโรคต่อมหมวกไตชั้นนอก มากกว่าร้อยละ 90 ของผู้ป่วยโรคนี้มีสาเหตุมาจากภาวะพร่องเอนไซม์ 21-ไฮดรอกซิเลส โดยถ่ายทอดทางพันธุกรรมแบบยีนด้อยบนออโตโซม ซึ่งเกิดจากการกลายพันธุ์ของยีน CYP21A2 ที่มีหน้าที่ควบคุมการสร้างเอนไซม์ 21-ไฮดรอกซิเลส ในวิถีการสังเคราะห์ฮอร์โมนสเตียรอยด์ของฮอร์โมนคอร์ติซอล ยีน CYP21A2 อยู่ในกลุ่มยีนที่มีโครงสร้างซับซ้อน เนื่องจากยีน CYP21A2 มีลำดับนิวคลีโอไทด์เหมือนกันกับยีนเทียม CYP21A1P สูงถึงร้อยละ 98 ส่งผลให้เกิดการครอสโอเวอร์ไม่ตรงกันในระหว่างแบ่งเซลล์แบบไมโอซิส บางแอลลีลมีการขาดหายขนาดใหญ่และได้ผลิตภัณฑ์เป็นยีนลูกผสมกับยีนเทียมที่ไม่สามารถทำงานได้ และบางแอลลีลมียีนคอนเวอร์ชัน ทำให้ส่วนหนึ่งของยีน CYP21A2 ถูกแทนที่ด้วยส่วนหนึ่งของยีนเทียม CYP21A1P ส่วนที่ถูกแทนที่ดังกล่าวจึงได้รับการแปรผันทางพันธุกรรมที่พบบนยีนเทียม CYP21A1P มาด้วย การกลายพันธุ์เหล่านี้ไม่สามารถตรวจพบได้ด้วยเทคนิคการหาลำดับนิวคลีโอไทด์ด้วยหลักการของแซงเกอร์หรือเทคนิค MLPA เพียงเทคนิคเดียว การศึกษานี้ใช้เทคนิคการเพิ่มปริมาณยีนแบบจำเพาะโลคัส (locus-specific PCR) ร่วมกับเทคโนโลยีวิเคราะห์หาลำดับนิวคลีโอไทด์โมเลกุลเดียวตามเวลาจริงแบบสายยาว (long-read single molecule real-time sequencing, long-read SMRT sequencing) ในการหาการกลายพันธุ์ในบริเวณที่ซับซ้อนและสามารถพบการกลายพันธุ์ทั้งหมดในผู้ป่วยไทยจำนวน 49 ราย โดยชนิดของการกลายพันธุ์ที่พบ ได้แก่ การกลายพันธุ์ตำแหน่งตัดเชื่อม การกลายพันธุ์แบบเปลี่ยนรหัส การกลายพันธุ์เป็นรหัสหยุด การกลายพันธุ์แบบเลื่อนกรอบ และการขาดหายขนาดใหญ่ของยีน โดยพบการกลายพันธุ์ตำแหน่ง IVS2-13A/C>G จำนวน 37 แอลลีล เป็นตำแหน่งที่มีความถี่แอลลีลสูงที่สุด มีความถี่แอลลีลเท่ากับ 0.378 นอกจากนี้ ยังพบการกลายพันธุ์ใหม่ตำแหน่ง IVS7+1G>T ซึ่งเป็นตำแหน่งที่น่าจะมีผลกระทบต่อตำแหน่งตัดเชื่อม การใช้เทคนิคการเพิ่มปริมาณยีนแบบจำเพาะโลคัสร่วมกับเทคโนโลยีวิเคราะห์หาลำดับนิวคลีโอไทด์โมเลกุลเดียวตามเวลาจริงแบบสายยาวนี้ สามารถหาสาเหตุทางพันธุกรรมของยีน CYP21A2 ที่มีความซับซ้อนได้ ซึ่งข้อมูลที่ได้สามารถใช้ในการให้คำปรึกษาทางพันธุศาสตร์ที่เหมาะสมแก่ผู้ป่วยและครอบครัวได้

Mitragynine Reduced Morphine-Induced Conditioned Place Preference And Withdrawal In Rodents, Rittinarong Meepong, Thongchai Sooksawate

The Thai Journal of Pharmaceutical Sciences

Introduction: Kratom (Mitragyna speciosa Korth) has been long used in folklore medicine in Southeast Asian countries for its analgesic effects and the treatment of opioid withdrawal. Mitragynine is a major alkaloid found in the leaves of kratom plant th.

Protecting Biodiversity In British Columbia: Recommendations For Developing Species At Risk Legislation, Alana R. Westwood, Sarah P. Otto, Arne Mooers, Chris Darimont, Karen E. Hodges, Chris Johnson, Brian M. Starzomski, Cole Burton, Kai M. A. Chan, Marco Festa-Bianchet, Shaun Fluker, Sumeet Gulati, Aerin L. Jacob, Dan Kraus, Tara G. Martin, Wendy J. Palen, John D. Reynolds, Jeannette Whitton

Threatened and Endangered Animal Populations Collection

British Columbia has the greatest biological diversity of any province or territory in Canada. Yet increasing numbers of species in British Columbia are threatened with extinction. The current patchwork of provincial laws and regulations has not effectively prevented species declines. Recently, the Provincial Government has committed to enacting an endangered species law. Drawing upon our scientific and legal expertise, we offer recommendations for key features of endangered species legislation that build upon strengths and avoid weaknesses observed elsewhere. We recommend striking an independent Oversight Committee to provide recommendations about listing species, organize Recovery Teams, and monitor the efficacy of actions …

Disease Prevention With A Plant-Based Lifestyle, Sabina V. Vyas

Dietary Choice and Foods of Animal Origin Collection

Animal experiments are commonly conducted to understand human diseases and responses to treatment. As decades of research indicate, the use of nonhuman animals (hereinafter referred to as animals) to translate the side effects, benefits, and impact of medications and treatments on the human body has been demonstrated to be ineffective; while billions of animals and humans have suffered (Shanks, Greek and Greek, 2009). Due to misleading safety and efficacy data from animal experiments, humans are often prescribed medications that may not be as effective or as safe as the patient, or even physician, may have been led to believe (Akhtar, …

The Land Of Meat And Potatoes? Exploring Ireland’S Vegan And Vegetarian Foodscape, Corey Lee Wrenn

Dietary Choice and Foods of Animal Origin Collection

While it would not be accurate to suggest that Ireland is a hub of veganism or vegetarianism, too often it is written off as inherently unsympathetic to the ethics of plant-based eating and anti-speciesist politics. While it is true that Irish culture is historically tied to speciesism and its economy is especially dependent upon “meat” and dairy production, Ireland’s relationship with other animals is complex and sometimes forgiving. This essay seeks to bring shape to the Irish vegan ethic, one that can be traced along its history of animism, agrarianism, ascendency, adaptation, and activism. From its pagan roots to its …

The Scientific Problems With Using Non-Human Animals To Predict Human Response To Drugs And Disease, Ray Greek, Lisa A. Kramer

Pharmacology and Animal Models in Research Collection

Every year, and in countries around the world, significant time and resources are devoted to the noble cause of developing drugs to treat and cure human disease. With rare exception, drug interventions cannot reach commercialization without safety and efficacy having first been demonstrated in animal models. The intention of regulations, which require the use of animal models in such contexts, is to ensure that only safe and effective drugs end up being used by patients. Similarly, it is standard practice for researchers to employ animal models in their attempts to understand the way diseases present and progress in humans. Unfortunately, …

Beyond Plausibility Checks: A Case For Moral Doubt In Review Processes Of Animal Experimentation, Mara-Daria Cojocaru, Philipp Von Gall

Morality and Ethics of Animal Experimentation Collection

The fact that countries all over the world continue to develop new regulations for experimentation on non-human animals testament that this practice raises many doubts. Our aim in this chapter is to show that one important type of doubt should receive more attention: a particular type of moral doubt that could play a pivotal role in the ethical review of animal experiments. We assume that there are a range of emotions that indicate morally complex or problematic situations. When one or all of these emotions are experienced, we say that someone is experiencing moral doubt. To illustrate this point, we …